| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
TTTCGGCTGTTCCTCTCTATTAAGGCGAATAACACCCACAGGTATCGGCCGAATTAAGCTAAAGCTTGAGCAGAGGATTAAAGAGATGTCGGAATTTTCGACCATCGTTGTAGGCGCGGGCCCGGATGGCCAGCCAGTCGGGCAAGCAATGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACTGGCAAGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGGCGGTGTTCGCCGCGGATGTCAAAGGCGACCTTTGTGGCCTGGGTGCTG > NC_002947/1562216‑1562514 | tttCGGCTGTTCCTCTCTATTAAGGCGAATAACACCCACAGGTATCGGCCGAATTAAGCTAAAGCTTGAGCAGAGGATTAAAGAGATGTCGGAATTTTCGACCATCGTTGTAGGCGCGGGCCCGGATGGCCAGCCAGTCGGGCAAGCAAt < 1:417345/150‑1 (MQ=255)ttcgggatGTTCCTCTCTATTAAGGCGAATAACACCCACAGGTATCGGCCGAATTAAGCTAAAGCTTGAGCAGAGGATTAAAGAGATGTCGGAATTTTCGACCATCGTTGTAGGCGCGGGCCCGGATGGCCAGCCAGTCGGGCAAGCAAt < 2:299938/143‑1 (MQ=255) ggCTGTTCCTCTCTATTAAGGCGAATAACACCCACAGGTATCGGCCGAATTAAGCTAAAGCTTGAGCAGAGGATTAAAGAGATGTCGGAATTTTCGACCATCGTTGTAGGCGCGGGCCCGGATGGCCAGCCAGTCGGGCAAGCAATgcgc < 2:621120/150‑1 (MQ=255) 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gTCGGGCAAGCAATGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACTGGCAAGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGGCGGTGTTCGCCGCGGATGTCAAAGGCGACCTTtgt > 2:1375991/1‑150 (MQ=255) gggCAAGCAATGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACTGGCAAGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGGCGGTGTTCGCCGCGGATGTCAAAGGCGACCTTTGTGGc > 2:2386992/1‑150 (MQ=255) gggCAAGCAATGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACTGGCAAGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGGCGGTGTTCGCCGCGGATGTCAAAGGCGACCTTTGTGGc > 1:15218/1‑150 (MQ=255) gggCAAGCAATGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACAGGCAAGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGGCGGTGTTCGCCGCGGATGTCAAAGGCGACCTTTGTGGc > 2:1559108/1‑150 (MQ=255) gcaagcaaTGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGTTGGCGCAACCGGTACTGGCAAGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGGCGGTGTTCGCCGCGGATGTCAAAGGCGACCTTTGTGGCCt > 2:1389989/1‑150 (MQ=255) caagcaaTGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACTGGCAAGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGGCGGTGTTCGCCGCGGATGTCAAAGGCGACCTTTGTGGCCTg > 1:1701745/1‑150 (MQ=255) aagcaaTGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACTGGCAAGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGGCGGTGTTCGCCGCGGATGTCAAAGGCGACCTTTGTGGCCTgg < 2:502871/150‑1 (MQ=255) gcaaTGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACTGGCAAGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCa < 2:681602/91‑1 (MQ=255) caaTGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACTGGCAAGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGCGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGGCGGTGTTCGCCGCGGATGTCAAAGGCGACCTTTGTGGCCTGGGtg < 1:1375991/150‑1 (MQ=255) TGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACTGGCAAGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGGCGGTGTTCGCCGCGGATGTCAAAGGCGACCTTTGTGGCCTGGGtgctg < 1:1018416‑M1/150‑1 (MQ=255) | TTTCGGCTGTTCCTCTCTATTAAGGCGAATAACACCCACAGGTATCGGCCGAATTAAGCTAAAGCTTGAGCAGAGGATTAAAGAGATGTCGGAATTTTCGACCATCGTTGTAGGCGCGGGCCCGGATGGCCAGCCAGTCGGGCAAGCAATGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCAACCGGTACTGGCAAGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGGCGGTGTTCGCCGCGGATGTCAAAGGCGACCTTTGTGGCCTGGGTGCTG > NC_002947/1562216‑1562514 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |