New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 204937 | 21 (0.660) | 4 (0.130) | 4/238 | NT | 14.2% | coding (10443/26049 nt) | PP_0168 | putative surface adhesion protein |
? | NC_002947 | = 211590 | 28 (0.920) | coding (17096/26049 nt) | PP_0168 | putative surface adhesion protein |
CGCTGCGCAGGGTGATGACGTTTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGCATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTTCAAGTGACCGATACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACGCCTTCGGTGACCGAAGGTGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCGATCAACAACCACAGTGCATTGACCTTCACCCTGAGCGACGGCAAAACCGTCATCACC > NC_002947/211444‑211735 | cGCTGCGCAGGGTGATGACGTTTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGCATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTTCAAGTGACCGATACCACCGACGAAGTggt > 2:197912‑M2/1‑147 (MQ=255) cTGCGCAGGGTGATGACGTTTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGCATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTTCAAGTGACCGATACCACCGACGAAGTggtgg > 2:643368‑M2/1‑145 (MQ=255) aGGGTGATGACGTTTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGCATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTTCAAGTGACCGATACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGc < 2:179791/150‑1 (MQ=38) aaCGTCGCGGTCCAGATCACCATGGGAATAACCTCGGCGGCGGAGGCCATGGGTTCGACCGTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTTCAAGTGACCGATACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACGCCTTCg < 2:649921/150‑1 (MQ=14) aaCGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGCATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTTCAAGTGACCGATACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACGcc > 1:849129/1‑146 (MQ=255) aaCGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGCATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTTCAAGTGACCGATACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACGcc < 2:849129/146‑1 (MQ=255) cgacgCTGGCCAGATCAGCCTGGGCATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACTTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTTCAAGTGACCGATACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACGCCTTCGGt < 1:693622/150‑1 (MQ=255) gCCAGATCAGCCTGGGCATCTTCTCGGCGGTGCACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTTTTTGACGCGGCTTCGGTTCAAGTGACCGATACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACGCCTTCGGTGACCGAAg < 1:363019/150‑1 (MQ=14) aGATCAGCCTGGGCATCAACTCGGCGGTGGACGGCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTTCAAGTGACCGATACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACGCCTTCGGTGACCGAAggtg < 2:708224/150‑1 (MQ=255) gATCAGCCTGGGCATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTTCAAGTGACCGATACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACGCCTTCGGTGACCGAAggtgg < 1:269377/150‑1 (MQ=255) aGCCTGGGCATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTTCAAGTGACCGATACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACACCTTCGGTCACCGAAggcgtcgcg < 1:119916/150‑8 (MQ=14) cTGGGCATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTTCAAGTGACCGATACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACGCCTTCGGTGACCGAAggtg > 2:817460/1‑142 (MQ=255) cTGGGCATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTTCAAGTGACCGATACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACGCCTTCGGTGACCGAAggtg < 1:817460/142‑1 (MQ=255) cATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTTCAAGTGACCGATACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACGCCTTCGGTGACCGAAGGTGGTGAGATCACCTa < 2:274393/150‑1 (MQ=255) cATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTTCAAGTGACCGATACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACGCCTTCGGTGACCGAAGGTGGTGAGATCACCTa > 1:274393/1‑150 (MQ=255) aTCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTTCAAGTGACCGATACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACGCCTTCg < 2:844121/123‑1 (MQ=255) aTCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTTCAAGTGACCGATACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACGCCTTCg > 1:844121/1‑123 (MQ=255) gCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTTCAAGTGACCGATACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACGCCTTCGGTGACCGAAGGTGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACcaac > 1:56208/1‑150 (MQ=255) cTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTTCAAGTGACCGATACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACGCCTTCGGTGACCGAAGGTGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGATGGTCTGcc < 2:62880/150‑1 (MQ=255) tCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTTCAAGTGACCGATACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACGCCTTCGGTGACCGAAGgtggtg < 1:600002/96‑1 (MQ=255) tCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTTCAAGTGACCGATACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACGCCTTCGGTGACCGAAGgtggtg > 2:600002/1‑96 (MQ=255) tCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTTCAAGTGACCGATACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACGCCTTCGGTGACCGAAGGTGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCGATCAACAAcc > 2:557453/1‑150 (MQ=255) tCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTTCAAGTGACCGATACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACGCCTTCGGTGACCGAAGATGGTGAGATCACCTACACCATCACTCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCGATCaacaaca > 2:195421/1‑149 (MQ=255) cTGGGCGGTGCGGCTTCGGTTCAAGTGACCGATACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACGCCTTCGGTGACCGAAGGTGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCGATCAACAACCACAGt < 2:788210/150‑1 (MQ=255) ggCTTCGGTTCAAGTGACCGATACCACCGACGAAGTggtggtatcggtcacttgaaccgaagccgcaccgcccagctccaggttttcgaaggtgcgaccgtctacatccacagcagacgtgatacccaggctgatctggccagcgtcgtt < 1:838473‑M2/150‑115 (MQ=255) tgTTAAAGTCACCGATACCACCGACAAAGTGGTGGACAAGCTGACCCCGACCACATAGGTGCCCTTATGTTGTGACATCCACTACACCATCACACTGACCAACAAAGATGGTCTGCCGATCAACAACCACAGTGCATTGACCTTCACCCt < 1:195421/149‑1 (MQ=11) ttCAAGTGACCGATACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACGCCTTGGGTGACCGAAGGTGGTGAGATCACCTGCACCATCACCCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCGATCAACAACCACAGTCCATTAACCTTCACCCTGa > 2:273995/1‑150 (MQ=255) ttaccGATACCACCGACGAAGTggtggtatcggtcacttgaaccgaagccgcaccgcccagctccaggttttcgaaggtgcga > 1:408559‑M2/3‑22 (MQ=255) tGACCGATACCACCGACGAAGTggtggtatcggtcacttgaaccgaagccgcaccgcccagctccaggttttcgaaggtgcga < 2:408559‑M2/83‑62 (MQ=255) tGACCGATACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACGCCTTCGGTGACCGAAGGTGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCGATCAACAACCACAGTGCATTGACCTTCACCCTGAGCGACg > 1:786586/1‑150 (MQ=255) tGACCGATACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACGCCTTCGGTGACCGAAGGTGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCGATCAACAACCACAGTGCATTGACCTTCACCCTGAGCGACg > 1:77113/1‑150 (MQ=255) aTACCACCGACGAAGTggtggtatcggtcacttgaaccgaagccgcaccgcccagctccaggttttcgaaggtgcgaccgtctacatccacagcagacgtgatacccaggctgatctggccagcgtcgttgtagacgtcatcaccctgag < 1:80102‑M2/150‑135 (MQ=255) aTACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACGCCTTCGGTGACCGAAGGTGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGAt < 1:119325/95‑1 (MQ=255) aTACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACGCCTTCGGTGACCGAAGGTGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGAt > 2:119325/1‑95 (MQ=255) gaAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACGCCTTCGGTGACCGAAGGTGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCGATCAACAACCCCAGTGCATTGACCTTCACCCTGAGCGACGGCAAAACCGTCATCAcc < 1:745384/150‑1 (MQ=255) | CGCTGCGCAGGGTGATGACGTTTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGCATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTTCAAGTGACCGATACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACGCCTTCGGTGACCGAAGGTGGTGAGATCACCTACACCATCACCCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCGATCAACAACCACAGTGCATTGACCTTCACCCTGAGCGACGGCAAAACCGTCATCACC > NC_002947/211444‑211735 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |