New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1036467 | 73 (0.820) | 5 (0.060) | 5/240 | NT | 6.4% | coding (169/591 nt) | PP_0895 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 1036482 | 76 (0.880) | coding (184/591 nt) | PP_0895 | hypothetical protein |
CGGTGCCGCTATCGCGCCTTACATCGATGACCTCGCTCGCCTGCGCCTTACTGTGTTCCGCGAGTTCCCCTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGTCGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGTACTACTTCGGTGAGTCGCTGGTGTTGCCG > NC_002947/1036319‑1036610 | cGGTGCCGCTATCGCGCCTTACTTCTATTACCTCGCTCGCCTGCGCCTTACTGTGTTCCGCGAGTTCCCCTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCt < 1:1699942/150‑1 (MQ=255) cGGTGCCGCTATCGCGCCTTACATCGATGACCTCGCTCGCCTGCGCCTTACTGTGTTCCGCGAGTTCCCCTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCt < 2:1070689/150‑1 (MQ=255) ggTGCCGCTATCGCGCCTTACATCGATGACCTCGCTCGCCTGCGCCTTACTGTGTTCCGCGAGTTCCCCTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTg < 2:1674685/150‑1 (MQ=255) ccGCTATCGCGCCTTACATCGATGACCTCGCTCGCCTGCGCCTTACTGTGTTCCGCGAGTTCCCCTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGgcg‑c > 2:1500427/1‑150 (MQ=255) ttACATCGATGACCTCGCTCGCCTGCGCCTTACTGTGTTCCGCGAGTTCCCCTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCaa < 2:2119793/150‑1 (MQ=255) aCATCGATGACCTCGCTCGCCTGCGCCTTACTGTGTTCCGCGAGTTCCCCTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAgg < 1:707865/150‑1 (MQ=255) aCATCGATGACCTCGCTCGCCTGCGCCTTACTGTGTTCCGCGAGTTCCCCTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAgg > 1:716865/1‑150 (MQ=255) cATCGATGACCTCGCTCGCCTGCGCCTTACTGTGTTCCGCGAGTTCCCCTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCcgtcgtccagcgccagcacaac < 2:382232‑M1/150‑23 (MQ=255) tCGATGACCTCGCTCTCCTGCGCCTTACTGTGTTCCGCGAGTTCCCCTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAggtgg > 2:867588/1‑150 (MQ=255) aTGACCTCGCTCGCCTGCGCCTTACTGTGTTCCGCGAGTTCCCCTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCg > 2:2073375/1‑150 (MQ=255) tcgctcgcCTGCGCCTTACTGTGTTCCGCGAGGTCCCCTACCTTTACGCCGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCGGGTTGTGCTGGCG‑CTGGCCGACGGCAAGGTGGTCGGCGCct > 2:352794/1‑150 (MQ=255) gctcgcCTGCGCCTTACTGTGTTCCGCGAGTTCCCCTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCctct > 2:2230191/1‑150 (MQ=255) tcgcCTGCGCCTTACTGTGTTCCGCGAGTTCCCCTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTgg > 2:82665/1‑116 (MQ=255) tcgcCTGCGCCTTACTGTGTTCCGCGAGTTCCCCTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTgg < 1:82665/116‑1 (MQ=255) tcgcCTGCGCCTTACTGTGTTCCGCGAGTTCCCCTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTAc > 1:1125950/1‑150 (MQ=255) tcgcCTGCGCCTTACTGTGTTCCGCGAGTTCCCCTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGC < 1:1952865‑M1/113‑1 (MQ=255) tcgcCTGCGCCTTACTGTGTTCCGCGAGTTCCCCTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGC > 2:1952865‑M1/1‑113 (MQ=255) tGCGCCTTACTGTGTTCCGCGAGTTCCCCTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGTCCGTCTACCTGGCGAACTATGCTCGCTCCGAGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGcc > 2:407835/1‑150 (MQ=255) tGCGCCTTACTGTGTTCCGCGAGTTCCCCTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑Ct > 1:2352589/1‑115 (MQ=255) tGCGCCTTACTGTGTTCCGCGAGTTCCCCTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑Ct < 2:2352589/115‑1 (MQ=255) ccTTACTGTGTTCCGCGAGTTCCCCTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGcc > 2:1528859/1‑150 (MQ=255) cTTACTGTGTTCCGCGAGTTCCCCTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCg > 1:1823285/1‑150 (MQ=255) ttACTGTGTTCCGCGAGTTCCCCTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCTGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGc > 1:160331/1‑150 (MQ=255) ttACTGTGTTCCGCGAGTTCCCCTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCCGTCGTCCAG‑CGCCAgcacaaccaggctgcgcccggagcgg > 1:2123208‑M2/1‑117 (MQ=255) ttACTGTGTTCCGCGAGTTCCCCTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCCGTCG‑TCCAGCGCCAgcacaaccaggctgcgcccggagcgg < 2:2123208‑M2/143‑27 (MQ=255) aCTGTGTTCCGCGAGTTCCCCTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCtg < 2:1125950/150‑1 (MQ=255) tgtgTTCCGCGAGTTCCCCTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCtggt > 2:1055057/1‑150 (MQ=255) tgtgTTCCGCGAGTTCCCCTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCACATGCAGGTGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGACTCTACCGGCCTGCCGCtggg > 1:1354012/1‑149 (MQ=255) gtgtTCCGCGAGTTCCCCTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCtggtg < 1:377908/150‑1 (MQ=255) gtgtTCCGCGAGTTCCCCTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCtggtg > 2:328050/1‑150 (MQ=255) gtTCCGCGAGTTCCCCTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGa < 1:328050/150‑1 (MQ=255) ttCCCCTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGTc > 2:2388061/1‑144 (MQ=255) ttCCCCTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGTc < 1:2388061/144‑1 (MQ=255) ttCCCCTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGTCGCGccc < 2:1692180/150‑1 (MQ=255) ttCCCCTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGTCGCGccc > 2:387557/1‑150 (MQ=255) cccTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCtgg < 1:343465/133‑1 (MQ=255) cccTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCtgg > 2:343465/1‑133 (MQ=255) cccTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGTCGCGCCCGaa > 1:1406651/1‑150 (MQ=255) cccTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGAAGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGGTGGTGGATGTCGCGCCCGaa > 2:1128895/1‑150 (MQ=255) ccTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCt > 2:2182077/1‑124 (MQ=255) ccTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCt < 1:2182077/124‑1 (MQ=255) ccTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGACAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGTCGCGCCCGAAt > 2:66278/1‑150 (MQ=255) cTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAggtg < 1:133538/103‑1 (MQ=255) cTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAggtg > 2:133538/1‑103 (MQ=255) cTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCtggtg < 2:190019/129‑1 (MQ=255) cTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCtggtg > 1:190019/1‑129 (MQ=255) ttACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGTCGCGCCCGAATTCcagca < 2:2391123/150‑1 (MQ=255) cACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGGTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGTCGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCt > 1:319814/1‑150 (MQ=255) cccGGAGTACGAGGCCGCCTACCTGCCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACCGTTAAGTGGTCGGCGAAGTGACTGTGTTGCCATAGTTTTAGGTCGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGc < 1:420781/150‑1 (MQ=255) cccGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCtggt < 2:441540/114‑1 (MQ=255) cccGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCtggt > 1:441540/1‑114 (MQ=255) cccGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGTCGCGCCCGAATTCca > 1:515477/1‑135 (MQ=255) cccGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGTCGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGc > 1:253153/1‑150 (MQ=255) cccGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGTCGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGc > 2:1931988/1‑150 (MQ=255) cccGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCGGGTGGATGTCGCGCCCGAATTCCAGCAGCCGTTCCTGGc > 1:1600715/1‑150 (MQ=255) cccGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGGCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGTCGCGCCCGAATTCca < 2:515477/135‑1 (MQ=255) ccGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGTCGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGcc > 1:1723511/1‑150 (MQ=255) aGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGTCGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAgg < 2:253153/150‑1 (MQ=255) gTACGAGGCCGACTATCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGTCGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAggg < 1:497260/150‑1 (MQ=255) gTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGTCGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAggg < 2:1823285/150‑1 (MQ=255) gTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGTCGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAggg < 1:387557/150‑1 (MQ=255) aCGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGTCGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGgc < 1:1055057/150‑1 (MQ=255) ggCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGTCGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGa > 2:307921/1‑150 (MQ=255) ccTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGTCgcgc < 2:365903/104‑1 (MQ=255) ccTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGTCgcgc > 1:365903/1‑104 (MQ=255) cTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGTCGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGCCAgt > 1:246531/1‑150 (MQ=255) gCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGTCGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCTACCCGGCCAgtttg < 2:1354012/150‑1 (MQ=255) cAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGTCGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAgggg > 2:358100/1‑130 (MQ=255) cAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGTCGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAgggg < 1:358100/130‑1 (MQ=255) aaCTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCTCTGGTGGATGTCGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGtac < 1:867588/150‑1 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ccGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCA‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGTCGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGTACTACTTCg > 2:1694227/1‑149 (MQ=255) ccGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCA‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGTCGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGTACTACTTCg < 1:1694227/149‑1 (MQ=255) cGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGTCGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGCCCCGGCCAGTGTGTACTACTTCGGt < 1:66278/150‑1 (MQ=255) cGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGTCGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGTACTACTTCGGt < 1:1218187/150‑1 (MQ=255) cGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGTCGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGTACTACTTCGGt < 1:2073375/150‑1 (MQ=255) ccGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGTCGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGTACTACTTCGGTGAGt < 1:2230191/150‑1 (MQ=255) cGGGCGCAGCCTGGTTGTGCcgtcgtccagcgccagca < 2:996511‑M1/38‑19 (MQ=255) cGGGCGCAGCCTGGTTGTGCcgtcgtccagcgccagca > 1:996511‑M1/1‑20 (MQ=255) cgcAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGTCGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGTACTACTTCGGTGAGTCGCTg < 1:1026729/150‑1 (MQ=255) ccTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGTCGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGTACTACTTCGGTGAGTCGCTGGTGtt > 1:169337/1‑150 (MQ=255) cTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGTCGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGTACTACTTCGGTGAGTCGCTGGTGTTg < 1:5526/150‑1 (MQ=255) ttgTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGTCGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGTACTACTTCGGTGAGTCGCTGGTGTTGc < 1:342129/148‑1 (MQ=255) gTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGgcacaaccaggctgcgcccggagcgggcatagttggccaggtagtcggcctcgtactccggggtgccgtcgtaaaggtaggggaactcgcggaacacagtaaggcgcaggcgagcgaggtcatcgatg < 2:382232‑M2/150‑129 (MQ=255) tgCTGGCG‑CTGGACGACGgcacaaccaggctgcgcccg > 1:996511‑M2/1‑18 (MQ=255) tgCTGGCG‑CTGGACGACGgcacaaccaggctgcgcccg < 2:996511‑M2/38‑21 (MQ=255) | CGGTGCCGCTATCGCGCCTTACATCGATGACCTCGCTCGCCTGCGCCTTACTGTGTTCCGCGAGTTCCCCTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGTCGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGTACTACTTCGGTGAGTCGCTGGTGTTGCCG > NC_002947/1036319‑1036610 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |