| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_002947 | = 4032894 | 88 (1.050) | coding (488/1008 nt) | PP_3555 | transmembrane sensor | |||||
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
ATGGGGTGGGAACAGGGCTGGTTGCCCAACCACTATCAGCACTTCGAAGCCGGTGACCGCATGCAGACCGTGGAGCTCAGCGACGGCAGCACGGTACAGCTCAACCTCCACACCGAACTCACCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAGGCGTTCTTCAAGGTGCGACACGACAGCAGCCACCCGTTCATCGTGCGTGCCGGCAGTGGCCAGACCCGGGTCACCGGCACCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTG > NC_002947/4032725‑4033021 | aTGGGGTGGGAACAGGGCTGGTTGCCCAACCACTATCAGCACTTCGAAGTCGGTGACCGCATGCAGACCGTGGAGCTCAGCGACGGCAGCACGGTACAGCTCAACCTCCACACCGAACTCACCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCAg < 2:1551513/150‑1 (MQ=255)aTGGGGTGGGAACAGGGCTGGTTGCCCAACCACTATCAGCACTTCGAAGCCGGTGACCGCATGCAGACCGTGGAGCTCAGCGACGGCAGCACGGTACAGCTCAACCTCCACACCGAACTCACCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCAg < 2:1300113/150‑1 (MQ=255)aTGGGGTGGGAACAGGGCTGGTTGCCCAACCACTATCAGCACTTCGAACATAGTGACCGCATGCAGACCGTGGAGCTCAGCGACGGCAGCACGGTACAGCTCAACCTCCACACCGAACTCACCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCAg < 1:2331771/150‑1 (MQ=255) gggAACAGGGCTGGTTGCCCAACCACTATCAGCACTTCGAAGCCGGTGACCGCATGCAGACCGTGGAGCTCAGCGACGGCAGCACGGTACAGCTCAACCTCCACACCGAACTCACCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCAgg < 2:1758014/144‑1 (MQ=255) gggAACAGGGCTGGTTGCCCAACCACTATCAGCACTTCGAAGCCGGTGACCGCATGCAGACCGTGGAGCTCAGCGACGGCAGCACGGTACAGCTCAACCTCCACACCGAACTCACCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCAgg > 1:1758014/1‑144 (MQ=255) tGGTTGCCCAACCACTATCAGCACTTCGAAGCCGGTGACCGCATGCAGACCGTGGAGCTCAGCGACGGCAGCACGGTACAGCTCAACCTCCACACCGAACTCACCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCAGGTCACGCTCAAGCgcggc > 2:2140981/1‑150 (MQ=255) gTTGCCCAACCACTATCAGCACTTCGAAGCCGGTGACCGCATGCAGACCGTGGAGCTCAGCGACGGCAGCACGGTACAGCTCAACCTCCACACCGAACTCACCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGa < 2:1035894/150‑1 (MQ=255) ttGCCCAACCACTATCAGCACGTCGAAGCCGGTGACCACATACAAACAGCGGAGCTGAGCCACGGCAGCACTGTACAGCTCAACCCCCACGCCGAACTCACCTTCCTCAGCTACAAGGACCAACGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAg > 2:1476732‑M2/1‑149 (MQ=255) cccAACCACTATCAGCACTTCGAAGCCGGTGACCGCATGCAGACCGTGGAGCTCAGCGACGGCAGCACGGTACAGCTCAACCTCCACACCGAACTCACCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAggcg < 2:1825107‑M2/150‑5 (MQ=255) cccAACCACTATCAGCACTTCGAAGCCGGTGACCGCATGCAGACCGTGGAGCTAAGCGACGGCAGCACGGTACAGCTCAACCTCCACACCGAACTCACCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCtcgccgcgcttgagcgtgacctggcg < 1:273831‑M1/150‑27 (MQ=255) ccAACCACTATCAGCACTTCGAAGCCGGTGACCGCATGCAGACCGTGGAGCTCAGCGACGGCAGCACGGTACAGCTCAACCTCCACACCGAACTCACCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAggcgt > 1:225500‑M2/1‑145 (MQ=255) ccAACCACTATCAGCACTTCGAAGCCGGTGACCGCATGCAGACCGTGGAGCTCAGCGACGGCAGCACGGTACAGCTCAACCTCCACACCGAACTCACCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAggcgt < 1:1543344‑M2/150‑6 (MQ=255) ccAACCACTATCAGCACTTCGAAGCCGGTGACCGCATGCAGACCGTGGAGCTCAGCGACGGCAGCACGGTACAGCTCAACCTCCACACCGAACTCACCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAggcgt < 1:167903‑M2/150‑6 (MQ=255) 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aCGCCtcgccgcgcttgagcgtgacctggcgttggtccttgtagttgaggaaggtgagttcggtgtggaggttgagctgtaccgtgctgccgtcgctgagctccacggtctgcatgcggtcaccggcttcgaagtgctgatagtggttgg > 1:225500‑M1/1‑5 (MQ=255) aCGCCtcgccgcgcttgagcgtgacctggcgttggtccttgtagttgaggaaggtgagttcggtgtggaggttgagctgtaccgtgctgccgtcgctgagctccacggtctgcatgcggtcaccggcttcgaagtgctgatagtggttgg < 1:167903‑M1/150‑146 (MQ=255) aCGCCtcgccgcgcttgagcgtgacctggcgttggtccttgtagttgaggaaggtgagttcggtgtggaggttgagctgtaccgtgctgccgtcgctgagctccacggtctgcatgcggtcaccggcttcgaagtgctgatagtggttgg < 1:414421‑M1/150‑146 (MQ=255) aCGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAggcgttggtccttgtagttgaggaaggtgagttcggtgtggaggttgagctgtaccgtgctgc < 1:797466‑M2/90‑64 (MQ=255) aCGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAggcgttggtccttgtagttgaggaaggtgagttcggtgtggaggttgagctgtaccgtgctgc > 2:797466‑M2/1‑27 (MQ=255) cGCCtcgccgcgcttgagcgtgacctggcgttggtccttgtagttgaggaaggtgagttcggtgtggaggttgagctgtaccgtgctgccgtcgctgagctccacggtctgcatgcggtcaccggcttcgaagtgctgatagtggttggg < 2:1825107‑M1/150‑147 (MQ=255) cGCCtcgccgcgcttgagcgtgacctggcgttggtccttgtagttgag < 1:17052‑M1/48‑45 (MQ=255) cGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAggcgttggtccttgtagttgaggaaggtgagttcggtgtggaggttgagctgtaccgtgctgccgtcgcttagctccacggtctgcatgcggtcaccggcttcgaagtgctgatagtggttggg < 1:273831‑M2/150‑125 (MQ=255) gCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAGGCGTTCTTCAAGGTGCGACACGACAGCAGCCACCCGTTCATCGTGCGTGCCGGCAGTGGCCAGACCCgg < 1:1718916/95‑1 (MQ=255) gCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAGGCGTTCTTCAAGGTGCGACACGACAGCAGCCACCCGTTCATCGTGCGTGCCGGCAGTGGCCAGACCCgg > 2:1718916/1‑95 (MQ=255) cctcgccgcgcttgagcgtgacctggcgttggtccttgtagttgaggaaggtgagttcggtgtggaggttgagctgtaccgtgctgccgtcgctgagctccacggtctgcatgcggtcaccggcttcgaagtgctgatagtggttgggca > 2:965280‑M1/1‑2 (MQ=255) ctcgccgcgcttgagcgtgacctggcgttggtccttgtagttgaggaaggaaatttcggtgtggaggttgagctgtaccgtgctgccgtcgctgagctccacggtctgcatgcggtcaccggcttcgaagtgctgatagtggttgggcaa > 1:1978988‑M1/1‑1 (MQ=255) ctcgccgcgcttgagcgtgacctggcgttggtccttgtagctgaggaaggtgagttcggcgtgggggttgagctgtacagtgctgccgtggctcagctccgctgtttgtatgtggtcaccggcttcgacgtgctgatagtggttgggcaa > 2:1476732‑M1/1‑1 (MQ=255) | ATGGGGTGGGAACAGGGCTGGTTGCCCAACCACTATCAGCACTTCGAAGCCGGTGACCGCATGCAGACCGTGGAGCTCAGCGACGGCAGCACGGTACAGCTCAACCTCCACACCGAACTCACCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAGGCGTTCTTCAAGGTGCGACACGACAGCAGCCACCCGTTCATCGTGCGTGCCGGCAGTGGCCAGACCCGGGTCACCGGCACCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTG > NC_002947/4032725‑4033021 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |