New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2942260 | 98 (1.110) | 11 (0.130) | 8/236 | NT | 10.4% | intergenic (‑18/‑1355) | PP_2575/PP_2577 | hypothetical protein/paraquat‑inducible protein B |
? | NC_002947 | = 2942265 | 96 (1.130) | intergenic (‑23/‑1350) | PP_2575/PP_2577 | hypothetical protein/paraquat‑inducible protein B |
Only 100 of 128 total aligned reads displayed.
CAATCGTTGATATCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGATGGTCTACACCGGATATCAGACGCCGTTCCGATTGGCCTCTTGGCCTGATCCAAGGCTACCTGCGGGCAAACCATGAGCCAGACGCAAGATCT > NC_002947/2942118‑2942412 | cAATCGTTGATATCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAgc < 2:1185935‑M2/150‑3 (MQ=255) cAATCGTTGATATCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGCCGCCCGATGCTGCGCACACCACCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCAAGCCCCCCCTCCCCCGGGGGGAAAgc < 2:279475‑M2/150‑3 (MQ=255) aaTCGTTGATATCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAgcc > 1:1720791‑M2/1‑147 (MQ=255) aaTCGTTGATATCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAAAAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTACACCGGGCGGAAAgcc < 1:976174‑M2/150‑4 (MQ=255) tCGTTGATATCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATAGTAGGAGAAGGCGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAgcccg < 1:1021327‑M2/150‑6 (MQ=255) cGTTGATATCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGc < 1:721344/150‑1 (MQ=255) ttGATATCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGTCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCt > 1:1973711/1‑150 (MQ=255) atatCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTcac > 2:617698/1‑150 (MQ=255) atCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAg < 1:1410111/150‑1 (MQ=255) aGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATa < 1:2084801/150‑1 (MQ=255) ttGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGt < 2:1968256/150‑1 (MQ=255) cATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAACAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCg > 2:905848/1‑150 (MQ=255) aTCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGc > 1:480997/1‑150 (MQ=255) tCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGcc > 2:321868/1‑150 (MQ=255) ctgctgGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCt < 1:1185935/150‑1 (MQ=255) gctgctCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAgg > 1:1096362/1‑150 (MQ=255) tgctCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTc < 1:961674/150‑1 (MQ=255) ctctGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGt > 1:1513048/1‑150 (MQ=255) tctGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCttt < 1:1428455/141‑1 (MQ=255) tctGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCttt > 2:1428455/1‑141 (MQ=255) ctGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGa < 2:1096362/150‑1 (MQ=255) tGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCTTTCCgcccggtggaggtgtgccatgc > 1:159535‑M2/1‑112 (MQ=255) tGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGGCGTGAt > 1:509790/1‑150 (MQ=255) ccTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGaa > 1:1082940/1‑150 (MQ=255) ttGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAg > 2:1288522/1‑136 (MQ=255) ttGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAg < 1:1288522/136‑1 (MQ=255) ttGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCAAAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAAAGTACGCATGACACACCCCCACCGGGCTGAAATCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAgg > 2:274381/1‑149 (MQ=255) gAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGttt > 2:1371417/1‑150 (MQ=255) gCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTg < 2:112942/150‑1 (MQ=255) caccacCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCa < 2:2103661/150‑1 (MQ=255) caccGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAg < 1:2361130/108‑1 (MQ=255) caccGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAg > 2:2361130/1‑108 (MQ=255) caccGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTc < 1:2235332/128‑1 (MQ=255) caccGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTc > 2:2235332/1‑128 (MQ=255) caccGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGAt > 2:2369549/1‑150 (MQ=255) caccGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGAt > 2:1066546/1‑150 (MQ=255) accGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCGCGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGATg > 1:1501691/1‑150 (MQ=255) ccGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAgccc > 1:505272‑M2/1‑93 (MQ=255) ccGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAgccc > 1:242182‑M2/1‑93 (MQ=255) cGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTc > 2:2292825/1‑113 (MQ=255) cGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTc < 1:2292825/113‑1 (MQ=255) cGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGATGGt < 2:1082940/150‑1 (MQ=255) cGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGATGGt < 1:1260398/150‑1 (MQ=255) aCTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGATGGTCt > 2:1696867/1‑150 (MQ=255) tGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGATGGTCTACACCGGa > 1:1996604/1‑150 (MQ=255) gcggcCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGATGGTCTACACCGGatat < 1:617698/150‑1 (MQ=255) cggcCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCACAGACTGTCTACACCTGATATc < 2:2395761/150‑1 (MQ=255) cGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGATGGTCTACACCGGATATCAGAc < 1:321868/150‑1 (MQ=255) aTGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGATGGTCTACACCGGATATCAGACGc < 1:602672/150‑1 (MQ=255) tgcGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGATGGTCTACACCGGATATCAGACGCCGtt > 1:423054/1‑150 (MQ=255) tgcgcagcaTCAACCGGTAAGTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGATGGTCTACACCGGATATCAGACGCCGTTCCgct > 2:1792872/4‑148 (MQ=255) acaGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGCCGCCTCGCCTCTGAGGTCGTGATGAAAGTTTTCACCATCTGGTCTCCACCGCCTATCAGACGCCCGTCCGAt > 1:2223065/1‑150 (MQ=255) acaGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGATGGTCTACACCGGa < 2:2218786/131‑1 (MQ=255) cagcaTCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGATGGTCTACACCGGATATCAGACGCCGTTCCGATTGGc < 2:1501691/150‑1 (MQ=255) caTCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGATGGTCTACACCGGATATCAGACGCCGTTCCGATTGGCctc < 1:1524641/150‑1 (MQ=255) tCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGATGGt > 1:2257724/1‑112 (MQ=255) tCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGATGGt < 2:2257724/112‑1 (MQ=255) tCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGATGGTCTACACCGGATATCAGACGCCGTTCCGATTGGCCTCtt > 2:2102796/1‑150 (MQ=255) aCAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGATGGTCTACACCGGATATCAGACGCCGTTCCGATTGGCCTCTTGGc > 2:1057867/1‑150 (MQ=255) gTACCTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGATGGTCTACACCGGATATCAGACGCCGTTCCGATTGGCCTCTTGGCCTGa < 1:816385/150‑1 (MQ=255) gTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGaaa > 1:1984572/1‑47 (MQ=255) gTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGaaa < 2:1984572/47‑1 (MQ=255) gTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGATGGTCTACACCGGATATCAGACGCCGTTCCGATTGGCCTCTTGGCCTGa > 2:1905082/1‑150 (MQ=255) tAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGATGGTCTACACCGGATATCAGACGCCGTTCCGATTGGCCTCTTGGCCTGAt < 2:480997/150‑1 (MQ=255) ccACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTTATGGAAGTTTTGCCCAGATGGTCTACACCGGATATCAGACGCCGTTCCGATTGGCCTCTTGGCCTGATCCAAg > 1:773478/1‑150 (MQ=255) ccACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGATGGTCTACACCGGATATCAGACGCCGTTCCGATTGGCCTCTTGGCCTGATCCAAg > 2:2027301/1‑150 (MQ=255) cACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGATGGTCTACACCGGATATCAGACGCCGTTCCGATTGGCCTCTTGTCCTGATCCAAgg > 1:726071/1‑150 (MQ=255) cACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGATGGTCTACACCGGATATCAGACGCCGTTCCGATTGGCCTCTTGGCCTGATCCAAgg < 2:423054/150‑1 (MQ=255) gAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATg < 2:1166320/74‑1 (MQ=255) aaCGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGATGGTCTACACCGGATATCAGACGCCGTTc > 1:2207034/1‑117 (MQ=255) aaCGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGATGGTCTACACCGGATATCAGACGCCGTTc < 2:2207034/117‑1 (MQ=255) cGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGATGGTCTACACCGGATATCAGACGCCGTTCCGATTGGCCTCTTGGCCTGATCCAAGGCTACCTGc < 1:274381/150‑1 (MQ=255) gTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGa > 1:1080091/1‑85 (MQ=255) gTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGATGGTCTACACCGGATATCAGAc > 1:741950/1‑107 (MQ=255) aTGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGATGGTCTACACCGGATATCAGACGCCGTTCCGATTGGCCTCTTGGCCTGATCCAAGGCTACCTGCGGGCaaa > 2:920670/1‑150 (MQ=255) aTGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGATGGTCTACACCGGATATCAGACGCCGTTCCGATTGGCCTCTTGGCCTGATCCAAGGCTACCTGCGGGCaaa < 1:1170185/150‑1 (MQ=255) aTGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGATGGTCTACACCGGATATCAGACGCCGTTCCGATTGGCCTCTTGGCCTGATCCAAGGCTACCTGCGGGCaaa < 2:736361/150‑1 (MQ=255) gCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGATGGTCTACACCGGATATCAGACGCCGTTCCGATTGGCCTCTTGGCCTGATCCAAGGCTACCTGCGGGCAAACCa > 1:1473394/1‑150 (MQ=255) gCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGATGGTCTACACCGGATATCAGACGCCGTTCCGATTGGCCTCTTGGCCTGATCCAAGGCTACCTGCGGGCAAACCa < 1:1792872/150‑1 (MQ=255) cacaCCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGATGGTCTACACCGGATATCAGACGCCGTTCCGATTGGCCTCTTGGCCTGATCCAAGGCTACCTGCGGGCAAACCAt < 1:2344892/150‑1 (MQ=255) acacCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGATGGTCTACACCGGat < 2:869320/89‑1 (MQ=255) acacCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGATGGTCTACACCGGat > 1:869320/1‑89 (MQ=255) acacCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGATGGTCTACACCGGATATCAGACGCCGTTCCGATTGGCCTCTTGGCCTGATCCAAGGCTACCTGCGGGCAAACCATg < 1:905848/150‑1 (MQ=255) acacCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGATGGTCTACACCGGATATCAGACGCCGTTCCGATTGGCCTCTTGGCCTGATCCAAGGCTACCTGCGGGCAAACCATg < 2:1513048/150‑1 (MQ=255) cacCGCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGTATAGTTCGCCTTTGATGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGATGGTCTACTCCGGATATCAGACGCCGTTCCGATTGGCCTCTTGGCCTGATCCAAGGCTTCCTGCGGGCAAACCATGa < 2:188186/150‑1 (MQ=255) tCCACCGGGCGGAAAgcccggtggaggtgtgccatgcgtacgttcacgtggagttacctgttgatgctgctgtgcgcagcatcggccgcccaggcgcagtcggtggtgccgctcaagggccagagcagccagcagatgcaactggatatc < 1:2215197‑M2/150‑136 (MQ=255) tCCACCGGGCGGAAAgcccggtggaggtgtgccatgcgtacgttcacgtggagttacctgttgatgctgctgtgcgcagcatcggccgcccaggcgcagtcggtggtgccgctcaagggccaga > 2:511420‑M2/1‑15 (MQ=255) tCCACCGGGCGGAAAgcccggtggaggtgtgccatgcgtacgttcacgtggagttacctgttgatgctgct > 1:1830244‑M2/1‑15 (MQ=255) tCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGATGGTCTACACCGGATATCAGACGCCGTTCCGATTGGCCTCTTGGc < 1:325591/114‑1 (MQ=255) tCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGATGGTCTACACCGGATATCAGACGCCGTTCCGATTGGCCTCTTGGc > 2:325591/1‑114 (MQ=255) tCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGATGGTCTACACCGGATATCAGACGCCGTTCCGATTGGCCTCTTGGCCTGATCCa < 2:2338011/122‑1 (MQ=255) tCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGATGGTCTACACCGGATATCAGACGCCGTTCCGATTGGCCTCTTGGCCTGATCCAAGGCTACCTGCGGGCAAACCATGAGCCa > 2:2222765/1‑150 (MQ=255) aCCGGGCGGAAAgcccggtggaggtgtgccatgcgtacgttcacgtggagttacctgttgatgctgctgtgcgcagcatcggccgcccaggcgcagtcggtggtgccgctcaagggccagagcagccagcagatgcaactggatatcaac > 2:2215197‑M2/1‑12 (MQ=255) aCCGGGCGGAAAgcccggtggaggtgtgccatgcgtacgttcacgtggagttacctgttgatgctgctgtgcgcagcatcggccgcccaggcgcagtcggtggtgccgctcaagggccagagcagccagcagatgcaactggatatcaac < 2:1562133‑M2/150‑139 (MQ=255) aCCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGATGGTCTACACCGGATATCAGACGCCGTTCCGATTGGCCTCTTGGCCTGATCCAAGGCTACCTGCGGGCAAACCATGAGCCAGAc > 2:496038/1‑150 (MQ=255) ggCGGAAAgcccggtggaggtgtgccatgcgtacgttcacgtggagttacctgttgatgctgctgtgcgcagcatcggccgcccaggcgcagtcggtggtgccgctcaagggccagagcagccagcagatgcaactggatatcaacgatt > 1:1562133‑M2/1‑8 (MQ=255) ggAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGATGGTCTACACCGGATATCAGACGCCGTTCCGa < 2:1801357/91‑1 (MQ=255) ggAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGATGGTCTACACCGGATATCAGACGCCGTTCCGATTGGCCTCTTGGCCTGATCCAAGGCTACCTGCGGGCAAACCATGAGCCAGACGCAAGAt > 1:35743/1‑150 (MQ=255) gAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGATGGTCTACACCGGATATCAGACGCCGTTCCGATTGGCCTCTTg > 2:604339/1‑101 (MQ=255) gAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGATGGTCTACACCGGATATCAGACGCCGTTCCGATTGGCCTCTTg < 1:604339/101‑1 (MQ=255) | CAATCGTTGATATCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGATGGTCTACACCGGATATCAGACGCCGTTCCGATTGGCCTCTTGGCCTGATCCAAGGCTACCTGCGGGCAAACCATGAGCCAGACGCAAGATCT > NC_002947/2942118‑2942412 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |