| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 2247118 = | 7 (0.540) | 3 (0.240) | 3/262 | 1.3 | 26.4% | coding (2524/3297 nt) | PP_1983 | PAS/PAC/GAF sensor‑containing diguanylate cyclase/phosphodiesterase |
| ? | NC_002947 | 2247154 = | 10 (0.800) | coding (2488/3297 nt) | PP_1983 | PAS/PAC/GAF sensor‑containing diguanylate cyclase/phosphodiesterase | |||||
GCAACAGTACTTCGGCACCGACGATGCGGTTGTCGCGGGCATCCACCTGCGGCTGGAAGTGCAGTGCCAGCTCGCCACGGGCCAGGGCCAGGCGCAGGTCGTTTTCCATGCGCAGGCGCTCGCTGGCGGCCTTCTGCATGGTGGTGTGAAACAGCTGGGTGGTGTTGCGACCGGAGTCCTTGGCCCGGTACAGGGCGATATCGGCACGTTTGAGCAGGTCGGCCGGTGTGGTGCCGTGGTCGGGGATCAGCGCCACGCCGATGCTGGGCGTTACCTGCAGGCGCTGGCCAT > NC_002947/2247013‑2247303 | gcAACAGTACTTCGGCACCGACGATGCGGTTGTCGCGGGCATCCACCTGCGGCTGGAAGTGCAGTGCCAGCTCGCCACGGGCCAGGGCCAGGCGCAGGTCGTTTTCCATGCGCAGGCGCTCGCTGGCGGCCTTCTGCATGGTGGTGTGaa > 1:251464/1‑150 (MQ=255) aCTTCGGCACCGACGATGCGGTTGTCGCGGGCATCCACCTGCGGCTGGAAGTGCAGTGCCAGCTCGCCACGGGCCAGGGCCAGGCGCAGGTCGTTTTCCATGCGCAGGCGCTCGCTGGCGGCCTTCTGCATGGTGGTGTGAAACAGCTgg < 1:273351/150‑1 (MQ=255) cTGCGGCTGGAAGTGCAGTGCCAGCTCGCCACGGGCCAGGGCCAGGCGCAGGTCGTTTTCCATGCGCAGGCGCTCGCTGGCGGCCTTCTGCATGGTGGTGTGAAACAGCTGGGTGGTGTTGCGACCGGAGTCCTTGGCCCGGTACAGGGc < 2:36732/150‑1 (MQ=255) gCTGGAAGTGCAGTGCCAGCTCGCCACGGGCCAGGGCCAGGCGCAGGTCGTTTTCCATGCGCAGGCGCTCGCTGGCGGCCTTCTGCATGGTGGTGTGAAACAGCTGGGTGGTGTTGCGACCGGAGTCCTTGGCCCGGTACAGGGCGatat > 1:93406/1‑150 (MQ=255) aCGGGCCAGGGCCAGGCGCAGGTCGTTTTCCATGCGCAGGCGCTCGCTGGCGGCCTTCTGCATGGTGGTGTGAAACAGCTGGGTGGTGTTGCGACCGGAGTCCTTGGCCCGGTACAGGGCGatat > 1:131682/1‑125 (MQ=255) aCGGGCCAGGGCCAGGCGCAGGTCGTTTTCCATGCGCAGGCGCTCGCTGGCGGCCTTCTGCATGGTGGTGTGAAACAGCTGGGTGGTGTTGCGACCGGAGTCCTTGGCCCGGTACAGGGCGatat < 2:131682/125‑1 (MQ=255) ttttCCATGCGCAGGCGCTCGCTGGCGGCCTTCTGCATGGTGGTGTGAAACAGCTGGGTGGTGTTGCGACCGGAGTCCTTGGCCCGGTACAGGGCGATATCGGCACGTTTGAGCAGGTCGGCCGGTGTGGTGCCGTGGTCGGGGATCAgc < 2:149157/150‑1 (MQ=255) ccatgcagaaggccgccagcgagcgcctgcgcatggTGGTGTGAAACAGCTGGGTGGTGTTGCGACCGGAGTCCTTGGCCCGGTACAGGGCGATATCGGCACGTTTGAGCAGGTCGGCCGGTGTGGTGCCGTGGTCGGGGATCAGCGCCa > 2:141925‑M2/37‑150 (MQ=255) catgcagaaggccgccagcgagcgcctgcgcatggTGGTGTGAAACAGCTGGGTGGTGTTGCGACCGGAGTCCTTGGCCCgg > 1:5991‑M2/36‑82 (MQ=255) catgcagaaggccgccagcgagcgcctgcgcatggTGGTGTGAAACAGCTGGGTGGTGTTGCGACCGGAGTCCTTGGCCCgg < 2:5991‑M2/47‑1 (MQ=255) tcgctGGCGGCCTTCTGCATGGTGGTGTGAAACAGCTGGGTGGTGTTGCGACCGGAGTCCTTGGCCCGGTACAGGGCGATATCGGCACGTTTGAGCAGGTCGGCCGGTGTGGTGCCGTGGTCg > 1:280021/1‑123 (MQ=255) tcgctGGCGGCCTTCTGCATGGTGGTGTGAAACAGCTGGGTGGTGTTGCGACCGGAGTCCTTGGCCCGGTACAGGGCGATATCGGCACGTTTGAGCAGGTCGGCCGGTGTGGTGCCGTGGTCg < 2:280021/123‑1 (MQ=255) ttCTGCATGGTGGTGTGAAACAGCTGGGTGGTGTTGCGACCGGAGTCCTTGGCCCGGTACAGGGCGATATCGGCACGTTTGAGCAGGTCGGCCGGTGTGGTGCCGTGGTCGGGGATCAGCGCCACGCCGATGCTGGGCGTTACCTGCAgg > 1:171148/1‑150 (MQ=255) atggTGGTGTGAAACAGCTGGGTGGTGTTGCGACCGGAGTCCTTGGCCCGGTACAGGGCGATATCGGCACGTTTGAGCAGGTCGGCCGGTGTGGTGCCGTGGTCGGGGATCAGCGCCACGCCGATGCTGGGCGTTACCTGCAGGCGCTgg < 1:141925‑M2/146‑1 (MQ=255) tggtgTGAAACAGCTGGGTGGTGTTGCGACCGGAGTCCTTGGCCCGGTACAGGGCGATATCGGCACGTTTGAGCAGGTCGGCCGGTGTGGTGCCGTGGTCGGGGATCAGCGCCACGCCGATGCTGGGCGTTACCTGCAGGCGCTGGCCAt < 2:93406/150‑1 (MQ=255) | GCAACAGTACTTCGGCACCGACGATGCGGTTGTCGCGGGCATCCACCTGCGGCTGGAAGTGCAGTGCCAGCTCGCCACGGGCCAGGGCCAGGCGCAGGTCGTTTTCCATGCGCAGGCGCTCGCTGGCGGCCTTCTGCATGGTGGTGTGAAACAGCTGGGTGGTGTTGCGACCGGAGTCCTTGGCCCGGTACAGGGCGATATCGGCACGTTTGAGCAGGTCGGCCGGTGTGGTGCCGTGGTCGGGGATCAGCGCCACGCCGATGCTGGGCGTTACCTGCAGGCGCTGGCCAT > NC_002947/2247013‑2247303 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |