| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | = 1581070 | 119 (1.340) | 10 (0.120) | 8/234 | NT | 7.9% | coding (369/3153 nt) | ttgB | efflux pump membrane protein TtgB |
| ? | NC_002947 | = 1581083 | 121 (1.440) | coding (356/3153 nt) | ttgB | efflux pump membrane protein TtgB | |||||
Only 100 of 142 total aligned reads displayed.
ACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGTCGGGGTTGGTGCCCTGTTCGAAGGTGGCGGTAATGGTCATGCTGCCGTCGGAGTTACTTTCCGACGACACATAACGCAGGTTGTCGATACCGTT > NC_002947/1580935‑1581231 | aCGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGg > 1:79083‑M2/1‑149 (MQ=255)aCGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGg > 1:79051‑M2/1‑149 (MQ=255) gggTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCggg < 2:1423044/150‑1 (MQ=255) tCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTg < 2:1364106/150‑1 (MQ=255) tCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTg < 2:1407968/150‑1 (MQ=255) aTGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAACAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAgg < 2:616138/150‑1 (MQ=255) tGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCACGGGGGTGGCCAGGt > 2:250292/1‑150 (MQ=255) ttCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTc < 2:896912/150‑1 (MQ=255) gaCGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCtt > 1:2172702/1‑150 (MQ=255) aCGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCCGCAGGAAGGGCAgcagcaaggtatccgcgtcaccaaagcag > 1:476753‑M2/1‑121 (MQ=255) aGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTctgta < 1:2206057/150‑1 (MQ=255) cAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTctgtacctgtac > 2:2087576/1‑150 (MQ=255) gtcgtcCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGtacctgtacctg > 2:120332/1‑150 (MQ=255) gtcgtcCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGtacctgtacctg > 1:1502708/1‑150 (MQ=255) gtcgtcCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGtacctgtacctg > 2:1640040/1‑150 (MQ=255) tcgtcCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTgc < 2:2403926/150‑1 (MQ=255) gtcCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTgcgc > 2:2273872/1‑150 (MQ=255) gccTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGcgcg < 2:1576311/149‑1 (MQ=255) cTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGc > 1:56033/1‑124 (MQ=255) cTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGc < 2:56033/124‑1 (MQ=255) cTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGtt > 2:347375/1‑129 (MQ=255) tCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCgg > 1:267439/1‑103 (MQ=255) gctgcCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGTCGGGGtt > 1:1807555/1‑150 (MQ=255) ctgcCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGc < 2:257686/114‑1 (MQ=255) 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ttCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGTCGGGGTTGGTGCCCTg > 2:627307/1‑150 (MQ=255) tCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGTGTGTTCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGTCGGGGTTGGTGCCCTGt < 2:330229/150‑1 (MQ=255) ggAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGTCGGGGTTGGTGCCCTGTTc > 1:1236783/1‑150 (MQ=255) ccAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCTGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGTCGGGGTTGGTGCCCTGTTCGAAgg < 2:351996/150‑1 (MQ=255) cAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTctgtac < 2:2153364/108‑1 (MQ=255) cAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTctgtac > 1:2153364/1‑108 (MQ=255) 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(MQ=255) cTTGCTGCTGCACTTCCTGCGgcagcaaggtatccgcgtcaccaaagcagtgaagaacttcctgctggtgatcggcctggtctcc < 1:1602258‑M2/85‑65 (MQ=255) cTTGCTGCTGCACTTCCTGCGgcagcaaggtatccgcgtcaccaaagcagtgaagaacttcctgctgg < 1:1550726‑M2/68‑48 (MQ=255) cTTGCTGCTGCACTTCCTGCGgcagcaaggtatccgcgtcaccaaagcagtgaagaacttcctgctgg > 2:1550726‑M2/1‑21 (MQ=255) cTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGTCGGGGTTGGTGCCCTGTTCGAAGGTGGCGGTAATGGTCATGCTGCCGTc < 2:798654/124‑1 (MQ=255) cTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGTCGGGGTTGGTGCCCTGTTCGAAGGTGGCGGTAATGGTCATGCTGCCGTc > 1:798654/1‑124 (MQ=255) cTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGTCGGGGTTGGTGCCCTGTTCGAAGGTGGCGGTAATGGTCATGCTGCCGTCGGAGTTACTTTCCGACGACACATAAc > 1:385221/1‑150 (MQ=255) cTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGTCGGGGTTGGTGCCCTGTTCGAAGGTGGCGGTAATGGTCATGCTGCCGTCGGAGTTACTTTCCGACGACACATAAc > 1:267084/1‑150 (MQ=255) cTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGTCGGGGTTGGTGCCCTGTTCGAAGGTGGCGGTAATGGTCATGCTGCCGTCGGAGTTACTTTCCGACGACACATAAc > 2:1819181/1‑150 (MQ=255) ttGCTGCTGCACTTCCTGCGgcagcagcaaggtatccgcgtcaccaaagcagtgaagaacttcctgctggtgatcggcctggtctccgaagacggcagcatgaccaaggacgacctggccaactatatcgtctcgaacatgcaggacccg < 2:50527‑M2/150‑131 (MQ=255) ttGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGTCGGGGTTGGTGCCCTGTTCGACGGTGGCGGTAATGGTCATGCTGCTGTCGGAGTTACTTTCCGACGACACCTAAca > 1:463652/1‑149 (MQ=255) ctgctgcACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGTCGGGGTTGGTGCCCTGTTCGAAGGTGGCGGTAATGGTCATGCTGCCGTCGGAGTTACTTTCCGACGACACATAACGCAg < 1:627307/150‑1 (MQ=255) ctgctgcACTTCCTGCAGAAACAGCGGGATGGTCTTTCCCTACTTGTTGTTTTTCTGTACCTGCGCGGTGTCGGGGTTGGTGCCCTGTTCGAAGGTGGCGGTAATGGTCATGCTGCCGTCGGAGTTACTTTCCGACGACACATAACGCAg < 2:634375/150‑1 (MQ=255) tgctgcACTTCCTGCGgcagcaaggtatccgcgtcaccaaagcagtgaagaacttcctgctggtgatcggcctggtctccgaagacggcagcatgaccaaggacgacctggccaactatatcgtctcgaacatgcaggacccgat > 2:787254‑M2/1‑16 (MQ=255) tgctgcACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGTCGGGGTTGGTGCCCTGTTCGAAGGTGGCGGTAATGGTCATGCTGCCGTCGGAGTTACTTTCCGACGACACATAACGCAgg > 1:2218630/1‑150 (MQ=255) tgctgcACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGTCGGGGTTGGTGCCCTGTTCGAAGGTGGCGGTAATGGTCATGCTGCCGTCGGAGTTACTTTCCGACGACACATAACGCAgg > 1:238513/1‑150 (MQ=255) tgcACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGTCGGGGTTGGTGCCCTGTTCGAAGGTGGCGGTAATg > 2:2214282/1‑102 (MQ=255) cACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGTCGGGGTTGGTGCCCTGTTCGAAGGTGGCGGTAATGGTCATGCTGCCGTCGGAGTTACTTTCCGACGACACATAACGCAGGTTGTc > 2:1088440/1‑150 (MQ=255) cACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGTCGGGGTTGGTGCCCTGTTCGAAGGTGGCGGTAATGGTCATGCTGCCGTCGGAGTTACTTTCCGACGACACATAACGCAGGTTGTc < 2:1807555/150‑1 (MQ=255) ccTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGTCGGGGTTGGTGCCCTGTTCGAAGGTGGCGGTAATGGTCATGCTGCCGTCGGAGTTACTTTCCGACGACACATAACGCAGGTTGTCGATa > 1:450659/1‑149 (MQ=255) ccTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGTCGGGGTTGGTGCCCTGTTCGAAGGTGGCGGTAATGGTCATGCTGCCGTCGGAGTTACTTTCCGACGACACATAACGCAGGTTGTCGATa < 2:450659/149‑1 (MQ=255) cTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGGGTCGAGGTGGGTGCCCTGTTCGAAGGTGGCGGTAATGGTCATGCTCACGACGGAGGTACTTTCCGCCCCCACATAACCCTGGTTGTCGAGAca > 2:831086/1‑149 (MQ=255) cGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGTCGGGGTTGGTGCCCTGTTCGAAGGTGGCGGTAATGGTCATGCTGCCGTCGGAGTTACTTTCCGACGACACATAACGCAGGTTGTCGATACCGtt > 1:1454588/1‑150 (MQ=255) cGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGTCGGGGTTGGTACCTACGCTGAAGGTGGCGGTAATGGTCATGCTGCCGTCGGAGTTACTTTCCGACGACACATAACGCAGGTTGTCGATACCGtt < 1:1621993/150‑1 (MQ=255) | ACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGCGGTGTCGGGGTTGGTGCCCTGTTCGAAGGTGGCGGTAATGGTCATGCTGCCGTCGGAGTTACTTTCCGACGACACATAACGCAGGTTGTCGATACCGTT > NC_002947/1580935‑1581231 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |