| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 1237638 = | 77 (0.870) | 4 (0.050) | 4/230 | NT | 5.8% | coding (477/1110 nt) | PP_1078 | ABC transporter ATP‑binding protein |
| ? | NC_002947 | 1237695 = | 57 (0.690) | coding (420/1110 nt) | PP_1078 | ABC transporter ATP‑binding protein | |||||
ACGCCGACCTGGTCGCTGACGGCAAAGGCTTCTTCCTGGTCATGGGTGACCAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAG‑CTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTGGCGTGGGTG > NC_002947/1237489‑1237787 | aCGCCGACCTGGTCGCTGACGGCAAAGGCTTCTTCCTGGTCATGGGTGACCAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAagc < 1:267330/150‑1 (MQ=255) cgcactgttcccgcacctgaccgtggcgcagaacattgcctttggtatcgccaaacacccacgccaggcggccgtcatcgaagagatgctggagctggtcaaactcggcgggctgggcgggcgttacccgcatgagctgtccggcggcca < 1:256186‑M1/2‑1 (MQ=255) cgcactgttcccgcacctgaccgtggcgcagaacattgcctttggtatcgccaaacacccacgccaggcggccgtcatcgaagagatgctggagctggtcaaactcggcgggctgggcgggcgttacccgcatgagctgtccggcggcca > 2:1506707‑M1/149‑150 (MQ=255) gcactgttcccgcacctgaccgtggcgcagaacattgcctttggtatcgccaaacacccacgccaggcggccgtcatcgaagagatgctggagctggtcaaactcggcgggctgggcgggcgttacccgcatgagctgtccggcggccag < 1:1535509‑M1/3‑1 (MQ=255) gcactgttcccgcacctgaccgtggcgcagaacattgcctttggtatcgccaaacacccacgccaggcggccgtcatcgaagagatgctggagctggtcaaactcggcgggctgggcgggcgttacccgcacgagctgtccgtcggccag < 2:989244‑M1/3‑1 (MQ=255) actgttcccgcacctgaccgtggcgcagaacattgcctttggtatcaccaaacacccacgccaggcggccgtcatcgaagagatgctggagctggtcaaactcggcgggctgggcgggcgttacccgcatgagctgtccggcggccagca < 1:1430108‑M1/5‑1 (MQ=255) actgttccagcacctgaccgtggcgcagaacattgcctttggtatcgccaaacacccacgccaggcggccgtcatcgaagagatgctggagctggtcaaactcggcgggctgggcgggcgttacccgcatgagctgtccggcggccagca < 2:101580‑M1/5‑1 (MQ=255) gACCTGGTCGCTGACGGCAAAGGCTTCTTCCTGGTCATGGGTGACCAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTAGAAATGATTGATGTAGACGTCCCGTTGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAagcagcag > 1:2089800/1‑150 (MQ=255) tgttcccgcacctgaccgtggcgcagaacattgcctttggtatcgccaaacaccaacgccaggcggccgtcctcgaagagatgctggagctgctcaaactcggcgggctgggcgggcgttacccgcataagctctccggccgccagcagc < 2:782115‑M1/7‑1 (MQ=255) cTGGTCGCTGACGGCAAAGGCTTCTTCCTGGTCATGGGTGACCAGAATGGCGCTTGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGGCAAGccgcagcag > 1:1692485/1‑150 (MQ=255) tGGTCGCTGACGGCAAGGGCTTCTTCCTGGTCATGGGTGACCAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTCGAGAATGGCTCATCAAGCCGCAGCAGt > 1:879490/1‑150 (MQ=255) gTCGCTGACGGCAAAGGCTTCTTCCTGGTCATGGGTGACCAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTg > 2:1641138/1‑150 (MQ=255) tCGCTGACGGCAAAGGCTTCTTCCTGGTCATGGGTGACCAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGc < 1:1826212/150‑1 (MQ=255) tCGCTGACGGCAAAGGCTTCTTCCTGGTCATGGGTGACCAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGAGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGc < 1:274207/150‑1 (MQ=255) cGCTGACGGCAAAGGCTTCTTCCTGGTCATGGGTGACCAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCg < 1:2284449/150‑1 (MQ=255) cGCTGACGGCAAAGGCTTCTTCCTGGTCATGGGTGACCAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCg < 1:2071812/150‑1 (MQ=255) ggCAAAGGCTTCTTCCTGGTCATGGGTGACCAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCggg > 2:82989/1‑150 (MQ=255) gCAAAGGCTTCTTCCTGGTCATGGGTGACCAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGgc > 2:1982675/1‑150 (MQ=255) 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tcCTGGTCATGGGTGACCAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCgg > 2:11731/1‑150 (MQ=255) ccTGGTCATGGGTGACCAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CCCGGGCGCTGGCGCCCgag < 1:69567/150‑3 (MQ=255) aTGGGTGACCAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGc < 2:2089800/150‑1 (MQ=255) gggTGACCAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGGGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGGAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCTAGCGCCCGGGGCAGGGCgg > 1:988509/1‑149 (MQ=255) tcgccaaacacccacgccaggcggccgtcatcgaagagatgctggagctggtcaaactcggcgggctgggcgggcgttacccgcatgagctgtccggcggccagca > 1:259850‑M1/102‑106 (MQ=255) tcgccaaacacccacgccaggcggccgtcatcgaagagatgctggagctggtcaaactcggcgggctgggcgggcgttacccgcatgagctgtccggcggccagca < 2:259850‑M1/5‑1 (MQ=255) aCCAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGCCACGt > 1:1115016/1‑150 (MQ=255) ccAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGtt > 2:256186/1‑150 (MQ=255) cAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTtg > 2:1704353/1‑150 (MQ=255) cAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTtg > 2:1103103/1‑150 (MQ=255) cAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTtg > 1:1052251/1‑150 (MQ=255) gAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTtgct > 2:1149400/1‑150 (MQ=255) aTGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTtgctgc < 2:371349/150‑1 (MQ=255) ggCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTTGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGctgctg < 1:1769375/150‑1 (MQ=255) ccacgccaggcggccgtcatcgaagagatgctggagctggtcaaactcggcgggctgggcgggcgttacccgcatgagctgtccggcggcCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGgc < 2:168627‑M1/59‑1 (MQ=255) ccacgccaggcggccgtcatcgaagagatgctggagctggtcaaactcggcgggctgggcgggcgttacccgcatgagctgtccggcggcCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGgc > 1:168627‑M1/91‑149 (MQ=255) gTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGccgccg < 1:1103103/150‑1 (MQ=255) gTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGccgccg < 2:1207579/150‑1 (MQ=255) aCCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGa > 1:1113577/1‑150 (MQ=255) aCCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCCAATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATAACTTGTCAAGCAGCAGCAG‑TGCGATCCTCGATC‑TGATCGCCCTTGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGa < 1:420744/150‑1 (MQ=255) ccGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGctgctg > 2:437119/1‑140 (MQ=255) 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gcgGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAg > 2:1535509/1‑150 (MQ=255) gcgGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCATCAAGCAGCAGCAGTTCCAG‑‑CTCGGGTGGCAGTGCGCTGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAg > 1:1143473/1‑150 (MQ=255) cgGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCa < 2:794111/106‑1 (MQ=255) cgGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCa > 1:794111/1‑106 (MQ=255) ttttGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCgg < 1:2257671/110‑1 (MQ=255) ttttGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCgg > 2:2257671/1‑110 (MQ=255) 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gagaATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAG‑CTCATGCgg < 1:82989/150‑1 (MQ=255) agaATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAG‑CTCATGCggg > 1:196988/1‑150 (MQ=255) gaagagatgctggagctggtcaaactcggcgggctgggcgggcgttacccgcatgagctgtccggcggccagcagc > 2:1082285‑M1/70‑76 (MQ=255) gaagagatgctggagctggtcaaactcggcgggctgggcgggcgttacccgcatgagctgtccggcggccagcagc < 1:1082285‑M1/7‑1 (MQ=255) tGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAG‑CTCATGCGGGTAAc < 1:1477038/150‑1 (MQ=255) tGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAG‑CTCATGCGGGTAAc < 2:2364097/150‑1 (MQ=255) 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aTGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAG‑CTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGccc < 1:1149400/150‑1 (MQ=255) tCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAG‑CTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGa > 1:101580/1‑150 (MQ=255) cgcCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAG‑CTCATGCggg > 1:2057999/1‑123 (MQ=255) cgcCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAG‑CTCATGCggg < 2:2057999/123‑1 (MQ=255) gcCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAG‑CTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGa < 1:1121477/150‑1 (MQ=255) gcCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGATGGTCGCCGGACAG‑CTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGa < 1:1641138/150‑1 (MQ=255) ccGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAG‑CTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGAc < 1:2031992/150‑1 (MQ=255) tgggcgggcgttacccgcatgagctgtccggcggcCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGctgctg > 2:2144456‑M1/36‑92 (MQ=255) tgggcgggcgttacccgcatgagctgtccggcggcCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGctgctg < 1:2144456‑M1/57‑1 (MQ=255) tCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGgccgc < 1:2106736/88‑1 (MQ=255) tCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGgccgc > 2:2106736/1‑88 (MQ=255) cGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAG‑CTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCTCCAGCATCTCtt < 1:1982675/150‑1 (MQ=255) gAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAG‑CTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCTCCAGCATCTCTTc < 2:1504228/150‑1 (MQ=255) caGGTTGGAGAATCGCTCGTCAAGCAGCTGCAGTTTCGG‑‑CTCGGGCGCTGGCGCCCGGCCGAGGGCGTCACGTTGCTGCTGGCCGCCTGACAT‑CTCATGCGGGTAACGCCAGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCTCCACCATCTCTTc < 2:1692485/149‑1 (MQ=255) ggAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAggg > 2:2198672/1‑59 (MQ=255) ggAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAggg < 1:2198672/59‑1 (MQ=255) agaATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCGGGGCCAGGGCGACACGTTGCTTTTGGGCGCCGGATGGCCTGACCCGGG‑AGCGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGGCgg > 1:782115/1‑150 (MQ=255) gaATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAG‑CTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGgc > 2:2125251/1‑150 (MQ=255) tGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGACGCCGGACAG‑CTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGgccgc > 2:2001448/1‑150 (MQ=255) gggagcGTCAAGCAGCAGCAGTCGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGAGCCAGCGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAG‑CTCATGCGGGTAACGCCTGCCCAGCCCCCCGCGTTTGACCAGCCCCAGCCTCACTCCGATCAccgccgg < 2:2173994/145‑2 (MQ=255) tCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAG‑CTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTgg > 2:478632/1‑150 (MQ=255) cGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAG‑CTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTGGc < 1:1609474/150‑1 (MQ=255) gTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGTTGGCCGCCGGACAG‑CTCATGCGGGTAACGCCCGCCAAGCCCGGCGAGTTTGACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACAGCCGCCTGGCg > 1:760221/1‑150 (MQ=255) cAAGCATCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGTGACGTTTTTCTGCTGGCCGCCGGACAG‑CTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTGGCGTg < 1:149779/150‑1 (MQ=255) cAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAG‑CTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTGGCGTg > 2:1633394/1‑150 (MQ=255) aaGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGAGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAG‑CTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTGGCGTgg > 2:2022618/1‑150 (MQ=255) CAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAG‑CTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTGGCGTGGgtg < 1:1541316‑M1/150‑1 (MQ=255) | ACGCCGACCTGGTCGCTGACGGCAAAGGCTTCTTCCTGGTCATGGGTGACCAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAG‑CTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTGGCGTGGGTG > NC_002947/1237489‑1237787 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |