New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2942260 | 98 (1.110) | 11 (0.130) | 8/236 | NT | 10.4% | intergenic (‑18/‑1355) | PP_2575/PP_2577 | hypothetical protein/paraquat‑inducible protein B |
? | NC_002947 | = 2942265 | 96 (1.130) | intergenic (‑23/‑1350) | PP_2575/PP_2577 | hypothetical protein/paraquat‑inducible protein B |
GACGGTATTGCAATCGTTGATATCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/2942108‑2942260 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgggcTTTCCGCCCGGTGGAGGTGTGCCATGCGTACGTTCACGTGGAGTTACCTGTTGATGCTGCTGTGCGCAGCATCGGCCGCCCAGGCGCAGTCGGTGGTGCCGCTCAAGGGCCAGAGCAGCCAGCAGATGCAACTGGATATCAACGATTG < NC_002947/2942265‑2942118 GACGGTATTGCAATCGTTGATATCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCG > 2:1260398/1‑150 AATCGTTGATATCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCTTTCCGCC > 1:1562133/1‑150 GTTGATATCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCTTTCCGCCCGGT > 2:2215197/1‑150 GTTGATATCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCTTTCCGCCCGGT < 2:1562133/150‑1 GATATCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCTTTCCGCCCGGTGGA < 1:1478725/150‑1 GATATCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCTTTCCGCCCGGTGGA < 1:2215197/150‑1 TCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCTTTCCGCCCGGTGGA > 2:511420/1‑124 TCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCTTTCCGCCCGGTGGA < 1:511420/124‑1 AGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCTTTCCGCCCGGTGGA > 1:1830244/1‑71 AGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCTTTCCGCCCGGTGGA < 2:1830244/71‑1 GCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGGTGGAGGTGTGCCATGCGTACGTTCACGTGGAGTTACCTGTTGATGCTGCTGTGCGCAGCATCGGCCGCCCAGGCGCAGTCGGTGGTGCCGCTCAAGGGCCA < 2:159535/134‑1 GCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGGTGGAGGTGTGCCATGCGTACGTTCACGTGGAGTTACCTGTTGATGCTGCTGTGCGCAGCATCGGCCGCCCAGGCGCAGTCGGTGGTGCCGCTCAAGGGCCA > 1:159535/1‑134 CGGGCTTTCCGCCCGGTGGAGGTGTGCCATGCGTACGTTCACGTGGAGTTACCTGTTGATGCTGCTGTGCGCAGCATCGGCCGCCCAGGCGCAGTCGGTGGTGCCGCTCAAGGGCCAGAGCAGCCAGCAGATGCAACTGGATATCAACGA < 2:1170185/150‑1 CGGGCTTTCCGCCCGGTGGAGGTGTGCCATGCGTACGTTCACGTGGAGTTACCTGTTGATGCGCCTTCTCCTACTATCGGCCGCCCAGGCGCAGTCGGTGGTGCCGCTCAAGGGCCAGAGCAGCCAGCAGATGCAACTGGATATCAACGA < 1:1021327/150‑1 GGGCTTTCCGCCCGGTGGAGGTGTGCCATGCGTACGTTCACGTGGAGTTACCTGTTGATGCTGCTGTGCGCAGCATCGGCCGCCCAGGCGCAGTCGGTGGTGCCGCTCAAGGGCCAGAGCAGCCAGCAGATGCAACTGGATATCAACGAT > 1:681620/1‑150 GGGCTTTCCGCCCGGTGGAGGTGTGCCATGCGTACGTTCACGTGGAGTTACCTGTTGATGCTGCTGTGCGCAGCATCGGCCGCCCAGGCGCAGTCGG > 1:505272/1‑97 GGGCTTTCCGCCCGGTGGAGGTGTGCCATGCGTACGTTCACGTGGAGTTACCTGTTGATGCTGCTGTGCGCAGCATCGGCCGCCCAGGCGCAGTCGG > 1:242182/1‑97 GGGCTTTCCGCCCGGTGGAGGTGTGCCATGCGTACGTTCACGTGGAGTTACCTGTTGATGCTGCTGTGCGCAGCATCGGCCGCCCAGGCGCAGTCGG < 2:242182/97‑1 GGGCTTTCCGCCCGGTGGAGGTGTGCCATGCGTACGTTCACGTGGAGTTACCTGTTGATGCTGCTGTGCGCAGCATCGGCCGCCCAGGCGCAGTCGG < 2:505272/97‑1 GGCTTTCCGCCCGGTGTAGGTGTGCCATGCGTACGTTCACGTGGAGTTACCTTTTGATGCTGCTGTGCGCAGCATCGGCCGCCCAGGCGCAGTCGGTGGTGCCGCTCAAGGGCCAGAGCAGCCAGCAGATGCAACTGGATATCAACGATT < 1:976174/150‑1 GGCTTTCCGCCCGGTGGAGGTGTGCCATGCGTACGTTCACGTGGAGTTACCTGTTGATGCTGCTGTGCGCAGCATCGGCCGCCCAGGCGCAGTCGGTGGTGCCGCTCAAGGGCCAGAGCAGCCAGCAGATGCAACTGGATATCAACGATT > 1:1720791/1‑150 GCTTTCCGCCCGGTGGAGGTGTGCCATGCGTACGTTCACGTGGAGTTACCTGTTGATGCTGCTGTGCGCAGCATCGGCCGCCCAGGCGCAGTCGGTGGTGCCGCTCAAGGGCCAGAGCAGCCAGCAGATGCAACTGGATATCAACGATTG < 2:1185935/150‑1 GCTTTCCCCCCGGGGGAGGGGGGGCTTGCGTACGTTCACGTGGAGTTACCTGTTGATGGTGGTGTGCGCAGCATCGGGCGGCCAGGCGCAGTCGGTGGTGCCGCTCAAGGGCCAGAGCAGCCAGCAGATGCAACTGGATATCAACGATTG < 2:279475/150‑1 GACGGTATTGCAATCGTTGATATCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/2942108‑2942260 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgggcTTTCCGCCCGGTGGAGGTGTGCCATGCGTACGTTCACGTGGAGTTACCTGTTGATGCTGCTGTGCGCAGCATCGGCCGCCCAGGCGCAGTCGGTGGTGCCGCTCAAGGGCCAGAGCAGCCAGCAGATGCAACTGGATATCAACGATTG < NC_002947/2942265‑2942118 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |