New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1651584 = | 106 (1.200) | 7 (0.080) | 7/232 | NT | 6.9% | coding (97/636 nt) | PP_1448 | membrane protein |
? | NC_002947 | 1651608 = | 88 (1.050) | coding (121/636 nt) | PP_1448 | membrane protein |
Only 100 of 122 total aligned reads displayed.
GGGAGAAGGTCGAGCAGCTGTACGTGAAGCTGCAGCGTCAGGCCTGACATGTCGCGTCGCCCTTGGCTGACCGGCATGGCGGTGCTGGGCTGGTTCGGCCTGGCCGTGCAGGTGAACCTGGTACTGCT‑GGCGCGTTGGCAGGAACAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCAATGTGTTCGGCTACTTCACCGTGCTGACCAATACCCTGGTGGCGACGGTGCTCAGCTATGCCGCATTCGGTAGGGAAGGCCGTGGCAAACGCTTTTTCCTGTCGCCCTCGGTAAGCTCTGC > NC_002947/1651440‑1651732 | gggAGAAGGTCGAGCAGCTGTACGTGAAGCTGCAGCGTCAGGCCTGACATGTCGCGTCGCCCTTGGCTGACCGGCATGGCGGTGCTGGGCTGGTTCGGCCTGGCCGTGCAGGTGAACCTGGTACTGCT‑GGCGCGTTGGCAGGAACAGGcc > 1:1913831/1‑150 (MQ=255) gcacgatactggcggccactgcagagcttaccgagggcgacaggaaaaagcgtttgccacggccttccctaccgaatgcggcatagctgagcaccgtcgccaccagggtattggtcagcacggtgaagtagccgaacacattgatCAGGc > 2:595678‑M1/146‑150 (MQ=255) cacgatactggcggccactgcagagcttaccgagggcgacaggaaaaagcgtttgccacggccttccctaccgaatgcggcatagctgagcaccgtcgccaccagggtattggtcagcacggtgaagtagccgaacacattgatCAGgcn > 2:1710909‑M1/145‑149 (MQ=255) ggTCGAGCAGCTGTACGTGAAGCTGCAGCGTCAGGCCTGACATGTCGCGTCGCCCTTGGCTGACCGGCATGGCGGTGCTGGGCTGGTTCGGCCTGGCCGTGCAGGTGAACCTGGTACTGCT‑GGCGCGTTGGCAGGAACAGGCCAGCCTGa < 1:768148/150‑1 (MQ=255) gTCGAGCAGCTGTACGTGAAGCTGCAGCGTCAGGCCTGACATGTCGCGTCGCCCTTGGCTGACCGGCATGGCGGTGCTGGGCTGGTTCGGCCTGGCCGTGCAGGTGAACCTGGTACTGCT‑GGCGCGTTGGCAGGAACAGGCCa < 1:1630967/143‑1 (MQ=255) gTCGAGCAGCTGTACGTGAAGCTGCAGCGTCAGGCCTGACATGTCGCGTCGCCCTTGGCTGACCGGCATGGCGGTGCTGGGCTGGTTCGGCCTGGCCGTGCAGGTGAACCTGGTACTGCT‑GGCGCGTTGGCAGGAACAGGCCAGCCTGAt > 1:966915/1‑150 (MQ=255) tCGAGCAGCTGTACGTGAAGCTGCAGCGTCAGGCCTGACATGTCGCGTCGCCCTTGGCTGACCGGCATGGCGGTGCTGGGCTGGTTCGGCCTGGCCGTGCAGGTGAACCTGGTACTGCT‑GGCGCGTTGGCAGGAACAGGCCAGCCTGAtt > 2:1124584/1‑150 (MQ=255) gAGCAGCTGTACGTGAAGCTGCAGCGTCAGGCCTGACATGTCGCGTCGCCCTTGGCTGACCAGCATGGCGGTGCTGGGCTGGTTCGGCCTGGCCGTGCATGTGAACCTGGTACTGCT‑GGCGCGTTGGCAGGAACAGGCCAGCCTGATtgg > 1:98283/1‑150 (MQ=255) cagcTGTACGTGAAGCTGCAGCGTCAGGCCTGACATGTCGCGTCGCCCTTGGCTGACCGGCATGGCGGTGCTGGGCTGGTTCGGCCTGGCCGTGCAGGTGAACCTGGTACTGCT‑GGCGCGTTGGCAGGAACAGGCCAGCCTGATtggtgg > 2:1645866/1‑150 (MQ=255) tggagagcttaccgagggcgacaggaaaaagcgtttgccacggccttccctcccgaatgcggcatagctgagcaccgtcgccaccagggtattggtcagcacggtgaagtagccgaacacattgatCAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTg > 1:832874‑M1/127‑150 (MQ=255) agagcttaccgagggcgacaggaaaaagcgtttgccacggccttccctaccgaatgcagcatagctgagcaccgtcgccaccagggtattggtcagcacggtgaagtagccgaacacattgatCAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATc > 1:637252‑M1/124‑150 (MQ=255) gTGAAGCTGCAGCGTCAGGCCTGACATGTCGCGTCGCCCTTGGCTGACCGGCATGGCGGTGCTGGGCTGGTTCGGCCTGGCCGTGCAGGTGAACCTGGTACTGCT‑GGCGCGTTGGCAGGAACAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCaa > 2:1603594/1‑150 (MQ=255) tGAAGCTGCAGCGTCAGGCCTGACATGTCGCGTCGCCCTTGGCTGACCGGCATGGCGGTGCTGGGCTGGTTCGGCCTGGCCGTGCAGGTGAACCTGGTACTGCT‑GGCGCGTTGGCAGGAACAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCAAt < 2:1327740/150‑1 (MQ=255) tGAAGCTGCAGCGTCAGGCCTGACATGTCGCGTCGCCCTTGGCTGACCGGCATGGCGGTGCTGGGCTGGTTCGGCCTGGCCGTGCAGGTGAACCTGGTACTGCT‑GGCGCGTTGGCAGGAACAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCAAt < 1:1125937/150‑1 (MQ=255) tGAAGCTGCAGCGTCAGGCCTGACATGTCGCGTCGCCCTTGGCTGACCGGCATGGCGGTGCTGGGCTGGTTCGGCCTGGCCGTGCAGGTGAACCTGGTACTGCT‑GGCGCGTTGGCAGGAACAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCAAt < 2:1328520/150‑1 (MQ=255) tGAAGCTGCAGCGTCAGGCCTGACATGTCGCGTCGCCCTTGGCTGACCGGCATGGCGGTGCTGGGCTGGTTCGGCCTGGCCGTGCAGGTGAAACTGGTACTGCT‑GGCGCGTTGGCAGGAACAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCAAt < 2:375057/150‑1 (MQ=255) tGCAGCGTCAGGCCTGACATGTCGCGTCGCCCTTGGCTGACCGGCATGGCGGTGCTGGGCTGGTTCGGCCTGGCCGTGCAGGTGAACCTGGTACTGCT‑GGCGCGTTGGCAGGAACAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCAATGTGTTc > 1:1446557/1‑150 (MQ=255) gCAGCGTCAGGTCTGACATGTCGCGTCGCCCTTGGCTGACCGGCATGGCGGTGCTGGGCGGGTTCGGCCTGGCCGTGCAGGTGAACCTGGTACTGCT‑GGCGCGGTGGCAAGAACAGGCCAGCCTGATTGGTTGCCTGATACATgtgtcag > 2:510023/1‑147 (MQ=255) 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cTGACATGTCGCGTCGCCCTTGGCTGACCGGCATGGCGGTGCTGGGCTGGTTCGGCCTGGCCGTGCAGGTGAACCTGGTACTGCT‑GGCGCGTTGGCAGGAACAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCAAt > 2:1522619/1‑131 (MQ=255) cTGACATGTCGCGTCGCCCTTGGCTGACCGGCATGGCGGTGCTGGGCTGGTTCGGCCTGGCCGTGCAGGTGAACCTGGTACTGCT‑GGCGCGTTGGCAGGAACAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCAAt < 1:1522619/131‑1 (MQ=255) cTGACATGTCGCGTCGCCCTTGGCTGACCGGCATGGCGGTGCTGGGCTGGTTCGGCCTGGCCGTGCAGGTGAACCTGGTACTGCT‑GGCGCGTTGGCAGGAACAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCAATGTGTTCGGCTACTTCACCg > 1:180957/1‑150 (MQ=255) tGACATGTCGCGTCGCCCTTGGCTGACCGGCATGGCGGTGCTGGGCTGGTTCGGCCTGGCCGTGCAGGTGAACCCGGTGC‑GCTCGGAACTGGTGCAGGAACAGGCCAGCCTGATTGGTGCCGTTATCAATGTGTTCGGCTACTTCACCGt > 1:1251986/1‑150 (MQ=255) aCATGTCGCGTCGCCCTTGGCTGACCGGCATGGCGGTGCTGGGCTGGTTCGGCCTGGCCGTGCAGGTGAACCTGGTACTGCT‑GGCGCGTTGGCAGGAACAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCAATGTGTTCGGCTACTTCACCGTGc < 2:878040/150‑1 (MQ=255) aCATGTCGCGTCGCCCTTGGCTGACCGGCATGGCGGTGCTGGGCTGGTTCGGCCTGGCCGTGCAGGTGAACCTGGTACTGCT‑GGCGCGTTGGCAGGAACAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCAATGTGTTCGGCTACTTCACCGTGc < 2:2287127/150‑1 (MQ=255) aTGTCGCGTCGCCCTTGGCTGACCGGCATGGCGGTGCTGGGCTGGTTCGGCCTGGCCGTGCAGGTGAACCTGGTACTGCT‑GGCGCGTTGGCAGGAACAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCAATGTGTTCGGCTACTTCACCGTGCTg > 2:2356140/1‑150 (MQ=255) gtcgcgtcgcCCTTGGCTGACCGGCATGGCGGTGCTGGGCTGGTTCTGCCTGGTCGTGCAGGTGAACCTGGTACTGCT‑GGCGCGTTGGCAGGAACAGGCCAGCCTGATTGGTTGCCTGATCAATGTGTTCGGCTACTTCACCGTGCTGAc < 2:1670763/150‑1 (MQ=255) gtcgcgtcgcCCTTGGCTGACCGGCATGGCGGTGCTGGGCTGGTTCGGCCTGGCCGTGCAGGTGAACCTGGTACTGCT‑GGCGCGTTGGCAGGAACAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCAATGTGTTCGGCTACTTCACCGTGCTGAc < 2:2396723/150‑1 (MQ=255) cgtttgccacggccttccctaccgaatgcggcatagctgagcaccgtcgccaccagggtattggtcagcacggtgaagtagccgaacacattgatCAGGc > 2:1373217‑M1/96‑100 (MQ=255) cgtttgccacggccttccctaccgaatgcggcatagctgagcaccgtcgccaccagggtattggtcagcacggtgaagtagccgaacacattgatCAGGc < 1:1373217‑M1/5‑1 (MQ=255) tcgcgtcgcCCTTGGCTGACCGGCATGGCGGTGCTGGGCTGGTTCGGCCTGGCCGTGCAGGTGAACCTGGTACTGCT‑GGCGCGTTGGCAGGAACAGGCCAGCCTGATtg < 1:1847588/109‑1 (MQ=255) tcgcgtcgcCCTTGGCTGACCGGCATGGCGGTGCTGGGCTGGTTCGGCCTGGCCGTGCAGGTGAACCTGGTACTGCT‑GGCGCGTTGGCAGGAACAGGCCAGCCTGATtg > 2:1847588/1‑109 (MQ=255) tcgcgtcgcCCTTGGCTGACCGGCATGGCGGTGCTGGGCTGGTTCGGCCTGGCCGTGCAGGTGAACCTGGTACTGCT‑GGCGCGTTGGCAGGAACAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCAATGTGTTCGGCTACTTCACCGTGCTGAcc < 1:122516/150‑1 (MQ=255) cgcgtcgcCCTTGGCTGACCGGCATGGCGGTGCTGGGCTGGTTCGGCCTGGCCGTGCAGGTGAACCTGGTACTGCT‑GGCGCGTTGGGAGGAACAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCAATGTGTTCGGCTACTTCACCGTGCTGACCa > 1:1944793/1‑150 (MQ=255) gcgtcgcCCTTGGCTGACCGGCATGGCGGTGCTGGGCTGGTTCGGCCTGGCCGTGCAGGTGAACCTGGTACTGCT‑GGCGCGTTGGCAGGAACAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCAATGTGTTCGGCTACTTCACCGTGCTGACCaa > 2:734633/1‑150 (MQ=255) cgtcgcCCTTGGCTGACCGGCATGGCGGTGCTGGGCTGGTTCGGCCTGGCCGTGCAGGTGAACCTGGTACTGCT‑GGCGCGTTGGCAGGAACAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCAATGTGTTCGGCTACTTCACCGTGCTGACCAAt < 2:76034/150‑1 (MQ=255) gtcgcCCTTGGCTGACCGGCATGGCGGTGCTGGGCTGGTTCGGCCTGGCCGTGCAGGTGAACCTGGTACTGCT‑GGCGCGTTGGCAGGAACAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCAATGTGTTCGGCTACTTCACCGTGCTGACCAATa > 2:2022141/1‑150 (MQ=255) cgcCCTTGGCTGACCGGCATGGCGGTGCTGGGCCGGTTCGGCCTGGCCGTGCAGGTGAACCTGGTACTGCT‑GGCGCGTTGGCAGGAACAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCAATGTGTTCGGCTACTTCACCGTGCTGACCAATAcc > 2:732979/1‑150 (MQ=255) gcCCTTGGCTGACCGGCATGGCGGTGCTGGGCTGGTTCGGCCTGGCCGTGCAGGTGAACCTGGTACTGCT‑GGCGCGTTGGCAGGAACAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCAATGTGTTCGGCTACTTCACCGTGCTGACCAATAccc < 1:357448/150‑1 (MQ=255) ccTTGGCTGACCGGCATGGCGGTGCTGGGCTGGTTCGGCCTGGCCGTGCAGGTGAACCTGGTACTGCT‑GGCGCGTTGGCAGGAACAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCAATGTGTTCGGCTACTTCACCGTGCTGACCAATACCCtg > 2:1115419/1‑150 (MQ=255) ttccctaccgaatgcggcatagctgagcaccgtcgccaccagggtattggtcagcacggtgaagtagccgaacacattgatCAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCAAt < 2:1182289‑M1/30‑1 (MQ=255) ttccctaccgaatgcggcatagctgagcaccgtcgccaccagggtattggtcagcacggtgaagtagccgaacacattgatCAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCAAt > 1:1182289‑M1/82‑111 (MQ=255) 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tGCAGGTGAACCTGGTACTGCT‑GGCGCGTTGGCAGGAACAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCAATGTGTTCGGCTACTTCACCGTGCTGACCAATACCCTGGTGGCGACGGTGCTCAGCTATGCCGCATTCGGTAGGGAAGGCCGTg < 1:732979/150‑1 (MQ=255) gCAGGTGAACCTGGTACTGCT‑GGCGCGTTGGCAGGACTGGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCAATGTGTTCGGCTACTTCACCGTGCTGACCAATACCCTGGTGGCGACGGTGCTCAGCTATGCCGCATTCGGTAGGGAAGGCCGTgg < 1:127247/150‑1 (MQ=255) ccTGGTACTGCT‑GGCGCGTTGGCAGGAACAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCAAt < 1:1640360/58‑1 (MQ=255) ccTGGTACTGCT‑GGCGCGTTGGCAGGAACAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCAAt > 2:1640360/1‑58 (MQ=255) ccTGGTACTGCT‑GGCGCGTTGGCAGGAACAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCAATGTGTTCGGCTACTTCACCGTGCTGACCAATACCCTGGTGGCGACGGTGCTCAGCTATGCCGCATTCg < 2:236055/125‑1 (MQ=255) ccTGGTACTGCT‑GGCGCGTTGGCAGGAACAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCAATGTGTTCGGCTACTTCACCGTGCTGACCAATACCCTGGTGGCGACGGTGCTCAGCTATGCCGCATTCg > 1:236055/1‑125 (MQ=255) aatctaggCGCGTTGGCAGGAACAGGCCAGCGTGATCGGTCACCTCATCAATGTGTTCGGCTACTTCACCGTGCTGACCAATACCCTGGTGGCGACGGTGCTCAGCTATGCCGCATTCGGTAGGGAAGGCCGTGGCAAACGCTTTTTCCt < 1:1834423/144‑1 (MQ=255) tgct‑gGCGCGTTGGCAGGAACAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCAATGTGTTCGGCTACTTCACCGTGCTGACCAATACCCtg < 2:2156529/86‑1 (MQ=255) tgct‑gGCGCGTTGGCAGGAACAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCAATGTGTTCGGCTACTTCACCGTGCTGACCAATACCCtg > 1:2156529/1‑86 (MQ=255) t‑gGCGCGTTGGCAGGAACAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCAATGTGTTCGGCTACTTCACCGTGCTGACCAATACCCTGGTGGCGACGGTGCTCAGCTATGCCGCATTCGGTAGGGAAGGCCGTGGCAAACGCTTTTTCCTGTCg > 1:956708/1‑149 (MQ=255) t‑gGCGCGTTGGCAGGAACAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCAATGTGTTCGGCTACTTCACCGTGCTGACCAATACCCTGGTGGCGACGGTGCTCAGCTATGCCGCATTCGGTAGGGAAGGCCGTGGCAAACGCTTTTTCCTGTCg < 2:956708/149‑1 (MQ=255) gccgaacacattgatCAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGa < 2:381094‑M1/25‑1 (MQ=255) gccgaacacattgatCAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGa > 1:381094‑M1/16‑40 (MQ=255) gcgTTGGCAGGAACAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCaa > 2:2322407/1‑42 (MQ=255) gcgTTGGCAGGAACAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCaa < 1:2322407/42‑1 (MQ=255) gcgTTGGCAGGAACAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCAATGTGTTCGGCTACTTCACCGTGCTGACCAATACCCTGGTGGCGACGGTGCTCAGCTATGCCGCATTCGGTAGGGAAGGCCGTGGCAAACGCTTTTTCCTGTCGccc > 2:2054191/1‑148 (MQ=255) gcgTTGGCAGGAACAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCAATGTGTTCGGCTACTTCACCGTGCTGACCAATACCCTGGTGGCGACGGTGCTCAGCTATGCCGCATTCGGTAGGGAAGGCCGTGGCAAACGCTTTTTCCTGTCGccc < 1:2054191/148‑1 (MQ=255) cgTTGGCAGGAACAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCAATGTGTTCGGCTACTTCACCGTGCTGACCAATACCCTGGTGGCGACGGTGCTCAGCTATGCCGCATTCGGTAGGGAAGGCCGTGGCAAACGCTTTTTCCTGTCGCCCTCg < 2:1446557/150‑1 (MQ=255) cgTTGGCAGGAACAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCAATGTGTTCGGCTACTTCACCGTGCTGACCAATACCCTGGTGGCGACGGTGCTCAGCTATGCCGCATTCGGTAGGGAAGGCCGTGGCAAACGCTTTTTCCTGTCGCCCTCg < 2:1251986/150‑1 (MQ=255) cgTTGGCAGGAACAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCAATGTGTTCGGCTACTTCACCGTGCTGACCAATACCCTGGTGGCGACGGTGCTCAGCTATGCCGCATTCGGTAGGGAAGGCCGTGGCAAACGCTTTTTCCTGTCGCCCTCg < 2:966915/150‑1 (MQ=255) aGGAACAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCAATGTGTTCGGCTACTTCACCGTGCTGACCAATACCCTGGTGGCGACGGTGCTCAGCTATGCCGCATTCGGTAGGGAAGGCCGTGGCAAACGCTTTTTCCTGTCGCCCTCGGTAAGct > 1:1052938/1‑150 (MQ=255) aatCAGGCTGGCCTGATTGGTGGCCTGATCAATGTGTTCGGCTACTTCACCGTGCTGACCAATACCCTGGTGGCGACGGTGCTCAGCTATGCCGCATTCGGTAGGGAAGGCCGTGGCAAACGCTTTTTCCTGTCGCCCTCGGTAAGctct < 2:1621238‑M1/147‑1 (MQ=255) aaCAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCAATGTGTTCGGCTACTTCACCGTTCTGACCAATACCCTGGTGGCGACGGTGCTCAGCTATGCCGCATTCGGTAGGGAAGGCCGTGGCAAACGCTTTTTCCTGTCGCCCTCGGTAAGCTCTg < 2:924678/150‑1 (MQ=255) aCAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCAATGTGTTCGGCTACTTCACCGTGCTGACCAATACCCTGGTGGCGACGGTGCTCAGCTATGCCGCATTCGGTAGGGAAGGCCGTGGCAAACGATGCTTCCTGTCGCCCTCGGTAAGCTGTGc > 1:506913/1‑150 (MQ=255) | GGGAGAAGGTCGAGCAGCTGTACGTGAAGCTGCAGCGTCAGGCCTGACATGTCGCGTCGCCCTTGGCTGACCGGCATGGCGGTGCTGGGCTGGTTCGGCCTGGCCGTGCAGGTGAACCTGGTACTGCT‑GGCGCGTTGGCAGGAACAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCAATGTGTTCGGCTACTTCACCGTGCTGACCAATACCCTGGTGGCGACGGTGCTCAGCTATGCCGCATTCGGTAGGGAAGGCCGTGGCAAACGCTTTTTCCTGTCGCCCTCGGTAAGCTCTGC > NC_002947/1651440‑1651732 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |