| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
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1:969475/150‑1 (MQ=255) tCATCGTCGGCGCCAATGTGGTCGGCGACCGTGTGGTGCTTGAGGTCACCGAGCCGCTGGACTGGAACGTGGACAACCCGCGCATCCTTATCCGCCGGCTCGACGGCTCAGCAACCCCGCTGATCGTGCCAACCCGGGTGAGCGAGTACg < 1:1640093/150‑1 (MQ=255) tCATCGTCGGCGCCAATGTGGTCGGCGACCGTGTGGTGCTTGAGGTCACCGAGCCGCTGGACTGGAACGTGGACAACCCGCGCATCCTTATCCGCCGGCACGACGGCTCAGCAACCCCGCTGATCGTGCCAACCCGGGt > 2:1856588/1‑139 (MQ=255) aTCGTCGGCGCCAATGTGGTCGGcgacgatgagtgccgactggctggtgccaggtatgtcgtcggacagggccatgcgatcaaaccgctcatagcacagcacctccaggtcggtggtgcccgagtacgaccagcgctgcgactgatgctt < 1:2160437‑M2/150‑128 (MQ=255) tcgtcgGCGCCAATGTGGTCGGcgacgatgagtgccgactggctggtgccaggtatgtcgtcggacagggccatgcgatcaaaccgctcatagcacagcacctccaggtcggtggtgacagggtacgaccagcgctgcgactgatgctta < 1:1811971‑M2/150‑129 (MQ=255) tcgtcgGCGCCAATGTGGTCGGCGACCGTGTGGTGCTTGAGGTCACCGAGCCGCTGGACTGGAACGTGGACAACCCGCGCATCCTTATCCGCCGGCACGACGGCTCAGCAACCCCGCTGATCGTGCCAACCCGGGTGAGCGAGTACgaga > 1:1264720/1‑150 (MQ=255) tcgtcgGCGCCAATGTGGTCGGCGACCGTGTGGTGCTTGAGGTCACCGAGCCGCTGGACTGGAACGTGGACAACCCGCGCATCCTTATCCGCCGGCACGACGGCTCAGCAACCCCGCTGATCGTGCCAACCCGGGTGAGCGAGTACgaga < 1:1425444/150‑1 (MQ=255) tcgtcgGCGCCAATGTGGTCGGCGACCGTGTGGTGCTTGAGGTCACCGAGCCGCTGGACTGGAACGTGGACAACCCGCGCATCCTTATCCGCCGGCACGACGGCTCAGCAACCCCGCTGATCGTGCCAACCCGGGTGAGCGAGTACgaga < 1:363590/150‑1 (MQ=255) ccgtcgGCGCCAATGTGGTCGGCGACCGTGTGGTGCTTGAGGTCACCGACCCGCTGGACTGGAACGTGGACAACCCGCGCATCCTTATCCGCCGGCACGACGGCTCAGCAACCCCGCTGATCGGGCCAACCCGAGTGAGCGAGTACgaga < 1:2149247/149‑1 (MQ=255) cgtcgGCGCCAATGTGGTCGGcgacgatgagtgccgactggctggtgccaggtatgtcgtcggacagggccatgcgatcaaaccgctcatagcacagcacctccagg > 1:2289054‑M2/1‑21 (MQ=255) cgtcgGCGCCAATGTGGTCGGcgacgatgagtgccgactggctggtgccaggtatgtcgtcggacagggccatgcgatcaaaccgctcatagcacagcacctccagg < 2:2289054‑M2/107‑87 (MQ=255) tcgGCGCCAATGTGGTCGGcgacgatgagtgccgactggctggtgccaggtatgtcgtc < 1:1863990‑M2/59‑41 (MQ=255) tcgGCGCCAATGTGGTCGGcgacgatgagtgccgactggctggtgccaggtatgtcgtc > 2:1863990‑M2/1‑19 (MQ=255) tcgGCGCCAATGTGGTCGGCGACCGTGTGGTGCTTGAGGTCACCGAGCCGCTGGACTGGAACGTGGACAACCCGCGCATCCTTATCCGCCGGCACGACGGCTCAGCAACCCCGCTGATCGTGCCAACCCGGGTGAGCGAGTACGCGATGa < 2:35373/150‑1 (MQ=255) tcgGCGCCAATGTGGTCGGCGACCGTGTGGTGCTTGAGGTCACCGAGCCGCTGGACTGGAACGTGGACAACCCGCGCATCCTTATCCGCCGGCACGACGGCTCAGCAACCCCGCTGATCGTGCCAACCCGGGTGAGCGAGTACGAGATGa < 1:251555/150‑1 (MQ=255) ggCGCCAATGTGGTCGGCGACCGTGTGGTGCTTGAGGTCACCGAGCCGCTGGACTGGAACGTGGACAACCCGCGCATCCTTATCCGCCGGCACGACGGCTCAGCAACCCCGCTGATAGTTCAATCCCGGGTGAGCGAGTACGAGATGAGc < 1:1871182/150‑1 (MQ=255) cAATGTGGTCGGCGACCGTGTGGTGCTTGAGGTCACCGAGCCGCTGGACTGGAACGTGGACAACCCGCGCATCCTTATCCGCCGGCACGACGGCTCAGCAACCCCGCTGATCGTGCCAACCCGGGTGAGCGAGTACGAGATGAGCATtgc > 1:434610/1‑150 (MQ=255) aTGTGGTCGGCGACCGTGTGGTGCTTGAGGTCACCGAGCCGCTGGACTGGAACGTGGACAACCCGCGCATCCTTATCCGCCGGCACGACGGCTCAGCAACCCCGCTGATCGTGCCAACCCGGGTGAGCGAGTACGAGATGAGCATtgctg < 1:1318388/150‑1 (MQ=255) tgtgGTCGGCGACCGTGTGGTGCTTGAGGTCACCGAGCCGCTGGACTGGAACGTGGACAACCCGCGCATCCTTATCCGCCGGCACGACGGCTCAGCAACCCCGCTGATCGTGCCAACCCGGGTGAGCGAGTACGAGATGAGCATtgctgc > 2:1526966/1‑150 (MQ=255) ggTCGGCGACCGTGTGGTGCTTGAGGTCACCGAGCCGCTGGACTGGAACGTGGACAACCCGCGCATCCTTATCCGCCGGCACGACGGCTCAGCAACCCCGCTGATCGTGCCAACCCGGGTGAGCGAGTACGAGATGAGCATTGCTGCGAc < 1:2045331/150‑1 (MQ=255) cGGCGACCGTGTGGTGCTTGAGGTCACCGAGCCGCTGGACTGGAACGTGGACAACCCGCGCATCCTTATCCGCCGGCACGACGGCTCAGCAACCCCGCTGATCGTGCCAACCCGGGTGAGCGAGTACGAGATGAGCATTGCTGCGACgga < 1:2206037/150‑1 (MQ=255) ggCGACCGTGTGGTGCTTGAGGTCACCGAGCCGCTGGACTGGAACGTGGACAACCcgc > 2:1147755/1‑58 (MQ=255) ggCGACCGTGTGGTGCTTGAGGTCACCGAGCCGCTGGACTGGAACGTGGACAACCcgc < 1:1147755/58‑1 (MQ=255) gCGACCGTGTGGTGCTTGAGGTCACCGAGCCGCTGGACTGGAACGTGGACAACCCGCGCATCCTTATCCGCCGGCACGACGGCTCAGCAACCCCGCTGATCGTGCCAACCCGGGTGAGCGAGTACGAGATGAGCATTGCTGCGACggact < 2:1264720/150‑1 (MQ=255) | GCGTAAGCATCAGTCGCAGCGCTGGTCGTACTCGGGCACCACCGACCTGGAGGTGCTGTGCTATGAGCGGTTTGATCGCATGGCCCTGTCCGACGACATACCTGGCACCAGCCAGTCGGCACTCATCGTCGGCGCCAATGTGGTCGGCGACCGTGTGGTGCTTGAGGTCACCGAGCCGCTGGACTGGAACGTGGACAACCCGCGCATCCTTATCCGCCGGCACGACGGCTCAGCAACCCCGCTGATCGTGCCAACCCGGGTGAGCGAGTACGAGATGAGCATTGCTGCGACGGACT > NC_002947/1771811‑1772106 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |