New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1377535 = | 39 (1.230) | 4 (0.130) | 4/236 | NT | 10.0% | coding (104/1293 nt) | PP_1201 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 1377557 = | 35 (1.160) | coding (82/1293 nt) | PP_1201 | hypothetical protein |
GGTCGAGCAGTTGCTTGCCCGTCAGTGCCTGGTCTTGTGGCACGCCGATGGCCACCCGGGCCTTGGGGTGCACGCCAGGGGTAACACGGGTGATGCTGGTGTCATTGATGCTCAACTGTTCCAGGCGCGCCTCGGGGGCCG‑GGCGCGTCCACAGCCAGAAGGCCAGCGCACCACCCAGGGCGGCCAGCAGCAGGGGAACCAGCAGGTACAACAAAAAGCGTCGGGTCATCAGCGTTTCACCAATCCAGTCAGGCCGCCTGCAATCAGGGCGGCGGTGTCGGCCAGTGCCAC > NC_002947/1377410‑1377700 | ggTCGAGCAGTTGCTTGCCCGTCAGTGCCTGGTCTTGTGGCACGCCGATGGCCACCCGGGCCTTGGGGTGCACGCCAGGGGTAACACGGGTGATGCTGGTGTCATTGATGCTCAACTGTTCCAGGCGCGCCTCGGGGGCCG‑GGCGCGTcc > 2:204717/1‑150 (MQ=255) tCGAGCAGTTGCTTGCCCGTCAGTGCCTGGTCTTGTGGCACGCCGATGGCCACCCGGGCCTTGGGGTGCACGCCAGGGGTAACACGGGTGATGCTGGTGTCATTGATGCTCAACTGTTCCAGGCGCGCCTCGGGGGCCG‑GGCGCGTCcac > 1:252633/1‑150 (MQ=255) tCGAGCAGTTGCTTGCCCGTCAGTGCCTGGTCTTGTGGCACGCCGATGGCCACCCGGGCCTTGGGGTGCACGCCAGGGGTAACACGGGTGATGCTGGTGTCATTGATGCTCAACTGTTCCAGGCGCGCCTCGGGGGCCG‑GGCGCGTCcac < 1:452769/150‑1 (MQ=255) tCGAGCAGTTGCTTGCCCGTCAGTGCCTGGTCTTGTGGCACGCCGATGGCCACCCGGGCCTTGGGGTGCACGCCAGGGGTAACACGGGTGATGCTGGTGTCATTGATGCTCAACTGTTCCAGGCGCGCCTCGGGGGCCG‑GGCGCGTCcac < 2:381975/150‑1 (MQ=255) aGCAGTTGCTTGCCCGTCAGTGCCTGGTCTTGTGGCACGCCGATGGCCACCCGGGCCTTGGGGTGCACGCCAGGGGTAACACGGGTGATGCTGGTGTCATTGATGCTCAACTGTTCCAGGCGCGCCTCGGGGGCCG‑GGCGCGTCCACAGc < 1:204717/150‑1 (MQ=255) gTTGCTTGCCCGTCAGTGCCTGGTCTTGTGGCACGCCGATGGCCACCCGGGCCTTGGGGTGCACGCCAGGGGTAACACGGGTGATGCTGGTGTCATTGATGCTCAACTGTTCCAGGCGCGCCTCGGGGGCCG‑GGCGCGTCCACAGCCAGa > 1:545657/1‑150 (MQ=255) gcttgcCCGTCAGTGCCTGGTCTTGTGGCACGCCGATGGCCACCCGGGCCTTGGGGTGCACGCCAGGGGTAACACGGGTGATGCTGGTGTCATTGATGCTCAACTGTTCCAGGCGCGCCTCGGGGGCCG‑GGCGCGTCCACAGCCAGAAgg > 1:447220/1‑150 (MQ=255) cttgcCCGTCAGTGCCTGGTCTTGTGGCACGCCGATGGCCACCCGGGCCTTGGGGTGCACGCCAGGGGTAACACGGGTGATGCTGGTGTCATTGATGCTCAACTGTTCCAGGCGCGCCTCGGGGGCCG‑GGCGCGTCCACAGCCAGAAGGc > 2:723652/1‑150 (MQ=255) cGTCAGTGCCTGGTCTTGTGGCACGCCGATGGCCACCCGGGCCTTGGGGTGCACGCCAGGGGTAACACGGGTGATGCTGGTGTCATTGATGCTCAACTGTTCCAGGCGCGCCTCGGGGGCCG‑GGCGCGTCCACAGCCAGAAGGCCAgcgc > 2:384481/1‑150 (MQ=255) cGTCAGTGCCTGGTCTTGTGGCACGCCGATGGCCACCCGGGCCTTGGGGTGCACGCCAGGGGTAACACGGGTGATGCTGGTGTCATTGATGCTCAACTGTTCCAGGCGCGCCTCGGGGGCCG‑GGCGCGTCCACAGCCAGAAGGCCAgcgc > 1:847588/1‑150 (MQ=255) aGTGCCTGGTCTTGTGGCACGCCGATGGCCACCCGGGCCTTGGGGTGCACGCCAGGGGTAACACGGGTGATGCTGGTGTCATTGATGCTCAACTGTTCCAGGCGCGCCTCGGGGGCCG‑GGCGCGTCCACAGCCAGAAGGCCAGCGcacca < 2:447220/150‑1 (MQ=255) cTGGTCTTGTGGCACGCCGATGGCCACCCGGGCCTTGGGGTGCACGCCAGGGGTAACACGGGTGATGCTGGTGTCATTGATGCTCAACTGTTCCAGGCGCGCCTCGGGGGCCG‑GGCGCGTCCACAGCCAGAAGGCCAGCGCACCACCCAg > 1:296816/1‑150 (MQ=255) gtgGCACGCCGATGGCCACCCGGGCCTTGGGGTGCACGCCAGGGCTAACACGGGTGATGCTGGTGTCATTGATGCTCAACTGTTCCAGGCGCGCCTCGGGGGCCG‑GGCGCGTCCACAGCCAGAAGGCCAGCGCACCACCCAGGGCGGCca < 2:616678/150‑1 (MQ=255) aCGCCGATGGCCACCCGGGCCTTGGGGTGCACGCCAGGGGTAACACGGGTGATGCTGGTGTCATTGATGCTCAACTGTTCCAGGCGCGCCTCGGGGGCCG‑GGCGCGTCCACAGc < 2:602335/114‑1 (MQ=255) aCGCCGATGGCCACCCGGGCCTTGGGGTGCACGCCAGGGGTAACACGGGTGATGCTGGTGTCATTGATGCTCAACTGTTCCAGGCGCGCCTCGGGGGCCG‑GGCGCGTCCACAGc > 1:602335/1‑114 (MQ=255) aCGCCGATGGCCACCCGGGCCTTGGGGTGCACGCCAGGGGTAACACGGGTGATGCTGGTGTCATTGATGCTCAACTGTTCCAGGCGCGCCTCGGGGGCCG‑GGCGCGTCCACAGCCAGAAGGCCAGCGCACCACCCAGGGCGGCcagcagc > 2:816198/1‑150 (MQ=255) aCGCCGATGGCCACCCGGGCCTTGGGGTGCACGCCAGGGGTAACACGGGTGATGCTGGTGTCATTGATGCTCAACTGTTCCAGGCGCGCCTCGGGGGCCG‑GGCGCGTCCACAGCCAGAAGGCCAGCGCACCACCCAGGGCGGCcagcagc > 1:226827/1‑150 (MQ=255) gatgacccgacgctttttgttgtacctgctggttcccctgctgctggccgccctgggtggtgcgctggccttctggctgtggacgcgcctcgggggccgggcgcgTCCACAGCCAGaa > 1:696970‑M2/106‑118 (MQ=255) gatgacccgacgctttttgttgtacctgctggttcccctgctgctggccgccctgggtggtgcgctggccttctggctgtggacgcgcctcgggggccgggcgcgTCCACAGCCAGaa < 2:696970‑M2/13‑1 (MQ=255) ccGATGGCCACCCGGGCCTTGGGGTGCACGCCAGGGGTAACACGGGTGATGCTGGTGTCATTGATGCTCAACTGTTCCAGGCGCGCCTCGGGGGCCG‑GGCGCGTCCACAGCCAGAAGGCCAGCGCACCACCCAGGGCGGCCCGCAGCAgg < 2:296816/150‑1 (MQ=255) ccACACGGGCATTGGCGTGCACGCCAGGGGTAACACGGGTGATGCTGGTGTCATTGGTGCTCAACTGTTCCAGGCGCGCCTCGGGGGCCG‑GGCGCGTCCACAGCCAGAAGGCCAGCGCACCACCCAGGGCTGCCAGCAGCAGGGGAACca > 2:480631/1‑150 (MQ=255) gTGCACGCCAGGGGTAACACGGGTGATGCTGGTGTCATTGATGCTCAACTGTTCCAGGCGCGCCTCGGGGGCCG‑GGCGCGTCCACAGCCAGAAGGCCAGCGCACCACCCAGGGCGGCCAGCAGCAGGGGAACCAGCAGGTACAACaaaaa > 2:632470/1‑150 (MQ=255) gTGCACGCCAGGGGTAACACGGGTGATGCTGGTGTCATTGATGCTCAACTGTTCCAGGCGCGCCTCGGGGGCCG‑GGCGCGTCCACAGCCAGAAGGCCAGCGCACCACCCAGGGCGGCCAGCAGCAGGGGAACCAGCAGGTACAACaaaaa > 1:522691/1‑150 (MQ=255) gTGCACGCCAGGGGTAACACGGGTGATGCTGGTGTCATTGATGCTCAACTGTTCCAGGCGCGCCTCGGGGGCCG‑GGCGCGTCCACAGCCAGAAGGCCAGCGCACCACCCAGGGCGGCCAGCAGCAGGGGAACCAGCAGGTACAACaaaaa < 1:723652/150‑1 (MQ=255) gCCAGGGGTAACACGGGTGATGCTGGTGTCATTGATGCTCAACTGTTCCAGGCGCGCCTCGGGGGCCG‑GGCGCGTCCACAGCCAGAAGGCCAGCGCACCACCCAGGGCGGCCAGCAGCAGGGGAACCAGCAGGTACAACAAAAAGCGTCg > 2:55541/1‑150 (MQ=255) ccAGGGGTAACACGGGTGATGCTGGTGTCATTGATGCTCAACTGTTCCAGGCGCGCCTCGGGGGCCG‑GGCGCGTCCACAGCCAGAAGGCCAGCGCACCACCCAGGGCGGCCAGCAGCAGGGGAACCAGCAGGTACAACAAAAAGCGTCgg < 1:816198/150‑1 (MQ=255) aaaCACGGGTGATGCTGGTGTCTGTGGTGCTCAACTGTTCCAGGCGCGCCTCGGGGGCCG‑GGAGCGGTGGTTACCAGAAGGCCAGCGCACCACCCAGGGCTGCCAGCAGCAGGGGAACCAGCAGGTACAACAAAAAGCGTCGGGtcatca < 1:480631/149‑1 (MQ=255) acGGGTGATGCTGGTGTCATTGATGCTCAACTGTTCCAGGCGCGCCTCGGGGGCCG‑GGCGCGTCCACAGCCAGAAGGCCAGCGCACCACCCAGGGCGGCCAGCAGCAGGGGAACCAGCAGGTACAACAAAAAGCGTCGGGTCATCAGCGt > 2:248926/1‑150 (MQ=255) gTGATGCTGGTGTCATTGATGCTCAACTGTTCCAGGCGCGCCTCGGGGGCCG‑GGCGCGTCCACAGCCAGAAGGCCAGCGCACCACCCAGGGCGGCCAGCAGCAGGGGAACCAGCAGGTACAACAAAAAGCGTCGGGTCATCAGCGTTTCa < 2:617693/150‑1 (MQ=255) ggTGTCATTGATGCTCAACTGTTCCAGGCGCGCCTCGGGGGCCG‑GGCGCGTCCACAGCCAGAAGGCCAGCGCACCACCCAGGGCGGCCAGCAGCAGGGGAACCAGCAGGTACAACAAAAAGCGTCGGGTCATCAGCGTTTCACCAATCCa < 2:522691/150‑1 (MQ=255) ttGATGCTCAACTGTTCCAGGCGCGCCTCGGGGGCCG‑GGCGCGTCCACAGCCAGAAGGCCAGCGCACCACCCAGGGCGGCCAGCAGCAGGGGAACCAGCAGGTACAACAAAAAGCGTCGGGTCATCAGCGTTTCACCAATCCAGTCAGgc > 1:648472/1‑150 (MQ=255) cTCAACTGTTCCAGGCGCGCCTCGGGGGCCG‑GGCGCGTCCACAGCCAGAAGGCCAGCGCACCACCCAGGGCGGCCAGCAGCAGGGGAACCAGCAGGTACAACAAAAAGCGTCGGGTCATCAGCGTTTCACCAATCCAGTCAGGCCGCCTg > 2:101488/1‑150 (MQ=255) ttctggctgtggaCGCGCC‑CGGCCCCCGAGGCGCGTCCACAGCCAGAAGGCCAGCGCACCACCCAGGGCGGCCAGCAGCAGGGGAACCAGCAGGTACAACAAAAAGCGTCGGGtcatc > 1:696970‑M1/14‑118 (MQ=255) ttctggctgtggaCGCGCC‑CGGCCCCCGAGGCGCGTCCACAGCCAGAAGGCCAGCGCACCACCCAGGGCGGCCAGCAGCAGGGGAACCAGCAGGTACAACAAAAAGCGTCGGGtcatc < 2:696970‑M1/105‑1 (MQ=255) aaCTGTTCCAGGCGCGCCTCGGGGGCCG‑GGCGCGTCCACAGCCAGAAGGCCAGCGCACCACCCAGGGCGGCCAGCAGCAGGGGAACCAGCAGGTACAACAAAAAGCGTCGGGTCATCAGCGTTTCACCAATc < 2:679168/132‑1 (MQ=255) aaCTGTTCCAGGCGCGCCTCGGGGGCCG‑GGCGCGTCCACAGCCAGAAGGCCAGCGCACCACCCAGGGCGGCCAGCAGCAGGGGAACCAGCAGGTACAACAAAAAGCGTCGGGTCATCAGCGTTTCACCAATc > 1:679168/1‑132 (MQ=255) tGTTCCAGGCGCGCCTCGGGGGCCG‑GGCGCGTCCACAGCCAGAAGGCCAGCGCACCACCCAGGGCGGCCAGCAGCAGGGGAACCAGCAGGTACAACAAAAAGCGTCGGGTCATCAGCGTTTCACCAATCCAGTCAGGCCGCCTGCAATCa < 1:596304/150‑1 (MQ=255) gTTCCAGGCGCGCCTCGGGGGCCG‑GGCGCGTCCACAGCCAGAAGGCCAGCGCACCACCCAGGGCGGCCAGCAGCAgg < 1:702626/77‑1 (MQ=255) gTTCCAGGCGCGCCTCGGGGGCCG‑GGCGCGTCCACAGCCAGAAGGCCAGCGCACCACCCAGGGCGGCCAGCAGCAgg > 2:702626/1‑77 (MQ=255) aGGCGCGCCTCGGGGGCCG‑GGCGCGTCCACAGCCAGAAGGCCAGCGCACCACCCAGGGCGGCCAGCAGCAGGGGAACCAGCAGGTACAACAAAAAGCGTCGGGTCATCAGCGTTTCACCAATCCAGTCAGGCCGCCTGCAATCAGggcgg < 1:763249/150‑1 (MQ=255) CCTCGGGGGCCG‑GGCGCGTCCACAGCCAGAAGGCCAGCGCACCACCCAGGGCGGCCAGCAGCAGGGGAACCAGCAGGTACAACAAAAAGCGTCGGGTCATCAGCGTTTCACCAATCCAGTCAGGCCGCCTGCAATCAGGGCGGCGGTGTc < 1:171382‑M1/150‑1 (MQ=255) cccggcccccgaggcgcgTCCACAGCCAGAAGGCCa > 2:732724‑M2/19‑36 (MQ=255) cccggcccccgaggcgcgTCCACAGCCAGAAGGCCa < 1:732724‑M2/18‑1 (MQ=255) tCGGGGGCCG‑GGCGCGTCCACAGCCAGAAGGCCAGCGCACCACCCAGGGCGGCCAGCAGCAGGGGAACCAGCAGGTACAACAAAAAGCGTc < 1:382985/91‑1 (MQ=255) tCGGGGGCCG‑GGCGCGTCCACAGCCAGAAGGCCAGCGCACCACCCAGGGCGGCCAGCAGCAGGGGAACCAGCAGGTACAACAAAAAGCGTc > 2:382985/1‑91 (MQ=255) cGGGGGCCG‑GGCGCGTCCACAGCCAGAAGGCCAGCGCACCACCCAGGGCGGCCAGCAGCAGGGGAACCAGCAGGTACAACAAAAAGCGTCGGGTCATCAGCGTTTCACCAATCCAGTCAGGCCGCCTGCAATCAGGGCGGCGGTGTCGGc < 2:252633/150‑1 (MQ=255) cG‑GGCGCGTCCACAGCCAGAAGGCCAGCGCACCACCCAGGGCGGCCAGCAGCAGGGGAACCAGCAGGTACAACAAAAAGCGTCGGGTCATCAGCGTTTCACCAATCCAGTCAGGCCGCCTGCAATCAGGGCGGCGGTGTCGGCCAGTGcc > 2:318808/1‑150 (MQ=255) ggcgcgTCCACAGCCAGAAGGCCAGCGCACCACCCAGGGCGGCCAGCAGCAGGGGAACCAGCAGGTACAACAAAAAGCGTCGGGTCATCAGCGTTTCACCAATCCAGTCAGGCCGCCTGCAATCAGGGCGGCGGTGTCGGCCAGTGccac < 1:55541‑M2/144‑1 (MQ=255) | GGTCGAGCAGTTGCTTGCCCGTCAGTGCCTGGTCTTGTGGCACGCCGATGGCCACCCGGGCCTTGGGGTGCACGCCAGGGGTAACACGGGTGATGCTGGTGTCATTGATGCTCAACTGTTCCAGGCGCGCCTCGGGGGCCG‑GGCGCGTCCACAGCCAGAAGGCCAGCGCACCACCCAGGGCGGCCAGCAGCAGGGGAACCAGCAGGTACAACAAAAAGCGTCGGGTCATCAGCGTTTCACCAATCCAGTCAGGCCGCCTGCAATCAGGGCGGCGGTGTCGGCCAGTGCCAC > NC_002947/1377410‑1377700 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |