New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_002947 | = 1036467 | 73 (0.820) | 5 (0.060) | 5/240 | NT | 6.4% | coding (169/591 nt) | PP_0895 | hypothetical protein |
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TTACATCGATGACCTCGCTCGCCTGCGCCTTACTGTGTTCCGCGAGTTCCCCTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCTGGTGGATGTCGCGCCCGAATTCCAGCAGCCATTCCTGGCCCAGGGGCGCGACCCGGCCAGTGTGTACTACTTCGGTGAGTCGCTGGTGTTGCCGGCATACCGCGGACAGGGCCTG > NC_002947/1036337‑1036631 | ttACATCGATGACCTCGCTCGCCTGCGCCTTACTGTGTTCCGCGAGTTCCCCTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCaa < 2:2119793/150‑1 (MQ=255) aCATCGATGACCTCGCTCGCCTGCGCCTTACTGTGTTCCGCGAGTTCCCCTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAgg < 1:707865/150‑1 (MQ=255) aCATCGATGACCTCGCTCGCCTGCGCCTTACTGTGTTCCGCGAGTTCCCCTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAgg > 1:716865/1‑150 (MQ=255) tCGATGACCTCGCTCTCCTGCGCCTTACTGTGTTCCGCGAGTTCCCCTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAggtgg > 2:867588/1‑150 (MQ=255) aTGACCTCGCTCGCCTGCGCCTTACTGTGTTCCGCGAGTTCCCCTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCg > 2:2073375/1‑150 (MQ=255) tcgctcgcCTGCGCCTTACTGTGTTCCGCGAGGTCCCCTACCTTTACGCCGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCGGGTTGTGCTGGCG‑CTGGCCGACGGCAAGGTGGTCGGCGCct > 2:352794/1‑150 (MQ=255) gctcgcCTGCGCCTTACTGTGTTCCGCGAGTTCCCCTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCctct > 2:2230191/1‑150 (MQ=255) tcgcCTGCGCCTTACTGTGTTCCGCGAGTTCCCCTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTAc > 1:1125950/1‑150 (MQ=255) tGCGCCTTACTGTGTTCCGCGAGTTCCCCTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGTCCGTCTACCTGGCGAACTATGCTCGCTCCGAGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGcc > 2:407835/1‑150 (MQ=255) ccTTACTGTGTTCCGCGAGTTCCCCTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGcc > 2:1528859/1‑150 (MQ=255) cTTACTGTGTTCCGCGAGTTCCCCTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCg > 1:1823285/1‑150 (MQ=255) ttACTGTGTTCCGCGAGTTCCCCTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCTGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGc > 1:160331/1‑150 (MQ=255) ttACTGTGTTCCGCGAGTTCCCCTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCCGTCGTCCAG‑CGCCAgcacaaccaggctgcgcccggagcgg > 1:2123208‑M2/1‑117 (MQ=255) ttACTGTGTTCCGCGAGTTCCCCTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCCGTCG‑TCCAGCGCCAgcacaaccaggctgcgcccggagcgg < 2:2123208‑M2/143‑27 (MQ=255) aCTGTGTTCCGCGAGTTCCCCTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCtg < 2:1125950/150‑1 (MQ=255) tgtgTTCCGCGAGTTCCCCTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCtggt > 2:1055057/1‑150 (MQ=255) tgtgTTCCGCGAGTTCCCCTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCACATGCAGGTGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGACTCTACCGGCCTGCCGCtggg > 1:1354012/1‑149 (MQ=255) gtgtTCCGCGAGTTCCCCTACCTTTACGACGGCACCCCGGAGTACGAGGCCGACTACCTGGCCAACTATGCCCGCTCCGGGCGCAGCCTGGTTGTGCTGGCG‑CTGGACGACGGCAAGGTGGTCGGCGCCTCTACCGGCCTGCCGCtggtg > 2:328050/1‑150 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |