New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 618970 = | 100 (1.130) | 6 (0.070) | 6/234 | NT | 5.9% | coding (1031/1329 nt) | pfeS‑I | histidine kinase |
? | NC_002947 | 619007 = | 98 (1.160) | coding (994/1329 nt) | pfeS‑I | histidine kinase |
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
GAAAATGCGCTCAAGGTCGGTATCCGGTACGCCTGGCCCTTGGTCGCTCAGGCGCAGGTGCCAGCATGCGCCCTCACGCCAGCCATCAAGGCTGACCCGGCCTTCGGTCGGCGAGTGGCGAATGGCATTGCGCAACAGGTTTTCCAGGGCCTG‑GGCCAGGCTGTCCAGATGGGCCTGCACCAGGCAGTCGGTGCCAAGTGAGCACGGCAGGCGCGCACGGTCCCAGCCGCTTTCGAAACAGACGTCCTCGCACAAGGCTTCCCACACGGAAAGCACCAATACCGGCTCGGTCACC > NC_002947/618822‑619116 | gacctggcctggatggacaccgaacagcggagcctggtgttcgagccggtattggtgctttccgcgggcggctgcttgtgcgaggacgtctgtttcgaaagcggctgggaccgtgcgcgcctgccgtgctcacttggcaccgactGCCTg > 1:1621980‑M1/146‑150 (MQ=255) gacctggcctggatggacaccgaacagcccagcctggtgaccgagccggtattggtgctttccgtgtgggaagccttgtgcgaggacgtctgtttcgaaagcggctgggaccgtgcgcgcctgccgtgctcacttggaaccgactgaatg > 2:1844920‑M1/146‑146 (MQ=255) aaTGCGCTCAAGGTCGGTATCCGGTACGCCTGGCCCTTGGTCGCTCAGGCGCAGGTGCCAGCATGCGCCCTCACGCCAGCCATCAAGGCTGACCCGGCCTTCGGTCGGCGAGTGGCGAATGGCATTGCGCAACAGGTTTTCCAGGGCCTg < 2:2206133/150‑1 (MQ=255) tGCGCTCAAGGTCGGTATCCGGTACGCCTGGCCCTTGGTCGCTCAGGCGCAGGTGCCAGCATGCGCCCTCACGCCAGCCATCAAGGCTGACCCGGCCTTCGGTCGGCGAGTGGCGAATGGCATTGCGCAACAGGTTTTCCAGGGCCTg‑gg > 1:625793/1‑150 (MQ=255) gcTCAAGGTCGGTATCCGGTACGCCTGGCCCTTGGTCGCTCAGGCGCAGGTGCCAGCATGCGCCCTCACGCCAGCCATCAAGGCTGACCCGGCCTTCGGTCGGCGAGTGGCGAATGGCATTGCGCAACAGGTTTTCCAGGGCCTG‑GGCCa > 1:444725/1‑150 (MQ=255) gcTCAAGGTCGGTATCCGGTACGCCTGGCCCTTGGTCACTCAGGCGCAGGTGCCAGCATGCGCCCTCACGCCAGCCATCAAGGCTGACCCGGCCTTCGGTCGGCGAGTGGCGAATGGCATTGCGCAACAGGTTTTCCAGGGCCTG‑GGCCa > 1:1665987/1‑150 (MQ=255) cTCAAGGTCGGTATCCGGTACGCCTGGCCCTTGGTCGCTCAGGCGCAGGTGCCAGCATGCGCCCTCACGCCAGCCATCAAGGCTGACCCGGCCTTCGGTCGGCGAGTGGCGACTGGCATTGCGCAACAGGTTTTCCAGGGCCTG‑GGCCAg < 1:1951632/150‑1 (MQ=255) tCAAGGTCGGTATCCGGTACGCCTGGCCCTTGGTCGCTCAGGCGCAGGTGCCAGCATGCGCCCTCACGCCAGCCATCAAGGCTGACCCGGCCTTCGGTCGGCGAGTGGCGAATGGCATTGCGCAACAGGTTTTCCAGGGCCTG‑GGCCAgg < 1:2149377/150‑1 (MQ=255) ggTCGGTATCCGGTACGCCTGGCCCTTGGTCGCTCAGGCGCAGGTGCCAGCATGCGCCCTCACGCCAGCCATCAAGGCTGACCCGGCCTTCGGTCGGCGAGTGGCGAATGGCATTGCGCAACAGGTTTTCCAGGGCCTG‑GGCCAGGCTGt > 1:1370307/1‑150 (MQ=255) tCGGTATCCGGTACGCCTGGCCCTTGGTCGCTCAGGCGCAGGTGCCAGCATGCGCCCTCACGCCAGCCATCAAGGCTGACCCGGCCTTCGGTCGGCGAGTGGCGAATGGCATTGCGCAACAGGTTTTCCAGGGCCTG‑GGCCAGGCTGTcc < 2:444725/150‑1 (MQ=255) ggTATCCGGTACGCCTGGCCCTTGGTCGCTCAGGCGCAGGTGCCAGCATGCGCCCTCACGCCAGCCATCAAGGCTGACCCGGCCTTCGGTCGGCGAGTGGCGAATGGCATTGCGCAACAGGTTTTCCAGGGCCTG‑GGCCAGGCTGTCCAg < 2:1030256/150‑1 (MQ=255) tATCCGGTACGCCTGGCCCTTGGTCGCTCAGGCGCAGGTGCCAGCATGCGCCCTCACGCCAGCCATCAAGGCTGACCCGGCCTTCGGTCGGCGAGTGGCGAATGGCATTGCGCAACAGGTTTTCCAGGGCCTG‑GGCCAGGCTGTCCAGAt > 1:953888/1‑150 (MQ=255) cGGTACGCCTGGCCCTTGGTCGCTCAGGCGCAGGTGCCAGCATGCGCCCTCACGCCAGCCATCAAGGCTGACCCGGCCTTCGGTCGGCGAGTGGCGAATGGCATTGCGCAACAGGTTTTCCAGGGCGTG‑GGGCAAGCTGTTCAGATGGGc > 2:20365/1‑150 (MQ=255) gTACGCCTGGCCCTTGGTCGCTCAGGCGCAGGTGCCAGCATGCGCCCTCACGCCAGCCATCAAGGCTGACCCGGCCTTCGGTCGGCGAGTGGCGAATGGCATTGCGCAACAGGTTTTCCAGGGCCTG‑GGCCAGGCTGTCCAGATGGGCCt < 1:926742/150‑1 (MQ=255) ccagcctggtgaccgagccggtattggtgctttccgtgtgggaagccttgtgcgaggacgtctgtttcgaaagcggctgggaccgtgcgcgcctgccgtgctcacttggcaccgactGCCTG‑GGCCAGGCTGTCCAGATGGGCCTGCAcc < 1:1223530‑M1/33‑1 (MQ=255) ccTGGCCCTTGGTCGCTCAGGCGCAGGTGCCAGCATGCGCCCTCACGCCAGCCATCAAGGCTGACCCGGCCTTCGGTCGGCGAGTGGCGAATGGCATTGCGCAACAGGTTTTCCAGGGCCTG‑GGCCAGGCTGTCCAGATGGGCCTGCAcc > 1:1098335/1‑150 (MQ=255) ccTGGCCCTTGGTCGCTCAGGCGCAGGTGCCAGCATGCGCCCTCACGCCAGCCATCAAGGCTGACCCGGCCTTCGGTCGGCGAGTGGCGAATGGCATTGCGCAACAGGTTTTCCAGGGCCTG‑GGCCAGGCTGTCCAGATGGGCCTGCAcc > 1:205917/1‑150 (MQ=255) cTGGCCCTTGGTCGCTCAGGCGCAGGTGCCAGCATGCGCCCTCACGCCAGCCATCAAGGCTGACCCGGCCTTCGGTCGGCGAGTGGCGAATGGCATTGCGCAACAGGTTTTCCAGGGCCTG‑GGCCAGGCTGTCCAGATGGGCCTGCACCa > 1:1258358/1‑150 (MQ=255) 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ctggtgaccgagccggtattggtgctttccgtgtgggaagccttgtgcgaggacgtctgtttcgaaagcggctgggaccgtgcgcgcctgccgtgctcacttggcaccgactGCCTG‑GGCCAGGCTGTCCAGATGGGCCTGCACCAGGCa > 2:1223530‑M1/113‑150 (MQ=255) cTTGGTCGCTCAGGCGCAGGTGCCAGCATGCGCCCTCACGCCAGCCATCAAGGCTGACCCGGCCTTCGGTCGGCGAGTGGCGAATGGCATTGCGCAACAGGTTTTCCAGGGCCTG‑GGCCAGGCTGTCCAGATGGGCCTGCACCAGGCAGt > 2:445181/1‑150 (MQ=255) gTCGCTCAGGCGCAGGTGCCAGCATGCGCCCTCACGCCAGCCATCAAGGCTGACCCGGCCTTCGGTCGGCGAGTGGCGAATGGCATTGCGCAACAGGTTTTCCAGGGCCTG‑GGCCAGGCTGTCCAGATGGGCCTGCACCAGGCAGTCGGt < 2:1674530/150‑1 (MQ=255) gccggtattggtgctttccgtgtgggaagccttgtgcgaggacgtctgtttcgaaagcggctgggaccgtgcgcgcctgccgtgctcacttggcaccgactGCCTG‑GGCCAGGCTGTCCAGATGGGCCTGCACCa < 2:1692749‑M1/34‑1 (MQ=255) ggCGCAGGTGCCAGCATGCGCCCTCACGCCAGCCATCAAGGCTGACCCGGCCTTCGGTCGGCGAGTGGCGAATGGCATTGCGCAACAGGTTTTCCAGGGCCTG‑GGCCAGGCTGTCCAGATGGGCCTGCACCAGGCAGTCGGTGCCAAGTg < 2:1137644/150‑1 (MQ=255) gcgcAGGTGCCAGCATGCGCCCTCACGCCAGCCATCAAGGCTGACCCGGCCTTCGGTCGGCGAGTGGCGAATGGCATTGCGCAACAGGTTTTCCAGGGCCTG‑GGCCAGGCTGTCCAGATGGGCCTGCACCAGGCAGTCGGTGCCAAGTGa > 2:637915/1‑150 (MQ=255) gcAGGTGCCAGCATGCGCCCTCACGCCAGCCATCAAGGCTGACCCGGCCTTCGGTCGGCGAGTGGCGAATGGCATTGCGCAACAGGTTTTCCAGGGCCTG‑GGCCAGGCTGTCCAGATGGGCCTGCACCAGGCAGTCGGTGCCAAGTGAGc < 1:1989371/150‑1 (MQ=255) cAGGTGCCAGCATGCGCCCTCACGCCAGCCATCAAGGCTGACCCGGCCTTCGGTCGGCGAGTGGCGAATGGCATTGCGCAACAGGTTTTCCAGGGCCTG‑GGCCAGGCTGTCCAGATGGGCCTGCACCAGGCAGTCGGTGCCAAGTGAGCa < 1:1293559/150‑1 (MQ=255) aGGTGCCAGCATGCGCCCTCACGCCAGCCATCAAGGCTGACCCGGCCTTTGGTCGGCGAGTGGCGAATGGCATTGCGCAACAGGTTTTCCAGGGCCTG‑GGCCAGGCTGTCCAGATGGGCCTGCACCAGGCAGTCGGTGCCAAGTGAGCAc < 2:1370307/150‑1 (MQ=255) ggtgctttccgtgtgggaagccttgtgcgaggacgtctgtttcgaaagcggctgggaccgtgcgcgcctgccgtgctcacttggcaccgactg > 2:1887159‑M1/93‑93 (MQ=255) ggtgctttccgtgtgggaagccttgtgcgaggacgtctgtttcgaaagcggctgggaccgtgcgcgcctgccgtgctcacttggcaccgactg < 1:1887159‑M1/1‑1 (MQ=255) 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2:1618270/1‑150 (MQ=255) tGGCATTGCGCAACAGGTTTTCCAGGGCCTG‑GGCCAGGCTGTCCAGATGGGCCTGCACCAGGCAGTCGGTGCCAAGTGAGCACGGCAGGCGCGCACGGTCCCAGCCGCTTTCGAAACAGACGTCCTCGCACAAGGCTTCCCACACGGaaa < 2:1322348/150‑1 (MQ=255) ggCATGGCGCAACAGGTTTTCCAGGGCCTG‑GGCCAGGCTGTCCAGATGGGCCTGCACCAGGCAGTCGGTGCCAAGTGAGCACGGCAGGCGCGCACGGTCCCAGCCGCTTTCGAAACAGACGTCCTCGCACAAGGCTTCCCACACGGAAAg < 1:619498/150‑1 (MQ=255) cATTGCGCAACAGGTTTTCCAGGGCCTG‑GGCCAGGCTGTCCAGATGGGCCTGCACCAGGCAGTCGGTGCCAAGTGa < 1:2358236/76‑1 (MQ=255) cATTGCGCAACAGGTTTTCCAGGGCCTG‑GGCCAGGCTGTCCAGATGGGCCTGCACCAGGCAGTCGGTGCCAAGTGa > 2:2358236/1‑76 (MQ=255) cATTGCGCAACAGGGTTTCCAGGGCCTG‑GGCCAGGCTGTCCAGATGGGCCTGCCCCAGGCAGTCGGTGCCAAGTGAGCACGGCAGGCGCGCACGGTCCCAGCCGCTTTCGAAACAGACGTCCTCGCACAAGGCTTCCCACACGGAAAGcc > 2:128248/1‑149 (MQ=255) aTTGCGCAACAGGTTTTCCAGGGCCTG‑GGCCAGGCTGTCCAGATGGGCCTGCACCAGGCAGTCGGTGCCAAGTGAGCACGGCAGGCGCGCACGGTCCCAGCCGCTTTCGAAACAGACGTCCTCGCACAAGGCTTcc > 2:639727/1‑136 (MQ=255) aTTGCGCAACAGCTTTTCCAGGGCCTG‑GGCCAGGCTGTCCAGATGGGCCTCCACCAGGCAGTCGGTGCCAAGTGAGCACGGCAGGCGCGCACGGTCCCAGCCGCTTTCGAAACAGACGTCCTCGCACAAGGCTTcc < 1:639727/136‑1 (MQ=255) aaCAGGTTTTCCAGGGCCTG‑GGCCAGGCTGTCCAGATGGGCCTGCACCAGGCAGTCGGTGCCAAGTGAGCACGGCAGGCGCGCACGGTCCCAGCCGCTTTCGAAACAGACGTCCTCGCACAAGGCTTCCCACACGGAAAGCACCAATAcc > 1:50393/1‑150 (MQ=255) aaCAGGTTTTCCAGGGCCTG‑GGCCAGGCTGTCCAGATGGGCCTGCACCAGGCAGTCGGTGCCAAGTGAGCACGGCAGGCGCGCACGGTCCCAGCCGCTTTCGAAACAGACGTCCTCGCACAAGGCTTCCCACACGGAAAGCACCAATAc < 2:159411/149‑1 (MQ=255) aaCAGGTTTTCCAGGGCCTG‑GGCCAGGCTGTCCAGATGGGCCTGCACCAGGCAGTCGGTGCCAAGTGAGCACGGCAGGCGCGCACGGTCCCAGCCGCTTTCGAAACAGACGTCCTCGCACAAGGCTTCCCACACGGAAAGCACCAATAc > 1:159411/1‑149 (MQ=255) aGGTTTTCCAGGGCCTG‑GGCCAGGCTGTCCAGATGGGCCTGCACCAGGCAGTCGGTGCCAAGTGAGCACGGCAGGCGCGCACGGTCCCAGCCGCTTTCGAAACAGACGTCCTCGCACAAGGCTTCCCACACGGAAAGCACCAATACCGGc < 1:1370570/150‑1 (MQ=255) ggTTTTCCAGGGCCTG‑GGCCAGGCTGTCCAGATGGGCCTGCACCAGGCAGTCGGTGCCAAGTGAGCACGGCAGGCGCGCACGGTCCCAGCCGCTTTCGAAACAGACGTCCTCGCACAAGGCTTCCCACACGGAAAGCACCAATACCGGCt > 1:1090698/1‑150 (MQ=255) gTTTTCCAGGGCCTG‑GGCCAGGCTGTCCAGATGGGCCTGCACCAGGCAGTCGGTGCCAAGTGAGCACGGCAGGCGCGCACGGTCCCAGCCGCTTTCGAAACAGACGTCCTCGCACAAGGCTTCCCACACGGAAAGCACCAATACCGGCTc > 1:2088255/1‑150 (MQ=255) gTTTTCCAGGGCCTG‑GGCCAGGCTGTCCAGATGGGCCTGCACCAGGCAGTCGGTGCCAAGTGAGCACGGCAGGCGCGCACGGTCCCAGCCGCTTTCGAAACAGACGTCCTCGCACAAGGCTTCCCACACGGAAAGCACCAATACCGGCTc < 2:1621109/150‑1 (MQ=255) gTTTTCCAGGGCCTG‑GGCCAGGCTGTCCAGATGGGCCTGCACCAGGCAGTCGGTGCCAAGTGAGCACGGCAGGCGCGCACGGTCCCAGCCGCTTTCGAAACAGACGTCCTCGCACAAGGCTTCCCACACGGAAAGCACCAATACCGGCTc > 1:771783/1‑150 (MQ=255) ttttCCAGGGCCTG‑GGCCAGGCTGTCCAGATGGGCCTGCACCAGGCAGTCGGTGCCAAGTGAGCACGGCAGgcgc < 1:1424084/75‑1 (MQ=255) ttttCCAGGGCCTG‑GGCCAGGCTGTCCAGATGGGCCTGCACCAGGCAGTCGGTGCCAAGTGAGCACGGCAGgcgc > 2:1424084/1‑75 (MQ=255) ttttCCAGGGCCTG‑GGCCAGGCTGTCCAGATGGGCCTGCACCAGGCAGTCGGTGCCAAGTGAGCACGGCAGGCGCGCACGGTCCCAGCCGCTTTCGAAACAGACGTCCTCGCACAAGGCTTCCCACACGGAAAGCACCAATACCGGCTCg < 1:16078/150‑1 (MQ=255) ccAGGGCCTG‑GGCCAGGCTGTCCAGATGGGCCTGCACCAGGCAGTCGGTGCCAAGTGAGCACGGCAGGCGCGCACGGTCCCAGCCGCTTTCGAAACAGACGTCCTCGCACAAGGCTTCCCACACGGAAAGCACCAATACCGGCTCGGTCa < 1:637915/150‑1 (MQ=255) cAGGGCCTG‑GGCCAGGCTGTCCAGATGGGCCTGCACCAGGCAGTCGGTGCCAAGTGAGCACGGCAGGCGCGCACGGTCCCAGCCGCTTTCGAAACAGACGTCCTCGCACAAGGCTTCCCACACGGAAAGCACCAATACCGGCTCGGTCAc > 1:139625/1‑150 (MQ=255) aGGGCCTG‑GGCCAGGCTGTCCAGATGGGCCTGCACCAGGCAGTCGGTGCCAAGTGAGCACGGCAGGCGCGCACGGTCCCAGCCGCGTTCGAAACAGACGTCCTCGCACAAGGCTTCCCACACGGAAAGCACCAATACCGGCTCGGTCAcc > 2:932216/1‑150 (MQ=255) | GAAAATGCGCTCAAGGTCGGTATCCGGTACGCCTGGCCCTTGGTCGCTCAGGCGCAGGTGCCAGCATGCGCCCTCACGCCAGCCATCAAGGCTGACCCGGCCTTCGGTCGGCGAGTGGCGAATGGCATTGCGCAACAGGTTTTCCAGGGCCTG‑GGCCAGGCTGTCCAGATGGGCCTGCACCAGGCAGTCGGTGCCAAGTGAGCACGGCAGGCGCGCACGGTCCCAGCCGCTTTCGAAACAGACGTCCTCGCACAAGGCTTCCCACACGGAAAGCACCAATACCGGCTCGGTCACC > NC_002947/618822‑619116 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |