New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_002947 | 729633 = | 86 (1.060) | coding (160/741 nt) | yfiH | protein YfiH |
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
CTGCTGAACCAGGACCGCGAGAGCTTCATCGGATGAGTGACCTGACGCAGGCGTTGCTGTTCCCCGACTGGCCGGCCCCGGCTTCGGTCCGCGCCTGTGTCACCACCCGTCAGGGCGGCGTCAGCCTGCCGCCTTACGAAACCTTCAACCTCGGCGACCATGTTGGGGATGACCCTGCCGCGGTCGCCGAGAACCGCCGCCGCCTGAGCGAACAGTTCACCATCCAACCGGCCTGGCTCAAGCAGGTGCATGGGCGGGTGGTGGCGGATGCCGACCCGACCGTGGTGGCCGAGGCCGA > NC_002947/729442‑729739 | ctgctgAACCAGGACCGCGAGAGCTTCATCGGATGAGTGACCTGACGCAGGCGTTGCTGTTCCCCGACTGGCCGGCCCCGGCTTCGGTCCGCGCCTGTGTCACCACCCGTCAGGGCGGCGTCAGCCTGCCGCCTTACGAAACCTTCAAcc > 2:433042/1‑150 (MQ=255) atcacggtgcaggcaatgccaggctggcgggtccagctggcatcggcctcggccaccacggtcgggtcggcatccgccaccacccgcccatgcacctgcttgagccaggccggttggatggtgaactgttcgctcaggcggcggcggttc < 2:1460011‑M1/1‑1 (MQ=255) ttgAACATGGTCCGCGAGACCTTCATCGGATGAGTGACCTGACGCAGGCGTTGCTGTTCCCCGACTGGCCGGCCCCGGCTTCGGTCCGCGCCTGTGTCACCACCCGTCAGGGCGGCGTCAGCCTGCCGCCTTACGAAACCTTCAACCTCg < 2:61887/149‑1 (MQ=255) acggtgcaggcaatgccaggctggcgggtccagctggcatcggcctcggccaccacggtcgggtcggcatccgccaccacccgcccatgcacctgcttgagccaggcctgttggatggtgaactgttcgctcaggcggcggcggttCTCg > 1:1759683‑M1/147‑150 (MQ=255) acggtgcaggcaatgccaggctggcgggtccagctggcatcggcctcggccaccacggtcgggtcggcatccgccaccacccgcccatgcacctgcttgagccaggccggttggatggtgaactgttcgctcaggcggcggcggttCTCg > 1:97052‑M1/147‑150 (MQ=255) acggtgcaggcaatgccaggctggcgggtccagctggcatcggcctcggccaccacggtcgggtcggcatccgccaccacccgcccatgcacctgcttgagccaggccggttggatggtgaactgttcgctcaggcggcggcggttCTCg > 2:1003389‑M1/147‑150 (MQ=255) aaCCAGGACCGCGAGAGCTTCATCGGATGAGTGACCTGACGCAGGCGTTGCTGTTCCCCGACTGGCCGGCCCCGGCTTCGGTCCGCGCCTGTGTCACCACCCGTCAGGGCGGCGTCAGCCTGCCGCCTTACGAAACCTTCAACCTCGGCg > 2:503261/1‑150 (MQ=255) ccAGGACCGTGAGAGCTTCATCGGATGAGTGACCTGACGCAGGCGTTGCTGTTCCCCGACTGGCCGGCCCCGGCTTCGGTCCGCGCCTGTGTCACCATCCTTCAGGGCGTCGTCAGCCTGCCGCCTTACGAAACCTTCAACCTCGGCGAc < 2:301983/150‑1 (MQ=255) caggcaatgccaggctggcgggtccagctggcatcggcctcggccaccacggtcgggtcggcatccgccaccacccgcccatgcacctgcttgagccaggccggttggatggtgaactgttcgctcaggcggcggcggttCTCGGCGAcc < 2:2305718‑M1/10‑1 (MQ=255) aGGACCGCGAGAGCTTCATCGGATGAGTGACCTGACGCAGGCGTTGCTGTTCCCCGACTGGCCGGCCCCGGCTTCGGTCCGCGCCTGTGTCACCACCCGTCAGGGCGGCGTCAGCCTTCCGCCTTACGAAACCTTCAACCTCGGCGACCa > 2:1708549/1‑150 (MQ=255) ggACCGCGAGAGCTTCATCGGATGAGTGACCTGACGCAGGCGTTGCTGTTCCCCGACTGGCCGGCCCCGGCTTCGGTCCGCGCCTGTGTCACCACCCGTCAGGGCGGCGTCAGCCTGCCGCCTTACGAAACCTTCAACCTCGGCGACCAt > 1:924914/1‑150 (MQ=255) ggACCGCGAGAGCTTCATCGGATGAGTGACCTGACGCAGGCGTTGCTGTTCCCCGACTGGCCGGCCCCGGCTTCGGTCCGCGCCTGTGTCACCACCCGTCAGGGCGGCGTCAGCCTGCCGCCTTACGAAACCTTCAACCTCGGCGACCAt < 1:1829384/150‑1 (MQ=255) aCCGCGAGAGCTTCATCGGATGAGTGACCTGACGCAGGCGTTGCTGTTCCCCGACTGGCCGGCCCCGGCTTCGGTCCGCGCCTGTGTCACCACCCGTCAGGGCGGCGTCAGCCTGCCGCCTTACGAAACCTTCAACCTCGGCGACCATGt > 1:1050851/1‑150 (MQ=255) 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gAAACCTTCAACCTCGGCGACCATGTTGGGGATGACCCTGCCGCGGTCGCCGAGAACCGCCGCCGCCTGAGCGAACAGTTCACCATCCAACCGGCCTGGCTCAAGCAGGTGCATGGGCGGGTGGTGGCGGATGCCGACCCGACCgtg > 1:2006400/1‑147 (MQ=255) gAAACCTTCAACCTCGGCGACCATGTTGGGGATGACCCTGCCGCGGTCGCCGAGAACCGCCGCCGCCTGAGCGAACAGTTCACCATCCAACCGGCCTGGCTCAAGCAGGTGCATGGGCGGGTGGTGGCGGATGCCGACCCGACCgtg < 2:2006400/147‑1 (MQ=255) cTTCAACCTCGGCGACCATGTTGGGGATGACCCTGCCGCGGTCGCCGAGAACCGCCGCCGCCTGAGCGAACAGTTCACCATCCAACCGGCCTGGCTCAAGCAGGTGCATGGGCGGGTGGTGGCGGATGCCGACCCGACCGTGGTggccga > 2:830217/1‑150 (MQ=255) cTTCAACCTCGGCGACAATGTTGGGGATGACCCTGCCGCGGTCGCCGAGAACCGCCGCCGCCTGAGCGAACAGTTCACCATCCAACCGGCCTGGCTCAAGCAGGTGCATGGGCGGGTGGTGGCGGATGCCGACCCGACCGTGGTggccga > 1:2001295/1‑150 (MQ=255) ttCAACCTCGGCGACCATGTTGGGGATGACCCTGCCGCGGTCGCCGAGAACCGCCGCCGCCTGAGCGAACAGTTCACCATCCAACCGGCCTGGCTCAAGCAGGTGCATGGGCGGGTGGTGGCGGAt < 1:1515512/126‑1 (MQ=255) ttCAACCTCGGCGACCATGTTGGGGATGACCCTGCCGCGGTCGCCGAGAACCGCCGCCGCCTGAGCGAACAGTTCACCATCCAACCGGCCTGGCTCAAGCAGGTGCATGGGCGGGTGGTGGCGGAt > 2:1515512/1‑126 (MQ=255) ttCAACCTCGGCGACCATGTTGGGGATGACCCTGCCGCGGTCGCCGAGAACCGCCGCCGCCTGAGCGAACAGTTCACCATCCAACCGGCCTGGCTCAAGCAGGTGCATGGGCGGGTGGTGGCGGATGCCGACCCGACCGTGGTggccgag > 2:1880891/1‑150 (MQ=255) ttCAACCTCGGCGACCATGTTGGGGATGACCCTGCCGCGGTCGCCGAGAACCGCCGCCGCCTGAGCGAACAGTTCACCATCCAACCGGCCTGGCTCAAGCAGGTGCATGGGCGGGTGGTGGCGGATGCCGACCCGACCGTGGTggccgag < 2:1050851/150‑1 (MQ=255) ccTCGGCGACCATGTTGGGGATGACCCTGCCGCGGTCGCCGAGAACCGCCGCCGCCTGAGCGAACAGTTCACCATCCAACCGGCCTGGCTCAAGCAGGTGCATGGGCGGGTGGTGGCGGATGCCGACCCGACCGTGGTggccgaggccga < 2:2193813/150‑1 (MQ=255) | CTGCTGAACCAGGACCGCGAGAGCTTCATCGGATGAGTGACCTGACGCAGGCGTTGCTGTTCCCCGACTGGCCGGCCCCGGCTTCGGTCCGCGCCTGTGTCACCACCCGTCAGGGCGGCGTCAGCCTGCCGCCTTACGAAACCTTCAACCTCGGCGACCATGTTGGGGATGACCCTGCCGCGGTCGCCGAGAACCGCCGCCGCCTGAGCGAACAGTTCACCATCCAACCGGCCTGGCTCAAGCAGGTGCATGGGCGGGTGGTGGCGGATGCCGACCCGACCGTGGTGGCCGAGGCCGA > NC_002947/729442‑729739 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |