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TGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCA‑A‑CCGGTACTGGCAAGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGGCGGTGTTCGCCGCGGATGTCAAAGGCGACCTTTGTGGCCTGGGtgctg < 1:1018416‑M1/150‑1 (MQ=255) CCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCA‑A‑CCGGTACTGGCAAGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGGCGGTGTTCGCCGCGGATGTCAAAGGCGACCTTTGTGGCCTGGGTGCTGCCgg > 2:2374849‑M1/1‑150 (MQ=255) cagccaccagaccgtggcggttggccaggcgcaA‑CCGGTACTGGCAAGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGGCGGTGTTCGCCGCGGATGTCAAAGGCGACCTTtgt < 2:1897330‑M2/99‑1 (MQ=255) cagccaccagaccgtggcggttggccaggcgcaA‑CCGGTACTGGCAAGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGGCGGTGTTCGCCGCGGATGTCAAAGGCGACCTTtgt > 1:1897330‑M2/34‑132 (MQ=255) ggCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCA‑A‑CCGGTACTGGCAAGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGGCGGTGTTCGCCGCGGATGTCAAAGGCGACCTTTGTGGCCTGGGTGCTGCCGGTgc < 2:1724575/150‑1 (MQ=255) gccaccagaccgtggcggttggccaggcgcaA‑CCGGTACTGGCAAGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGGCGGTGTTCGCCGCGGATGTCAAAGGCGACCTTTGTGGCCTGGGTGCTGCCGGTgc < 1:697693‑M2/119‑1 (MQ=255) ccAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCA‑A‑CCGGTACTGGCAAGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGGCGGTGTTCGCCGCGGATGTCAAAGGCGACCTTTGTGGCCTGGGTGCTGCCGGTgcgc > 1:1961403/1‑150 (MQ=255) ccGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCA‑A‑CCGGTACTGGCAAGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGGCGGTGTTCGCCGCGGATGTCAAAGGCGACCTTTGTGGCCTGGGTGCTGCCGGTGCGCcaca < 1:1359067/150‑1 (MQ=255) gCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCA‑A‑CCGGTACTGGCAAGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGGCGGTGTTCGCCGCGGATGTCAAAGGCGACCTTTGTGGCCTGGGTGCTGCCGGTGCGCCACAgg < 2:1961403/150‑1 (MQ=255) gCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCA‑A‑CCGGTACTGGCAAGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGGCGGTGTTCGCCGCGGATGTCAAAGGCGACCTTTGTGGCCTGGGTGCTGCCGGTGCGCCACAgg < 2:1931708/150‑1 (MQ=255) gCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCA‑A‑CCGGTACTGGCAAGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGGCGGTGTTCGCCGCGGATGTCAAAGGCGACCTTTGTGGCCTGGGTGCTGCCGGTGCGCCACAgg < 1:1634495/150‑1 (MQ=255) cTGGTGGCTGGCGCA‑A‑CCGGTACTGGCAAGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGGCGGTGTTCGCCGCGGATGTCAAAGGCGACCTTTGTGGCCTGGGTGCTGCCGGTGCGCCACAGGGCAAGGTg < 2:1519147/150‑1 (MQ=255) gtggCTGGCGCA‑A‑CCGGTACTGGCAAGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGGCGGTGTTCGCCGCGGATGTCAAAGGCGACCTTTGTGGCCTGGGTGCTGCCGGTGCGCCACAGGGCAAGGTGGCt > 1:1445316/1‑150 (MQ=255) gtggCTGGCGCA‑A‑CCGGTACTGGCAAGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGGTGTGGTGTTCGAAGCGGATGTAAAAGGAGGATTTGATGGCCTGGGTGCTGCCGGTGCGCCACAGGGCAAGGTGGCt > 1:1143189/1‑150 (MQ=255) ctggcGCA‑A‑CCGGTACTGGCAAGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGGCGGTGTTCGCCGCGGATGTCAAAGGCGACCTTTGTGGCCTGGGTGCTGCCGGTGCGCCACAGGGCAAGGTGGCTGAgc < 1:197182/150‑1 (MQ=255) tggcGCA‑A‑CCGGTACTGGCAAGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGGCGGTGTTCGCCGCGGATGTCAAAGGCGACCTTTGTGGCCTGGGTGCTGCCg < 2:168479/122‑1 (MQ=255) tggcGCA‑A‑CCGGTACTGGCAAGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGGCGGTGTTCGCCGCGGATGTCAAAGGCGACCTTTGTGGCCTGGGTGCTGCCg > 1:168479/1‑122 (MQ=255) | AGGTATCGGCCGAATTAAGCTAAAGCTTGAGCAGAGGATTAAAGAGATGTCGGAATTTTCGACCATCGTTGTAGGCGCGGGCCCGGATGGCCAGCCAGTCGGGCAAGCAATGCGCCTGGCCAACCGCCACGGTCTGGTGGCTGGCGCA‑A‑CCGGTACTGGCAAGACCGTCACCCTGCAGCGCCTGGCGGAGGTGTTCAGCGACGCAGGGGTGGCGGTGTTCGCCGCGGATGTCAAAGGCGACCTTTGTGGCCTGGGTGCTGCCGGTGCGCCACAGGGCAAGGTGGCTGAGC > NC_002947/1562255‑1562544 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |