| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | = 1581070 | 119 (1.340) | 10 (0.120) | 8/234 | NT | 7.9% | coding (369/3153 nt) | ttgB | efflux pump membrane protein TtgB |
| ? | NC_002947 | = 1581083 | 121 (1.440) | coding (356/3153 nt) | ttgB | efflux pump membrane protein TtgB | |||||
Only 100 of 155 total aligned reads displayed.
CTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCT‑‑‑TGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGTCGGGGTTGGTGCCCTGTTCGAAGGTGGCGGTAATGGTCATGCTGCCGTCGGAGTTACTTTCCGACGACACATAACGCAGGTT > NC_002947/1580922‑1581219 | cTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCT‑‑‑tgctgct < 1:1561597/150‑1 (MQ=255) tACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCT‑‑‑tgctgctg > 2:311112/1‑150 (MQ=255) cccGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCT‑‑‑TGCTGCTGCACt < 1:311112/150‑1 (MQ=255) ccGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGGCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCT‑‑‑TGCTGCTGCACtt > 1:864554/1‑150 (MQ=255) cgcgGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCT‑‑‑TGCTGCTGCACTTc < 2:537197/150‑1 (MQ=255) aCGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCT‑‑‑TGCTGCTGCACTTCCTGCGg > 1:79051‑M2/1‑149 (MQ=255) agaTCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCT‑‑‑TGCTGCTGCACTTCCTGCGgcagca > 2:2149031‑M2/1‑144 (MQ=255) aTCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCT‑‑‑TGCTGCcgcaggaagtgcagca > 2:787254‑M1/1‑129 (MQ=255) cGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCcgcaggaagtgcagcagcaa < 2:50527‑M1/150‑21 (MQ=255) cGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCT‑‑‑TGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCgg > 2:570913/1‑150 (MQ=255) tCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCT‑‑‑TGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTg < 2:1407968/150‑1 (MQ=255) tCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCT‑‑‑TGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTg < 2:1364106/150‑1 (MQ=255) ttCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCT‑‑‑TGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTc < 2:896912/150‑1 (MQ=255) agaCGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCT‑‑‑TGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTc < 1:1533026/146‑1 (MQ=255) gaCGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCT‑‑‑TGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCtt > 1:2172702/1‑150 (MQ=255) aCGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCT‑‑‑TGCTGCCGCAGGAAGGGCAgcagcaaggtatccgcgtcaccaaagcag > 1:476753‑M2/1‑121 (MQ=255) gATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCT‑‑‑TGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGtt < 2:2174994/150‑1 (MQ=255) gATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCT‑‑‑TGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGtt > 1:1149099/1‑150 (MQ=255) gTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCT‑‑‑TGCTGCTGCa > 1:976765/1‑104 (MQ=255) gCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCT‑‑‑TGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTctgtacctgt < 2:426238/150‑1 (MQ=255) cAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCT‑‑‑TGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGTGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTctgtacctgtac < 1:570913/150‑1 (MQ=255) gtcgtcCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCT‑‑‑TGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGtacctgtacctg > 2:1640040/1‑150 (MQ=255) gtcgtcCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCT‑‑‑TGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGtacctgtacctg > 1:1502708/1‑150 (MQ=255) tcgtcCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCT‑‑‑TGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGc > 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cTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCT‑‑‑TGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGgt > 1:1207848/1‑150 (MQ=255) tCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCT‑‑‑TGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCgg > 1:267439/1‑103 (MQ=255) tCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCT‑‑‑TGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGTCgg > 1:1420313/1‑150 (MQ=255) aTGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCT‑‑‑TGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGCCgccg < 2:1297792/150‑4 (MQ=255) gctgcCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCT‑‑‑TGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGTCGGGGtt > 1:1807555/1‑150 (MQ=255) ctgcCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCT‑‑‑TGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGc < 2:257686/114‑1 (MQ=255) ctgcCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCT‑‑‑TGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGc > 1:257686/1‑114 (MQ=255) ctgcCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCT‑‑‑TGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCtt > 1:849723/1‑116 (MQ=255) ctgcCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCT‑‑‑TGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGTCGGGGTTg < 2:1502708/150‑1 (MQ=255) tgcCGTCTTCTGAACCTAGTCCAATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTTGTGACGCGGCTATCT‑‑‑TCCTGCTGCACTTCCTGCCGCAGCAGCGGAGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGTCGGGGTTgg > 2:596014/1‑150 (MQ=255) tgcCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCT‑‑‑TGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTgcgc > 1:1368295/1‑136 (MQ=255) ccGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCT‑‑‑TGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCAAGGTTTAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGTCGGGGTTGGTg < 1:1160444/150‑1 (MQ=255) 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tGCTTTGGTGACGCGGATACCT‑‑‑TGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGTCGGGGTTg > 2:619049/1‑103 (MQ=255) gCTTTGGTGACGCGGATACCT‑‑‑TGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGTCGGGGTTGGTGCCCTGTTCGAAGGTGGCGGTAATGGTCATGCTGCCGTCGGAGTTa < 2:1207848/150‑1 (MQ=255) tttGGTGACGCGGATACCT‑‑‑TGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGTCGGGGTTGGTGCCCTGt < 2:2007146/109‑1 (MQ=255) gTGACGCGGATACCT‑‑‑TGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGTCGGGGTTGGTGCCCTGTTCGAAGGTGGCGGTAATGGTCATGCTGCCGTCGGAGTTACTTTcc > 2:1621993/1‑150 (MQ=255) gTGACGCGGATACCT‑‑‑TGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGTCGGGGTTGGTGCCCTGTTCGAAGGTGGCGGTAATGGTCATGCTGCCGTCGGAGTTACTTTcc < 2:1423184/150‑1 (MQ=255) gTGACGCGGATACCT‑‑‑TGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGAAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGTCGGGGTTGGTGCCCTGTTCGAGAATTGCGGTAATGGTCATGCTGCCGTCGGGGTTACTTTcc > 1:634375/1‑150 (MQ=255) cT‑‑‑TGCTGCTGCACTTCCTGCGgcagcaaggtatccgcgtcaccaaagcagtgaagaacttcctgctggtgatcggcctggtctcc < 1:1602258‑M2/85‑65 (MQ=255) cT‑‑‑TGCTGCTGCACTTCCTGCGgcagcaaggtatccgcgtcaccaaagcagtgaagaacttcctgctggtgatcggcctggtctcc > 2:1602258‑M2/1‑21 (MQ=255) cT‑‑‑TGCTGCTGCACTTCCTGCGgcagcaaggtatccgcgtcaccaaagcagtgaagaacttcctgctgg < 1:1550726‑M2/68‑48 (MQ=255) cT‑‑‑TGCTGCTGCACTTCCTGCGgcagcaaggtatccgcgtcaccaaagcagtgaagaacttcctgctgg > 2:1550726‑M2/1‑21 (MQ=255) cT‑‑‑TGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGTCGGGGTTGGTGCCCTGTTCGAAGGTGGCGGTAATGGTc > 2:494961/1‑113 (MQ=255) cT‑‑‑TGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGTCGGGGTTGGTGCCCTGTTCGAAGGTGGCGGTAATGGTc < 1:494961/113‑1 (MQ=255) cT‑‑‑TGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGTCGGGGTTGGTGCCCTGTTCGAAGGTGGCGGTAATGGTCATGCTGCCGTc < 2:798654/124‑1 (MQ=255) cT‑‑‑TGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGTCGGGGTTGGTGCCCTGTTCGAAGGTGGCGGTAATGGTCATGCTGCCGTCGGa > 1:1500991/1‑127 (MQ=255) cT‑‑‑TGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGTCGGGGTTGGTGCCCTGTTCGAAGGTGGCGGTAATGGTCATGCTGCCGTCGGAGTTACTTTCCGACGACACATAAc > 1:385221/1‑150 (MQ=255) cT‑‑‑TGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGTCGGGGTTGGTGCCCTGTTCGAAGGTGGCGGTAATGGTCATGCTGCCGTCGGAGTTACTTTCCGACGACACATAAc > 2:1819181/1‑150 (MQ=255) t‑‑‑tGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGTCGGGGTTGGTGCCCTGTTCGACGGTGGCGGTAATGGTCATGCTGCTGTCGGAGTTACTTTCCGACGACACCTAAca > 1:463652/1‑149 (MQ=255) tgctgccgcaggaagtgcagcagcaaggtatccgcgtcaccaaagcagtgaagaacttcctgctggtgatcggcctggtctccgaagacggcagcatgaccaaggacgacctggccaactatatcgtctcgaacatgcaggacccgatct > 2:2149031‑M1/1‑6 (MQ=255) ctgctgcACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGTCGGGGTTGGTGCCCTGTTCGAAGGTGGCGGTAATGGTCATGCTGCCGTCGGAGTTACTTTCCGACGACACATAACGCAg < 1:627307/150‑1 (MQ=255) ctgctgcACTTCCTGCAGAAACAGCGGGATGGTCTTTCCCTACTTGTTGTTTTTCTGTACCTGCGCGGTGTCGGGGTTGGTGCCCTGTTCGAAGGTGGCGGTAATGGTCATGCTGCCGTCGGAGTTACTTTCCGACGACACATAACGCAg < 2:634375/150‑1 (MQ=255) tgctgcACTTCCTGCGgcagcaaggtatccgcgtcaccaaagcagtgaagaacttcctgctggtgatcggcctggtctccgaagacggcagcatgaccaaggacgacctggccaactatatcgtctcgaacatgcaggacccgatctcgc < 1:902336‑M2/150‑135 (MQ=255) tgctgcACTTCCTGCGgcagcaaggtatccgcgtcaccaaagcagtgaagaacttcctgctggtgatcggcctggtctccgaagacggcagcatgaccaaggacgacctggccaactatatcgtctcgaacatgcaggacccgatctcgc > 2:902336‑M2/1‑16 (MQ=255) tgctgcACTTCCTGCGgcagcaaggtatccgcgtcaccaaagcagtgaagaacttcctgctggtgatcggcctggtctccgaagacggcagcatgaccaaggacgacctggccaactatatcgtctcgaacatgcaggacccgat < 1:787254‑M2/145‑130 (MQ=255) tgctgcACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGTCGGGGTTGGTGCCCTGTTCGAAGGTGGCGGTAATGGTCATGCTGCCGTCGGAGTTACTTTCCGACGACACATAACGCAgg > 1:2218630/1‑150 (MQ=255) ccgcaggaagtgcagcagcaaggtatccgcgtcaccaaagcagtgaagaacttcctgctggtgatcggcctggtctccgaagacggcagcatgaccaaggacgacctggccaactatatcgtctcgaacatgcaggacccgatctcgcgt > 1:79083‑M1/1‑1 (MQ=255) | CTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCT‑‑‑TGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGTCGGGGTTGGTGCCCTGTTCGAAGGTGGCGGTAATGGTCATGCTGCCGTCGGAGTTACTTTCCGACGACACATAACGCAGGTT > NC_002947/1580922‑1581219 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |