| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
GCATGCGCGTTTTGCGTAAGCATCAGTCGCAGCGCTGGTCGTACTCGGGCACCACCGACCTGGAGGTGCTGTGCTATGAGCGGTTTGATCGCATGGCCCTGTCCGACGACATACCTGGCACCAGCCAGTCGGCACTCATCGTCGGCGCCAATGTGGTCGGCGACCGTGTGGTGCTTGAGGTCACCGAGCCGCTGGACTGGAACGTGGACAACCCGCGCATCCTTATCCGCCGGCACGACGGCTCAGCAACCCCGCTGATCGTGCCAACCCGGGTGAGCGAGTACGAGATGAGC > NC_002947/1771798‑1772090 | gCATGCGCGTTTTGCGTAAGCATCAGTCGCAGCGCTGGTCGTACTCGGGCACCACCGACCTGGAGGTGCTGTGCTATGAGCGGTTTGATCGCATGGCCCTGTCCGACGACATACCTGGCACCAGCCAGTCGGCACTCATCGTCGGCGCCa > 1:747532/1‑150 (MQ=255) cgcgTTTTGCGTAAGCATCAGTCGCAGCGCTGGTCGTACTCGGGCACCACCGACCTGGAGGTGCTGTGCTATGAGCGGTTTGATCGCATGGCCCTGTCCGACGACATACCTGGCACCAGCCAGTCGGCACTCATCGTCGGCGCCAAtgtg < 2:1141126/150‑1 (MQ=255) gcgTTTTGCGTAAGCATCAGTCGCAGCGCTGGTCGTACTCGGGCACCACCGACCTGGAGGTGCTGTGCTATGAGCGGTTTGATCGCATGGCCCTGTCCGACGACATACCTGGCACCAGCCAGTCGGCACTCATCGTCGGCGCCAATGTgg < 2:418671/150‑1 (MQ=255) tcgTAAGCATCAGTCGCAGCGCTGGTCGTACTCGGGCACCACCGACCTGGAGGTGCTGTGCTATGAGCGGTTTGATCGCATGGCCCTGTCCGACGACATACCTGGCACCAGCCAGTCGGCACTCATCGTCGGCGCCAATGTGGTCGGcga < 2:1108967‑M2/149‑4 (MQ=255) gTAAGCATCAGTCGCAGCGCTGGTCGTACTCGGGCACCACCGACCTGGAGGTGCTGTGCTATGAGCGGTTTGATCGCATGTCCCTGTCCGACGACATACCTGGCACCAGCCAGTCGGCACTCATCGTCGGCGCCATTGTTGTCGGCGAcc > 1:605239/1‑150 (MQ=255) gTAAGCATCAGTCGCAGCGCTGGTCGTACTCGGGCACCACCGACCTGGAGGTGCTGTGCTATGAGCGGTTTGATCGCATGGCCCTGTCCGACGACATACCTGGCACCAGCGAGTCGGCACTCATCGTCGGCGCCAATGTGGTCGGCGAcc > 1:633448/1‑150 (MQ=255) tAAGCATCAGTCGCAGCGCTGGTCGTACCCTGTCACCACCGACCTGGAGGTGCTGTGCTATGAGCGGTTTGATCGCATGGCCCTGTCCGACGACATACCTGGCACCAGCCAGTCGGCACTCATCGTCGccgaccacattggcgccgacga < 1:1811971‑M1/150‑23 (MQ=255) aaGCATCAGTCGCAGCGCTGGTCGTACTCGGGCACCACCGACCTGGAGGTGCTGTGCTATGAGCGGTTTGATCGCATGGCCCTGTCCGACGACATACCTGGCACCAGCCAGTCGGCACTCATCGTCGccgaccacattggcgccgacgat < 1:2160437‑M1/150‑24 (MQ=255) 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2:2206037/1‑150 (MQ=255) cTCATCGTCGGCGCCAATGTGGTCGGCGACCGTGTGGTGCTTGAGGTCACCGAGCCGCTGGACTGGAACGTGGACAACCCGCGCATCCTTATCCGCCGGCACGACGGCTCAGCAACCCCGCTGATCGTGCCAACCCGGGTGAGCGAGTAc < 1:969475/150‑1 (MQ=255) tCATCGTCGGCGCCAATGTGGTCGGCGACCGTGTGGTGCTTGAGGTCACCGAGCCGCTGGACTGGAACGTGGACAACCCGCGCATCCTTATCCGCCGGCTCGACGGCTCAGCAACCCCGCTGATCGTGCCAACCCGGGTGAGCGAGTACg < 1:1640093/150‑1 (MQ=255) tCATCGTCGGCGCCAATGTGGTCGGCGACCGTGTGGTGCTTGAGGTCACCGAGCCGCTGGACTGGAACGTGGACAACCCGCGCATCCTTATCCGCCGGCACGACGGCTCAGCAACCCCGCTGATCGTGCCAACCCGGGt < 1:1856588/139‑1 (MQ=255) tCATCGTCGGCGCCAATGTGGTCGGCGACCGTGTGGTGCTTGAGGTCACCGAGCCGCTGGACTGGAACGTGGACAACCCGCGCATCCTTATCCGCCGGCACGACGGCTCAGCAACCCCGCTGATCGTGCCAACCCGGGt > 2:1856588/1‑139 (MQ=255) aTCGTCGGCGCCAATGTGGTCGGcgacgatgagtgccgactggctggtgccaggtatgtcgtcggacagggccatgcgatcaaaccgctcatagcacagcacctccaggtcggtggtgcccgagtacgaccagcgctgcgactgatgctt < 1:2160437‑M2/150‑128 (MQ=255) tcgtcgGCGCCAATGTGGTCGGcgacgatgagtgccgactggctggtgccaggtatgtcgtcggacagggccatgcgatcaaaccgctcatagcacagcacctccaggtcggtggtgacagggtacgaccagcgctgcgactgatgctta < 1:1811971‑M2/150‑129 (MQ=255) tcgtcgGCGCCAATGTGGTCGGCGACCGTGTGGTGCTTGAGGTCACCGAGCCGCTGGACTGGAACGTGGACAACCCGCGCATCCTTATCCGCCGGCACGACGGCTCAGCAACCCCGCTGATCGTGCCAACCCGGGTGAGCGAGTACgaga < 1:363590/150‑1 (MQ=255) ccgtcgGCGCCAATGTGGTCGGCGACCGTGTGGTGCTTGAGGTCACCGACCCGCTGGACTGGAACGTGGACAACCCGCGCATCCTTATCCGCCGGCACGACGGCTCAGCAACCCCGCTGATCGGGCCAACCCGAGTGAGCGAGTACgaga < 1:2149247/149‑1 (MQ=255) cgtcgGCGCCAATGTGGTCGGcgacgatgagtgccgactggctggtgccaggtatgtcgtcggacagggccatgcgatcaaaccgctcatagcacagcacctccagg > 1:2289054‑M2/1‑21 (MQ=255) tcgGCGCCAATGTGGTCGGcgacgatgagtgccgactggctggtgccaggtatgtcgtc < 1:1863990‑M2/59‑41 (MQ=255) tcgGCGCCAATGTGGTCGGcgacgatgagtgccgactggctggtgccaggtatgtcgtc > 2:1863990‑M2/1‑19 (MQ=255) tcgGCGCCAATGTGGTCGGCGACCGTGTGGTGCTTGAGGTCACCGAGCCGCTGGACTGGAACGTGGACAACCCGCGCATCCTTATCCGCCGGCACGACGGCTCAGCAACCCCGCTGATCGTGCCAACCCGGGTGAGCGAGTACGCGATGa < 2:35373/150‑1 (MQ=255) ggCGCCAATGTGGTCGGCGACCGTGTGGTGCTTGAGGTCACCGAGCCGCTGGACTGGAACGTGGACAACCCGCGCATCCTTATCCGCCGGCACGACGGCTCAGCAACCCCGCTGATAGTTCAATCCCGGGTGAGCGAGTACGAGATGAGc < 1:1871182/150‑1 (MQ=255) | GCATGCGCGTTTTGCGTAAGCATCAGTCGCAGCGCTGGTCGTACTCGGGCACCACCGACCTGGAGGTGCTGTGCTATGAGCGGTTTGATCGCATGGCCCTGTCCGACGACATACCTGGCACCAGCCAGTCGGCACTCATCGTCGGCGCCAATGTGGTCGGCGACCGTGTGGTGCTTGAGGTCACCGAGCCGCTGGACTGGAACGTGGACAACCCGCGCATCCTTATCCGCCGGCACGACGGCTCAGCAACCCCGCTGATCGTGCCAACCCGGGTGAGCGAGTACGAGATGAGC > NC_002947/1771798‑1772090 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |