New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 938458 | 43 (1.360) | 3 (0.100) | 3/232 | NT | 7.4% | coding (7167/18933 nt) | PP_0806 | surface adhesion protein |
? | NC_002947 | = 938510 | 35 (1.180) | coding (7115/18933 nt) | PP_0806 | surface adhesion protein |
GCACGCTGGCCCCGGCTTCGCCGCGGCCATTGAGCTGGGCGCCGGCCAGGCCAACTACCAAGTTGGTTGCGGCATCCGGTGGTGTGGTGTCGCCACCGTCGATGTCCGGCGCGGTGATGTCGCCGGCCGTGGAGGTGTTGCCGGCGGCGTCGGTGGCGGTGACTTGTAGTACCTCTCCACTCACCTGCGGCGGGTCGAGGGTGATGCTGAAACTGCCAGTGGCGTCGACCACCACACTACCCAGCACGGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGCACGGTGCTGCCCACTTCGGCGC > NC_002947/938361‑938657 | gCACGCTGGCCCCGGCTTCGCCGCGGCCATTGAGCTGGGCGCCGGCCAGGCCAACTACCAAGTTGGTTGCGGCATCCGGTGGTGTGGTGTCGCCACCGTCGATGTCCGGCGCGGTGATGTCGCCGGCCGTGGAGGTGTTGCCGGCGGCGt > 2:652858/1‑150 (MQ=255) aCGCTGGCCCCGGCTTCGCCGCGGCCATTGAGCTGGGCGCCGGCCAGGCCAACTACCAAGTTGGTTGCGGCATCCGGTGGTGTGGTGTCGCCACCGTCGATGTCCGGCGCGGTGATGTCGCCGGCCGTGGAGGTGTTGCCGGCGGCGTcg > 2:471292‑M2/1‑148 (MQ=255) cTGGCCCCGGCTTCGCCGCGGCCATTGAGCTGGGCGCCGGCCAGGCCAACTACCAAGTTGGTTGCGGCATCCGGTGGTGTGGTGTCGCCACCGTCGATGTCCGGCGCGGTGATGTCGCCGGCCGTGGAGGTGTTGCCGGCGGCGTcggtg > 1:751243‑M2/1‑145 (MQ=255) tGGCCCCGGCTTCGCCGCGGCCATTGAGCTGGGCGCCGGCCAGGCCAACTACCAAGTTGGTTGCGGCATCCGGTGGTGTGGTGTCGCCACCGTCGATGTCCGGCGCGGTGATGTCGCCGGCCGTGGAGGTGTTGCCGGCGGCGTcggtgg > 2:167934‑M2/1‑144 (MQ=255) gCCCCGGCTTCGCCGCGGCCATTGAGCTGGGCGCCGGCCAGGCCAACTACCAAGTTGGTTGCGGCATCCGGTGGTGTGGTGTCGCCACCGTCGATGTCCGGCGCGGTGATGTCGCCGGCCGTGGAGGTGTTGCCGGCGGCGTcggtggcg < 2:171740‑M2/150‑9 (MQ=255) cGGCTTCGCCGCGGCCATTGAGCTGGGCGCCGGCCAGGCCAACTACCAAGTTGGTTGCGGCATCCGGTGGTGTGGTGTCGCCACCGTCGATGTCCGGCGCGGTGATGTCGCCGGCCGTGGAGGTGTTGCCGGCGGCGTCGGTGGCGGTGa < 1:279830/150‑1 (MQ=255) gCTTCGCCGCGGCCATTGAGCTGGGCGCCGGCCAGGCCAACTACCAAGTTGGTTGCGGCATCCGGTGGTGTGGTGTCGCCACCGTCGATGTCCGGCGCGGTGATGTCGCCGGCCGTGGAGGTGTTGCCGGCGGCGTCGGTGGCGGTGCCt > 1:329658/1‑150 (MQ=255) cTTCGCCGCGGCCATTGAGCTGGGCGCCGGCCAGGCCAACTACCAAGTTGGTTGCGGCATCCGGTGGTGTGGTGTCGCCACCGTCGATGTCCGGCGCGGTGATGTCGCCGGCCGTGGAGGTGTTGCCGGCGGCGTCGGTGGCGGTGACtt < 1:588017/150‑1 (MQ=255) ttCGCCGCGGCCATTGAGCTGGGCGCCGGCCAGGCCAACTACCAAGTTGGTTGCGGCATCCGGTGGTGTGGTGTCGCCACCGTCGATGTCCGGCGCGGTGATGTCGCCGGCCGTGGAGGTGTTGCCGGCGGCGTCGGTGGCGGTGACTTg > 2:710356/1‑150 (MQ=255) cgccgcGGCCATTGAGCTGGGCGCCGGCCAGGCCAACTACCAAGTTGGTTGCGGCATCCGGTGGTGTGGTGTCGCCACCGTCGATGTCCGGCGCGGTGATGTCGCCGGCCGTGGAGGTGTTGCCGGCGGCGTCGGTGGCGGTGACTTgta < 2:231112/150‑1 (MQ=255) gcgGCCATTGAGCTGGGCGCCGGCCAGGCCAACTACCAAGTTGGTTGCGGCATCCGGTGGTGTGGTGTCGCCACCGTCGATGTCCGGCGCGGTGATGTCGCCGGCCGTGGAGGTGTTGCAGGCTGGGTCGGTGGCGGTGACTTGTAGTAc < 1:240246/150‑1 (MQ=255) gcgGCCAGTGAGCTGGGCGCCGGCCAGGCCAACTACCAAGTTGGTTGCGGCATCCGGTGGTGTGGTGTCGCCACCGTCGATGTCCGGCGCGGTGATGTCGCCGGCCGTGGAGGTGTTGCCGGCGGCGTCGGTGGCGGTGACTTGTAGTAc < 1:97164/150‑1 (MQ=255) cATTGAGCTGGGCGCCGGCCAGGCCAACTACCAAGTTGGTTGCGGCATCCGGTGGTGTGGTGTCGCCACCGTCGATGTCCGGCGCGGTGATGTCGCCGGCCGTGGAGGTGTTGCCGGCGGCGTCGGTGGCGGTGACTTGTAGTACCtctc < 1:789239/150‑1 (MQ=255) cTGGGCGCCGGCCAGGCCAACTACCAAGTTGGTTGCGGCATCCGGTGGTGTGGTGTCGCCACCGTCGATGTCCGGCGCGGTGATGTCGCCGGCCGTGGAGGTGTTGCCGGCGGCGTCGGTGGCGGTGACTTGTAGTACCTCTCCACTCAc < 1:515871/150‑1 (MQ=255) ggccaggccaACTACCAAGTTGGTTGCGGCATCCGGTGGTGTGGTGTCGCCACCGTCGATGTCCGGCGCGGTGATGTCGCCGGCCGTGGAGGTGTTGCCGGCGGCGTCGGTGGCGGTGACTTGTAGTACCTCTCCACTCACCTGcggcgg < 2:305291/150‑1 (MQ=255) caggccaACTACCAAGTTGGTTGCGGCATCCGGTGGGGTGGTGTCGCCACAGACGATGTCCGGCGCGGTGATGTCGCCGGCGGTGGAGGTGTTGCCGGCGGTGTCGGTGGCGGTGACTTGTAGTAGCTCTCCCCTCACCTGcggcggccc > 2:147132/1‑147 (MQ=255) ggccaACTACCAAGTTGGTTGCGGCATACGGTGGTGTGGTGTCGCCACTGTCGATGTCCGGCGCGGTGGTGGGTCCGGCCGTGGAGGTGTTGCCGGCGGCGTCGGTGGCGGTGACTTGTAGTACCTCTCCACTCACCTGCGGCGGGTCGa < 1:149350/150‑1 (MQ=255) gccaACTACCAAGTTGGTTGCGGCATCCGGTGGTGTGGTGTCGCCACCGTCGATGTCCGGCGCGGTGATGTCGCCGGCCGTGGAGGTGTTGCCGGCGGCGTCGGTGGCGGTGACTTGTAGTACCTCTCCACTCACCTGCGGCGGGTCGAg < 1:231500/150‑1 (MQ=255) gccaACTACCAAGTTGGTTGCGGCATCCGGTGGTGTGGTGTCGCCACCGCCGATGTCCGGTGCGGTGATGTCGCCGGCCGTGGAGGTGTTGCCGGCGGCGTCGGTGGCGGTGACTTGTAGTACCTCTCCACTCACCTGCGGCGGGTCGAg < 2:117084/150‑1 (MQ=255) ccAAGTTGGTTGCGGCATCCGGTGGTGTGGTGTCGCCACCGTCGATGTCCGGCGCGGTGATGTCGCCGGCCGTGGAGGTGTTGCCGGCGGCGTCGGTGGCGGTGACTTGTAGTACCTCTCCACTCACCTGCGGCGGGTCGAGGGTGATGc > 1:632641/1‑150 (MQ=255) ttgCGGCATCCGGTGGTGTGGTGTCGCCACCGTCGATGTCCGGCGCGGTGATGTCGCCGGCCGTGGAGGTGTTGCCGGCGGCGTCGGTGGCGGTGACTTGTAGTACCTCTCCACTCACCTGCGGCGGGTCGAGGGTGATGCTGAAACTGc < 1:652858/150‑1 (MQ=255) aTCCGGTGGTGTGGTGTCGCCACCGTCGATGTCCGGCGCGGTGATGTCGCCGGCCGTGGAGGTGTTGCCGGCGGCGTCGGTGGCGGTGACTTGTAGTACCTCTCCACTCACCTGCGGCGGGTCGAGGGTGATGCTGAAACTGCCAGTGGc < 2:366381/150‑1 (MQ=255) cGGTGGTGTGGTGTCGCCACCGTCGATGTCCGGCGCGGTGATGTCGCCGGCCGTGGAGGTGTTGCCGGCGGCGTCGGTGGCGGTGACTTGTAGTACCTCTCCACTCACCTGCGGCGGGTCGAGGGTGATGCTGAAACTGCCAGTGGCGTc < 1:171740/150‑1 (MQ=255) gtggtgtggtGTCGCCACCGTCGATGTCCGGCGCGGTGATGTCGCCGGCCGTGGAGGTGTTGCCGGCGGCGTCGGTGGCGGTGACTTGTAGTACCTCTCCACTCACCTGCGGCGGGTCGAGGGTGATGCTGAAACTGCCAGTGGc < 1:2877/145‑1 (MQ=255) gtggtgtggtGTCGCCACCGTCGATGTCCGGCGCGGTGATGTCGCCGGCCGTGGAGGTGTTGCCGGCGGCGTCGGTGGCGGTGACTTGTAGTACCTCTCCACTCACCTGCGGCGGGTCGAGGGTGATGCTGAAACTGCCAGTGGc > 2:2877/1‑145 (MQ=255) gtgtggtgtCGCCACCGTCGATGTCCGGCGCGGTGATGTCGCCGGCCGTGGAGGTGTTGCCGGCGGCGTCGGTGGCGGTGACTTGTAGTACCTCTCCACTCACCTGCGGCGGGTCGAGGGTGATGCTGAAACTGCCAGTGGCGTCGacca < 1:710356/150‑1 (MQ=255) tggtgtCGCCACCGTCGATGTCCGGCGCGGTGATGTCGCCGGCCGTGGAGGTGTTGCCGGCGGCGTCGGTGGCGGTGACTTGTAGTACCTCTCCACTCACCTGCGGCGGGTCGAGGGTGATGCTGAAACTGCCAGTGGCGTCGAccacca < 2:425003/150‑1 (MQ=255) gtgtCGCCACCGTCGATGTCCGGCGCGGTGATGTCGCCGGCCGTGGAGGTGTTGCCGGCGGCGTCGGTGGCGGTGACTTGTAGTACCTCTCCACTCACCTGCGGCGCGTCGAGGGTGATGCTGAAACTGCCAGTGGCGTCGACCACcaca > 1:696575/1‑150 (MQ=255) tCGCCACCGTCGATGTCCGGCGCGGTGATGTCGCCGGCCGTGGAGGTGTTGCCGGCGGCGTcggtggcgacaccacaccaccggatgccgcaaccaacttggtagttggcctggccggcgcccagctcaatggccgcggcgaagccgggg < 1:507164‑M2/150‑90 (MQ=255) gCCACCGTCGATGTCCGGCGCGGTGATGTCGCCGGCCGTGGAGGTGTTGCCGGCGGCGTCGGTGGCGGTGACTTGTAGTACCTCTCCACTCACCTGCGGCGGGTCGAGGGTGATGCTGAAACTGCCAGTGGCGTCGACCACCACACTAcc > 1:290560/1‑150 (MQ=255) ccACCGTCGATGTCCGGCGCGGTGATGTCGCCGGCCGTGGAGGTGTTGCCGGCGGCGTCGGTGGCGGTGACTTGTAGTACCTCTCCACTCACCTGCGGCGGGTCGAGGGTGATGCTGAAACTGCCAGTGGCGTCGACCACCACACTAccc < 1:449088/150‑1 (MQ=255) gTCGATGTCCGGCGCGGTGATGTCGCCGGCCGTGGAGGTGTTGCCGGCGGCGTCGGTGGCGGTGACTTGTAGTACCTCTCCACTCACCTGCGGCGGGTCGAGGGTGATGCTGAAACTGCCAGTGGCGTCGACCACCACACTACCCAGCAc > 1:256525/1‑150 (MQ=255) gTCGATGTCCGGCGCGGTGATGTCGCCGGCCGTGGAGGTGTTGCCGGCGGCGTCGGTGGCGGTGACTTGTAGTACCTCTCCACTCACCTGCGGCGGGTCGAGGGAAATACTGGCCATGCCAGTGTCGATGACCGTGACACTACCCAGCAc > 2:224592/1‑150 (MQ=37) tCGATGTCCGGCGCGGTGATGTCGCCGGCCGTGGAGGTGTTGCCGGCGGCGTcggtggcgacaccacaccaccggatgccgcaaccaacttggtagttggcctggccggcgcccagctcaatggccgcggcgaagccgg < 2:730145‑M2/139‑88 (MQ=255) tCGATGTCCGGCGCGGTGATGTCGCCGGCCGTGGAGGTGTTGCCGGCGGCGTcggtggcgacaccacaccaccggatgccgcaaccaacttggtagttggcctggccggcgcccagctcaatggccgcggcgaagccgg > 1:730145‑M2/1‑52 (MQ=255) aTGTCCGGCGCGGTGATGTCGCCGGCCGTGGAGGTGTTGCCGGCGGCGTCGGTGGCGGTGACTTGTAGTACCTCTCCACTCACCTGCGGCGGGTCGAGGGTGATGCTGAAACTGCCAGTGGCGTCGACCACCACACTACCCAGCACggtg > 1:17220/1‑150 (MQ=255) ggTGATGTCGCCGGCCGTGGAGGTGTTGCCGGCGGCGTCGGTGGCGGTGACTTGTAGTACCTCTCCACTCACCTGCGGCGGGTCGAGGGTGATGCTGAAACTGCCAGTGGCGTCGACCACCACACTACCCAGCACGGTGGTGCCATcggc < 2:632641/150‑1 (MQ=255) ggccgTGGAGGTGTTGCCGGCGGCGTCGGTGGCGGTGACTTGTAGTACCTCTCCACTCACCTGCGGCGGGTCGAGGGTGATGCTGAAACTGCCa > 2:267633/1‑94 (MQ=255) ggccgTGGAGGTGTTGCCGGCGGCGTCGGTGGCGGTGACTTGTAGTACCTCTCCACTCACCTGCGGCGGGTCGAGGGTGATGCTGAAACTGCCa < 1:267633/94‑1 (MQ=255) gTGGAGGTGTTGCCGGCGGCGTCGGTGGCGGTGACTTGTAGTACCTCTCCACTCACCTGCGGCGGGTCGAGGGTGATGCTGAAACTGCCAGTGGCGTCGACCACCACACTACCCAGCACGGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCAcacgcacg < 1:342059/150‑1 (MQ=255) gTGGAGGTGTTGCCGGCGGCGTCGGTGGCGGTGACTTGTAGTACCTCTCCACTCACCTGCGGCGGGTCGAGGGTGATGCTGAAACTGCCAGTGGCGTCGACCACCACACTACCCAGCACGGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCAcacgcacg < 2:696575/150‑1 (MQ=255) gtTGCCGGCGGCGCCGGTGGCGGTGACTTGTAGTTCCTCTCCACTCACCTGCGGCGGGTCGAGGGTGATGCTGAAACTGCCAGTGGCGTCGACCACCACACTACCAAGCACGGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGCACGGTGCTGcc < 2:329658/150‑1 (MQ=255) gcggcgTCGGTGGCGGTGACTTGTAGTACCTCTCCACTCACCTGCGGCGGGTCGAGGGTGATGCTGAAACTGCCAGTGGCGTCGACCACCACACTACCCAGCACGGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGCACGGt > 2:206761/1‑137 (MQ=255) gcggcgTCGGTGGCGGTGACTTGTAGTACCTCTCCACTCACCTGCGGCGGGTCGAGGGTGATGCTGAAACTGCCAGTGGCGTCGACCACCACACTACCCAGCACGGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGCACGGt < 1:206761/137‑1 (MQ=255) cgTCGGTGGCGGTGACTTGTAGTACCTCTCCACTCACCTGCGGCGGGTCGAGGGTGATGCTGAAACTGCCAGTGGCGTCGACCACCACACTACCCAGCACGGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGCACGGTGCTGCCCACTTCGgcgc < 2:17220/150‑1 (MQ=255) gTCGGTGGCGGTGACTTGTAGTACCTCTCCACTCACCTGCGGCGGGTCGAGGGTGATGCTGAAACTGCCAGTGGCGTCGACCACCACACTACCCAGCACGGTGGTGCCATcg > 2:620096/1‑112 (MQ=255) gTCGGTGGCGGTGACTTGTAGTACCTCTCCACTCACCTGCGGCGGGTCGAGGGTGATGCTGAAACTGCCAGTGGCGTCGACCACCACACTACCCAGCACGGTGGTGCCATcg < 1:620096/112‑1 (MQ=255) | GCACGCTGGCCCCGGCTTCGCCGCGGCCATTGAGCTGGGCGCCGGCCAGGCCAACTACCAAGTTGGTTGCGGCATCCGGTGGTGTGGTGTCGCCACCGTCGATGTCCGGCGCGGTGATGTCGCCGGCCGTGGAGGTGTTGCCGGCGGCGTCGGTGGCGGTGACTTGTAGTACCTCTCCACTCACCTGCGGCGGGTCGAGGGTGATGCTGAAACTGCCAGTGGCGTCGACCACCACACTACCCAGCACGGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGCACGGTGCTGCCCACTTCGGCGC > NC_002947/938361‑938657 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |