| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
GTTGCCCAACCACTATCAGCACTTCGAAGCCGGTGACCGCATGCAGACCGTGGAGCTCAGCGACGGCAGCACGGTACAGCTCAACCTCCACACCGAACTCACCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAGGCGTTCTTCAAGGTGCGACACGACAGCAGCCACCCGTTCATCGTGCGTGCCGGCAGTGGCCAGACCCGGGTCACCGGCACCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTGGTGGAAGGTTCAGTGCTGGT > NC_002947/4032745‑4033041 | gTTGCCCAACCACTATCAGCACTTCGAAGCCGGTGACCGCATGCAGACCGTGGAGCTCAGCGACGGCAGCACGGTACAGCTCAACCTCCACACCGAACTCACCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGa < 2:1035894/150‑1 (MQ=255) ttGCCCAACCACTATCAGCACTTCGAAGCCGGTGACCGCATGCAGACCGTGGAGCTCAGCGACGGCAGCACGGTACAGCTCAACCTCCACACCGAAATTTCCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAg > 1:1978988‑M2/1‑149 (MQ=255) ttGCCCAACCACTATCAGCACGTCGAAGCCGGTGACCACATACAAACAGCGGAGCTGAGCCACGGCAGCACTGTACAGCTCAACCCCCACGCCGAACTCACCTTCCTCAGCTACAAGGACCAACGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAg > 2:1476732‑M2/1‑149 (MQ=255) tGCCCAACCACTATCAGCACTTCGAAGCCGGTGACCGCATGCAGACCGTGGAGCTCAGCGACGGCAGCACGGTACAGCTCAACCTCCACACCGAACTCACCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAgg > 2:965280‑M2/1‑148 (MQ=255) cccAACCACTATCAGCACTTCGAAGCCGGTGACCGCATGCAGACCGTGGAGCTCAGCGACGGCAGCACGGTACAGCTCAACCTCCACACCGAACTCACCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAggcg < 2:1825107‑M2/150‑5 (MQ=255) ccAACCACTATCAGCACTTCGAAGCCGGTGACCGCATGCAGACCGTGGAGCTCAGCGACGGCAGCACGGTACAGCTCAACCTCCACACCGAACTCACCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAggcgt < 1:1543344‑M2/150‑6 (MQ=255) ccAACCACTATCAGCACTTCGAAGCCGGTGACCGCATGCAGACCGTGGAGCTCAGCGACGGCAGCACGGTACAGCTCAACCTCCACACCGAACTCACCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAggcgt < 1:167903‑M2/150‑6 (MQ=255) ccAACCACTATCAGCACTTCGAAGCCGGTGACCGCATGCAGACCGTGGAGCTCAGCGACGGCAGCACGGTACAGCTCAACCTCCACACCGAACTCACCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAggcgt > 1:225500‑M2/1‑145 (MQ=255) ccAACCACTATCAGCACTTCGAAGCCGGTGACCGCATGCAGACCGTGGAGCTCAGCGACGGCAGCACGGTACAGCTCAACCTCCACACCGAACTCACCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAggcgt < 1:414421‑M2/150‑6 (MQ=255) cAACCACTATCAGCACTTCGAAGCCGGTGACCGCATGCAGACCGTGGAGCTCAGCGACGGCAGCACGGTACAGCTCAACCTCCACACCGAACTCACCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAggcgtt < 1:531399‑M2/150‑7 (MQ=255) aCCACTATCAGCACTTCGAAGCCGGTGACCGCATGCAGACCGTGGAGCTCAGCGACGGCAGCACGGTACAGCTCAACCTCCACACCGAACTCACCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAGGCGttct < 1:2212043/150‑1 (MQ=255) aCCACTATCAGCACTTCGAAGCCGGTGACCGCATGCAGACCGTGGAGCTCAGCGACGGCAGCACGGTACAGCTCAACCTCCACACCGAACTCACCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAGGCGttct < 1:2140981/150‑1 (MQ=255) tcggCACTTCGAAGCCGGTGACTGCATGCAGAGCGTGGAGCTCAGCGACGGGAGCACGGTACAGCTCAACCTCCACACAGCACTCACCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCAGGTCACTCTCAAGCGCGGCGAGGCGTTCTTCAAGGt < 2:620093/147‑1 (MQ=255) aGCACTTCGAAGCCGGTGACCGCATGCAGACCGTGGAGCCCAGCGACGGCAGCACGGTACAGCTCAACCTCCACACCGAACTCACCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAGGCGTTCTTCAAGGTGc > 1:2136222/1‑150 (MQ=255) aGCACTGCGAAGCCGGTGACCGCATGCAGACCGTGGAGCGCAGCGACGGCAGCACGGTACAGCCCAACCTCCACACCGAACTCACCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAGGCGTTCTTCAAGGTGc < 2:906945/150‑1 (MQ=255) gCACTTCGAAGCCGGTGACCGCATGCAGACCGTGGAGCTCAGCGACGGCAGCACGGTACAGCTCAACCTCCACACCGAACTCACCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAGGCGTTCTTCAAGGTGcg > 1:698563/1‑150 (MQ=255) cGAAGCCGGTGACCGCATGCAGACCGTGGAGCTCAGCGACGGCAGCACGGTACAGCTCAACCTCCACACCGAACTCACCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAGGCGTTCTTCAAGGTGcgacccga < 2:2402010/150‑1 (MQ=255) aaGCCGGTGACCGCATGCAGACCGTGGAGCTCAGCGACGGCAGCACGGTACAGCTCAACCTCCACACCGAACTCACCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAGGCGTTCTTCAAGGTGcgacacgaca > 1:2118589/1‑150 (MQ=255) 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1:1178273/150‑1 (MQ=255) aCGCTCAAGCGCGGCGAGGCGTTCTTCAAGGTGCGACACGACAGCAGCCACCCGTTCATCGTGCGTGCCGGCAGTGGCCAGACCCGGGTCACCGGCACCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTGGTGGaa < 1:92104/150‑1 (MQ=255) aCGCTCAAGCGCGGCGAGGCGTTCTTCAAGGTGCGACACGACAGCAGCCACCCGTTCATCGTGCGTGCCGGCAGTGGCCAGACCCGGGTCACCGGCACCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTGGTGGaa < 1:1335408/150‑1 (MQ=255) cGCTCAAGCGCGGCGAGGCGTTCTTCAAGGTGCGACACGACAGCAGCCACCCGTTCATCGTGCGTGCCGGCAGTGGCCAGACCCGGGTCACCGGCACCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTGGTGGAAg < 2:218316/150‑1 (MQ=255) cGCTCAAGCGCGGCGAGGCGTTCTTCAAGGTGCGACACGACAGCAGCCACCCGTTCATCGTGCGTGCCGGCAGTGGCCAGACCCGGGTCACCGGCACCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTGGTGGAAg < 2:1933900/150‑1 (MQ=255) gCTCAAGCGCGGCGAGGCGTTCTTCAAGGTGCGACACGACAGCAGCCACCCGTTCATCGTGCGTGCCGGCAGTGGCCAGACCCGGGTCACCGGCACCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTGGTGGAAgg > 1:307490/1‑150 (MQ=255) cTCAAGCGCGGCGAGGCGTTCTTCAAGGTGCGACACGACAGCAGCCACCCGTTCATCGTGCGTGCCGGCAGTGGCCAGACCCGGGTCACCGGCACCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTGGTGGAAGGt > 1:735506/1‑150 (MQ=255) aaGCGCGGCGAGGCGTTCTTCAAGGTGCGACACGACAGCAGCCACCCGTTCATCGTGCGTGCCGGCAGTGGCCAGACCCGGGTCACCGGCACCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTGGTGGAAGGTTCa < 2:735506/150‑1 (MQ=255) gcgcGGCGAGGCGTTCTTCAAGGTGCGACACGACAGCAGCCACCCGTTCATCGTGCGTGCCGGCAGTGGCCAGACCCGGGTCACCGGCACCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTGGTGGAAGGTTCAGt > 2:207641/1‑150 (MQ=255) gcgcGGCGAGGCGTTCTTCAAGGTGCGACACGACAGCAGCCACCCGTTCATCGTGCGTGCCGGCAGTGGCCAGACCCGGGTCACCGGCACCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTGGTGGAAGGTTCAGt < 1:2192236/150‑1 (MQ=255) gcggcgAGGCGTTCTTCAAGGTGCGACACGACAGCAGCCACCCGTTCATCGTGCGTGCCGGCAGTGGCCAGACCCGGGTCACCGGCACCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTGGTGGAAGGTTCAGTGc > 1:1626793/1‑150 (MQ=255) cggcgAGGCGTTCTTCAAGGTGCGACACGACAGCAGCCACCCGTTCATCGTGCGTGCCGGCAGTGGCCAGACCCGGGTCACCGGCACCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTGGTGGAAGGTTCAGTGCt < 2:682340/150‑1 (MQ=255) ggcgAGGCGTTCTTCAAGGTGCGACACGACAGCAGCCACCCGTTCATCGTGCGTGCCGGCAGTGGCCAGACCCGGGTCACCGGCACCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTGGTGGAAGGTTCAGTGCTg < 2:2059012/150‑1 (MQ=255) cgAGGCGTTCTTCAAGGTGCGACACGACAGCAGCCACCCGTTCATCGTGCGTGCCGGCAGTGGCCAGACCCGGGTCACCGGCACCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTGGTGGAAGGTTCAGTGCTGgt < 2:307490/150‑1 (MQ=255) | GTTGCCCAACCACTATCAGCACTTCGAAGCCGGTGACCGCATGCAGACCGTGGAGCTCAGCGACGGCAGCACGGTACAGCTCAACCTCCACACCGAACTCACCTTCCTCAACTACAAGGACCAACGCCAGGTCACGCTCAAGCGCGGCGAGGCGTTCTTCAAGGTGCGACACGACAGCAGCCACCCGTTCATCGTGCGTGCCGGCAGTGGCCAGACCCGGGTCACCGGCACCCAGTTCAACGTGTGGAAGTACCAGGACCAGGTGAAGGTCACCCTGGTGGAAGGTTCAGTGCTGGT > NC_002947/4032745‑4033041 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |