New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4016697 = | 23 (0.730) | 4 (0.140) | 4/226 | NT | 13.6% | coding (555/1410 nt) | PP_3544 | GntR family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | 4016768 = | 30 (1.040) | coding (626/1410 nt) | PP_3544 | GntR family transcriptional regulator |
CGCATGGTGGTGACCGATCTGTCCCCCGGTAACCCGCAGTTGCGCCGGCAGATAGCCCTGCGCTACATGGTCGGTGGGCTGATGCTGCCGATGGAAGAGCTGCTGATCACCAACGGCGCACTGGAGGCCCTGAACCTGTGCCTGCAGGCAGTGACCCAGCCGGGCGATCTGGTCGCCATCGAGGCCCCGGCCTTCTATGCCTGCCTGCAGGTGCTGGAGCGGCTCAAGCTCAAGGCTGTGGAAATCCCCGTGCACCCGCGCGAGGGCATGGACCTGGGGGTGCTGGC > NC_002947/4016557‑4016843 | caccgggttctggaaattggtcatgcaccacacggcctttaccgggtgcatttccagggtctgcgccagcacccccaggtccatgccctcgcgcgggtgcacggggatttccacagccttgagcttgagccgctccagcaCCTgcaggca < 1:228672‑M1/10‑1 (MQ=255) gtgACCGATCTGTCCCCCGGTAACCCGCAGTTGCGCCGGCAGATAGCCCTGCGCTACATGGTCGGTGGGCTGATACCATGGTTTCAATGGCTGCTGATCACCAACGGCGCACTGGAGGCCCTGAACCTGTGCCTGCAGGCAGTGACCCAg > 1:787221/1‑150 (MQ=255) ccGATCTGTCCCCCGGTAACCCGCAGTTGCGCCGGCAGATAGCCCTGCGCTACATGGTCGGTGGGCTGATGCTGCCGATGGAAGAGCTGCTGATCACCAACGGCGCACTGGAGGCCCTGAACCTGTGCCTGCAGGCAGTGACCCAGCCgg < 2:664190/150‑1 (MQ=255) cGATCTGTCCCCCGGTAACCCGCAGTTGCGCCGGCAGATAGCCCTGCGCTACATGGTCGGTGGGCTGATGCTGCCGATGGAAGAGCTGCTGATCACCAACGGCGCACTGGAGGCCCTGAACCTGTGCCTGCAGGCAGTGACCCAGCCggg < 1:500747/150‑1 (MQ=255) gcaccacacggcctttaccgggtgcatttccagggtctgcgccagcacccccaggtccatgccctcgcgcgggtgcacgggggtttccacagccttgagcttgagccgctccagcaCCTGCAGGCAGTGACCCAGCCGGGCGATCTGGTc < 2:730050‑M1/34‑1 (MQ=255) ttGCGCCGGCAGATAGCCCTGCGCTACATGGTCGGTGGGCTGATGCTGCCGATGGAAGAGCTGCTGATCACCAACGGCGCACTGGAGGCCCTGAACCTGTGCCTGCAGGCAGTGACCCAGCCGGGCGATCTGGTCGCCATCGAGGCCCCg < 2:190178/150‑1 (MQ=255) cTGCGCTACATGGTCGGTGGGCTGATGCTGCCGATGGAAGAGCTGCTGATCACCAACGGCGCACTGGAGGCCCTGAACCTGTGCCTGCAGGCAGTGACCCAGCCGGGCGATCTGGTCGCCATCGAGGCCCCGGCCTTCTATGcctgcctg > 1:558975/1‑150 (MQ=255) ggcgcTATAGGGTCGGTGGGCTGATGCTTCCGGTGGAAGAGATGCTGATCACCAACGGCGCACTGGAGGCCCTAAACCTGTGCCTGCAGGCAGTGACCCAGCCGGGCGATCTGGTCGCCATCGAGGCCCCGGCCATCTATGCctgcctgc > 2:228672/2‑150 (MQ=255) gcgccagcacccccaggtccatgccctcgcgcgggtgcacgggggtttccacagccttgagcttgagccgctccagcaCCTGCAGGCAGTGACCCAGCCGGGCGATCTGGTCGCCATCGAGGCCCCGGCCTTCTATGCCTGCCTGCAGGt > 1:730050‑M1/79‑150 (MQ=255) tACATGGTCGGTGGGCTGATGCTGCCGATGGAAGAGCTGCTGATCACCAACGGCGCACTGGAGGCCCTGAACCTGTGCCTgcaggcacagg < 1:237416/91‑5 (MQ=255) tACATGGTCGGTGGGCTGATGCTGCCGATGGAAGAGCTGCTGATCACCAACGGCGCACTGGAGGCCCTGAACCTGTGCCTgcaggcacagg > 2:237416/1‑87 (MQ=255) aTGGTCGGTGGGCTGATGCTGCCGATGGAAGAGCTGCTGATCACCAACGGCGCACTGGAGGCATTGAACCTGTGCCTGCAGGCAGTGACCCAGCCGGGCGATCTGGTCGCCATCGAGGCCCCGGCCTTCTATGCCTGCCTGCAGGTGCTg < 1:292146/150‑1 (MQ=255) gTCGGTGGGCTGATGCTGCCGATGGAAGAGCTGCTGATCACCAACGGCGCACTGGAGGCCCTGAACCTGTGCCTGCAGGCAGTGACCCAGCCGGGCGATCTGGTCGCCATCGAGGCCCCGGCCTTCTATGCCTGCCTGCAGGTGCTGGAg > 2:201306/1‑150 (MQ=255) gTCGGTGGGCTGATGCTGCCGATGGAAGAGCTGCTGATCACCAACGGCGCACTGGAGGCCCTGAACCTGTGCCTGCAGGCAGTGACCCAGCCGGGCGATCTGGTCGCCATCGAGGCCCCGGCCTTCTATGCCTGCCTGCAGGTGCTGGAg > 1:772020/1‑150 (MQ=255) ccccaggtccatgccctcgcgcgggtgcacggggatttccacagccttgagcttgagccgctccagcaCCTGCAGGCAGTGACCCAGCCGGGCGATCTGGTCGCCATCGAGGCCCCGGCCTTCTATGCCTGCCTGCAGGTGCTg > 2:67273‑M1/69‑144 (MQ=255) ccccaggtccatgccctcgcgcgggtgcacggggatttccacagccttgagcttgagccgctccagcaCCTGCAGGCAGTGACCCAGCCGGGCGATCTGGTCGCCATCGAGGCCCCGGCCTTCTATGCCTGCCTGCAGGTGCTg < 1:67273‑M1/76‑1 (MQ=255) tgcCGATGGAAGAGCTGCTGATCACCAACGGCGCACTGGAGGCCCTGAACCTGTGCCTGCAGGCAGTGACCCAGCCGGGCGATCTGGTCGCCATCGAGGCCCCGGCCTTCTATGCCTGCCTGCAGGTGCTGGAGCGGCTCAAGCTCAAgg > 2:626606/1‑150 (MQ=255) gAAGAGCTGCTGATCACCAACGGCGCACTGGAGGCCCTGAACCTGTGCCTGCAGGCAGTGACCCAGCCGGGCGATCTGGTCGCCATCGAGGCCCCGGCCTTCTATGCCTGCCTGCAGGTGCTGGAGCGGCTCAAGCTCAAGGCTGTGGaa > 1:642641/1‑150 (MQ=255) ctgctgATCACCAACGGCGCACTGGAGGCCCTGAACCTGTGCCTGCAGGCAGTGACCCAGCCGGGCGATCTGGTCGCCATCGAGGCCCCGGCCTTCTATGCCTGCCTGCAGGTGCTGGAGCGGCTCAAGCTCAAGGCTGTGGAAATcccc < 2:787221/150‑1 (MQ=255) ctgctgATCACCAACGGCGCACTGGAGGCCCTGAACCTGTGCCTGCAGGCAGTGACCCAGCCGGGCGATCTGGTCGCCATCGAGGCCCCGGCCTTCTATGCCTGCCTGCAGGTGCTGGAGCGGCTCAAGCTCAAGGCTGTGGAAATcccc < 1:201306/150‑1 (MQ=255) gctgATCACCAACGGCGCACTGGAGGCCCTGAACCTGTGCCTGCAGGCAGTGACCCAGCCGGGCGATCTGGTCGCCATCGAGGCCCCGGCCTTCTATGCCTGCCTGCAGGTGCTGGAGCGGCTCAAGCTCAAGGCTGTGGAAATCCCCGt < 1:27885/150‑1 (MQ=255) cggggatttccacagccttgagcttgagccgctccagcacc > 2:97431‑M1/40‑41 (MQ=255) cggggatttccacagccttgagcttgagccgctccagcacc < 1:97431‑M1/2‑1 (MQ=255) aTCACCAACGGCGCACTGGAGGCCCTGAACCTGTGCCTGCAGGCAGTGACCCAGCCGGGCGATCTGGTCGCCATCGAGGCCCCGGCCTTCTATGCCTGCCTGCAGGTGCTGGAGCGGCTCAAGCTCAAGGCTGTGGAAATCCCCGTGCAc > 2:782223/1‑150 (MQ=255) cAACGGCGCACTGGAGGCCCTGAACCTGTGCCTGCAGGCAGTGACCCAGCCGGGCGATCTGGTCGCCATCGAGGCCCCGGCCTTCTATGCCTGCCTGCAGGTGCTGGAGCGGCTCAAGCTCAAGGCTGTGGAAATCCCCGt < 2:659578/141‑1 (MQ=255) cAACGGCGCACTGGAGGCCCTGAACCTGTGCCTGCAGGCAGTGACCCAGCCGGGCGATCTGGTCGCCATCGAGGCCCCGGCCTTCTATGCCTGCCTGCAGGTGCTGGAGCGGCTCAAGCTCAAGGCTGTGGAAATCCCCGt > 1:659578/1‑141 (MQ=255) ccTGAACCTGTGCCTGCAGGCAGTGACCCAGCCGGGCGATCTGGTCGCCATCGAGGCCCCGGCCTTCTATGCCTGCCTGCAGGTGCTGGAGCGGCTCAAGCTCAAGGCTGTGGAAATCCCCGTGCACCCGCGCGAGGGCAt > 2:307464/1‑141 (MQ=255) ccTGAACCTGTGCCTGCAGGCAGTGACCCAGCCGGGCGATCTGGTCGCCATCGAGGCCCCGGCCTTCTATGCCTGCCTGCAGGTGCTGGAGCGGCTCAAGCTCAAGGCTGTGGAAATCCCCGTGCACCCGCGCGAGGGCAt < 1:307464/141‑1 (MQ=255) ccTGAACCTGTGCCTGCAGGCAGTGACCCAGCCGGGCGATCTGGTCGCCATCGAGGCCCCGGCCTTCTATGCCTGCCTGCAGGTGCTGGAGCGGCTCAAGCTCAAGGCTGTGGAAATCCCCGTGCACCCGCGCGAGGGCATGGACCTggg > 2:739234/1‑150 (MQ=255) cTGAACCTGTGCCTGCAGGCAGTGACCCAGCCGGGCGATCTGGTCGCCATCGAGGCCCCGGCCTTCTATGCCTGCCTGCAGGTGCTGGAGCGGCTCAAGCTCAAGGCTGTGGAAATCCCCGTGCACCCGCGCGAGGGCATGGACCTgggg < 2:558975/150‑1 (MQ=255) cTGTGCCTGCAGGCAGTGACCCAGCCGGGCGATCTGGTCGCCATCGAGGCCCCGGCCTTCTATGCCTGCCTGCAGGTGCTGGAGCGGCTCAAGCTCAAGGCTGTGGAAATCCCCGTGCACCCGCGCGAGGGCATGGACCTGGGGGTGCTg > 1:376128/1‑150 (MQ=255) gtgCCTGCAGGCAGTGACCCAGCCGGGCGATCTGGTCGCCATCGAGGCCCCGGCCTTCTATGCCTGCCTGCAGGTGCTGGAGCGGCTCAAGCTCAAGGCTGTGGAAATCCCCGTGCACCAGCGCGAGGGCATGGACCTGGGGGTGCTGgc < 1:626606/150‑1 (MQ=255) | CGCATGGTGGTGACCGATCTGTCCCCCGGTAACCCGCAGTTGCGCCGGCAGATAGCCCTGCGCTACATGGTCGGTGGGCTGATGCTGCCGATGGAAGAGCTGCTGATCACCAACGGCGCACTGGAGGCCCTGAACCTGTGCCTGCAGGCAGTGACCCAGCCGGGCGATCTGGTCGCCATCGAGGCCCCGGCCTTCTATGCCTGCCTGCAGGTGCTGGAGCGGCTCAAGCTCAAGGCTGTGGAAATCCCCGTGCACCCGCGCGAGGGCATGGACCTGGGGGTGCTGGC > NC_002947/4016557‑4016843 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |