| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | = 1452353 | 108 (1.220) | 8 (0.090) | 7/236 | NT | 7.5% | coding (508/1542 nt) | PP_1271 | putative Multidrug efflux MFS transporter |
| ? | NC_002947 | = 1452371 | 95 (1.120) | coding (526/1542 nt) | PP_1271 | putative Multidrug efflux MFS transporter | |||||
Only 100 of 137 total aligned reads displayed.
GCCTGATGTTGCTGCGCGTACTGCAGGGCTTTGCCGCTGGCGCCTTGCCGCCGATGCTGATGAGCGTGGCCCTGCGCTTTCTGCCGCCAGGTATCAAGGTCTATGGCCTGGCCTGCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCACGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCAGATCATCCTGCCCTCGCTGCTGGCCATGGTCTGCGTAGGCTGGGGGCTGCCGCAGGACCCGCTGCGCCTGGAGCGTTTCAAACAGTT > NC_002947/1452207‑1452501 | gCCTGATGTTGCTGCGCGTACTGCAGGGCTTTGCCGCTGGCGCCTTGCCGCCGATGCTGATGAGCGTGGCCCTGCGCTTTCTGCCGCCAGGTATCAAGGTCTATGGCCTGGCCTGCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCg < 2:371314/150‑1 (MQ=255) ccTGATGTTGCTGCGCGTACTGCAGGGCTTTGCCGCTGGCGCCTTGCCGCCGATGCTGATGAGCGTGGCCCTGCGCTTTCTGCCGCCAGGTATCAAGGTCTATGGCCTGGCCTGCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCgg < 1:1465518/150‑1 (MQ=255) gTTGCTGCGCGTACTGCAGGGCTTTGCCGCTGGCGCCTTGCCGCCGATGCTGATGAGCGTGGCCCTGCGCTTTCTGCCGCCAGGTATCAAGGTCTATGGCCTGGCCCGCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCAcgcc > 2:2395800/1‑150 (MQ=255) 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tGCAGGGCTTTGCCGCTGGCGCCTTGCCGCCGATGCTGATGAGCGTGGCCCTGCGCTTTCTGCCGCCAGGTATCAAGGTCTATGGCCTGGCCTGCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCACGCCGCTGGCGGGGTtgt > 2:1037067/1‑150 (MQ=255) tGCAGGGCTTTGCCGCTGGCGCCTTGCCGCCGATGCTGATGAGCGTGGCCCTGCGCTTTCTGCCGCCAGGTATCAACCTGCATATCGTGGCCTGCTACGCCCTGACCGCCACCTTTTGCTGCTAGCGCGGCACGCCGCTGGCGGGGTtgt > 1:420422/1‑150 (MQ=255) cgCAGGGCTTTGCCGCTGGCGCCTTGCCGCCGATGCTGATGAGCGTGGCCCTGCGCTTTCTGCCGCCAGGTATCAAGGTCTATGGCCTGGCCTGCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCACGCCGCTGGCGGGGTtgt < 1:1013376/149‑1 (MQ=255) gCAGGGCTTTGCCGCTGGCGCCTTGCCGCCGATGCTGATGAGCGTGGCCCTGCGCTTTCTGCCACCAGGTATCAAGGTCTATGGCCTGGCCTGCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCACGCCGCTGGCGGGGTtgtg < 1:1517590/150‑1 (MQ=255) cAGGGCTTTGGCGCTGGCGCCTTGCCGCCGATGCTGATGAGCGTGGCCCTGCGCTTTCTTCCGCCAGGTGTCAAGGTCTATGGCCTGGCCTGCTACGCCCTGACCGCCACCTTTTGCCCCAACCTCGGCACGCCGCTGGCGGGGTTGTgg > 2:1008960/1‑150 (MQ=255) 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aCCTTTGGCCCCAACCTCGGCACGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCAGATCATCCTGCCCTCGCTGCTGGCCATgg > 1:352397/1‑106 (MQ=255) aCCTTTGGCCCCAACCTCGGCACGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCAGATCATCCTGCCCTCGCTGCTGGCCATgg > 1:352373/1‑106 (MQ=255) aCCTTTGGCCCCAACCTCGGCACGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCAGATCATCCTGCCCTCGCTGCTGGCCATgg < 2:352397/106‑1 (MQ=255) ccTTTGGCCCCAACCTCGGCACGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCAGATCATCCTGCCCTCGCTGCTGGCCATGGTCTGCGTAGGCTGGGGGCTGCCGCAGGACCCGCTGCGCCTGGAGc > 1:848138/1‑150 (MQ=255) ccTTTGGCCACAACCccgccagcggcgtgccgaggttggggccaaaggtggcggtcagggcgtagcaggccag < 1:1090480‑M1/73‑59 (MQ=255) ccTTTGGCCACAACCccgccagcggcgtgccgaggttggggccaaaggtggcggtcagggcgtagcaggccag > 2:1090480‑M1/1‑15 (MQ=255) cTTTGGCCCCAACCTCGGCACGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCAGATCATCCTGCCCTCGCTGCTGGCCATGGTCTGCGTAg > 2:1356978/1‑113 (MQ=255) cTTTGGCCCCAACCTCGGCACGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCAGATCATCCTGCCCTCGCTGCTGGCCATGGTCTGCGTAg < 1:1356978/113‑1 (MQ=255) ttGGCCCCAACCTCGGCACGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCAGATCATCCTGCCCTCGCTGCTGGCCATGGTCTGCGTAGGCTGGGGGCTGCCGCAGGACCCGCTGCGCCTGGAGCGtt < 1:14070/150‑1 (MQ=255) gCCCCAACCTCGGCACGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCAGATCATCCTGCCCTCGCTGCTGGCCATGGTCTGCGTAGGCTGGGGGCTGCCGCAGGACCCGCTGCGCCTGGAGCGTTTCa < 1:2329076/150‑1 (MQ=255) cggaaCGTCGGCACGCGGCTGCCGGGGGTGGGGACCGAATCCGCCGGTTTGCAATGGGCGTTCTGGCAGATCATCCTGCTCGAGCTGCTGACCATGGTCTGCGTCTTCTGGTGACTGCCGCATGACCAGCTGCTCCTGATGCGTTTCaga > 2:1895998/4‑148 (MQ=255) cccAACCTCGGCACGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCAGATCATCCTGCCCTCGCTGCTGGCCATGGTCTGCGTAGGCTGGGGGCTGCCGCAGGACCCGCTGCGCCTGGAGCGTTTCaaa < 1:1072058/150‑1 (MQ=255) cccAACCTCGGCACGCCGCTGGCGGGGATGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTATGGCAGATCATCCTGCCCTCGCTGCTGGCCATGGTCTGCGTAGGCTGGGGGCTGCCGCAGGACCCGCTGCGCCTGGAGCGTTTCaaa > 2:2141138/1‑150 (MQ=255) cccAACCGCGGCACGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCAGATCATCCTGCCCTCGCTGCTGGCCATGGTCTGCGTAGGCTGGGGGCTGCCGCAGGACCCGCTGCGCCTCGCGCGTTTCaaa < 2:2271105/150‑1 (MQ=255) ccAACCTCGGCACGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCAGATCATCCTGCCCTCGCTGCTGGCCATGGTCTGCGTAGGCTGGGGGCTGCCGCAGGACCCGCTGCGCCTGGAGCGTTTCAAAc > 1:2269858/1‑150 (MQ=255) aaCCTCGGCACGCCGCTGGCGGggttggggccaaaggtggcggtcagggcgtagcaggccaggccatagaccttgatacctggcggcagaaa > 2:703037‑M2/1‑22 (MQ=255) aaCCTCGGCACGCCGCTGGCGGggttggggccaaaggtggcggtcagggcgtagcaggccaggccatagac < 2:59910‑M2/71‑50 (MQ=255) aCCccgccagcggcgtgccgaggttggggccaaaggtggcggtcagggcgtagcaggccaggccatagaccttgatacctggcggcagaaagcgcagggccacgctcatcagcatcggcggcaaggcgccagcggcaaagccctgcagta > 1:1608195‑M1/1‑3 (MQ=255) ccccgccagcggcgtgccgaggttggggccaaaggtggcggtcagggcgtagcaggccaggccatagaccttgatacctggcggcagaaagcgcagggccacgctcatcagcatcggcggcaaggcgccagcggcaaagccctgcagtac < 2:1930824‑M1/150‑149 (MQ=255) ccTCGGCACGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCAGATCATCCTGCCCTCGCTGCTGGCCATGGTCTGc < 1:2327302/97‑1 (MQ=255) ccTCGGCACGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCAGATCATCCTGCCCTCGCTGCTGGCCATGGTCTGc > 2:2327302/1‑97 (MQ=255) ccTCGGCACGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCAGATCATCCTGCCCTCGCTGCTGGCCATGGTCTGCGTAGGCTGGGGGCTGCCGCAGGACCCGCTGCGCCTGGAGCGTTTCAAACAGtt > 1:1551714/1‑150 (MQ=255) | GCCTGATGTTGCTGCGCGTACTGCAGGGCTTTGCCGCTGGCGCCTTGCCGCCGATGCTGATGAGCGTGGCCCTGCGCTTTCTGCCGCCAGGTATCAAGGTCTATGGCCTGGCCTGCTACGCCCTGACCGCCACCTTTGGCCCCAACCTCGGCACGCCGCTGGCGGGGTTGTGGACCGAATACGTCGGTTGGCAATGGGCGTTCTGGCAGATCATCCTGCCCTCGCTGCTGGCCATGGTCTGCGTAGGCTGGGGGCTGCCGCAGGACCCGCTGCGCCTGGAGCGTTTCAAACAGTT > NC_002947/1452207‑1452501 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |