New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1651584 = | 106 (1.200) | 7 (0.080) | 7/232 | NT | 6.9% | coding (97/636 nt) | PP_1448 | membrane protein |
? | NC_002947 | 1651608 = | 88 (1.050) | coding (121/636 nt) | PP_1448 | membrane protein |
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
CGTGAAGCTGCAGCGTCAGGCCTGACATGTCGCGTCGCCCTTGGCTGACCGGCATGGCGGTGCTGGGCTGGTTCGGCCTGGCCGTGCAGGTGAACCTGGTACTGCT‑GGCGCGTTGGCAGGAACAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCAATGTGTTCGGCTACTTCACCGTGCTGACCAATACCCTGGTGGCGACGGTGCTCAGCTATGCCGCATTCGGTAGGGAAGGCCGTGGCAAACGCTTTTTCCTGTCGCCCTCGGTAAGCTCTGCAGTGGCCGCCAGTATCGTGCTGGTG > NC_002947/1651462‑1651757 | agagcttaccgagggcgacaggaaaaagcgtttgccacggccttccctaccgaatgcggcatagctgagcaccgtcgccaccagggtattggtcagcacggtgaagtagccgaacacattgatcaggccaccaatcaggccagcctgatt < 2:1621238‑M2/3‑2 (MQ=255) agagcttaccgagggcgacaggaaaaagcgtttgccacggccttccctaccgaatgcagcatagctgagcaccgtcgccaccagggtattggtcagcacggtgaagtagccgaacacattgatCAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATc > 1:637252‑M1/124‑150 (MQ=255) gTGAAGCTGCAGCGTCAGGCCTGACATGTCGCGTCGCCCTTGGCTGACCGGCATGGCGGTGCTGGGCTGGTTCGGCCTGGCCGTGCAGGTGAACCTGGTACTGCT‑GGCGCGTTGGCAGGAACAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCaa > 2:1603594/1‑150 (MQ=255) tGAAGCTGCAGCGTCAGGCCTGACATGTCGCGTCGCCCTTGGCTGACCGGCATGGCGGTGCTGGGCTGGTTCGGCCTGGCCGTGCAGGTGAACCTGGTACTGCT‑GGCGCGTTGGCAGGAACAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCAAt < 2:1328520/150‑1 (MQ=255) tGAAGCTGCAGCGTCAGGCCTGACATGTCGCGTCGCCCTTGGCTGACCGGCATGGCGGTGCTGGGCTGGTTCGGCCTGGCCGTGCAGGTGAACCTGGTACTGCT‑GGCGCGTTGGCAGGAACAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCAAt < 1:1125937/150‑1 (MQ=255) tGAAGCTGCAGCGTCAGGCCTGACATGTCGCGTCGCCCTTGGCTGACCGGCATGGCGGTGCTGGGCTGGTTCGGCCTGGCCGTGCAGGTGAAACTGGTACTGCT‑GGCGCGTTGGCAGGAACAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCAAt < 2:375057/150‑1 (MQ=255) aaGCTGCAGCGTCAGGCCTGACATGTCGCGTCGCCCTTGGCTGACCGGCATGGCGGTGCTGGGCTGGTTCGGCCTGGCCGTGCAGGTGAACCTGGTACTGCT‑GGCGCGTTGGCAGGAACAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCAAtgt < 1:1645866/150‑1 (MQ=255) tGCAGCGTCAGGCCTGACATGTCGCGTCGCCCTTGGCTGACCGGCATGGCGGTGCTGGGCTGGTTCGGCCTGGCCGTGCAGGTGAACCTGGTACTGCT‑GGCGCGTTGGCAGGAACAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCAATGTGTTc > 1:1446557/1‑150 (MQ=255) gCAGCGTCAGGTCTGACATGTCGCGTCGCCCTTGGCTGACCGGCATGGCGGTGCTGGGCGGGTTCGGCCTGGCCGTGCAGGTGAACCTGGTACTGCT‑GGCGCGGTGGCAAGAACAGGCCAGCCTGATTGGTTGCCTGATACATgtgtcag > 2:510023/1‑147 (MQ=255) gagggcgacaggaaaaagcgtttgccacggccttccctaccgaatgcggcatagctgagcaccgtcgccaccagggtattggtcagcacggtgaagtagccgaacacattgaaCAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCAATGTGTTCg > 2:2301313‑M1/114‑150 (MQ=255) cAGCGTCAGGCCTGACATGTCTCGTCCCCCTTGGCTGACCGGCATGGCGGTGCTGGGCTGGTTCGGCCTGGCCGTGCAGGTGAACCTGGTACTGCT‑GGCGCGTTGGCAGGAACAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCAATGTGTTCgg < 1:532826/150‑1 (MQ=255) cAGCGTCAGGCCTGACATGTCGCGTCGCCCTTGGCTGACCGGCATGGCGGTGCTGGGCTGGTTCGGCCTGGCCGTGCAGGTGAACCTGGTACTGCT‑GGCGCGTTGGCAGGAACAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCAATGTGTTCgg > 1:878040/1‑150 (MQ=255) cGTCAGACCGGACATGGCTCGTCGCCCTGGGCTGACCGGCATGGCGGTGCTGGGCTGGTTCGGCCTGGCCGTGCAGGTGAACCTGGTACTGCT‑GGCGCGTTGGCAGGAACAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCAATGTGTTCGGCTa < 2:1119177/150‑1 (MQ=255) 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gcgTTGGCAGGAACAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCaa > 2:2322407/1‑42 (MQ=255) gcgTTGGCAGGAACAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCaa < 1:2322407/42‑1 (MQ=255) gcgTTGGCAGGAACAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCAATGTGTTCGGCTACTTCACCGTGCTGACCAATACCCTGGTGGCGACGGTGCTCAGCTATGCCGCATTCGGTAGGGAAGGCCGTGGCAAACGCTTTTTCCTGTCGccc > 2:2054191/1‑148 (MQ=255) gcgTTGGCAGGAACAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCAATGTGTTCGGCTACTTCACCGTGCTGACCAATACCCTGGTGGCGACGGTGCTCAGCTATGCCGCATTCGGTAGGGAAGGCCGTGGCAAACGCTTTTTCCTGTCGccc < 1:2054191/148‑1 (MQ=255) cgTTGGCAGGAACAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCAATGTGTTCGGCTACTTCACCGTGCTGACCAATACCCTGGTGGCGACGGTGCTCAGCTATGCCGCATTCGGTAGGGAAGGCCGTGGCAAACGCTTTTTCCTGTCGCCCTCg < 2:966915/150‑1 (MQ=255) cgTTGGCAGGAACAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCAATGTGTTCGGCTACTTCACCGTGCTGACCAATACCCTGGTGGCGACGGTGCTCAGCTATGCCGCATTCGGTAGGGAAGGCCGTGGCAAACGCTTTTTCCTGTCGCCCTCg < 2:1446557/150‑1 (MQ=255) cgTTGGCAGGAACAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCAATGTGTTCGGCTACTTCACCGTGCTGACCAATACCCTGGTGGCGACGGTGCTCAGCTATGCCGCATTCGGTAGGGAAGGCCGTGGCAAACGCTTTTTCCTGTCGCCCTCg < 2:1251986/150‑1 (MQ=255) attgatcaggccaccaatcaggctggcctgATCAATGTGTTCGGCTACTTCACCGTGCTGACCAATACCCTGGTGGCGACGGTGCTCAGCTATGCCGCATTCGGTAGGGaa > 1:1182289‑M2/31‑111 (MQ=255) attgatcaggccaccaatcaggctggcctgATCAATGTGTTCGGCTACTTCACCGTGCTGACCAATACCCTGGTGGCGACGGTGCTCAGCTATGCCGCATTCGGTAGGGaa < 2:1182289‑M2/81‑1 (MQ=255) aGGAACAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCAATGTGTTCGGCTACTTCACCGTGCTGACCAATACCCTGGTGGCGACGGTGCTCAGCTATGCCGCATTCGGTAGGGAAGGCCGTGGCAAACGCTTTTTCCTGTCGCCCTCGGTAAGct > 1:1052938/1‑150 (MQ=255) gatcaggccaccaatcaggctggcctgATCAATGTGTTCGGCTACTTCACCGTGCTGACCAATACCCTGGTGGCGACGGTGCTCAGCTATGCTGCATTCGGTAGGGAAGGCCGTGGCAAACGCTTTTTCCTGTCGCCCTCGGTAAGctct > 1:637252‑M2/28‑150 (MQ=255) aaCAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCAATGTGTTCGGCTACTTCACCGTTCTGACCAATACCCTGGTGGCGACGGTGCTCAGCTATGCCGCATTCGGTAGGGAAGGCCGTGGCAAACGCTTTTTCCTGTCGCCCTCGGTAAGCTCTg < 2:924678/150‑1 (MQ=255) tcaggccaccaatcaggctggcctgATCAATGTGTTCGGc > 1:381094‑M2/26‑40 (MQ=255) aCAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCAATGTGTTCGGCTACTTCACCGTGCTGACCAATACCCTGGTGGCGACGGTGCTCAGCTATGCCGCATTCGGTAGGGAAGGCCGTGGCAAACGATGCTTCCTGTCGCCCTCGGTAAGCTGTGc > 1:506913/1‑150 (MQ=255) AGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCAATGTGTTCGGCTACTTCACCGTGCTGACCAATACCCTGGTGGCGACGGTGCTCAGCTATGCCGCATTCGGTAGGGAAGGCCGTGGCAAACGCTTTTTCCTGTCGCCCTCGGTAAGCTCTGCAg < 2:2100221‑M1/150‑1 (MQ=255) GCCAGCCTGATTGGTGTCCTGATCAATGTGTTCGGCTACTTCACCGTGCTGACCAATACCCTGGTGGCGACGGTGCTCAGCTAGGCCGCATTCGGTAggg < 2:2066207‑M1/100‑1 (MQ=255) GCCAGCCTGATTGGTGTCCTGATCAATGTGTTCGGCTACTTCACCGTGCTGACCAATACCCTGGTGGCGACGGTGCTCAGCTAGGCCGCATTCGGTAggg > 1:2066207‑M1/1‑100 (MQ=255) GCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCAATGTGTTCGGCTACTTCACCGTGCTGACCAATACCCTGGTGGCGACGGTGCTCAGCTATGCCGCATTCGGTAGGGAAGGCCGt > 1:1482183‑M1/1‑108 (MQ=255) GCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCAATGTGTTCGGCTACTTCACCGTGCTGACCAATACCCTGGTGGCGACGGTGCTCAGCTATGCCGCATTCGGTAGGGAAGGCCGt < 2:1482183‑M1/108‑1 (MQ=255) cTGATTGGTGGCCTGATCAATGTGTTCGGCTACTTCACCGTGCTGACCAATACCCtggtgg > 2:432366/1‑61 (MQ=255) ngcctgATCAATGTGTTCGGCTACTTCACCGTGCTGACCAATACCCTGGTGGCGACGGTGCTCAGCTATGCCGCATTCGGTAGGGAAGGCCGTGGCAAACGCTTTTTCCTGTCGCCCTCGGTAAGCTCTGCAGTGGCCGCCAGTATCGTg > 2:1710909‑M2/7‑150 (MQ=255) gcctgATCAATGTGTTCGGCTACTTCACCGTGCTGACCAATACCCTGGTGGCGACGGTGCTCAGCTATGCCGCATTCGGTAGGGAAGGCCGTGGCAAACg > 2:1373217‑M2/6‑100 (MQ=255) gcctgATCAATGTGTTCGGCTACTTCACCGTGCTGACCAATACCCTGGTGGCGACGGTGCTCAGCTATGCCGCATTCGGTAGGGAAGGCCGTGGCAAACGCTTTTTCCTGTCGCCCTCGGTAAGCTCTGCAGTGGCCGCCAGTATCGTGc > 2:595678‑M2/6‑150 (MQ=255) cTGATCAATGTGTTCGGCTACTTCACCGTGCTGACACTTACTGCGGTCAACCCAGTGCTCAGCTATGCCGGAGGCGGTAGGGAAGGCCGTGGCAAACGCTTTTTCCTGTCGCCCTCGGTACGCTCTGCAGTGGCCGCCAGTATCGTGCtg > 1:47079/1‑150 (MQ=255) cTGAGCAATGTAGTACGCCACTGCGCCGTGCTGGCCAGCACCCTGGTGGCGACGGTGGTCGCCTATGCCGCATGGGGCAGGGAAGGCCGTGGCAAACGCTTTTTCCTGTCGCACTCGGTAAGCTCTGCAGTGGCCGCCAGTGTCGTGCtc < 2:506913/150‑2 (MQ=255) | CGTGAAGCTGCAGCGTCAGGCCTGACATGTCGCGTCGCCCTTGGCTGACCGGCATGGCGGTGCTGGGCTGGTTCGGCCTGGCCGTGCAGGTGAACCTGGTACTGCT‑GGCGCGTTGGCAGGAACAGGCCAGCCTGATTGGTGGCCTGATCAATGTGTTCGGCTACTTCACCGTGCTGACCAATACCCTGGTGGCGACGGTGCTCAGCTATGCCGCATTCGGTAGGGAAGGCCGTGGCAAACGCTTTTTCCTGTCGCCCTCGGTAAGCTCTGCAGTGGCCGCCAGTATCGTGCTGGTG > NC_002947/1651462‑1651757 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |