| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 1237638 = | 77 (0.870) | 4 (0.050) | 4/230 | NT | 5.8% | coding (477/1110 nt) | PP_1078 | ABC transporter ATP‑binding protein |
| ? | NC_002947 | 1237695 = | 57 (0.690) | coding (420/1110 nt) | PP_1078 | ABC transporter ATP‑binding protein | |||||
GCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAG‑CTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTG‑ACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTGGCGTGGGTGTTTGGCGATACCAAAGGCAATGTTCTGCGCCACGGTCAGGTGCGGGAACAGTGCGTA > NC_002947/1237548‑1237844 | ccacgccaggcggccgtcatcgaagagatgctggagctggtcaaactcggcgggctgggcgggcgttacccgcatgagctgtccggcggcCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGgc > 1:168627‑M1/91‑149 (MQ=255)ccacgccaggcggccgtcatcgaagagatgctggagctggtcaaactcggcgggctgggcgggcgttacccgcatgagctgtccggcggcCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGgc < 2:168627‑M1/59‑1 (MQ=255) gTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGccgccg < 2:1207579/150‑1 (MQ=255) gTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGccgccg < 1:1103103/150‑1 (MQ=255) aCCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGa > 1:1113577/1‑150 (MQ=255) aCCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCCAATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATAACTTGTCAAGCAGCAGCAG‑TGCGATCCTCGATC‑TGATCGCCCTTGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGa < 1:420744/150‑1 (MQ=255) cgcgGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACa < 1:1704353/150‑1 (MQ=255) gcgGCTTTTGAGAATTTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAg > 2:1609474/1‑150 (MQ=255) gcgGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGAc > 2:2345901/1‑148 (MQ=255) gcgGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGAc < 1:2345901/148‑1 (MQ=255) gcgGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAg > 2:1535509/1‑150 (MQ=255) gcgGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCATCAAGCAGCAGCAGTTCCAG‑‑CTCGGGTGGCAGTGCGCTGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAg > 1:1143473/1‑150 (MQ=255) ttttGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAG‑CTCAt < 2:1113577/150‑1 (MQ=255) ttttGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAG‑CTCAt > 1:232177/1‑150 (MQ=255) ttGAGAATGTCTCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAG‑CTCATGc > 2:1430108/1‑150 (MQ=255) gggaATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAG‑CTCATGCgg < 1:2398747/148‑1 (MQ=255) gagaATGTCGCGCACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCCCCACGTCGAGGTTGGAGAATTGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAG‑CTCATGCgg < 2:2193173/150‑1 (MQ=255) gagaATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAG‑CTCATGCgg < 1:82989/150‑1 (MQ=255) agaATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAG‑CTCATGCggg > 1:196988/1‑150 (MQ=255) tGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAG‑CTCATGCGGGTAAc < 2:2364097/150‑1 (MQ=255) tGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAG‑CTCATGCGGGTAAc < 1:1477038/150‑1 (MQ=255) tCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAG‑CTCATGCGGGTAAcg < 2:1415311/149‑1 (MQ=255) tCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAG‑CTCATGCGGGTAAcg > 1:1415311/1‑149 (MQ=255) gcgAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAG‑CTCATGCGGGTAAcgccc > 1:1504228/1‑150 (MQ=255) gcgAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAG‑CTCATGCGGGTAAcgccc < 1:2231184/150‑1 (MQ=255) aTGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAG‑CTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGccc < 1:1149400/150‑1 (MQ=255) tCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAG‑CTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGa > 1:101580/1‑150 (MQ=255) cgcCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAG‑CTCATGCggg < 2:2057999/123‑1 (MQ=255) cgcCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAG‑CTCATGCggg > 1:2057999/1‑123 (MQ=255) gcCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAG‑CTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTG‑a < 1:1121477/150‑1 (MQ=255) gcCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGATGGTCGCCGGACAG‑CTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTG‑a < 1:1641138/150‑1 (MQ=255) ccGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAG‑CTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTG‑Ac < 1:2031992/150‑1 (MQ=255) tCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGgccgc < 1:2106736/88‑1 (MQ=255) tCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGgccgc > 2:2106736/1‑88 (MQ=255) cGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAG‑CTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTG‑ACCAGCTCCAGCATCTCtt < 1:1982675/150‑1 (MQ=255) gAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAG‑CTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTG‑ACCAGCTCCAGCATCTCTTc < 2:1504228/150‑1 (MQ=255) caGGTTGGAGAATCGCTCGTCAAGCAGCTGCAGTTTCGG‑‑CTCGGGCGCTGGCGCCCGGCCGAGGGCGTCACGTTGCTGCTGGCCGCCTGACAT‑CTCATGCGGGTAACGCCAGCCCAGCCCGCCGAGTTTG‑ACCAGCTCCACCATCTCTTc < 2:1692485/149‑1 (MQ=255) agaATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCGGGGCCAGGGCGACACGTTGCTTTTGGGCGCCGGATGGCCTGACCCGGG‑AGCGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTG‑ACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGGCgg > 1:782115/1‑150 (MQ=255) gaATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAG‑CTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTG‑ACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGgc > 2:2125251/1‑150 (MQ=255) tGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGACGCCGGACAG‑CTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTG‑ACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGgccgc > 2:2001448/1‑150 (MQ=255) gggagcGTCAAGCAGCAGCAGTCGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGAGCCAGCGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAG‑CTCATGCGGGTAACGCCTGCCCAGCCCCCCGCGTTTG‑ACCAGCCCCAGCCTCACTCCGATCAccgccgg < 2:2173994/145‑2 (MQ=255) tCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAG‑CTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTG‑ACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTgg > 2:478632/1‑150 (MQ=255) cGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAG‑CTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTG‑ACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTGGc < 1:1609474/150‑1 (MQ=255) gTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGTTGGCCGCCGGACAG‑CTCATGCGGGTAACGCCCGCCAAGCCCGGCGAGTTTG‑ACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACAGCCGCCTGGCg > 1:760221/1‑150 (MQ=255) 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tgg‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAG‑CTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTG‑ACCAGCTCCAGCATCTCTTc < 1:1452608/113‑1 (MQ=255) tgg‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAG‑CTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTG‑ACCAGCTCCAGCATCTCTTc > 2:1452608/2‑114 (MQ=255) ccgccgcGGGCGCCAGCGCCCGGGCAAGGGCCACACGTCCCAGCTCGCCGCCGGACCG‑TTGATGCGGGGAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTG‑ACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGTATGGCGTGGGTGTTTGGGGATAc < 2:879490/144‑1 (MQ=255) tCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAG‑CTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTG‑ACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTGGCGTGGGTGTTTGGCGATACCAAAg < 1:2001448/150‑1 (MQ=255) ccGGGCGCTGGCGCCCGAGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAG‑CTCATGCGGGTa < 1:1362140/64‑1 (MQ=37) ccGGGCGCTGGCGCCCGAGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAG‑CTCATGCGGGTa > 2:1362140/2‑65 (MQ=37) aGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTCGCCGCCGGACAG‑CTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTG‑ACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTGGCGTGGGTGTTTGGCGATACCAAAGGCAATGTTc > 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gctgctgGCGGCCGGAGAG‑CTTATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTG‑AGCAGCTCCAGCATCTCTTCGAGGACGGCCGCCTGGCGTTGGTGTTTGGCGATACCAAAGGCAATGTTCTGCGCCACGGTCAGGTGCGGGAACa < 2:782115‑M2/143‑1 (MQ=255) gctgctgGCCGCCGGACAG‑CTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTG‑ACCAGCTCCAGCATCTCTTc < 1:1082285‑M2/69‑1 (MQ=255) gctgctgGCCGCCGGACAG‑CTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTG‑ACCAGCTCCAGCATCTCTTc > 2:1082285‑M2/8‑76 (MQ=255) tgctgGCCGCCGGACAG‑CTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTG‑ACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTGGCGTGGGTGTTTGGTGATACCAAAGGCAATGTTCTGCGCCACGGTCAGGTGCGGGAACAGt < 1:1430108‑M2/145‑1 (MQ=255) tgctgGCCGCCGGACAG‑CTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTG‑ACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTGGCGTGGGTGTTTGGCGa < 2:259850‑M2/101‑1 (MQ=255) tgctgGCCGCCGGACAG‑CTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTG‑ACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTGGCGTGGGTGTTTGGCGa > 1:259850‑M2/6‑106 (MQ=255) tgctgGCCGCCGGACAG‑CTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTG‑ACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTGGCGTGGGTGTTTGGCGATACCAAAGGCAATGTTCTGCGCCACGGTCAGGTGCTGGAACAGt < 2:101580‑M2/145‑1 (MQ=255) ctgGCCGCCGGACAG‑CTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTG‑ACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTGGCGTGGGTGTTTGGCGATACCAAAGGCAATGTTCTGCGCCACGGTCAGGTGCGGGAACAGTGc < 1:1535509‑M2/147‑1 (MQ=255) ctgGCCGACGGACAG‑CTCGTGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTG‑ACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTGGCGTGGGTGTTTGGCGATACCAAAGGCAATGTTCTGCGCCACGGTCAGGTGCGGGAACAGTGc < 2:989244‑M2/147‑1 (MQ=255) tgGCCGCCGGACAG‑CTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTG‑ACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTGGCGTGGGTGTTTGGCGATACCAAAGGCAATGTTCTGCGCCACGGTCAGGTGCGGGAACAGTGCg > 2:1506707‑M2/3‑150 (MQ=255) tgGCCGCCGGACAG‑CTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTG‑ACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTGGCGTGGGTGTTTGGCGATACCAAAGGCAATGTTCTGCGCCACGGTCAGGTGCGGGAACAGTGCg < 1:256186‑M2/148‑1 (MQ=255) gccgccGGACAG‑CTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTG‑ACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTGGCGTGGGTGTTTGGCGATACCAAAGGCAATGTTCTGCGCCACGGTCAGGTGCGGGAACAGTGCGTa < 1:1809646/150‑1 (MQ=255) | GCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGG‑‑CTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCCGGACAG‑CTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTG‑ACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTGGCGTGGGTGTTTGGCGATACCAAAGGCAATGTTCTGCGCCACGGTCAGGTGCGGGAACAGTGCGTA > NC_002947/1237548‑1237844 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |