| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 1126676 | 67 (0.760) | 4 (0.050) | 4/228 | NT | 5.8% | intergenic (‑125/+25) | tdcG‑II/gcvP‑I | L‑serine dehydratase/glycine dehydrogenase |
| ? | NC_002947 | = 1126683 | 67 (0.820) | intergenic (‑132/+18) | tdcG‑II/gcvP‑I | L‑serine dehydratase/glycine dehydrogenase | |||||
ATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCA‑CC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/1126520‑1126676‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cccgcca‑ccTGGCTTGGGTGGCGGGCTCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACAGGGCTCAATGTCCACCCAACAACCTGGCAGGAGGTCCACATGTCACTGAGCGTC < NC_002947/1126683‑1126537 ATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCC > 1:987586/1‑150 TCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCC < 1:2081253/150‑1 TTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGC > 2:1441473/1‑150 GAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCA < 1:1104500/150‑1 AACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCA‑C > 1:1417606/1‑150 AACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCA‑C < 1:383271/150‑1 ATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCA‑CCTGGCTTGGGTGGCGGGCTCT < 1:157373/73‑1 ATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCA‑CCTGGCTTGGGTGGCGGGCTCT > 2:157373/1‑73 CCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGC‑CAGGTGGCGGGCTCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGC > 2:339643/1‑100 CCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGC‑CAGGTGGCGGGCTCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGC < 1:339643/100‑1 CCCGCCA‑CCTGGCTTGGGTGGCGGGCTCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACAGGGCTCAATGTCCACCCAACAACCTGGCAGGAGGTCCACATGTCACTG > 2:293726/1‑150 CCCGCCA‑CCTGGCTTGGGTGGCGGGCTCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACAGGGCTCAATGTCCA < 2:84936/116‑1 CCCGCCA‑CCTGGCTTGGGTGGCGGGCTCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACAGGGCTCAATGTCCA > 1:84936/1‑116 CCGCCA‑CCTGGCTTGGGTGGCGGGCTCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACAGGGCTCAATGTCCACCCAACAACCTGGCAGGAGGTCCACATGTCACTGA < 2:1609073/150‑1 CCGCCA‑CCTGGCTTGGGTGGCGGGCTCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACAGGGCTCAATGTCCACCCAACAACCTGGCAGGAGGTCCACATGTCACTGA > 1:1609073/1‑150 CCGCCA‑CCTGGCTTGGGTGGCGGGCTCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACAGGGCTCAATGTCCACCCAACAACCTGGCAGGAGGTCCACATGTCACTGA < 1:1595221/150‑1 CCGCCA‑CCTGGCTTGGGTGGCGGGCTCTGTGTAGGAGCGGGTGTACCCCCGAATGCGATGATGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACAGGGCTCAATGTCCACCCAACAACCTGGCAGGAGGTCCACATGTCACTGA > 2:336332/1‑150 CA‑CCTGGCTTGGGTGGCGGGCTCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGT < 2:387880/58‑1 CA‑CCTGGCTTGGGTGGCGGGCTCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGT > 1:387880/1‑58 A‑CCTGGCTTGGGTGGCGGGCTCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACAGGGCTCAATGTCCACCCAACAACCTGGCAGGAGGTCCACATGTCACTGAGCGTC < 1:293726/150‑1 A‑CCTGGCTTGGGTGGCGGGCTCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACAGGGCTCAATGTCCACCCAACAACCTGGCAGGAGGTCCACATGTCACTGAGCGTC > 1:2368511/1‑150 A‑CCTGGCTTGGGTGGCGGGCTCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACAGGGCTCAATGTCCACCCAACAACCTGGCAGGAGGTCCACATGTCACTGAGCGTC > 1:118291/1‑150 A‑CCTGGCTTGGGTGGCGGGCTCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACAGGGCTCAATGT < 2:1709113/107‑1 A‑CCTGGCTTGGGTGGCGGGCTCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACAGGGCTCAATGT > 1:1709113/1‑107 A‑CCTGGCTTGGGTGGCGGGCTCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGAGGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACAGGGCTCAATGTCCACCCAACAACCTGGCAGGAGGTCCACATGTCACTGAGCGTC > 1:673170/1‑150 ATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCA‑CC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/1126520‑1126676‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cccgcca‑ccTGGCTTGGGTGGCGGGCTCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACAGGGCTCAATGTCCACCCAACAACCTGGCAGGAGGTCCACATGTCACTGAGCGTC < NC_002947/1126683‑1126537 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |