New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5816823 | 15 (0.470) | 4 (0.130) | 4/236 | NT | 20.9% | coding (577/624 nt) | PP_5092 | NLP/P60 protein |
? | NC_002947 | = 5816856 | 16 (0.530) | coding (610/624 nt) | PP_5092 | NLP/P60 protein |
TCTTCAACATCAAGAGCCGTCGGGTCAATCACGTAGCCATCTACCTGGGTAACGACCGCTTCATCCACGCTCCACGCCGTGGCAAGCGGGTGAGTATCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCG > NC_002947/5816680‑5816972 | tcttcAACATCAAGAGCCGTCGGGTCAATCACGTAGCCATCTACCTGGGTAACGACGGCTTCAGCCACGCTCCACGCCGTGGCAAGCGGGTGAGTATCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCggg < 2:296126/150‑1 (MQ=255) aTCAAGAGCCGTCGGGACAATCACGTAGCCATCTACCTGGGTAACGACCGCTTCATCCACGCTCCACGCCGTGGCAAGCGGGTGAGTATTGACACCGTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCg > 1:317048/1‑150 (MQ=255) tCACGTAGCCATCTACCTGGGTAACGACCGCTTCATCCACGCTCCACGCCGTGGCAAGCGGGTGAGTATCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCt < 2:851253‑M2/150‑2 (MQ=255) aCGTAGCCATCTACCTGGGTAACGACCGCTTCATCCACGCTCCACGCCGTGGCAAGCGGGTGAGTATCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAgactcagctgctgctctttcggcagcacccgcttgg > 2:625718‑M1/1‑114 (MQ=255) aGCCATCTACCTGGGTAACGACCGCTTCATCCTCGCTCCACGCCGTGGCAAGCGGGTGAGTATCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAgactcagctgctgctctttcggcagcacccgcttggccac < 1:625718‑M1/150‑41 (MQ=255) aCCTGGGTAACGACCGCTTCATCCACTCTCCACGCCGTGGCAAGCGGGTGAGTATCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCg < 1:232392/106‑1 (MQ=255) aCCTGGGTAACGACCGCTTCATCCACGCTCCACGCCGTGGCAAGCGGGTGAGTATCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCg > 2:232392/1‑106 (MQ=255) aCGACCGCTTCATCCACGCTCCACGCCGTGGCAAGCGGGTGAGTATCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGgc > 2:590394/1‑150 (MQ=255) aCGACCGCTTCATCCACGCTCCACGCCGTGGCAAGCGGGTGAGTATCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCCgc < 1:851253/150‑1 (MQ=255) cGCTTCATCCACGCTCCACGCCGTGGCAAGCGGGTGAGTATCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGGAAGAGCAGCAGCTGAGGCTGGCCAAGCGTTAAGCTTATCGGCGCTAt > 1:180938/1‑150 (MQ=255) ttCATCCACGCTCCACGCCGTGGCAAGCGGGTGAGTATCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGAAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCg < 1:590394/150‑1 (MQ=255) acgcCGTGGCAAGCGGGTGAGTATCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTc > 2:827665/1‑150 (MQ=255) ccGTGGCAAGCGGGTGAGTATCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTcgcg < 1:108351/150‑1 (MQ=255) aaGCGGGTGAGTATCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGC > 1:107297‑M1/1‑150 (MQ=255) aaGCGGGTGAGTATCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGC > 1:321862‑M1/1‑150 (MQ=255) aGCGGGTGAGTATCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCC > 1:318263‑M1/1‑150 (MQ=255) aTCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAgactcagctgctgctctttcggcagcacccgcttgg > 1:732506‑M1/1‑49 (MQ=255) aTCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAgactcagctgctgctctttcggcagcacccgcttgg < 2:732506‑M1/85‑37 (MQ=255) tCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCtg > 1:808862‑M2/1‑81 (MQ=255) tCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCtg < 2:808862‑M2/83‑3 (MQ=255) tCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGc > 1:14744/1‑121 (MQ=255) tCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGc < 2:14744/121‑1 (MQ=255) ttGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCCCGCCCGCTCCCACAGTTAgcgctt > 2:725105/1‑148 (MQ=255) gCAAGCCTTACTGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCGCTTCGCGGGCACGACCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGct > 2:653968/1‑150 (MQ=255) ccTTACTGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTcgc < 2:321862/150‑1 (MQ=255) ttACTGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTcgcgc > 1:778640/1‑150 (MQ=255) cAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTc < 2:778640/150‑1 (MQ=255) gCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAta < 2:697583‑M2/150‑3 (MQ=255) tACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGATGAGTCTGGCCAAGCGTTCAGCTGATCTGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGGGTCGCTCTCTCACGCAGCTCACAtacctg < 2:50047‑M2/150‑7 (MQ=255) gtggCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCtggccaccacgtagtgcttctgccagtaaggcttgctcaaggtgtcgatactcacccgcttgccacggcgtggagcgaggatgaagcggtcgttacccaggtagatggct < 1:625718‑M2/150‑111 (MQ=255) ccAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCtggccaccacgtagtgcttctgccagtaaggcttgctcaaggtgtcgatactcacccgcttgccacggcgtggagcgtggatgaagcggtcgttacccaggtagatggctacgt > 2:625718‑M2/1‑36 (MQ=255) ccAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCtggccaccacgtagtgcttctgccagtaaggcttgctcaaggtgtcgat < 2:732506‑M2/85‑50 (MQ=255) ccAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCtggccaccacgtagtgcttctgccagtaaggcttgctcaaggtgtcgat > 1:732506‑M2/1‑36 (MQ=255) cAgactcagctgctgctctttcggcagcacccgcttggccaccacgtagtgcttctgccagtaaggcttgctcaaggtgtcga < 2:808862‑M1/83‑82 (MQ=255) cAgactcagctgctgctctttcggcagcacccgcttggccaccacgtagtgcttctgccagtaaggcttgctcaaggtgtcga > 1:808862‑M1/1‑2 (MQ=255) cAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACAtacctgtgggagcgggc < 1:652246‑M2/150‑18 (MQ=255) agactcagctgctgctctttcggcagcacccgcttggccaccacgtagtgcttctgccagtaaggcttgctcaaggtgtcgatactcacccgcttgccacggcgtggagcgtggatgaagcggtcgttacccaggtagatggctacgtga < 2:851253‑M1/150‑150 (MQ=255) | TCTTCAACATCAAGAGCCGTCGGGTCAATCACGTAGCCATCTACCTGGGTAACGACCGCTTCATCCACGCTCCACGCCGTGGCAAGCGGGTGAGTATCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGCACTACGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCG > NC_002947/5816680‑5816972 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |