| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 2942260 | 98 (1.110) | 11 (0.130) | 8/236 | NT | 10.4% | intergenic (‑18/‑1355) | PP_2575/PP_2577 | hypothetical protein/paraquat‑inducible protein B |
| ? | NC_002947 | = 2942265 | 96 (1.130) | intergenic (‑23/‑1350) | PP_2575/PP_2577 | hypothetical protein/paraquat‑inducible protein B | |||||
Only 100 of 145 total aligned reads displayed.
TTGCAATCGTTGATATCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGATGGTCTACACCGGATATCAGACGCCGTTCCGATTGGCCTCTTGGCCTGATCCAAGGCTACCTGCGGGCAAACCATGAGCCAGACGCAA > NC_002947/2942115‑2942407 | cAATCGTTGATATCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAgc < 2:1185935‑M2/150‑3 (MQ=255) cAATCGTTGATATCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGCCGCCCGATGCTGCGCACACCACCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCAAGCCCCCCCTCCCCCGGGGGGAAAgc < 2:279475‑M2/150‑3 (MQ=255) aaTCGTTGATATCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAAAAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTACACCGGGCGGAAAgcc < 1:976174‑M2/150‑4 (MQ=255) aTCGTTGATATCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAgccc > 1:681620‑M2/1‑146 (MQ=255) tCGTTGATATCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAgcccg < 2:1170185‑M2/150‑6 (MQ=255) tCGTTGATATCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATAGTAGGAGAAGGCGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAgcccg < 1:1021327‑M2/150‑6 (MQ=255) cGTTGATATCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGc < 1:721344/150‑1 (MQ=255) gTTGATATCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCtttccgcccggt < 2:1562133‑M1/150‑13 (MQ=255) ttGATATCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGTCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCt > 1:1973711/1‑150 (MQ=255) gATATCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCtttccgcccggtgga < 1:1478725‑M1/150‑16 (MQ=255) atatCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTcac > 2:617698/1‑150 (MQ=255) atCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAg < 1:1410111/150‑1 (MQ=255) aGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATa < 1:2084801/150‑1 (MQ=255) aGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATa < 1:156351/150‑1 (MQ=255) ttGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGt < 2:1968256/150‑1 (MQ=255) cATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAACAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCg > 2:905848/1‑150 (MQ=255) aTCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGc > 1:480997/1‑150 (MQ=255) tCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGcc > 2:321868/1‑150 (MQ=255) 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tctGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCttt > 2:1428455/1‑141 (MQ=255) ctGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGa < 2:1096362/150‑1 (MQ=255) tGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCTTTCCgcccggtggaggtgtgccatgc > 1:159535‑M2/1‑112 (MQ=255) tGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCTTTCCgcccggtggaggtgtgccatgc < 2:159535‑M2/134‑23 (MQ=255) tGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGGCGTGAt > 1:509790/1‑150 (MQ=255) 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< 2:2218786/131‑1 (MQ=255) agcagcATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCtttccgcccggtgga > 1:1830244‑M1/1‑56 (MQ=255) agcagcATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCtttccgcccggtgga < 2:1830244‑M1/71‑16 (MQ=255) cagcaTCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGATGGTCTACACCGGATATCAGACGCCGTTCCGATTGGc < 2:1501691/150‑1 (MQ=255) caTCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGATGGTCTACACCGGATATCAGACGCCGTTCCGATTGGCctc < 1:1524641/150‑1 (MQ=255) tCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGATGGt > 1:2257724/1‑112 (MQ=255) tCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGATGGTCTACACCGGATATCAGACGCCGTTCCGATTGGCCTCtt > 2:2102796/1‑150 (MQ=255) 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2:736361/150‑1 (MQ=255) aTGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGATGGTCTACACCGGATATCAGACGCCGTTCCGATTGGCCTCTTGGCCTGATCCAAGGCTACCTGCGGGCaaa > 2:920670/1‑150 (MQ=255) gCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGATGGTCTACACCGGATATCAGACGCCGTTCCGATTGGCCTCTTGGCCTGATCCAAGGCTACCTGCGGGCAAACCa > 1:1473394/1‑150 (MQ=255) gCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGATGGTCTACACCGGATATCAGACGCCGTTCCGATTGGCCTCTTGGCCTGATCCAAGGCTACCTGCGGGCAAACCa < 1:1792872/150‑1 (MQ=255) cacaCCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGATGGTCTACACCGGATATCAGACGCCGTTCCGATTGGCCTCTTGGCCTGATCCAAGGCTACCTGCGGGCAAACCAt < 1:2344892/150‑1 (MQ=255) acacCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGATGGTCTACACCGGat > 1:869320/1‑89 (MQ=255) cacCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGATGGTCTACACCGGATATCAGACGCCGTTCCGATTGGCCTCTTGGCCTGATCCAAGGCTACCTGCGGGCAAACCATGa < 2:1404938/150‑1 (MQ=255) tCCACCGGGCGGAAAgcccggtggaggtgtgccatgcgtacgttcacgtggagttacctgttgatgctgctgtgcgcagcatcggccgcccaggcgcagtcggtggtgccgctcaagggccagagcagccagcagatgcaactggatatc < 1:1478725‑M2/150‑136 (MQ=255) tCCACCGGGCGGAAAgcccggtggaggtgtgccatgcgtacgttcacgtggagttacctgttgatgctgctgtgcgcagcatcggccgcccaggcgcagtcggtggtgccgctcaagggccagagcagccagcagatgcaactggatatc < 1:2215197‑M2/150‑136 (MQ=255) tCCACCGGGCGGAAAgcccggtggaggtgtgccatgcgtacgttcacgtggagttacctgttgatgctgctgtgcgcagcatcggccgcccaggcgcagtcggtggtgccgctcaagggccaga > 2:511420‑M2/1‑15 (MQ=255) tCCACCGGGCGGAAAgcccggtggaggtgtgccatgcgtacgttcacgtggagttacctgttgatgctgctgtgcgcagcatcggccgcccaggcgcagtcggtggtgccgctcaagggccaga < 1:511420‑M2/124‑110 (MQ=255) tCCACCGGGCGGAAAgcccggtggaggtgtgccatgcgtacgttcacgtggagttacctgttgatgctgct < 2:1830244‑M2/71‑57 (MQ=255) tCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGATGGTCTACACCGGATATCAGACGCCGTTCCGATTGGCCTCTTGGc < 1:325591/114‑1 (MQ=255) tCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGATGGTCTACACCGGATATCAGACGCCGTTCCGATTGGCCTCTTGGCCTGATCCa < 2:2338011/122‑1 (MQ=255) tCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGATGGTCTACACCGGATATCAGACGCCGTTCCGATTGGCCTCTTGGACTGATCCa > 1:2338011/1‑122 (MQ=255) aCCGGGCGGAAAgcccggtggaggtgtgccatgcgtacgttcacgtggagttacctgttgatgctgctgtgcgcagcatcggccgcccaggcgcagtcggtggtgccgctcaagggccagagcagccagcagatgcaactggatatcaac > 2:2215197‑M2/1‑12 (MQ=255) aCCGGGCGGAAAgcccggtggaggtgtgccatgcgtacgttcacgtggagttacctgttgatgctgctgtgcgcagcatcggccgcccaggcgcagtcggtggtgccgctcaagggccagagcagccagcagatgcaactggatatcaac < 2:1562133‑M2/150‑139 (MQ=255) aCCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTTGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGATGGTCTACACCGGATATCAGACGCCGTTCCGATTGGCCTCTTGGCCTGATCCAAGGCTACCTGCGGGCAAACCATGAGCCAGAc < 2:2223065/150‑1 (MQ=255) cGGGCtttccgcccggtggaggtgtgccatgcgtacgttcacgtggagttacctgttgatgctgctgtgcgcagcatcggccgcccaggcgcagtcggtggtgccgctcaagggccagagcagccagcagatgcaactggatatcaacga < 2:1170185‑M1/150‑146 (MQ=255) cGGGCtttccgcccggtggaggtgtgccatgcgtacgttcacgtggagttacctgttgatgcgccttctcctactatcggccgcccaggcgcagtcggtggtgccgctcaagggccagagcagccagcagatgcaactggatatcaacga < 1:1021327‑M1/150‑146 (MQ=255) gggCtttccgcccggtggaggtgtgccatgcgtacgttcacgtggagttacctgttgatgctgctgtgcgcagcatcggccgcccaggcgcagtcgg < 2:505272‑M1/97‑94 (MQ=255) ggCtttccgcccggtgtaggtgtgccatgcgtacgttcacgtggagttaccttttgatgctgctgtgcgcagcatcggccgcccaggcgcagtcggtggtgccgctcaagggccagagcagccagcagatgcaactggatatcaacgatt < 1:976174‑M1/150‑148 (MQ=255) ggCtttccgcccggtggaggtgtgccatgcgtacgttcacgtggagttacctgttgatgctgctgtgcgcagcatcggccgcccaggcgcagtcggtggtgccgctcaagggccagagcagccagcagatgcaactggatatcaacgatt > 1:1720791‑M1/1‑3 (MQ=255) ggCGGAAAgcccggtggaggtgtgccatgcgtacgttcacgtggagttacctgttgatgctgctgtgcgcagcatcggccgcccaggcgcagtcggtggtgccgctcaagggccagagcagccagcagatgcaactggatatcaacgatt > 1:1562133‑M2/1‑8 (MQ=255) | TTGCAATCGTTGATATCCAGTTGCATCTGCTGGCTGCTCTGGCCCTTGAGCGGCACCACCGACTGCGCCTGGGCGGCCGATGCTGCGCACAGCAGCATCAACAGGTAACTCCACGTGAACGTACGCATGGCACACCTCCACCGGGCGGAAAGCCCGCCTCACAGGATAGTTCGCCTTTGAGGTCGTGATGGAAGTTTTGCCCAGATGGTCTACACCGGATATCAGACGCCGTTCCGATTGGCCTCTTGGCCTGATCCAAGGCTACCTGCGGGCAAACCATGAGCCAGACGCAA > NC_002947/2942115‑2942407 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |