New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1432044 | 29 (0.920) | 4 (0.140) | 4/232 | NT | 12.1% | coding (117/1092 nt) | xenA | protein XenA |
? | NC_002947 | = 1432069 | 31 (1.050) | coding (142/1092 nt) | xenA | protein XenA |
GCACTGTTCGAACCCTACACCCTCAAAGACGTCACCCTGCGTAACCGTATCGCCATTCCGCCGATGTGCCAGTACATGGCCGAAGACGGCATGATCAACGACTGGCACCACGTTCACCTGGCCGGCCTGGCCCGTGGTGGTGCCGGCTTGCTGGTGGTCGAGGCCACTGCTGTGGCGCCGG‑AAGGGCGTATCACCCCCGGTTGCGCCGGTATCTGGAGCGATGCCCACGCTCAGGCGTTCGTACCGGTGGTGCAGGCCATCAAGGCTGCCGGTTCCGTGCCGG > NC_002947/1431934‑1432216 | gCACTGTTCGAACCCTACACCCTCAAAGACGTCACCCTGCGTAACCGTATCGCCATTCCGCCGATGTGCCAGTACATGGCCGAAGACGGCATGATCAACGACTGGCACCACGTTCACCTGGCCGGCCTGGCCCGTGGTGGTGCCGGCTTg > 1:467083/1‑150 (MQ=255) gCACTGTTCGAACCCTACACCCTCAAAGACGTCACCCTGCGTAACCGTATCGCCATTCCGCCGATGTGCCAGTACATGGCCGAAGACGGCATGATCAACGACTGGCACCACGTTCACCTGGCCGGCCTGGCCCGTGGTGGTGCCGGCTTg < 1:302592/150‑1 (MQ=255) aCTGTTCGAACCCTACACCCTCAAAGACGTCACCCTGCGTAACCGTATCGCCATTCCGCCGATGTGCCAGTACATGGCCGAAGACGGCATGATCAACGACTGGCACCACGTTCACCTGGCCGGCCTGGCCCGTGGTGGTGCCGGCTTGCt > 2:468523/1‑150 (MQ=255) tttacGAACCCTACACCCTCAAAGACGTCACCCTGCGTAACCGTATCGCCATTCCGCCGATGTGCCAGTACATGGCCGAAGACGGCATGATCAACGACTGGCACCACGTTCACCTGGCCGGCCTGGCCCGTGGTGGTGCCGGCTTGCtgg > 1:166452/5‑150 (MQ=255) aCCCTACACCCTCAAAGACGTCACCCTGCGTAACCGTATCGCCATTCCGCCGATGTGCCAGTACATGGCCGAAGACGGCATGATCAACGACTGGCACCACGTTCACCTGGCCGGCCTGGCCCGTGGTGGTGCCGGCTTGCTGGTGGTCGa < 1:315434/150‑1 (MQ=255) ccTACACCCTCAAAGACGTCACCCTGCGTAACCGTATCGCCATTCCGCCGATGTGCCAGTACATGGCCGAAGACGGCATGATCAACGACTGGCACCACGTTCACCTGGCCGGCCTGGCCCGTGGTGGTGCCGGGTTGCTGGTGGTCGAgg < 1:839858/150‑1 (MQ=255) cTCAAAGACGTCACCCTGCGTAACCGTATCGCCATTCCGCCGATGTGCCAGTACATGGCCGAAGACGGCATGATCAACGACTGGCACCACGTTCACCTGGCCGGCCTGGCCCGTGGTGGTGCCGGCTTGCTGGTGGTCGAGGCCActgct < 2:166452/150‑1 (MQ=255) cTCAAAGACGTCACCCTGCGTAACCGTATCGCCATTCCGCCGATGTGCCAGTACATGGCCGAAGACGGCATGATCAACGACTGGCACCACGTTCACCTGGCCGGCCTGGCCCGTGGTGGTGCCGGCTTGCTGGTGGTCGAGGCCActgct > 2:462357/1‑150 (MQ=255) aaGACGTCACCCTGCGTAACCGTATCGCCATTCCGCCGATGTGCCAGTACATGGCCGAAGACGGCATGATCAACGACTGGCACCACGTTCACCTGGCCGGCCTGGCCCGTGGTGGTGCCGGCTTGCTGGTGGTCGAGGCCACTGCTGTgg < 1:247941/150‑1 (MQ=255) ccTGCGTAACCGTATCGCCATTCCGCCGATGTGCCAGTACATGGCCGAAGACGGCATGATCAACGACTGGCACCACGTTCACCTGGCCGGCCTGGCCCgtg > 1:736480/1‑101 (MQ=255) ccTGCGTAACCGTATCGCCATTCCGCCGATGTGCCAGTACATGGCCGAAGACGGCATGATCAACGACTGGCACCACGTTCACCTGGCCGGCCTGGCCCgtg < 2:736480/101‑1 (MQ=255) ccTGCGTAACCGTATCGCCATTCCGCCGATGTGCCAGTACATGGCCGAAGACGGCATGATCAACGACTGGCACCACGTTCACCTGGCCGGCCTGGCCCGTGGTGGTGCCgg < 1:370941/111‑1 (MQ=255) ccTGCGTAACCGTATCGCCATTCCGCCGATGTGCCAGTACATGGCCGAAGACGGCATGATCAACGACTGGCACCACGTTCACCTGGCCGGCCTGGCCCGTGGTGGTGCCgg > 2:370941/1‑111 (MQ=255) tGCGTAACCGTATCGCCATTCCGCCGATGTGCCAGTACATGGCCGAAGACGGCATGATCAACGACTGGCACCACGTTCACCTGGCCGGCCTGGCCCGTGGTGGTGCCGGCTTGCTGGTGGTCGAGGCCACTGCTGTGGCGCCGG‑AAGGGc < 2:467083/150‑1 (MQ=255) gTATCGCCATTCCGCCGATGTGCCAGAACATGGCCGAAGACGGCATGATCAACGACTGGCACCACGTTCACCTGGCCGGCCTGGCCCGTGGGGGTGCCGGCTTGCTGGTGGTCGAGGCCACTGCTGGGGAGCAGG‑AAAGGCGTATCAccc > 2:599599/1‑150 (MQ=255) tCGCCATTCCGCCGATGTGCCAGTACATGGCCGAAGACGGCATGATCAACGACTGGCACCACGTTCACCTGGCCGGCCTGGCCCGTGGTGGTGCCGGCTTGCTGGTGGTCGAGGCCACTGCTGTGGCGCCGG‑aa < 2:260353/134‑1 (MQ=255) tCGCCATTCCGCCGATGTGCCAGTACATGGCCGAAGACGGCATGATCAACGACTGGCACCACGTTCACCTGGCCGGCCTGGCCCGTGGTGGTGCCGGCTTGCTGGTGGTCGAGGCCACTGCTGTGGCGCCGG‑aa > 1:260353/1‑134 (MQ=255) cGCCATTCCGCCGATGTGCCAGTACATGGCCGAAGAAGGCATGATCAACGACTGGCACCACGTTCACCTGGCCGGCCTGGCCCGTGGTGGTGCCGGCTTGCTGGTGGTCGAGGCCACTGCTGTGGCGCCGG‑AAGGGCGTATCACCCCCgg > 2:210959/1‑150 (MQ=255) ccAGTACATGGCCGAAGACGGCATGATCAACGACTGGCACCACGTTCACCTGGCCGGCCTGGCCCGTGgtggtgccagtcgttgatcatgccgtcttcggcc > 1:559311‑M2/1‑68 (MQ=255) ccAGTACATGGCCGAAGACGGCATGATCAACGACTGGCACCACGTTCACCTGGCCGGCCTGGCCCGTGgtggtgccagtcgttgatcatgccgtcttcggcc < 2:559311‑M2/102‑35 (MQ=255) tACATGGCCGAAGACGGCATGATCAACGACTGGCACCACGTTCACCTGGCCGGCCTGGCCCGTGGTGGTGCCGGCTTGCTGGTGGTCGAGGCCACTGCTGTGGCGCCGG‑AAGGGCGTATCACCCCCGGTTGCGCCGGTATCTGGAGCGAt < 2:385834/150‑1 (MQ=255) cGAAGACGGCATGATCAACGACTGGCACCACGTTCACCTGGCCGGCCTGGCCCGTGGTGGTGCCGGCTTGCTGGTGGTCGAGGCCACTGCTGTGGCGCCGG‑AAGGGCGTATCACCCCCGGTTGCGCCGGTATCTGGAGCGATGCCCACGc > 1:817501/1‑150 (MQ=255) aGACGGCATGATCAACGACTGGCACCACGTTCACCTGGCCGGCCTGGCCCGTGGTGGTGCCGGCTTGCTGGTGGTCGAGGCCACTGCTGTGGCGCCGG‑AAGGGCGTATCACCCCCGGTTGCGCCGGTATCTGGAGCGATGCCCACGCTCa > 2:74869/1‑150 (MQ=255) aGACGGCATGATCAACGACTGGCACCACGTTCACCTGGCCGGCCTGGCCCGTGGTGGTGCCGGCTTGCTGGTGGTCGAGGCCACTGCTGTGGCGCCGG‑AAGGGCGTATCACCCCCGGTTGCGCCGGTATCTGGAGCGATGCCCACGCTCa < 2:726233/150‑1 (MQ=255) ggCATGATCAACGACTGGCACCACGTTCACCTGGCCGGCCTGGCCCGTGGTGGTGCCGGCTTGCTGGTGGTCGAGGCCACTGCTGTGGCGCCGG‑AAGGGCGTATCACCCCCGGTTGCGCCGGTATCTGGAGCGATGCCCACGCTCAGGCg > 2:75705/1‑150 (MQ=255) cATGATCAACGACTGGCACCACGTTCACCTGGCCGGCCTGGCCCGTGGTGGTGCCGGCTTGCTGGTGGTCGAGGCCACTGCTGTGGCGCCGG‑AAGGGCGTATCACCCCCGGTTGCGCCGGTATCTGGAGCGATGCCCACGCTCAGGCGtt < 1:75705/150‑1 (MQ=255) aTCAACGACTGGCACCACGTTCACCTGGCCGGCCTGGCCCGTGGTGGTGCCGGCTTGCTGGTGGTCGAGGCCACTGCTGTGGCGCCGG‑AAGGGCGTATCACCCCCGGTTGCGCCGGTATCTGGAGCGATGCCCACGCTCAGGCGTTCGTa > 2:47111/1‑150 (MQ=255) aCTGGCACCACGTTCACCTGGCCGGCCTGGCCCGTGGTGGTGCCGGCTTGCTGGTGGTCGAGGCCACTGCTGTGGCGCCGG‑AAGGGCGTATCACCCCCGGTTGCGCCGGTATCTGGAGCGATGCCCACGCTCAGGCGTTCGTACCggtgg < 1:187985/150‑1 (MQ=255) cTGGCACCACGTTCACCTGGCCGGCCTGGCCCGTGGTGGTGCCGGCTTGCTGGTGGTCGAGGCCACTGCTGTGGCGCCGG‑AAGGGCGTATCACCCCCGGTTGCGCCGGTATCTGGAGCGATGCCCACGCTCAGGCGTTCGTACCggtggt < 1:462357/150‑1 (MQ=255) accacGTTCACCTGGCCGGCCTGGCCCGTGgtggtgccagtcgttgatcatgccgtcttcggccatgtactggcacatcggcggaatggcga < 1:645610‑M2/92‑63 (MQ=255) accacGTTCACCTGGCCGGCCTGGCCCGTGgtggtgccagtcgttgatcatgccgtcttcggccatgtactggcacatcggcggaatggcga > 2:645610‑M2/1‑30 (MQ=255) accacGTTCACCTGGCCGGCCTGGCCCGTGGTGGTGCCGGCTTGCTGGTGGTCGAGGCCGCTGCTGTGGGGCCGGCGAGGAGGCAACCCACGCGG‑AAAGGGGGTAGCTGGAGCGATGCCCACGCTCAGGCCTTCGTACCCGCGGTGGAgg > 1:831483/1‑150 (MQ=255) ccacGTTCACCTGGCCGGCCTGGCCCGTGGTGGTGCCGGCTTGCTGGTGGTCGAGGCCACTGCTGTGGCGCCGG‑AAGGGCGTATCACCCCCGGTTGCGCCGGTATCTGGAGCGATGCCCACGCTCAGGCGTTAGTACCGGTGGTGCAGGc > 2:720412/1‑150 (MQ=255) cggccTGGCCCGTGGTGGTGCCGGCTTGCTGGTGGTCGAGGCCACTGCTGTGGCGCCGG‑AAGGGCGTATCACCCCCGGTTGCGCCGGTATCTGGAGCGATGCCCACGCTCAGGCGTTc < 1:43985/118‑1 (MQ=255) cggccTGGCCCGTGGTGGTGCCGGCTTGCTGGTGGTCGAGGCCACTGCTGTGGCGCCGG‑AAGGGCGTATCACCCCCGGTTGCGCCGGTATCTGGAGCGATGCCCACGCTCAGGCGTTc > 2:43985/1‑118 (MQ=255) cggccTGGCCCGTGGTGGTGCCGGCTTGCTGGTGGTCGAGGCCACTGCTGTGGCGCCGG‑AAGGGCGTATCACCCCCGGTTGCGCCGGTATCTGGAGCGATGCCCACGCTCAGGCGTTCGTACCGGTGGTGCAGGCCATCAAGGCTGCCgg > 2:281310/1‑150 (MQ=255) cTGGCCCGTGGTGGTGCCGGCTTGCTGGTGGTCGAGGCCACTGCTGTGGCGCCGG‑AAGGGCGTATCACCCCCGGTTGCGCCGGTATCt > 1:821462/1‑88 (MQ=255) cTGGCCCGTGGTGGTGCCGGCTTGCTGGTGGTCGAGGCCACTGCTGTGGCGCCGG‑AAGGGCGTATCACCCCCGGTTGCGCCGGTATCt < 2:821462/88‑1 (MQ=255) cccGTGGTGGTGCCGGCTTGCTGGTGGTCGAGGCCACTGCTGTGGCGCCGG‑AAGGGCGTATCACCCCCGGTTGCGCCGGTATCTGGAGCGATGCCCACGCTCAGGCGTTCGTACCGGTGGTGCAGGCCATCAAGGCTGCCGGTTCCGTGc < 1:281310/150‑1 (MQ=255) ccGTGGTGGTGCCGGCTTGCTGGTGGTCGAGGCCACTGCTGTGGCGCCGG‑AAGGGCGTATCACCCCCGGTTGCGCCGGTATCTGGAGCGATGCCCACGCTCAGGCGTTCGTACCGGTGGTGCAGGCCATCAAGGCTGCCGGTTCCGTGcc > 1:135497/1‑150 (MQ=255) ttggtggtgCCCGCGTGCTGGTGCTCGAGGCCCCTGCTGTGGCGCCGG‑AAGGGCGTATCACCCCCGGTTGCGCCGGTATCTGGAGCGATGCCCACGCTCAGGCGTTCGTACCGGTGGTGCAGGCCATCAAGGCTGCCGGTTCCGTGCCgg < 2:831483/149‑1 (MQ=255) | GCACTGTTCGAACCCTACACCCTCAAAGACGTCACCCTGCGTAACCGTATCGCCATTCCGCCGATGTGCCAGTACATGGCCGAAGACGGCATGATCAACGACTGGCACCACGTTCACCTGGCCGGCCTGGCCCGTGGTGGTGCCGGCTTGCTGGTGGTCGAGGCCACTGCTGTGGCGCCGG‑AAGGGCGTATCACCCCCGGTTGCGCCGGTATCTGGAGCGATGCCCACGCTCAGGCGTTCGTACCGGTGGTGCAGGCCATCAAGGCTGCCGGTTCCGTGCCGG > NC_002947/1431934‑1432216 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |