New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 6062179 | 43 (1.360) | 4 (0.130) | 4/242 | NT | 9.5% | coding (581/1149 nt) | alkT | rubredoxin‑NAD(+) reductase |
? | NC_002947 | = 6062220 | 34 (1.100) | coding (540/1149 nt) | alkT | rubredoxin‑NAD(+) reductase |
CGTGGGCGCAGGCCGATGGCCGAAACCACCAGGTCGCAGGCGATCACGCTGCCGTCCGACAAGTGCGCCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACC‑CAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTCATGTCGTTTGCGAATTCGCAGCCGATCAGGCCGGCACCGAGGATCAGTACACGC > NC_002947/6062035‑6062328 | cGTGGGCGCAGGCCGATGGCCGAAACCACCAGGTCGCAGGCGATCACGCTGCCGTCCGACAAGTGCGCCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACC‑CAGGCCCTCCAGCCCAccc < 1:85269/150‑1 (MQ=255) ggCCGAAACCACCAGGTCGCAGGCGATCACGCTGCCGTCCGACAAGTGCGCCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACC‑CAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGc < 1:327154/150‑1 (MQ=255) ccaGGTCGCAGGCGATCACGCTGCCGTCCGACAAGTGCGCCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACC‑CAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGc < 2:292388/139‑1 (MQ=255) ccaGGTCGCAGGCGATCACGCTGCCGTCCGACAAGTGCGCCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACC‑CAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTgca > 1:614534/1‑150 (MQ=255) ccaGGTAGCAGGCGATCACGCTGCCGTCCGACAAGTGCGCCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACC‑CAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGc > 1:292388/1‑139 (MQ=255) ccaGGGCGCAGGCGATCACGCTGCCGCCCGACAAGTGCGCCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGCACCGGCCGCA‑CTGCCGGGGGTCGCCACTATCCTGCCAGCCCACGCTGCACAGCGGCCGCAGCCGCCGGGTgca < 2:670110/150‑1 (MQ=255) caGGTCGCAGGCGATCACGCTGCCGTCCGACAAGTGCGCCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACC‑CAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTgcag > 2:810767/1‑150 (MQ=255) caGGTCGCAGGCGATCACGCTGCCGTCCGACAAGTGCGCCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACC‑CAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTgcag > 1:165411/1‑150 (MQ=255) caGGTCGCAGGCGATCACGCTGCCGTCCGACAAGTGCGCCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACC‑CAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTgcag > 1:214010/1‑150 (MQ=255) ggTCGCAGGCGATCACGCTGCCGTCCGACAAGTGCGCCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACC‑CAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTgcagca < 2:614534/150‑1 (MQ=255) gTCGCAGGCGCTCACGCTGCCGTCCGACAAGTGCGCCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGGAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACC‑CAGGCCCTCCAGCCcaccctgctgcacccggccgctgcggcggctgtgcag < 1:557471‑M1/150‑38 (MQ=255) tcacAGGCGATCACGCTGCCGTCCGACAAGTGCGCCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACC‑CAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAgg < 2:675844/147‑1 (MQ=255) aGGCGATCACGCTGCCGTCCGACAAGTGCGCCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACC‑CAGGCCCTCCAGCCgaccctgctgcacccggccgctgcggcggctgtgcagggtgg > 1:140595‑M1/1‑108 (MQ=255) gCGATCACGCTGCCGTCCGACAAGTGCGCCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACC‑CAGGCCCTCCAGCCgaccctgctgcacccggccgctgcggcggctgtgcagggtgggc < 2:444763‑M1/150‑45 (MQ=255) tCACGCTGCCGTCCGACAAGTGCGCCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACC‑CAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGa < 1:652881/150‑1 (MQ=255) tCACGCTGCCGTCCGAAAAGTGCGCCTCAAGGCATTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACC‑CAGGCCCTCCAGCCgaccctgctgcacccggccgctgcggcggctgtgcagggtgggctgga < 2:140595‑M1/150‑49 (MQ=255) tCCGACAAGTGCGCCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACC‑CAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGAt > 2:818852/1‑140 (MQ=255) tCCGACAAGTGCGCCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACC‑CAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGAt < 1:818852/140‑1 (MQ=255) gACAAGTGCGCCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACC‑CAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGgc < 1:810767/150‑1 (MQ=255) cAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACC‑CAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGAc > 1:454371/1‑150 (MQ=255) cAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAACACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACC‑CAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGt > 1:458545/1‑127 (MQ=255) cAGGCCTTGAGTAACCTGCTGAAGACGGGTCAACACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACC‑CAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGt < 2:458545/127‑1 (MQ=255) ccTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACC‑CAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGAGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTg > 1:401736/1‑150 (MQ=255) ttGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACC‑CAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGaa < 1:377727/150‑1 (MQ=255) ttGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACC‑CAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGaa < 2:214010/150‑1 (MQ=255) tCACCTGCTGAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACC‑CAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGAt > 1:756641/1‑112 (MQ=255) tCACCTGCTGAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACC‑CAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGAt < 2:756641/112‑1 (MQ=255) tCACCTGCTGAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACC‑CAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAgccgc > 1:337479/1‑150 (MQ=255) ccTGCTGAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACC‑CAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCa < 2:602403/150‑1 (MQ=255) tgctgAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACC‑CAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCa > 2:786011/1‑103 (MQ=255) tgctgAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACC‑CAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCa < 1:786011/103‑1 (MQ=255) gTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACC‑CAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTCATGTCGttt < 2:410441/150‑1 (MQ=255) aGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACC‑CAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTCATGTCGTTTGCg > 1:495703/1‑150 (MQ=255) cACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACC‑CAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGAt > 2:762939/1‑90 (MQ=255) cACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACC‑CAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGAt < 1:762939/90‑1 (MQ=255) aCCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACC‑CAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGa < 2:70433/88‑1 (MQ=255) aCCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACC‑CAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGa > 1:70433/1‑88 (MQ=255) ccGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACC‑CAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTc > 2:701113/1‑94 (MQ=255) ccGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACC‑CAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTc < 1:701113/94‑1 (MQ=255) ccccAGGTGGAAGCGTACACC‑CAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTCATGTCGTTTGCGAATTCGCa < 1:697779/150‑1 (MQ=255) cccAGGTGGAAGCGTACACC‑CAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTc < 1:382812/129‑1 (MQ=255) cccAGGTGGAAGCGTACACC‑CAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTc > 2:382812/1‑129 (MQ=255) ccAGGTGGAAGCGTACACC‑CAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTCATGTCGTTTGCGAATTCGCAGc > 1:171785/1‑150 (MQ=255) aaGCGTACACC‑CAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTCATGTCGTTTGCGAATTCGCAGCCGATCAgg < 2:454371/150‑1 (MQ=255) c‑cAGGCCCTCCAGCCCACCCTTCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTCATGTCGTTTGCGAATTCGCAGCCGATCAGGCCGGCACCGa > 1:131771/1‑150 (MQ=255) aGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGACGCCCGGACTACTGCCGGTTGGGAATGCGCATCCGATCAGGCCGGCACCGAgg > 2:310015/1‑150 (MQ=255) gCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTCATGTCGTTTGCGAATTCGCAGCCGATCAGGCCGGCACCGAGGAt < 2:171785/150‑1 (MQ=255) cTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTCATGTCGTTTGCGAATTCGCAGCCGATCAGGCCGGCACCGAGGATCAg > 1:556634/1‑150 (MQ=255) tCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCggctggagggcctgggtgtacgcttccacctggggccggtgctgacccgtcttcagcaggtgactcaatgccttgaggcgcacttttcggacggcagcgtga < 2:140595‑M2/150‑103 (MQ=255) gCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCggctggagggcctgggtgtacgcttccacctggggccggtgctgacccgtcttcagcaggtgactcaaggcctggaggcgcacttgtcggacggcagcgtgatcgc < 2:444763‑M2/150‑107 (MQ=255) cccACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTGACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTCATGTCGTTTGCGAATTCGCAGCCGATCAGGCCGGCACCGAGGATCAGTACACg > 2:554042/1‑150 (MQ=255) cccACCCTGCACAGCCACCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACTGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTCATGTCGTTTGCGAATTCGCAGCCGATCAGGCCGGCACCGAGGATCAGTACACg > 2:745523/1‑150 (MQ=255) ccACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCggctggagggcctgggtgtacgcttccacctggggccggtgctgacccgtcttcagcaggtgactcaaggcctggaggcgcacttgtcggacggcagcgtgatcgcct > 1:140595‑M2/1‑42 (MQ=255) | CGTGGGCGCAGGCCGATGGCCGAAACCACCAGGTCGCAGGCGATCACGCTGCCGTCCGACAAGTGCGCCTCCAGGCCTTGAGTCACCTGCTGAAGACGGGTCAGCACCGGCCCCAGGTGGAAGCGTACACC‑CAGGCCCTCCAGCCCACCCTGCACAGCCGCCGCAGCGGCCGGGTGCAGCAGGGTCGGCATGATCTGTTCACACGGCGCCACAACGTCGACCTTGAAGCCGCCCAGGCTCATGTCGTTTGCGAATTCGCAGCCGATCAGGCCGGCACCGAGGATCAGTACACGC > NC_002947/6062035‑6062328 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |