| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 4032872 | 77 (0.870) | 5 (0.060) | 5/234 | NT | 5.8% | coding (466/1008 nt) | PP_3555 | transmembrane sensor |
| ? | NC_002947 | = 4032894 | 88 (1.050) | coding (488/1008 nt) | PP_3555 | transmembrane sensor | |||||
CGGCTGGATGGGGTGGGAACAGGGCTGGTTGCCCAACCACTATCAGCACTTCGAAGCCGGTGACCGCATGCAGACCGTGGAGCTCAGCGACGGCAGCACGGTACAGCTCAACCTCCACACCGAACTCACCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/4032718‑4032872‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aacgccTCGCCGCGCTTGAGCGTGACCTGGCGTTGGTCCTTGTAGTTGAGGAAGGTGAGTTCGGTGTGGAGGTTGAGCTGTACCGTGCTGCCGTCGCTGAGCTCCACGGTCTGCATGCGGTCACCGGCTTCGAAGTGCTGATAGTGGTTGGGCAA < NC_002947/4032894‑4032746 CGGCTGGATGGGGTGGGAACAGGGCTGGTTGCCCAACCACTATCAGCACTTCGAAGCCGGTGACCGCATGCAGACCGCCGGAATGAGCGACGGCAGCACGGTACGGCTCAACCTCCACACCGAACTCACCTTCCTCAACTACAAGGACCA > 1:1852438/1‑150 GGCTGGATGGGGTGGGAACAGGGCTGGTTGCCCAACCACTATCAGCACTTCGAAGCCGGTGACCGCATGCAGACCGTGGAGCTCAGCGACGGCAGCACGGTACAGCTCAACCTCCACACCGAACTCACCTTCCTCAACTACAAGGACCAA < 2:1564988/150‑1 GGCTGGATGGGGTGGGAACAGGGCTGGTTGCCCAACCACTATCAGCACTTCGAAGCCGGTGACCGCATGCAGACCGTGGAGCTCAGCGACGGCAGCACGGTACAGCTCAACCTCCACACCGAACCCACCTTCCTCAACTACAAGGACCAA < 2:69722/150‑1 GCTGGATGGGGTGGGAACAGGGCTGGTTGCCCAACCACTATCAGCACTTCGAAGCCGGTGACCGCATGCAGACCGTGGAGCTCAGCGACGGCAGCACGGTACAGCTCAACCTCCACACCGAACTCACCTTCCTCAACTACAAGGACCAAC > 2:1052022/1‑150 CCCAACCACTATCAGCACTTCGAAGCCGGTGACCGCATGCAGACCGTGGAGCTAAGCGACGGCAGCACGGTACAGCTCAACCTCCACACCGAACTCACCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCTCGCCGCGCTTGAGCGTGACCTGGCG < 1:273831/150‑1 GCAGCACGGTACAGCTCAACCTCCACACCGAACTCACCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCTCGCCGCGCTTGAGCGTGACCTGGCGT > 2:797466/1‑90 GCAGCACGGTACAGCTCAACCTCCACACCGAACTCACCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCTCGCCGCGCTTGAGCGTGACCTGGCGT < 1:797466/90‑1 AACCTCCACACCGAACTCACCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCTCGCCGCGCTTGAGCGTGACCTGGCGTTG > 1:1867731/1‑75 AACCTCCACACCGAACTCACCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCTCGCCGCGCTTGAGCGTGACCTGGCGTTG < 2:1867731/75‑1 AACGCCTCGCCGCGCTTGAGCGTGACCTGGCGTTGGTCCTTGTAGTTGAGGAAGGTGAGTTCGGTGTGGAGGTTGAGCTGTACCGTGCTGCCGTCGCTGAGCTCCACGGTCTGCATGCGGTCACCGGCTTCGAAGTGCTGATAGTGGTTG < 1:531399/150‑1 ACGCCTCGCCGCGCTTGAGCGTGACCTGGCGTTGGTCCTTGTAGTTGAGGAAGGTGAGTTCGGTGTGGAGGTTGAGCTGTACCGTGCTGCCGTCGCTGAGCTCCACGGTCTGCATGCGGTCACCGGCTTCGAAGTGCTGATAGTGGTTGG < 1:167903/150‑1 ACGCCTCGCCGCGCTTGAGCGTGACCTGGCGTTGGTCCTTGTAGTTGAGGAAGGTGAGTTCGGTGTGGAGGTTGAGCTGTACCGTGCTGCCGTCGCTGAGCTCCACGGTCTGCATGCGGTCACCGGCTTCGAAGTGCTGATAGTGGTTGG < 1:414421/150‑1 ACGCCTCGCCGCGCTTGAGCGTGACCTGGCGTTGGTCCTTGTAGTTGAGGAAGGTGAGTTCGGTGTGGAGGTTGAGCTGTACCGTGCTGCCGTCGCTGAGCTCCACGGTCTGCATGCGGTCACCGGCTTCGAAGTGCTGATAGTGGTTGG > 1:225500/1‑150 ACGCCTCGCCGCGCTTGAGCGTGACCTGGCGTTGGTCCTTGTAGTTGAGGAAGGTGAGTTCGGTGTGGAGGTTGAGCTGTACCGTGCTGCCGTCGCTGAGCTCCACGGTCTGCATGCGGTCACCGGCTTCGAAGTGCTGATAGTGGTTGG < 1:1543344/150‑1 CGCCTCGCCGCGCTTGAGCGTGACCTGGCGTTGGTCCTTGTAGTTGAGGAAGGTGAGTTCGGTGTGGAGGTTGAGCTGTACCGTGCTGCCGTCGCTGAGCTCCACGGTCTGCATGCGGTCACCGGCTTCGAAGTGCTGATAGTGGTTGGG < 2:1825107/150‑1 CGCCTCGCCGCGCTTGAGCGTGACCTGGCGTTGGTCCTTGTAGTTGAG > 2:17052/1‑48 CGCCTCGCCGCGCTTGAGCGTGACCTGGCGTTGGTCCTTGTAGTTGAG < 1:17052/48‑1 CCTCGCCGCGCTTGAGCGTGACCTGGCGTTGGTCCTTGTAGTTGAGGAAGGTGAGTTCGGTGTGGAGGTTGAGCTGTACCGTGCTGCCGTCGCTGAGCTCCACGGTCTGCATGCGGTCACCGGCTTCGAAGTGCTGATAGTGGTTGGGCA > 2:965280/1‑150 CTCGCCGCGCTTGAGCGTGACCTGGCGTTGGTCCTTGTAGTTGAGGAAGGAAATTTCGGTGTGGAGGTTGAGCTGTACCGTGCTGCCGTCGCTGAGCTCCACGGTCTGCATGCGGTCACCGGCTTCGAAGTGCTGATAGTGGTTGGGCAA > 1:1978988/1‑150 CTCGCCGCGCTTGAGCGTGACCTGGCGTTGGTCCTTGTAGCTGAGGAAGGTGAGTTCGGCGTGGGGGTTGAGCTGTACAGTGCTGCCGTGGCTCAGCTCCGCTGTTTGTATGTGGTCACCGGCTTCGACGTGCTGATAGTGGTTGGGCAA > 2:1476732/1‑150 CGGCTGGATGGGGTGGGAACAGGGCTGGTTGCCCAACCACTATCAGCACTTCGAAGCCGGTGACCGCATGCAGACCGTGGAGCTCAGCGACGGCAGCACGGTACAGCTCAACCTCCACACCGAACTCACCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/4032718‑4032872‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aacgccTCGCCGCGCTTGAGCGTGACCTGGCGTTGGTCCTTGTAGTTGAGGAAGGTGAGTTCGGTGTGGAGGTTGAGCTGTACCGTGCTGCCGTCGCTGAGCTCCACGGTCTGCATGCGGTCACCGGCTTCGAAGTGCTGATAGTGGTTGGGCAA < NC_002947/4032894‑4032746 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |