New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_002947 | = 1126683 | 67 (0.820) | intergenic (‑132/+18) | tdcG‑II/gcvP‑I | L‑serine dehydratase/glycine dehydrogenase |
Only 100 of 168 total aligned reads displayed.
CAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCA‑CCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCTTCCACCAGGCTCGCCAGGGGGTATA > NC_002947/1126528‑1126825 | cAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCA‑ccc < 1:1373113/150‑1 (MQ=255) gACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCCTCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCA‑CCCAAGCCAggt > 1:673170‑M2/1‑147 (MQ=255) gACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCA‑CCCAAGCCAggt > 1:118291‑M2/1‑147 (MQ=255) gACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCA‑CCCAAGCCAggt < 1:293726‑M2/150‑4 (MQ=255) gACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCA‑CCCAAGCCAggt > 1:2368511‑M2/1‑147 (MQ=255) tCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCATCATCGCATTCGGGGGTACACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCA‑CCCAAGCCAggtggcgg > 2:336332‑M2/1‑142 (MQ=255) tCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCA‑CCCAAGCCAggtggcgg > 1:1609073‑M2/1‑142 (MQ=255) cAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCA‑CCCAAGCCAggtggcggg > 2:293726‑M2/1‑141 (MQ=255) aGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCA‑CCCAAGCCAGGTGGCgggg > 2:1498176/1‑150 (MQ=255) gtgaattgtgGCCCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCA‑CCCAAGCCAGGTGGCGGGGa < 2:1868770/144‑1 (MQ=255) gTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCA‑CCCAAGCCAGGTGGCGGGGa > 1:616372/1‑150 (MQ=255) tgGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCA‑CCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATc > 1:466900/1‑150 (MQ=255) gACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCA‑CCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAg < 2:2217906/150‑1 (MQ=255) 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cccgcTCCTACACAGAGCCCGCCA‑CCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCt > 1:15063‑M2/6‑150 (MQ=255) cccGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCaagccaggtggcgggctctgtgtaggagcgggtttacccgcgaatgcgatggtggctatacctccgcattcgc > 2:339643‑M1/1‑27 (MQ=255) ccgcTCCTACACAGAGCCCGCCA‑CCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTAAACCCTGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCtt > 2:1507693‑M2/5‑150 (MQ=255) gcTCCTACACAGAGCCCGCCA‑CCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCTTcc < 2:1007017‑M2/148‑1 (MQ=255) cTCCTACACAGAGCCCGCCA‑CCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCTTCCa < 2:763302‑M2/149‑1 (MQ=255) cTACACAGAGCCCGCCA‑CCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGAGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCTTccacca < 2:1613008/150‑1 (MQ=255) tACACAGAGCCCGCCA‑CCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGtt > 2:201894/1‑108 (MQ=255) acaGAGCCCGCCA‑CCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATACCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCTTCCACCAGGCt > 1:1297589/1‑150 (MQ=255) agagCCCGCCA‑CCCAAGCCAggtggcgggctctgtgtaggagcgggtttacccgcgaatgcgatggtggctat < 1:157373‑M2/73‑54 (MQ=255) agagCCCGCCA‑CCCAAGCCAggtggcgggctctgtgtaggagcgggtttacccgcgaatgcgatggtggctat > 2:157373‑M2/1‑20 (MQ=255) agagCCCGCCA‑CCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACcggc > 2:850280/1‑122 (MQ=255) cccGCCA‑CCtggcttgggtggcgggctctgtgtaggagcgggtttacccgcgaatgcgatggtggctatacctccgcattcgcgggtaaacccgcgcctacagggctcaatgtccacccaacaacctggcaggaggtccacatgtcactg > 2:293726‑M1/1‑9 (MQ=255) cccGCCA‑CCtggcttgggtggcgggctctgtgtaggagcgggtttacccgcgaatgcgatggtggctatacctccgcattcgcgggtaaacccgcgcctacagggctcaatgtcca > 1:84936‑M1/1‑9 (MQ=255) ccGCCA‑CCtggcttgggtggcgggctctgtgtaggagcgggtttacccgcgaatgcgatggtggctatacctccgcattcgcgggtaaacccgcgcctacagggctcaatgtccacccaacaacctggcaggaggtccacatgtcactga < 1:1595221‑M1/150‑143 (MQ=255) ccGCCA‑CCtggcttgggtggcgggctctgtgtaggagcgggtttacccgcgaatgcgatggtggctatacctccgcattcgcgggtaaacccgcgcctacagggctcaatgtccacccaacaacctggcaggaggtccacatgtcactga > 1:1609073‑M1/1‑8 (MQ=255) ccGCCA‑CCtggcttgggtggcgggctctgtgtaggagcgggtttacccgcgaatgcgatggtggctatacctccgcattcgcgggtaaacccgcgcctacagggctcaatgtccacccaacaacctggcaggaggtccacatgtcactga < 2:1609073‑M1/150‑143 (MQ=255) cGCCA‑CCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCTTCCACCAGGCTCGCCAggg < 1:417335/150‑1 (MQ=255) gCCA‑CCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCTTCCACCAGGCTCGCCAgggg > 2:2167891/1‑150 (MQ=255) cA‑CCtggcttgggtggcgggctctgtgtaggagcgggtttacccgcgaatgcgatggt < 2:387880‑M1/58‑55 (MQ=255) cA‑CCtggcttgggtggcgggctctgtgtaggagcgggtttacccgcgaatgcgatggt > 1:387880‑M1/1‑4 (MQ=255) a‑CCtggcttgggtggcgggctctgtgtaggagcgggtttacccgcgaatgcgatggtggctatacctccgcattcgcgggtaaacccgcgcctacagggctcaatgtccacccaacaacctggcaggaggtccacatgtcactgagcgtc > 1:118291‑M1/1‑3 (MQ=255) a‑CCtggcttgggtggcgggctctgtgtaggagcgggtttacccgcgaatgcgatggtggctatacctccgcattcgcgggtaaacccgcgcctacagggctcaatgtccacccaacaacctggcaggaggtccacatgtcactgagcgtc > 1:2368511‑M1/1‑3 (MQ=255) a‑CCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAg < 2:1921492/61‑1 (MQ=255) a‑CCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCTTCCACCAGGCTCGCCAGGGGGta < 2:1810877/150‑1 (MQ=255) a‑CCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCTTCCACCAGGCTCGCCAGGGGGta > 2:1424002/1‑150 (MQ=255) | CAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCA‑CCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCTTCCACCAGGCTCGCCAGGGGGTATA > NC_002947/1126528‑1126825 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |