New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1208314 = | 38 (1.200) | 3 (0.100) | 3/236 | NT | 8.3% | coding (693/3150 nt) | PP_1058 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 1208344 = | 30 (1.000) | coding (663/3150 nt) | PP_1058 | hypothetical protein |
TCGGTGGTGTCGGGGCCGCCCTGGTAGGCACGCACGCTGGCAGAAATCATCTGCCGGATCTTCTCCGCGCCCGACACCGTCAGGCCGTCGGGTGAGTGGCGATATTTCTCCAGCTGTGTGGCCAGGGTGCTGCCGCCGGCAGACTGGCCGGGCAGGGCCAGGTACTTGGCGACCTGGCTGTAGGCGGCCTTGGCAAAGCGTGGCCAGTCCACTGCCGGGTTGTTACGTGGGTCCTGGGTATCCAGCAGGTCGCGGTTTTCGATGAACAGCAAGCTGTTGACCATCACGG > NC_002947/1208195‑1208483 | tCGGTGGTGTCGGGGCCGCCCTGGTAGGCACGCACGCTGGCAGAAATCATCTGCCGGATCTTCTCCGCGCCCGACACCGTCAGGCCGTCGGGTGAGTGGCGATATTTCTCCAGCTGTGTGGCCAGGGTGCTGCCGCCGGCAGACTGGCCg < 2:677025/150‑1 (MQ=255) tcgaaaaccgcgacctgctggatacccaggacccacgtaacaacccggcagtggactggccacgctttgccaaggccgcctacagccaggtcgccaagtacctggccctgcccGGCCAGGGTGCTGCCGCCGGCAGACTGGCCGGGCAgg > 1:67209‑M1/114‑150 (MQ=255) gccCTGGTAGGCACGCACGCTGGCAGAAATCATCTGCCGGATCTTCTCCGCGCCCGACACCGTCAGGCCGTCGGGTGAGTGGCGATATTTCTCCAGCTGTGTGGCCAGGGTGCTGCCGCCGGCAGACTGGCCGGGCAGGGCCAGGTACtt > 2:284583/1‑150 (MQ=255) gccCTGGTAGGCACGCACGCTGGCAGAAATCATCTGCCGGATCTTCTCCGCGCCCGACACCGTCAGGCCGTCGGGTGAGTGGCGATATTTCTCCAGCTGTGTGGCCAGGGTGCTGCCGCCGGCAGACTGGCCGGGCAGGGCCAGGTACtt > 1:493802/1‑150 (MQ=255) cccTGGTAGGCACGCACGCTGGCAGAAATCATCTGCCGGATCTTCTCCGCGCCCGACACCGTCAGGCCGTCGGGTGAGTGGCGATATTTCTCCAGCTGTGTGGCCAGGGTGCTGCCGCCGGCAGACTGGCCGGGCAGGGCCAGGTACTTg < 2:173556/150‑1 (MQ=255) gTAGGCACGCACGCTGGCAGAAATCATCTGCCGGATCTTCTCCGCGCCCGACACCGTCAGGCCGTCGGGTGAGTGGCGATATTTCTCCAGCTGTGTGGCCAGGGTGCTGCCGCCGGCAGACTGGCCGGGCAGGGCCAGGTACTTGGCGAc < 2:32717/150‑1 (MQ=255) cacgcTGGCAGAAATCATCTGCCGGATCTTCTCCGCGCCCGACACCGTCAGGCCGTCGGGTGAGTGGCGATATTTCTCCAGCTGTGTGGCCAGGGTGCTGCCGCCGGCAGACTGGCCGGGCAGGGCCAGGTACTTGGCGACCTGGccctg < 1:284583/150‑5 (MQ=255) tcatcTGCCGGATCTTCTCCGCGCCCGACACCGTCAGGCCGTCGGGTGAGTGGCGATATTTCTCCAGCTGTGTGGCCAGGGTGCTGCCGCCGGCAGACTGGCCGGGCa < 2:702822/108‑1 (MQ=255) tcatcTGCCGGATCTTCTCCGCGCCCGACACCGTCAGGCCGTCGGGTGAGTGGCGATATTTCTCCAGCTGTGTGGCCAGGGTGCTGCCGCCGGCAGACTGGCCGGGCa > 1:702822/1‑108 (MQ=255) catcTGCCGGATCTTCTCCGCGCCCGACACCGTCAGGCCGTCGGGTGAGTGGCGATATTTCTCCAGCTGTGTGGCCAGGGTGCTGCCGCCGGCAGACTGGCCGGGCAGGGCCAGGTACTTGGCGACCTGGCTGTAGGCGGCCTTGGCaaa < 1:646222/150‑1 (MQ=255) tcTGCCGGATCTTCTCCGCGCCCGACACCGTCAGGCCGTCGGGTGAGTGGCGATATTTCTCCAGCTGTGTGGCCAGGGTGCTGCCGCCGGCAGACTGGCCGGGCAGGGCCAGGTACTTGGCGACCTGGCTGTAGGCGGCCTTGGCAAAGc < 1:520984/150‑1 (MQ=255) ccggcagtggactggccacgctttgccaaggccgcctacagccaggtcgccaagtacctggccctgcccGGCCAGGGTGCTGCCGCCGGCAGACTGGCCg > 2:820666‑M1/70‑100 (MQ=255) ccggcagtggactggccacgctttgccaaggccgcctacagccaggtcgccaagtacctggccctgcccGGCCAGGGTGCTGCCGCCGGCAGACTGGCCg < 1:820666‑M1/31‑1 (MQ=255) cTGCCGGATCTTCTCCGCGCCCGACACCGTCAGGCCGTCGGGTGAGTGGCGATATTTCTCCAGCTGTGTGGCCAGGGTGCTGCCGCCGGCAGACTGGCCGGGCAGGGCCAGGTACTTGGCGACCTGGCTGTAGGCGGCCTTGGCAAAGCg > 1:319247/1‑150 (MQ=255) ccGGATCTTCTCCGCGCCCGACACCGTCAGGCCGTCGGGTGAGTGGCGATATTTCTCCAGCTGTGTGGCCAGGGTGCTGCCGCCGGCAGACTGGCCGGGCAGGGCCAGGTACTTGGCGACCTGGCTGTAGGCGGCCTTGGCAAAGCGTgg < 1:135204/150‑1 (MQ=255) gcCCGACACCGTCAGGCCGTCGGGTGAGTGGCGATATTTCTCCAGCTGTGTGGCCAGGGTGCTGCCGCCGGCAGACTGGCCGGGCAGGGCCAGGTACTTGGCGACCTGGCTGTAGGCGGCCTTGGCAAAGCGTGGCCAGTCCACTGCCgg < 2:445955/150‑1 (MQ=255) gcCCGACACCGTCAGGCCGTCGGGTGAGTGGCGATATTTCTCCAGCTGTGTGGCCAGGGTGCTGCCGCCGGCAGACTGGCCGGGCAGGGCCAGGTACTTGGCGAACTGGTTTTAGGCGGCCTTGGCAAAGCGTGGCCAGTCCACTGCCgg < 2:29944/150‑1 (MQ=255) gACACCGTCAGGCCGTCGGGTGAGTGGCGATATTTCTCCAGCTGTGTGGCCAGGGTGCTGCCGCCGGCAGACTGGCCGGGCAGGGCCAGGTACTTGGCGACCTGGCTGTAGGCGGCCTTgg > 1:317475/1‑121 (MQ=255) gACACCGTCAGGCCGTCGGGTGAGTGGCGATATTTCTCCAGCTGTGTGGCCAGGGTGCTGCCGCCGGCAGACTGGCCGGGCAGGGCCAGGTACTTGGCGACCTGGCTGTAGGCGGCCTTgg < 2:317475/121‑1 (MQ=255) gACACCGTCAGGCCGTCGGGTGAGTGGCGATATTTCTCCAGCTGTGTGGCCAGGGTGCTGCCGCCGGCAGACTGGCCGGGCAGGGCCAGGTACTTGGCGACCTGGCTGTAGGCGGCCTTGGCAAAGCATGACAAGTACACTGcctttttt > 2:108813/1‑144 (MQ=255) acacCGTCAGGCCGTCGGGTGAGTGGCGATATTTCTCCAGCTGTGTGGCCAGGGTGCTGCCGCCGGCAGACTGGCCGGGCAGGGCCAGGTACTTGGCGACCTGGCTGTAGGCGGCCTTGGCAAAGCGTGGCCAGTCCACTGCCGGgtt > 2:45297/1‑148 (MQ=255) acacCGTCAGGCCGTCGGGTGAGTGGCGATATTTCTCCAGCTGTGTGGCCAGGGTGCTGCCGCCGGCAGACTGGCCGGGCAGGGCCAGGTACTTGGCGACCTGGCTGTAGGCGGCCTTGGCAAAGCGTGGCCAGTCCACTGCCGGgtt < 1:45297/148‑1 (MQ=255) cacCGTCAGGCCGTCGGGTGAGTGGCGATATTTCTCCAGCTGTGTGGCCAGGGTGCTGCCGCCGGCAGACTGGCCGGGCAGGGCCAGGTACTTGGCGACCTGGCTGTAGGCGGCCTTGGCAAAGCGTGGCCAGTCCACTGCCGGgttgtt < 2:319247/150‑1 (MQ=255) cGTCAGGCCGTCGGGTGAGTGGCGATATTTCTCCAGCTGTGTGGCCAGGGTGCTGCCGCCGGCAGACTGGCCGGGCAGGGCCAGGTACTTGGCGACCTGGCTGTAGGCGGCCTTGGCAAAGCGTGGCCAGTCCACTGCCGGGTTGTTACg > 2:711689/1‑150 (MQ=255) tCGGGTGAGTGGCGATATTTCTCCAGCTGTGTGGCCAGGGTGCTGCCGCCGGCAGACTGGCCGGGCAGGGCCAGGTACTTGGCGACCTGGCTGTAGGCGGCCTTGGCAAAGCGTGGCCAGTCCACTGCCGGGTTGTTACGTGGGTCCTgg < 1:711689/150‑1 (MQ=255) aGTGGCGATATTTCTCCAGCTGTGTGGCCAGGGTGCTGCCGCCGGCAGACTGGCCGGGCAGGGCCAGGTACTTGGCGACCTGGCTGTAGGCGGCCTTGGCAAAGCGTGGCCAGTCCACTGCCGGGTTGTTACGTGGGTCCTGGGTATCca > 1:39502/1‑150 (MQ=255) cAGCTGTGTGGCCAGGGTGCTGCCGCCGGCAGACTGGCCGGGCAGGGCCAGGTACTTGGCGACCTGGCTGTAGGCGGCCTTGGCAAAGCGTGGCCAGTCCACTGCCGGGTTGTTACGTg > 1:538423/1‑119 (MQ=255) cAGCTGTGTGGCCAGGGTGCTGCCGCCGGCAGACTGGCCGGGCAGGGCCAGGTACTTGGCGACCTGGCTGTAGGCGGCCTTGGCAAAGCGTGGCCAGTCCACTGCCGGGTTGTTACGTg < 2:538423/119‑1 (MQ=255) cAGCTGTGTGGCCAGGGTGCTGCCGCCGGCAGACTGGCCGGGCAGGGCCAGGTACTTGGCGACCTGGCTGTAGGCGGCCTTGGCAAAGCGTGGCCAGTCCACTGCCGGGTTGTTACGTGGGTCCTgg > 2:171825/1‑127 (MQ=255) cAGCTGTGTGGCCAGGGTGCTGCCGCCGGCAGACTGGCCGGGCAGGGCCAGGTACTTGGCGACCTGGCTGTAGGCGGCCTTGGCAAAGCGTGGCCAGTCCACTGCCGGGTTGTTACGTGGGTCCTgg < 1:171825/127‑1 (MQ=255) cAGCTGTGTGGCCAGGGTGCTGCCGCCGGCAGACTGGCCGGGCAGGGCCAGGTACTTGGCGACCTGGCTGTAGGCGGCCTTGGCAAAGCGTGGCCAGTCCACTGCCGGGTTGTTACGTGGGTCCTGGGTATCCAGCAGGTCGCGGTTTTc < 1:486761/150‑1 (MQ=255) cAGCTGTGTGGCCAGGGTGCTGCCACCGGCAGACTGGCCGGGCAGGGCCAGGTACTTGGCGACCTGGCTGTAGGCGGCCTTGGCAAAGCGTGGCCAGTCCACTGCCGGGTTGTTACGTGGGTCCTGGGTATCCAGCAGGTCGCGGTTTTc < 1:640366/150‑1 (MQ=255) cctgcccggccagtctgccggcggcagcaccctggccGGGCAGGGCCAGGTACTTGGCGACCTGGCTGTAGGCGGCCTTGGCAAAGCGTGGCCAGTCCACTGCCGGGTTGTTACGTGGGTCCTGGGTATCCAGCAGGTCGCGGTTTTCGa > 1:67209‑M2/38‑150 (MQ=255) cTGTGTGGCCAGGGTGCTGCCGCCGGCAGACTGGCCGGGCAGGGCCAGGTACTTGGCGACCTGGCTGTAGGCGGCCTTGGCAAAGCGTGGCCAGTCCACTGCCGGGTTGTTACGTGGGTCCTGGGTATCCAGCAGGTCGCGGTTTTCGAt < 1:636543/150‑1 (MQ=255) cggccagtctgccggcggcagcaccctggccGGGCAGGGCCAGGTACTTGGCGACCTGGCTGTAGGCGGCCTTGGCAAAGCGTGGCCAGTCCACTGCCgg < 1:820666‑M2/69‑1 (MQ=255) cggccagtctgccggcggcagcaccctggccGGGCAGGGCCAGGTACTTGGCGACCTGGCTGTAGGCGGCCTTGGCAAAGCGTGGCCAGTCCACTGCCgg > 2:820666‑M2/32‑100 (MQ=255) GGCCAGGGTGCTGCCGCCGGCAGACTGGCCGGGCAGGGCCAGGTACTTGGCGACCTGGCTGTAGGCGGCCTTGGCAAAGCGTGGCCAGTCCACTGCCGGGTTGTTACGTGGGTCCTGGGTATCCAGCAGGTCGCGGTTTTCGATGAACAg > 1:108813‑M1/1‑150 (MQ=255) gctgcCGCCGGCAGACTGGCCGGGCAGGGCCAGGTACTTGGCGACCTGGCTGTAGGCGGCCTTGGCAAAGCGTGGCCAGTCCACTGCCGGGTTGTTACGTGGGTCCTGGGTATCCAGCAGGTCGCGGTTTTCGATGAACAGCAAGCTGtt < 2:493802/150‑1 (MQ=255) gccgccGGCAGACTGGCCGGGCAGGGCCAGGTACTTGGCGACCTGGCTGTAGGCGGCCTTGGCAAAGCGTGGCCAGTCCACTGCCGGGTTGTTACGt > 1:789943/1‑97 (MQ=255) gccgccGGCAGACTGGCCGGGCAGGGCCAGGTACTTGGCGACCTGGCTGTAGGCGGCCTTGGCAAAGCGTGGCCAGTCCACTGCCGGGTTGTTACGt < 2:789943/97‑1 (MQ=255) gggCAGGGCCAGGTACTTGGCGACCTGGCTGTAGGCGGCCTTGGCAAAGCGTGGCCAGTCCACTGCCGGGTTGTTACGTGGGTCCTGGGTATCCAGCAGGTCGCGGTTTTCGATGAACAGCAAGCTGTTGACCATCACgg > 2:272600/1‑140 (MQ=255) gggCAGGGCCAGGTACTTGGCGACCTGGCTGTAGGCGGCCTTGGCAAAGCGTGGCCAGTCCACTGCCGGGTTGTTACGTGGGTCCTGGGTATCCAGCAGGTCGCGGTTTTCGATGAACAGCAAGCTGTTGACCATCACgg < 1:272600/140‑1 (MQ=255) | TCGGTGGTGTCGGGGCCGCCCTGGTAGGCACGCACGCTGGCAGAAATCATCTGCCGGATCTTCTCCGCGCCCGACACCGTCAGGCCGTCGGGTGAGTGGCGATATTTCTCCAGCTGTGTGGCCAGGGTGCTGCCGCCGGCAGACTGGCCGGGCAGGGCCAGGTACTTGGCGACCTGGCTGTAGGCGGCCTTGGCAAAGCGTGGCCAGTCCACTGCCGGGTTGTTACGTGGGTCCTGGGTATCCAGCAGGTCGCGGTTTTCGATGAACAGCAAGCTGTTGACCATCACGG > NC_002947/1208195‑1208483 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |