| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 4243583 | 40 (1.260) | 5 (0.170) | 5/234 | NT | 12.4% | coding (199/708 nt) | PP_3720 | NAD(P)H quinone oxidoreductase |
| ? | NC_002947 | = 4243607 | 33 (1.100) | coding (175/708 nt) | PP_3720 | NAD(P)H quinone oxidoreductase | |||||
GTCGATCCAGCCCTTGAGCATGGCCGGGGCCGAGAACCAGAAGATCGGGAAGTTCAGCACCAGCAGATCGGCCCACAACAGCTTGTCCAGCTCCTGCTGGATATCTGCGGCAATGGCACCGCGCTTGACGCCCTGACGCTGCTCCAGCGCATACACGAGGTACTCGGGGTTCTCGCGCTGGGTAAAGTCATCGGCACTGGCCACCGGGTTCCAGCCCATGGCGTACAAGTCACTGACCTGCACCTGATGACCTTGGGCACGGAAGGTTTCCACAGCCTGGTCACGCAGGGCTGCCGTG > NC_002947/4243434‑4243731 | gTCGATCCAGCCCTTGAGCATGGCCGGGGCCGAGAACCAGAAGATCGGGAAGTTCAGCACCAGCAGATCGGCCCACAACAGCTTGTCCAGCTCCTGCTGGATATCTGCGGCAATGGCACCGCGCTTGACGCCCTGACGCTGCTCCAGCGC < 1:143822‑M1/150‑1 (MQ=255) aTCCAGCCCTTGAGCATGGCCGGGGCCGAGAACCAGAAGATCGGGAAGTTCAGCACCAGCAGATCGGCCCACAACAGCTTGTCCAGCTCCTGCTGGATATCTGCGGCAATGGCACCGCGCTTGACGCCCTGACGCTGCTCCAGCGCAtcc > 2:605032/1‑148 (MQ=255) aGCCCTTGAGCATGGCCGGGGCCGAGAACCAGAAGATCGGGAAGTTCAGCACCAGCAGATCGGCCCACAACAGCTTGTCCAGCTCCTGCTGGATATCTGCGGCAATGGCACCGCGCTTGACGCCCTGACGCTGCTCCAGCGCATACACGa < 2:502097/150‑1 (MQ=255) ccTTGAGCATGGCCGGGGCCGAGAACCAGAAGATCGGGAAGTTCAGCACCAGCAGATCGGCCCACAACAGCTTGTCCAGCTCCTGCTGGATATCTGCGGCAATGGCACCGCGCTTGACGCCCTGACGCTGCTCCAGCGCATACACGAGGt > 2:850570/1‑150 (MQ=255) ttGAGCATGGCCGGGGCCGAGAACCAGAAGATCGGGAAGTTCAGCACCAGCAGATCGGCACACAACAGCTTGTCCAGCTCCTGCTGGATATCTGCGGCAATGGCACCGCGCTTGACGCCCTGACGCTGCTCCAGCGCATACACGAGGTAc > 2:291522/1‑150 (MQ=255) cATGGCCGGGGCCGAGAACCAGAAGATCGGGAAGTTCAGCACCAGCAGATCGGCCCACAACAGCTTGTCCAGCTCCTGCTGGATATCTGCGGCAATGGCACCGCGCTTGACGCCCTGACGCTGCTCCAGCGCATACACGAGGTACTCggg < 2:307390/150‑1 (MQ=255) cGGGGCCGAGAACCAGAAGATCGGGAAGTTCAGCACCAGCAGATCGGCCCACAACAGCTTGTCCAGCTCCTGCTGGATATCTGCGGCAATGGCACCGCGCTTGACGCCCTGACGCTGCTCCAGCGCATACACGAGGTACTCGGGGTtctc < 1:830701/150‑1 (MQ=255) gggCCGAGAACCAGAAGATCGGGAAGTTCAGCACCAGCAGATCGGCCCACAACAGCTTGTCCAGCTCCTGCTGGATATCTGCGGCAATGGCACCGCGCTTGACGCCCTGACGCTGCCCCAGCGCgagaaccccgagtacctcgtgtatgc < 2:691298‑M1/150‑27 (MQ=255) aCCAGAAGATCGGGAAGTTCAGCACCAGCAGATCGGCCCACAACAGCTTGTCCAGCTCCTGCTGGATATCTGCGGCAATGGCACCGCGCTTGACGCCCTGACGCTGCTCCAGCGCgagaaccccgagtacctcgtgtatgcgctggagca < 2:70294‑M1/150‑36 (MQ=255) ccAGAAGATCGGGAAGTTCAGCACCAGCAGATCGGCCCACAACAGCTTGTCCAGCTCCTGCTGGATATCTGCGGCAATGGCACCGCGCTTGACGCCCTGACGCTGCTCCAGCGCATACCCGAGGTACTCGGGGTTCTCGCGCTGGGTaaa < 2:480866/150‑1 (MQ=255) ccAGAAGATCGGGAAGTTCAGCACCAGCAGATCGGCCCACAACAGCTTGTCCAGCTCCTGCTGGATATCTGCGGCAATGGCACCGCGCTTGACGCCCTGACGCTGCTCCAGCGCATACACGAGGTACTCGGGGTTCTCGCGCTGGGTaaa > 1:272817/1‑150 (MQ=255) cAGAAGATCGGGAAGTTCAGCACCAGCAGATCGGCCCACAACAGCTTGTCCAGCTCCTGCTGGATATCTGCGGCAATGGCACCGCGCTTGACGCCCTGACGCTGCTCCAGCGCATACACGAGGTACTCGGGGTTCTCGCGCTGGGTAAAg > 1:620834/1‑150 (MQ=255) gaTCGGGAAGTTCAGCACCAGCAGATCGGCCCACAACAGCTTGTCCAGCTCCTGCTGGATATCTGCGGCAATGGCACCGCGCTTGACGCCCTGACGCTGCTCCAGCGCgagaaccccgagtacctcgtgtatgcgctggagcagcgtcag < 1:123544‑M1/150‑43 (MQ=255) aaGTTCAGCACCAGCAGATCGGCCCACAACAGCTTGTCCAGCTCCTGCTGGATATCTGCGGCAATGGCACCGCGCTTGACGCCCTGACGCTGCTCCAGCGCATACACGAGGTACTCGGGGTTCTCGCACTGGGTAAAGTCATCGGCACTg < 1:850570/150‑1 (MQ=255) ccAGCAGATCGGCCCACAACAGCTTGTCCAGCTCCTGCTGGATATCTGCGGCAATGGCACCGCGCTTGACGCCCTGACGCTGCTCCAGCGCATACACGAGGTACTCGGGGTTCTCGCGCTGGGTAAAGTCATCGGCACTGGCCAACGGGt > 1:358170/1‑150 (MQ=255) cagcagATCGGCCCACAACAGCTTGTCCAGCTCCTGCTGGATATCTGCGGCAATGGCACCGCGCTTGACGCCCTGACGCTGCTCCAGCGCgagaaccccgagtacctcgtgtatgcgctgga > 2:777918‑M1/1‑90 (MQ=255) cagcagATCGGCCCACAACAGCTTGTCCAGCTCCTGCTGGATATCTGCGGCAATGGCACCGCGCTTGACGCCCTGACGCTGCTCCAGCGCgagaaccccgagtacctcgtgtatgcgctgga < 1:777918‑M1/122‑33 (MQ=255) cagcagATCGGCCCACAACAGCTTGTCCAGCTCCTGCTGGATATCTGCGGCAATGGCACCGCGCTTGACGCCCTGACGCTGCTCCAGCGCATACACGa > 2:361900/1‑98 (MQ=255) cagcagATCGGCCCACAACAGCTTGTCCAGCTCCTGCTGGATATCTGCGGCAATGGCACCGCGCTTGACGCCCTGACGCTGCTCCAGCGCATACACGa < 1:361900/98‑1 (MQ=255) cagcagATCGGCCCACAACAGCTTGTCCAGCTCCTGCTGGATATCTGCGGCAATGGCACCGCGCTTGACGCCCTGACGCTGCTCCAGCGCATACACGAGGTACTCGGGGTTCTCGCGCTGGGTAAAGTCATCGGCACTGGCCACCggg < 1:518905/148‑1 (MQ=255) cagcagATCGGCCCACAACAGCTTGTCCAGCTCCTGCTGGATATCTGCGGCAATGGCACCGCGCTTGACGCCCTGACGCTGCTCCAGCGCATACACGAGGTACTCGGGGTTCTCGCGCTGGGTAAAGTCATCGGCACTGGCCACCggg > 2:518905/1‑148 (MQ=255) cagcagATCGGCCCACAACAGCTTGTCCAGCTCCTGCTGGATATCTGCGGCAATGGCACCGCGCTTGACGCCCTGACGCTGCTCCAGCGCATACACGAGGTACTCGGGGTTCTCGCGCTGGGTAAAGTCATCGGCACTGGCCACCGGGtt > 1:717291/1‑150 (MQ=255) agcagATCGGCCCACAACAGCTTGTCCAGCTCCTGCTGGATATCTGCGGCAATGGCACCGCGCTTGACGCCCTGACGCTGCTCCAGCGCATACACGAGGTACTCGGGGTTCTCGCGCTGGGTAAAGTCATCGGCACTGGCCACCGGGTTc < 2:620834/150‑1 (MQ=255) cagATCGGCCCACAACAGCTTGTCCAGCTCCTGCTGGATATCTGCGGCAATGGCACCGCGCTTGACGCCCTGACGCTGCTCCAGCGCATACACGAGGTACTCGGGGTTCTCGCGCTGGGTAAAGTCATCGGCACTGGCCACCGGGTTCCa < 1:605032/150‑1 (MQ=255) agATCGGCCCACAACAGCTTGTCCAGCTCCTGCTGGATATCTGCGGCAATGGCACCGCGCTTGACGCCCTTACGCTGCTCCAGCGCATACACGAGGTACTCGGGGTTCTCGCGCTGGGTAAAGTCATCGGCACTGGCCACCGGGTTCCAg < 1:786500/150‑1 (MQ=255) aTCGGCCCACAACAGCTTGTCCAGCTCCTGCTGGATATCTGCGGCAATGGCACCGCGCTTGACGCCCTGACGCTGCTCCAGCGCATACACGAGGTACTCGGGGTTCTCGCGCTGGGTAAAGTCATCGGCACTGGCCACCGGGTTCCAGcc > 1:49066/1‑150 (MQ=255) gCCCACAACAGCTTGTCCAGCTCCTGCTGGATATCTGCGGCAATGGCACCGCGCTTGACGCCCTGACGCTGCTCCAGCGCa < 2:776268/81‑1 (MQ=255) gCCCACAACAGCTTGTCCAGCTCCTGCTGGATATCTGCGGCAATGGCACCGCGCTTGACGCCCTGACGCTGCTCCAGCGCa > 1:776268/1‑81 (MQ=255) ccACAACAGCTTGTCCAGCTCCTGCTGGATATCTGCGGCAATGGCACCGCGCTTGACGCCCTGACGCTGCTCCAGCGCATACACGAGGTACTCGCGGGTCTCGCGCTGGGTAAAGTCATCGGCACTGGCCACCGGGTTCCAGCCCATGGc > 1:83256/1‑150 (MQ=255) acaGCTTGTCCAGCTCCTGCTGGATATCTGCGGCAATGGCACCGCGCTTGACGCCCTGACGCTGCTCCAGCGCATACACGa > 1:790019/1‑81 (MQ=255) acaGCTTGTCCAGCTCCTGCTGGATATCTGCGGCAATGGCACCGCGCTTGACGCCCTGACGCTGCTCCAGCGCATACACGa < 2:790019/81‑1 (MQ=255) caGCTTGTCCAGCTCCTGCTGGATATCTGCGTCAATGGCACCGCGCTTGACGCCCTGACGCTGCTCCAGCGCATACACGAGGTACTCGGGGTTCTCGCGCTGGGTAAAGTCATCGGCACTGGCCACCGGGTTCCAGCCCATGGCGTACaa < 1:458225/150‑1 (MQ=255) caGCTTGTCCAGCTCCTGCTGGATATCTGCGGCAATGGCACCGCGCTTGACGCCCTGACTCTGCTCCAGCGCATa < 2:550109/75‑1 (MQ=255) caGCTTGTCCAGCTCCTGCTGGATATCTGCGGCAATGGCACCGCGCTTGACGCCCTGACGCTGCTCCAGCGCATa > 1:550109/1‑75 (MQ=255) caGCTTGTCCAGCTCCTGCTGGATATCTGCGGCAATGGCACCGCGCTTGACGCCCTGACGCTGCTCCAGCGCATACACGAGGTACTCGGGGTTCTCGCGCTGGGTAAAGTCATCGGCACTGGCCACCGGGTTCCAGCCCATGGTGTACaa < 2:49066/150‑1 (MQ=255) caGCTTGTCCAGCTCCTGCTGGATATCTGCGGCAATGGCACCGCGCTTGACGCCCTGACGCTGCTCCAGCGCATACACGAGGTACTCGGGGTTCTCGCGCTGGGTAAAGTCATCGGCACTGGCCACCGGGTTCCAGCCCATGGCGTACaa < 1:739790/150‑1 (MQ=255) ttGTCCAGCTCCTGCTGGATATCTGCGGCAATGGCACCGCGCTTGACGCCCTGACGCTGCTCCAGCGCATACACGAGGTACTCGGGGTTCTCGCGCTGGGTAAAGTCATCGGCACTGGCCACCGGGTTCCAGCCCATGGCGTACAAGTCa > 2:129649/1‑150 (MQ=255) gTCCAGCTCCTGCTGGATATCTGCGGCAATGGCACCGCGCTTGACGCCCTGACGCTGCTCCAGCGCATACACGAGGTACTCGGGGTTCTCGCGCTGGGTAAAGTCATCGGCACTGGCCACCGGGTTCCAGCCCATGGCGTACAAGTCACt < 2:272817/150‑1 (MQ=255) ctgctgGATATCTGCGGCAATGGCACCGCGCTTGACGCCCTGACGCTGCTCCAGCGCATACACGAGGTACTCGGGGTTCTCGCGCTGGGTAAAGTCATCGGCACTGGCCACCGGGTTCCAGCCCATGGCGTACAAGTCACTGACCTGCAc < 1:671745/150‑1 (MQ=255) ggATATCTGCGGCAATGGCACCGCGCTTGACGCCCTGACGCTGCTCCAGCGCATACACGAGGTACTCGGGGTTCTCGCGCTGGGTAAAGTCATCGGCACTGGCCACCGGGTTCCAGCCCATGGCGTACAAGTCACTGACCTGCACCtgat > 1:148517/1‑150 (MQ=255) tCTGCGGCAATGGCACCGCGCTTGACGCCCTGACGCTGCTCCAGCGCATACACGAGGTACTCGGGGTTCTCgcgct < 1:643047‑M2/76‑6 (MQ=255) tCTGCGGCAATGGCACCGCGCTTGACGCCCTGACGCTGCTCCAGCGCATACACGAGGTACTCGGGGTTCTCgcgct > 2:643047‑M2/1‑71 (MQ=255) aCCGCGCTTGCCGCCCTGACGCTGCTCCAGCGCATACACGAGGTACTCGGGGTTCTCGCGCTGGGTAAAGTCATCGGCACTGGCCACCGGGTTCCAGCCCATGGCGTACAAGTCACTGACCTGCACCTGATGACCTTGGGCACGGAAGGt > 2:676056/1‑150 (MQ=255) cgcgCTTGACGCCCTGACGCTGCTCCAGCGCATACACGAGGTACTCGGGGTtctc > 1:513203/1‑55 (MQ=255) cgcgCTTGACGCCCTGACGCTGCTCCAGCGCATACACGAGGTACTCGGGGTtctc < 2:513203/55‑1 (MQ=255) gcgcTTGACGCCCTGACGCTGCTCCAGCGCATACACGAGGTACTCGGGGTTCTCGCGCTGGGTAAAGTCATCGGCACTGGCCACCGGGTTCCAGCCCATGGCGTACAAGTCACTGACCTGCACCTGATGACCTTGGGCACGGAAGGTTTc < 1:676056/150‑1 (MQ=255) ccTGACGCTGCTCCAGCGCATACACGAGGTACTCGGGGTTCTCGCGCTGGGTAAAGTCATCGGCACTGGCCACCGGGTTCCAGCCCATGGCGTACAAGTCACTGACCTGCACCTGATGACCTTGGGCACGGAAGGTTTCCACAGCCTGGt > 2:730778/1‑150 (MQ=255) cTGACGCTGCTCCAGCGCATACACGAGGTACTCGGGGTTCTCgcgctggagcagcgtcagggcgtcaagcgcggtgccattgccgcagatatccagcaggagctggacaagctgttgtgggccgatctgctggtgctgaacttcccgatc < 1:123544‑M2/150‑109 (MQ=255) tgctCCAGCGCATACACGAGGTACTCGGGGTTCTCgcgctggagcagcgtcagggcgtcaagcgcggtgccattgccgcagatatccagcaggagctggacaagctgttgtgggccgatctgctggtgctgaacttcccgatcttctggt < 2:70294‑M2/150‑116 (MQ=255) tgctCCAGCGCATACACGAGGTACTCGGGGTTCTCGCGCTGGGTAAAGTCATCGGCACTGGCCACCGGGTTCCAGCCCATGGCGTACAAGTCACTGACCTGCACCTGATGACCtt > 2:517297/1‑115 (MQ=255) tgctCCAGCGCATACACGAGGTACTCGGGGTTCTCGCGCTGGGTAAAGTCATCGGCACTGGCCACCGGGTTCCAGCCCATGGCGTACAAGTCACTGACCTGCACCTGATGACCtt < 1:517297/115‑1 (MQ=255) tgctCCAGCGCATACACGAGGTACTCGGGGTTCTCGCGCTGGGTAAAGTCATCGGCACTGGCCACCGGGTTCCAGCCCATGGCGTACAAGTCACTGACCTGCACCTGATGACCTTGGGCACGGAAGGTTTCCACAGCCTGGTCACGCAgg < 2:717291/150‑1 (MQ=255) tgctCCAGCGCATACACGAGGTACTCGGGGTTCTCGCGCTGGGTAAAGTCATCGGCACTGGCCACCGGGTTCCAGCCCATGGCGTACAAGTCACTGACCTGCACCTGATGACCTTGGGCACGGAAGGTTTCCACAGCCTGGTCACGCAgg < 1:291522/150‑1 (MQ=255) tCCAGCGCATACACGAGGTACTCGGGGTTCTCgcgctggagcagcgtcagggcgtcaagcgcggtgccattgccgcagatatccagcaggagctggacaagctgttgtgggccgatctgctg > 2:777918‑M2/1‑32 (MQ=255) tCCAGCGCATACACGAGGTACTCGGGGTTCTCgcgctggagcagcgtcagggcgtcaagcgcggtgccattgccgcagatatccagcaggagctggacaagctgttgtgggccgatctgctg < 1:777918‑M2/122‑91 (MQ=255) tCCAGCGCATACACGAGGTACTCGGGGTTCTCGCGCTGGGTAAAGTCATCGGCACTGGCCACCGGGTTCCAGCCCATGGCGTACAAGTCACTGACCTGCACCTGATGACCTTGGGCACGGAAGGTTTCCACAGCCTGGTCACGCAGGGCt > 1:77750/1‑150 (MQ=255) tCCAGCGCATACACGAGGTACTCGGGGTTCTCGCGCTGGGTAAAGTCATCGGCACTGGCCACCGGGTTCCAGCCCATGGCGTACAAGTCACTGACCTGCACCTGATGACCTTGGGCACGGAAGGTTTCCACAGCCTGGTCACGCAGGGCt > 1:13163/1‑150 (MQ=255) aGCGCgagaaccccgagtacctcgtgtatgcgctggagcagcgtcagggcgtcaagcgcggtgccattgccgcaga > 2:643047‑M1/1‑5 (MQ=255) aGCGCgagaaccccgagtacctcgtgtatgcgctggagcagcgtcagggcgtcaagcgcggtgccattgccgcaga < 1:643047‑M1/76‑72 (MQ=255) aGCGCATACACGAGGTACTCGGGGTTCTCGCGCTGGGTAAAGTCATCGGCACTGGCCACCGGGTTCCAGCCCATGGCGTACAAGTCACTGACCTGCACCTGATGACCTTGGGCACGGAAGGTTTCCACAGCCTGGTCACGCAGGGCTGcc < 1:129649/150‑1 (MQ=255) gcgcATACACGAGGTACTCGGGGTTCTCGCGCTGGGTAAAGTCATCGGCACTGGCCACCGGGTTCCAGCCCATGGCGTACAAGTCACTGACCTGCACCTGATGACCTTggg < 2:59898/111‑1 (MQ=255) gcgcATACACGAGGTACTCGGGGTTCTCGCGCTGGGTAAAGTCATCGGCACTGGCCACCGGGTTCCAGCCCATGGCGTACAAGTCACTGACCTGCACCTGATGACCTTggg > 1:59898/1‑111 (MQ=255) gcATACACGAGGTACTCGGGGTTCTCgcgctggggcagcgtcagggcgtcaagcgcggtgccattgccgcagatatccagcaggagctggacaagctgttgtgggccgatctgctggtgctgaacttcccgatcttctggttctcggccc < 2:691298‑M2/150‑125 (MQ=255) | GTCGATCCAGCCCTTGAGCATGGCCGGGGCCGAGAACCAGAAGATCGGGAAGTTCAGCACCAGCAGATCGGCCCACAACAGCTTGTCCAGCTCCTGCTGGATATCTGCGGCAATGGCACCGCGCTTGACGCCCTGACGCTGCTCCAGCGCATACACGAGGTACTCGGGGTTCTCGCGCTGGGTAAAGTCATCGGCACTGGCCACCGGGTTCCAGCCCATGGCGTACAAGTCACTGACCTGCACCTGATGACCTTGGGCACGGAAGGTTTCCACAGCCTGGTCACGCAGGGCTGCCGTG > NC_002947/4243434‑4243731 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |