New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 6045763 = | 25 (0.950) | 8 (0.310) | 7/264 | 2.0 | 25.0% | coding (404/768 nt) | PP_5298 | glutamine amidotransferase |
? | NC_002947 | 6045795 = | 24 (0.940) | coding (372/768 nt) | PP_5298 | glutamine amidotransferase |
CTGGCTGTGCAGCGAATTGACCTCGAACTGCGCCACCAACCCCAGGCGCTCGAACAACCCGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGG‑‑CTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGCTGCCTGCAACAGCGGCAGGGTCAGGCGATCACGCGCCAGATC > NC_002947/6045618‑6045905 | cTGGCTGTGCAGCGAATTGACCTCGAACTGCGCCACCAACCCCAGGCGCTCGAACAACCCGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAg > 2:3025/1‑150 (MQ=255) tggcgcccccagtgtggcgggtaaccggcatgatctggcgcgtgatcgcctgaccctgccgctgttgcaggcagccattgccgtcggtgtgcccgtattctgcatctgccgaggctaccaggagctgaacgtggcccttggcGGCAGTTc < 2:613725‑M1/8‑1 (MQ=255) tgtgCAGCGAATTGACCTCGAACTGCGCCACCAACCCCAGGCGCTCGAACAACCCGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCt < 1:94982/150‑1 (MQ=255) cgggtacccggcatgatctggcgcgtgatcgcctgaccctgccgctgttgcaggcagccattgccgtcggtgtgcccgtattctgcatctgccgaggctaccaggagctgaacgtggcccttggcGGCAG‑‑CCTGCACACGCTGGTGCAgg > 2:605141‑M1/126‑150 (MQ=255) cgggtacccggcatgatctggcgcgtgatcgcctgaccctgccgctgttgcaggcagccattgccgtcggtgtgcccgtattctgcatctgccgaggctaccaggagctgaacgtggcccttggcGGCAG‑‑CCTGCACACGCTGGTGCAgg > 1:228402‑M1/126‑150 (MQ=255) cTCGAACTGCGCCACCAACCCCAGGCGCTCGAACAACCCTCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAg > 1:435073/1‑150 (MQ=255) cTCGAACTGCGCCACCAACCCCAGGCGCTCGAACAACCCGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGca < 1:82137/137‑1 (MQ=255) cTCGAACTGCGCCACCAACCCCAGGCGCTCGAACAACCCGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGca > 2:82137/1‑137 (MQ=255) tGCGCCACCAACCCCAGGCGCTCGAACAACCCGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGG‑‑CTgccg < 1:298483/150‑1 (MQ=255) gcCACCAACCCCAGGCGCTCGAACAACCCGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCa > 1:321897/1‑139 (MQ=255) gcCACCAACCCCAGGCGCTCGAACAACCCGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCa < 2:321897/139‑1 (MQ=255) ccaccaACCCCAGGCGCTCGAACAACCCGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGG‑‑CTGCCGCCaa > 2:584629/1‑150 (MQ=255) cccaACCCCAGGCGCTCGAACAACCCGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGG‑‑CTGCCGCCaatg < 1:555463/149‑3 (MQ=255) acaacCCGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGG‑‑CTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGt > 2:531671/1‑150 (MQ=255) ttgcaggcagccattgccgtcggtgtgcccgtattctgcatctgccgaggctaccaggagctgaacgtggcccttggcGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGG‑‑CTGCCGCCAAg > 1:49687‑M1/79‑116 (MQ=255) ttgcaggcagccattgccgtcggtgtgcccgtattctgcatctgccgaggctaccaggagctgaacgtggcccttggcGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGG‑‑CTGCCGCCAAg < 2:49687‑M1/38‑1 (MQ=255) aCCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGG‑‑CTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACg > 1:62200/1‑150 (MQ=255) cGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGG‑‑CTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACggg < 2:363913/150‑1 (MQ=255) cGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGG‑‑CTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACggg < 1:148831/150‑1 (MQ=255) cGAGTGGCGAGGACCGTATTGCACCTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGG‑‑CTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACggg < 1:537671/150‑1 (MQ=255) cgtcggtgtgcccgtattctgcatctgccgaggctaccaggagctgaacgtggcccttggcGGCAG‑‑CCTGCACACGCTGGTGCAGG‑‑Ct > 2:14595‑M1/62‑88 (MQ=255) cgtcggtgtgcccgtattctgcatctgccgaggctaccaggagctgaacgtggcccttggcGGCAG‑‑CCTGCACACGCTGGTGCAGG‑‑Ct < 1:14595‑M1/27‑1 (MQ=255) ggCCGTATTGCACCTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGG‑‑CTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACgg > 2:447926/1‑150 (MQ=255) ggCCGTATTGCACCTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGG‑‑CTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACgg < 2:62200/150‑1 (MQ=255) gTATTGCACCTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGG‑‑CTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAAt < 1:3025/150‑1 (MQ=255) cTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGG‑‑CTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTgg > 1:139504/1‑100 (MQ=255) cTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGG‑‑CTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTgg < 2:139504/100‑1 (MQ=255) cTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGGAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGG‑‑CTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGctgcctg > 1:520149/1‑150 (MQ=255) tCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGG‑‑CTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGctgcctgc > 1:65907/1‑150 (MQ=255) aGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGGGGTCAATGTAGCCATGCAGTTCCTGCACAAGCTGGTGCAGG‑‑CTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGCTGCCTGCAAc > 1:177377/1‑150 (MQ=255) tCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGG‑‑CTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGCTGCCTGCAACAGCGGCAgg < 1:447926/150‑1 (MQ=255) tCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGG‑‑CTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGCTGCCTGCAACAGCGGCAGGGTCAGGCGATCACGCGcc < 1:531671/150‑1 (MQ=255) ccttggcGGCAG‑‑CCTGCACCAGCGTGTGCAGGAACTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGCTGCCTGCAACAGCGGCAGGGTCAGGCGATCACGCGCCAGATc < 1:613725‑M1/143‑1 (MQ=255) | CTGGCTGTGCAGCGAATTGACCTCGAACTGCGCCACCAACCCCAGGCGCTCGAACAACCCGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGG‑‑CTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGCTGCCTGCAACAGCGGCAGGGTCAGGCGATCACGCGCCAGATC > NC_002947/6045618‑6045905 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |