New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
GACGCAGGCGTTGCTGTTCCCCGACTGGCCGGCCCCGGCTTCGGTCCGCGCCTGTGTCACCACCCGTCAGGGCGGCGTCAGCCTGCCGCCTTACGAAACCTTCAACCTCGGCGACCATGTTGGGGATGACCCTGCCGCGGTCGCCGAGAACCGCCGCCGCCTGAGCGAACAGTTCACCATCCAACCGGCCTGGCTCAAGCAGGTGCATGGGCGGGTGGTGGCGGATGCCGACCCGACCGTGGTGGCCGAGGCCGATGCCAGCTGGACCCGCCAGCCTGGCATTGCCTGCACCGTGATG > NC_002947/729485‑729782 | cggcctcggccaccacggtcgggtcggcatccgccaccacccgcccatgcacctgcttgagccaggccggttggatggtgaactgttcgctcaggcggcggcggttCTCGGCGACCATGTTGGGGATGACCCTGCCGCGGTCGCCGAGaa > 1:1781342‑M1/107‑150 (MQ=255) cGCAGGCGTTGCTGTTCCCCGACTGGCCGGCCCCGGCTTCGGTCCGCGCCTGTGTCACCACCCGTCAGGGCGGCGTCAGCCTGCCGCCTTACGAAACCTTCAACCTCGGCGACCATGTTGGGGATGACCCTGCCGCGGTCGCCGAGAAcc < 2:2329007/150‑1 (MQ=255) tGTTCCCCGACTGGCCGGCCCCGGCTTCGGTCCGCGCCTGTGTCACCACCCGTCAGGGCGGCGTCAGCCTGCCGCCTTACGAAACCTTCAACCTCGGCGACCATGTTGGGGATGACCCTGCCGAGGTCGCCGAGAACCGCCGCCGCCTGa < 1:433042/150‑1 (MQ=255) 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ttGGGGATGACCCTGCCGCGGTCGCCGAGAACCGCCGCCGCCTGAGCGAACAGTTCACCATCCAACCTGCCTGGCTCAAGCAGGTGCATGGGCGGGTGGTGGCGGATGCCGACCCGACCGTGGTGGCCGAGGCCGATGCCAGCTGGAccc < 1:1015001/150‑1 (MQ=255) ttGGGGATGACCCTGCCGCGGTCGCCGAGAACCGCCGCCGCCTGAGCGAACAGTTCACCATCCAACCGGCCTGGCTCAAGCAgg > 2:2054951/1‑84 (MQ=255) ttGGGGATGACCCTGCCGCGGTCGCCGAGAACCGCCGCCGCCTGAGCGAACAGTTCACCATCCAACCGGCCTGGCTCAAGCAgg < 1:2054951/84‑1 (MQ=255) tGGGGATGACCCTGCCGCGGTCGCCGAGAACCGCCGCCGCCTGAGCGAACAGTTCACCATCCAACCGGCCTGGCTCAAGCAGGTGCATGGGCGGGTGGTGGCGGATGCCGACCCGACCGTGGTGGCCGAGGCCGATGCCAGCTGGACCCg < 2:2001295/150‑1 (MQ=255) ggggATGACCCTGCCGCGGTCGCCGAGAACCGCCGCCGCCTGAGCGAACAGTTCACCATCCAACCGGCCTGGCTCAAGCAGGTGCATGGGCGGGTGGTGGCGGATGCCGACCCGACCGTGGTGGCCGAGGCCGATGCCAGCTGGACCCGc > 2:1028979/1‑150 (MQ=255) gATGACCCTGCCGCGGTCGCCGAGAACCGCCGCCGCCTGAGCGAACAGTTCACCATCCAACCGGCCTGGCTCAAGCAGGTGCATGGGCGGGTGGTGGTGGATGCCGACCCGACCGTGGTGGCCGAGGCCGATGCCAGCTGGACCCGCCAg > 2:1064388/1‑150 (MQ=255) aTGACCCTGCCGCGGTCGCCGAGAACCGCCGCCGCCTGAGCGAACAGTTCACCATCCAACCGGc < 1:127801/64‑1 (MQ=255) gACCCTGCCGCGGTCGCCGAGAACCGCCGCCGCCTGAGCGAACAGTTCACCATCCAACCGGCCTGGCTCAAGCAGGTGCATGGGCGGGTGGTGGCGGATGCCGACCCGACCGTGGTGGCCGAGGCCGATGCCAGCTGGACCCGCCAGCCt > 1:2002051/1‑150 (MQ=255) ccTGCCGCGGTCGCCGAGAACCGCCGCCGCCTGAGCGAACAGTTCACCATCCAACCGGCCTGGCTCAAGCAGGTGCATGGGCGGGTGGTGGCGGATGCCGACCCGACCGTGGTggccgaggccgacgaaaa < 2:298691/131‑7 (MQ=255) cTGCCGCGGTCGCCGAGAACCGCCGCCGCCTGAGCGAACAGTTCACCATCCAACCGGCCTGGCTCAAGCAGGTGCATGGGCGGGTGGTGGCGGATGCCGACCCGACCgtg > 2:295058/1‑110 (MQ=255) cTGCCGCGGTCGCCGAGAACCGCCGCCGCCTGAGCGAACAGTTCACCATCCAACCGGCCTGGCTCAAGCAGGTGCATGGGCGGGTGGTGGCGGATGCCGACCCGACCgtg < 1:295058/110‑1 (MQ=255) cTGCCGCGGTCGCCGAGAACCGCCGCCGCCTGAGCGAACAGTTCACCATCCAACCGGCCTGGCTCAAGCAGGTGCATGGGCGGGTGGTGGCGGATGCCGACCCGACCGTGGTGGCCGAGGCCGATGCCAGCTg > 1:374230/1‑133 (MQ=255) cTGCCGCGGTCGCCGAGAACCGCCGCCGCCTGAGCGAACAGTTCACCATCCAACCGGCCTGGCTCAAGCAGGTGCATGGGCGGGTGGTGGCGGATGCCGACCCGACCGTGGTGGCCGAGGCCGATGCCAGCTGGACCCGCCAGCCTGGCa < 1:1028979/150‑1 (MQ=255) gCCGCGGTCGCCGAGAACCGCCGCCGCCTGAGCGAACAGTTCACCATCCAACCGGCCTGGCTCAAGCAGGTGCATGGGCGGGTGGTGGCGGATGCCGACCCGACCGTGGTGGCCGAGGCCGATGCCAGCTGGACCCGCCAGCCTGGCAtt < 1:1197185/150‑1 (MQ=255) cgcgGTCGCCGAGAACCGCCGCCGCCTGAGCGAACAGTTCACCATCCAACCGGCCTGGCTCAAGCAGGTGCATGGGCGGGTGGTGGCGGATGCCGACCCGACCGTGGTGGCCGAGGCCGATGCCAGCTGGACCCGCCAGCCTGGCATTGc > 2:753579/1‑150 (MQ=255) ggtcgccgagAACCGCCGCCGCCTGAGCGAACAGTTCACCATCCAACCGGCCTGGCTCAAGCAGGTGCATGGGCGGGTGGTGGCGGATGCCGACCCGACCGTGGTGGCCGAGGCCGATGCCAGCTGGACCCGCCAGCCTGGCATTGCCTg < 2:2305718‑M2/140‑1 (MQ=255) cgagAACCGCCGCCGCCTGAGCGAACAGTTCACCATCCAACCGGCCTGGCTCAAGCAGGTGCATGGGCGGGTGGTGGCGGATGCCGACCCGACCGTGGTGGCCGAGGCCGATGCCAGCTGGACCCGCCAGCCTGGCATTGCCTGCACCGt > 2:1003389‑M2/5‑150 (MQ=255) cgagAACCGCCGCCGCCTGAGCGAACAGTTCACCATCCAACCGGCCTGGCTCAAGCAGGTGCATGGGCGGGTGGTGGCGGATGCCGACCCGACCGTGGTGGCCGAGGCCGATGCCAGCTGGACCCGCCAGCCTGGCATTGCCTGCACCGt > 1:97052‑M2/5‑150 (MQ=255) cgagAACCGCCGCCGCCTGAGCGAACAGTTCACCATCCAACAGGCCTGGCTCAAGCAGGTGCATGGGCGGGTGGTGGCGGATGCCGACCCGACCGTGGTGGCCGAGGCCGATGCCAGCTGGACCCGCCAGCCTGGCATTGCCTGCACCGt > 1:1759683‑M2/5‑150 (MQ=255) gAACCGCCGCCGCCTGAGCGAACAGTTCACCATCCAACCGGCCTGGCTCAAGCAGGTGCATGGGCGGGTGGTGGCGGATGCCGACCCGACCGTGGTGGCCGAGGCCGATGCCAGCTGGACCCGCCAGCCTGGCATTGCCTGCACCGTGAt < 2:1460011‑M2/149‑1 (MQ=255) aaCCGCCGCCGCCTGAGCGAACAGTTCACCATCCAACCGGCCTGGCTCAAGCAGGTGCATGGGCGGGTGGTGGCGGATGCCGACCCGACCGTGGTGGCCGAGGCCGATGCCAGCTGGACCCGCCAGCCTGGCATTGCCTGCACCGtgatg > 2:184130/1‑150 (MQ=255) | GACGCAGGCGTTGCTGTTCCCCGACTGGCCGGCCCCGGCTTCGGTCCGCGCCTGTGTCACCACCCGTCAGGGCGGCGTCAGCCTGCCGCCTTACGAAACCTTCAACCTCGGCGACCATGTTGGGGATGACCCTGCCGCGGTCGCCGAGAACCGCCGCCGCCTGAGCGAACAGTTCACCATCCAACCGGCCTGGCTCAAGCAGGTGCATGGGCGGGTGGTGGCGGATGCCGACCCGACCGTGGTGGCCGAGGCCGATGCCAGCTGGACCCGCCAGCCTGGCATTGCCTGCACCGTGATG > NC_002947/729485‑729782 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |