| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 1126676 | 67 (0.760) | 4 (0.050) | 4/228 | NT | 5.8% | intergenic (‑125/+25) | tdcG‑II/gcvP‑I | L‑serine dehydratase/glycine dehydrogenase |
| ? | NC_002947 | = 1126683 | 67 (0.820) | intergenic (‑132/+18) | tdcG‑II/gcvP‑I | L‑serine dehydratase/glycine dehydrogenase | |||||
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GACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCTTCCACCAGGCTCGCCAGGGGGTATACCGCC > NC_002947/1126537‑1126830 | gACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCCTCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAggt > 1:673170‑M2/1‑147 (MQ=255)gACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAggt > 1:118291‑M2/1‑147 (MQ=255)gACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAggt > 1:2368511‑M2/1‑147 (MQ=255)gACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAggt < 1:293726‑M2/150‑4 (MQ=255) tCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCATCATCGCATTCGGGGGTACACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAggtggcgg > 2:336332‑M2/1‑142 (MQ=255) tCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAggtggcgg < 2:1609073‑M2/150‑9 (MQ=255) tCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAggtggcgg > 1:1609073‑M2/1‑142 (MQ=255) cAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAggtggcggg > 2:293726‑M2/1‑141 (MQ=255) aGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCgggg > 2:1498176/1‑150 (MQ=255) gTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGa > 1:616372/1‑150 (MQ=255) tgtgGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTa > 2:754507/1‑150 (MQ=255) tgGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATc < 1:975610/150‑1 (MQ=255) tgGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATc > 1:466900/1‑150 (MQ=255) aCCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAgg < 2:1744989/150‑1 (MQ=255) ctcctGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTATACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGTGGGGAGGGCTAt < 1:231567/144‑1 (MQ=255) ctcctGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGTGGGGAGGGCTAt > 2:231567/1‑144 (MQ=255) ctcctGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAAGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAgg > 1:1948779/1‑148 (MQ=255) tGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCt > 1:1843202/1‑150 (MQ=255) 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acccgcTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGcc > 1:763302‑M2/7‑150 (MQ=255) acccgcTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGcc > 2:1305084‑M2/7‑150 (MQ=255) cccgcTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCt > 1:15063‑M2/6‑150 (MQ=255) cTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCTTCCa < 2:763302‑M2/149‑1 (MQ=255) tCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCTTccac < 1:1769176/150‑1 (MQ=255) cTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑AGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCTTccacca < 2:1613008/150‑1 (MQ=255) tACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGtt > 2:201894/1‑108 (MQ=255) tACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGtt < 1:201894/108‑1 (MQ=255) caGAGCTCGCCACCCAGGCAAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCTTCCACCAGGCTc < 2:426099/150‑1 (MQ=255) agagCCCGCCACCCAAGCCAggtggcgggctctgtgtaggagcgggtttacccgcgaatgcgatggtggctat < 1:157373‑M2/73‑54 (MQ=255) agagCCCGCCACCCAAGCCAggtggcgggctctgtgtaggagcgggtttacccgcgaatgcgatggtggctat > 2:157373‑M2/1‑20 (MQ=255) agagCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACcggc > 2:850280/1‑122 (MQ=255) agagCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACcggc < 1:850280/122‑1 (MQ=255) agagCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCCCGATCAACGGGCAGGCGCACACTAGGTTGCGGTCGCCGAACACGCTGTAGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCCTCCACCAGGCCCg > 2:378379/1‑150 (MQ=255) cGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAac < 1:1592854/92‑1 (MQ=255) cGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAac > 2:1592854/1‑92 (MQ=255) cGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCTTCCACCAGGCTCGCCAggg < 1:417335/150‑1 (MQ=255) gCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCTTCCACCAGGCTCGCCAgggg > 2:2167891/1‑150 (MQ=255) aCCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAg < 2:1921492/61‑1 (MQ=255) aCCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCTTCCACCAGGCTCGCCAGCGGGta < 2:205168/150‑1 (MQ=255) ccAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCGATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGAGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCTTCCACCAGGCTCGCCAGGGGGtata > 1:55712/1‑150 (MQ=255) cAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCTTCCACCAGGCTCGCCAGGGGGTATAc > 2:2350188/1‑150 (MQ=255) aaGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCTTCCACCAGGCTCGCCAGGGGGTATAcc < 2:1378659/150‑1 (MQ=255) ccAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCTTCCACCAGGCTCGCCAGGGGGTATACCGcc > 1:2272460/1‑150 (MQ=255) | GACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGG‑CGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCTTCCACCAGGCTCGCCAGGGGGTATACCGCC > NC_002947/1126537‑1126830 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |