New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3632487 | 21 (0.660) | 3 (0.100) | 3/240 | NT | 13.2% | coding (1338/1368 nt) | PP_5590 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 3632505 | 19 (0.620) | coding (1356/1368 nt) | PP_5590 | hypothetical protein |
TGCTGCCTGACCTGCCGGGCGTGGTGACCTTGACCAACGGCTTCTACGACCTGCTCTCCGGTGCCTGGTTCGCCGGTGACCTGTTCGCAGGCAAGAACGAACAGTACCGCATCGTGCCGCCCTACAAGGACTCGGTGTTCACCGCCGACGCCATGGCC‑‑GGCGAGGGCGTGCGCTGAGCAGGCGCGCTGCGCAGGTGCTGTACCGACTCTAAGAACAAAAGGTTGCGTGCGATGAACAAGATGCTCTACGGCTGGCTGCTGGCAGCCTGTTGCGGGCTGCCGCCGGCGTTCGCC > NC_002947/3632342‑3632634 | tgctgcCTGACCTGCCGGGCGTGGTGACCTTGACCAACGGCTTCTACGACCTGCTCTCCGGTGCCTGGTTCGCCGGTGACCTGTTCGCAGGCAAGAACGAACAGTACCGCATCGTGCCGCCCTACAAGGACTCGGTGTTCACCGCCGACg > 1:798017/1‑150 (MQ=255) ctgcCTGACCTGCCGGGCGTGGTGACCTTGACCAACGGCTTCTACGACCTGCTCTCCGGTGCCTGGTTCGCCGGTGACCTGTTCGCAGGCAAGAACGAACAGTACCGCATCGTGCCGCCCTACAAGGACTCGGTGTTCACCGCCGACGcc > 1:672998/1‑150 (MQ=255) ccTGACCTGCCGGGCGTGGTGACCTTGACCAACGGCTTCTACGACCTGCTCTCCGGTGCCTGGTTCGCCGGTGACCTGTTCGCAGGCAAGAACGAACAGTACCGCATCGTGCCGCCCTACAAGGACTCGGTGTTCACCGCCGACGCCATg > 2:362713/1‑150 (MQ=255) tGACCTGCCGGGCGTGGTGACCTTGACCAACGGCTTCTACGACCTGCTCTCCGGTGCCTGGTTCGCCGGTGACCTGTTCGCAGGCAAGAACGAACAGTACCGCATCGTGCCGCCCTACAAGGACTCGGTGTTCACCGCCGACGCCATGGc > 2:805610/1‑150 (MQ=255) cGGGCGTGGTGACCTTGACCAACGGCTTCTACGACCTGCTCTCCGGTGCCTGGTTCGCCGGTGACCTGTTCGCAGGCAAGAACGAACAGTACCGCATCGTGCCGCCCTACAAGGACTCGGTGTTCACCGCCGACGCCATGGCC‑‑GGCGAGg > 1:493254‑M2/1‑149 (MQ=255) gtgACCTTGACCAACGGCTTCTACGACCTGCTCTCCGGTGCCTGGTTCGCCGGTGACCTGTTCGCAGGCAAGAACGAACAGTACCGCATCGTGCCGCCCTACAAGGACTCGGTGTTCACCGCCGACGCCATGGCC‑‑GGCGAGGGCGTgcgc > 2:255764/1‑150 (MQ=255) tgACCTTGACCAACGGCTTCTACGACCTGCTCTCCGGTGCCTGGTTCGCCGGTGACCTGTTCGCAGGCAAGAACGAACAGTACCGCATCGTGCCGCCCTACAAGGACTCGGTGTTCACCGCCGACGCCATGGCC‑‑GGCGAGGGCGTGCGCt < 2:701301/150‑1 (MQ=255) ccaacGGCTTCTACGACCTGCTCTCCGGTGCCTGGTTCGCCGGTGACCTGTTCGCAGGCAAGAACGAACAGTACCGCATCGTGCCGCCCTACAAGGACTCGGTGTTCACCGCCGACGCCATGGCC‑‑GGCTAGGGCGTGCGCTGAGCAGgcg > 2:440557‑M2/6‑150 (MQ=255) ggCTTCTACGACCGGCTCTCCGGTGCCTGGTTCGCCGGTGACCTGTTCGCAGGCAAGAACGAACAGTACCTCATCGTGCCGCCCTACAAGGACTCGGTGTTCACCGCCCTCGCC‑‑GGCCATGGCGTCggcggtgaacaccgagtccttgta > 1:762769‑M2/1‑126 (MQ=255) tCTACGACCTGCTCTCCGGTGCCTGGTTCGCCGGTGACCTGTTCGCAGGCAAGAACGAACAGTACCGCATCGTGCCGCCCTACAAGGACTCGGTGTTCACCGCCGACGCCATGGCC‑‑GGCGAGGGCGTGCGCTGAGCAGGCGCGCTGCGCa < 1:703158/150‑1 (MQ=255) cTACGACCTGCTCTCCGGTGCCTGGTTCGCCGGTGACCTGTTCGCAGGCAAGAACGAACAGTACCGCATCGTGCCGCCCTACAAGGACTCGGTGTTCACCGCCGACGCCATGGCC‑‑GGCGAGGGCGTGCGCTGAGCAGGCGCGCTGCGCAg < 1:255764/150‑1 (MQ=255) cGACCTGCTCTCCGGTGCCTGGTTCGCCGGTGACCTGTTCGCAGGCAAGAACGAACAGTACCGCATCGTGCCGCCCTACAAGGACTCGGTGTTCACCGCAGACGCCATGGCC‑‑GGCGAGGGCGTGCGCTGAGCAGGAACATTGAGCAGGTg < 2:672998/150‑1 (MQ=255) ccGGTGACCTGTTCGCAGGCAAGAACGAACAGTACCGCATCGTGCCGCCCTACAAGGACTCGGTGTTCACCGACGACGCCATGGCC‑‑GGCGAGGCCGTGCGCTGAGCAGGCGCGCTGCCCAGGTGCTGTACCGACTCTAAGAACAAAAGGt > 2:167014/1‑150 (MQ=255) tGTTCGCAGGCAAGAACGAACAGTACCGCATCGTGCCGCCCTACAAGGACTCGGTGTTCACCGCCctcgccggccatggcgtcggcggt < 1:338357‑M1/89‑25 (MQ=255) tGTTCGCAGGCAAGAACGAACAGTACCGCATCGTGCCGCCCTACAAGGACTCGGTGTTCACCGCCctcgccggccatggcgtcggcggt > 2:338357‑M1/1‑65 (MQ=255) gCAGGCAAGAACGAACAGTACCGCATCGTGCCGCCCTACAAGGACTCGGTGTTCACCGCCGACGCCATGGCC‑‑GGCGAGGGCGTGCGCTGAGCAGGCGCGCTGCGCAGGTGCTGTACCGCCTCTACGACCAAAAGGTTGCGTGCGATGacc < 2:228478/150‑3 (MQ=255) acAGTACCGCATCGTGCCGCCCTACAAGGACTCGGTGTTCACCGCCGACGCCATGGCC‑‑GGCGAGGGCGTGCGCTGAGCAGGCGCGCTGCGCAGGTGCTGTACCGACTCTAAGAACAAAAGGTtgc < 1:434860/125‑1 (MQ=255) acAGTACCGCATCGTGCCGCCCTACAAGGACTCGGTGTTCACCGCCGACGCCATGGCC‑‑GGCGAGGGCGTGCGCTGAGCAGGCGCGCTGCGCAGGTGCTGTACCGACTCTAAGAACAAAAGGTtgc > 2:434860/1‑125 (MQ=255) aGTACCGCATCGTGCCGCCCTACAAGGACTCGGTGTTCACCGCCGACGCCATGGCC‑‑GGCGAGGGCGTGCGCTGAGCAGGCGCGCTGCGCAGGTGCTGTACCGACTCTAAGAACAAAAGGTTGCGTGCGATGAACAAGATGCTCTACggct > 1:65335/1‑150 (MQ=255) cccTACAAGGACTCGGTGTTCACCGCCGACGCCATGGCC‑‑GGCGAGGGCGTGCGCTGAGCAGGCGCGCTGCGCAGGTGCTGTACCGACTCTAAGAACAAAAGGTTGCGTGCGATGAACAAGATGCTCTACGGCTGGCTGCTGGCAGCCTGt < 2:215500/150‑1 (MQ=255) tACAAGGACTCGGTGTTCACCGCCgacgccatggccggcgagggcggtgaacaccgagtccttgtagggcggcacgatgaggtactgttcgttcttgcctgcgaacaggtcaccggcgaaccaggcaccggagagccggtcgtagaagcc > 1:762769‑M1/1‑24 (MQ=255) tACAAGGACTCGGTGTTCACCGCCGACGCCATGGCC‑‑GGCGAGGGCGTGCGCTGAGCAGGCGCGCTGCGCAGGTTCTGTACCGACTCTAAGAACAAAAGGTTGCGTGCGATGAACAAGATGCTCTACGGCTGGCTGCTGGCAGCCTGTTGc > 1:454428/1‑150 (MQ=255) aaGGACTCGGTGTTCACCGCCGACGCCATGGCC‑‑GGCGAGGGCGTGCGCTGAGCAGGCGCGCTGCGCAGGTGCTGTACCGACTCTAAGAACAAAAGGTTGCGTGCGATGAACAAGATGc > 1:794395/1‑118 (MQ=255) aaGGACTCGGTGTTCACCGCCGACGCCATGGCC‑‑GGCGAGGGCGTGCGCTGAGCAGGCGCGCTGCGCAGGTGCTGTACCGACTCTAAGAACAAAAGGTTGCGTGCGATGAACAAGATGc < 2:794395/118‑1 (MQ=255) tCGGTGTTCACCGCCGACGCCATGGCC‑‑GGCGAGGGCGTGCGCTGAGCAGCCGCGCTGCGCAGGTGCTGTACCGACTCTAAGAACAAAAGGTTGCGTGCGATGAACAAGATGCTCTACGGCTGGCTACTGGCAGCCTGTTGCGAGCTgccg > 2:54981/1‑150 (MQ=255) ggTGTTCACCGCCGACGCCATGGCC‑‑GGCGAGGGCGTGCGCTGAGCAGGCGCGCTGCGCAGGTGCt < 1:808630/65‑1 (MQ=255) ggTGTTCACCGCCGACGCCATGGCC‑‑GGCGAGGGCGTGCGCTGAGCAGGCGCGCTGCGCAGGTGCt > 2:808630/1‑65 (MQ=255) aCCGCCGACGCCATGGCC‑‑GGCGAGggcggtgaacaccgagtccttgtagggcggcacgatgcggtactgttcgttcttgcctgcgaaca > 2:338357‑M2/1‑24 (MQ=255) aCCGCCGACGCCATGGCC‑‑GGCGAGggcggtgaacaccgagtccttgtagggcggcacgatgcggtactgttcgttcttgcctgcgaaca < 1:338357‑M2/89‑66 (MQ=255) aCCGCCGACGCCATGGCC‑‑GGCGAGGGCGTGCGCTGAGCAGGCGCGCTGCGCAGGTGCTGTACCGACTCTAAGAACAAAAGGTTGCGTGCGATGAACAAGATGCTCTACGGCTGGCTGCTGGCAGCCTGTTGCGGGCTGCCGCCGGCGTTc < 1:362713/150‑1 (MQ=255) ccgccgATGCTATGGGC‑‑GGCGAGGGCGTGCGGTGAGCAGGCGCGCCGCGCAGGTGCTCTACCGACTCTAAGAACAAAAGGTTGCGTGAGATGAACAAGATGCTCTACGGCTGGCTTCTGGCAGGCTGTTGCGGGCTGCCGCCGGCGTTCg > 2:79538/1‑150 (MQ=255) cctcgccggccatggcgtcggcggtgaacaccgagtccttgtagggcggcacgatgcggtactgttcgttcttgcctgcgaacaggtcaccggcgaaccaggcaccggagagcaggtcgtagaagccgttggtcaaggtcaccacgcccg > 1:493254‑M1/1‑1 (MQ=255) | TGCTGCCTGACCTGCCGGGCGTGGTGACCTTGACCAACGGCTTCTACGACCTGCTCTCCGGTGCCTGGTTCGCCGGTGACCTGTTCGCAGGCAAGAACGAACAGTACCGCATCGTGCCGCCCTACAAGGACTCGGTGTTCACCGCCGACGCCATGGCC‑‑GGCGAGGGCGTGCGCTGAGCAGGCGCGCTGCGCAGGTGCTGTACCGACTCTAAGAACAAAAGGTTGCGTGCGATGAACAAGATGCTCTACGGCTGGCTGCTGGCAGCCTGTTGCGGGCTGCCGCCGGCGTTCGCC > NC_002947/3632342‑3632634 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |