New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2568662 | 95 (1.070) | 6 (0.070) | 5/234 | NT | 6.1% | coding (929/1050 nt) | PP_2252 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 2568673 | 93 (1.100) | coding (918/1050 nt) | PP_2252 | hypothetical protein |
Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
TGCGAAAACGCCGGCACAGGCCGCCACTAAGGTGGCAGGCGAATGATCAAAGGCGCCTGCTGCTGCTCGACCTGCTGCTCCACCGGCCGCGGCGCACTGGCCAGCAAGCTGTCCTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCACCCCGTAACCGGCTGCGGCAATCGAAATCATCGCC > NC_002947/2568515‑2568811 | tGCGAAAACGCCGGCACAGGCCGCCACTAAGGTGGCAGGCGAATGATCAAAGGCGCCTGCTGCTGCTCGACCTGCTGCTCCACCGGCCGCGGCGCACTGGCCAGCAAGCTGTCCTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATg < 2:101307/150‑1 (MQ=255) aaaCGCCGGCACAGGCCGCCACTAAGGTGGCAGGCGAATGATCAAAGGCGCCTGCTGCTGCTCGACCTGCTGCTCCACCGGCCGCGGCGCACTGGCCAGCAAGCTGTCCTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGcccc > 2:2097021/1‑150 (MQ=255) aaaCGCCGGCACAGGCCGCCACTAAGGTGGCAGGCGAAAGATCAAAGGCGCCTGCTGCTGCTCGACCTGCTGCTCCACCGGCCGCGGCGCACTGGCCAGCAAGCTGTCCTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGcccc > 2:1396488/1‑150 (MQ=255) aaCGCCGGCACAGGCCGCCACTAAGGTGGCAGGCGAATGATCAAAGGCGCCTGCTGCTGCTCGACCTGCTGCTCCACCGGCCGCGGCGCACTGGCCAGCAAGCTGTCCTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCg < 1:2003003/150‑1 (MQ=255) acaGGCCGCCACTAAGGTGGCAGGCGAATGATCAAAGGCGCCTGCTGCTGCTCGACCTGCTGCTCCACCGGCCGCGGCGCACTGGCCAGCAAGCTGTCCTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCtgg > 2:1258040‑M2/1‑144 (MQ=255) aGGCCGCCACTAAGGTGGCAGGCGAATGATCAAAGGCGCCTGCTGCTGCTCGACCTGCTGCTCCACCGGCCGCGGCGCACTGGCCAGCAAGCTGTCCTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGtt > 1:1190230/1‑150 (MQ=255) aGGCCGCCACTAAGGTGGCAGGCGAATGATCAAAGGCGCCTGCTGCTGCTCGACCTGCTGCTCCACCGGCCGCGGCGCACTGGCCAGCAAGCTGTCCTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGtt > 1:620286/1‑150 (MQ=255) ggCCGCCACTAAGGTGGCAGGCGAATGATCAAAGGCGCCTGCTGCTGCTCGACCTGCTGCTCCACCGGCCGCGGCGCACTGGGCAGCAAGCTGTCCTCAACCTGCCCCGACAGGGAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTtc < 2:1105450/150‑1 (MQ=255) cgccACTAAGGTGGCAGGCGAATGATCAAAGGCGCCTGCTGCTGCTCGACCTGCTGCTCCACCGGCCGCGGCGCACTGGCCAGCAAGCTGTCCTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTcc > 1:818954/1‑150 (MQ=255) cgccACTAAGGTGGCAGGCGAATGATCAAAGGCGCCTGCTGCTGCTCGACCTGCTGCTCCACCGGCCGCGGCGCACTGGCCAGCAAGCTGTCCTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTcc > 1:207785/1‑150 (MQ=255) gccACTAAGGTGGCAGGCGAATGATCAAAGGCGCCTGCTGCTGCTCGACCTGCTGCTCCACCGGCCGCGGCGCACTGGCCAGCAAGCTGTCCTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCa < 2:1190230/150‑1 (MQ=255) cACTAAGGTGGCAGGCGAATGATCAAAGGCGCCTGCTGCTGCTCGACCTGCTGCTCCACCGGCCGCGGCGCACTGGCCAGCAAGCTGTCCTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATc < 1:1558258/150‑1 (MQ=255) tAAGGTGGCAGGCGAATGATCAAAGGCGCCTGCTGCTGCTCGACCTGCTGCTCCACCGGCCGCGGCGCACTGGCCAGCAAGCTGTCCTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAAc > 2:2226482/1‑150 (MQ=255) aGGTGGCAGGCGAATGATCAAAGGCGCCTGCTGCTGCTCGACCTGCTGCTCCACCGGCCGCGGCGCACTGGCCAGCAAGCTGTCCTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTc < 1:597724/150‑1 (MQ=255) gCGAATGATCAAAGGCGCCTGCTGCTGCTCGACCTGCTGCTCCACCGGCCGCGGCGCACTGGCCAGCAAGCTGTCCTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTc > 1:563567/1‑150 (MQ=255) gCGAATGATCAAAGGCGCCTGCTGCTGCTCGACCTGCTGCTCCACCGGCCGCGGCGCACTGGCCAGCAAGCTGTCCTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTc < 1:1195824/150‑1 (MQ=255) cGAATGATCAAAGGCGCCTGCTGCTGCTCGACCTGCTGCTCCACCGGCCGCGGCGCACTGGCCAGCAAGCTGTCCTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTcc < 1:220387/150‑1 (MQ=255) gAATGATCAAAGGCGCCTGCTGCTGCTCGACCTGCTGATCCACCGGCCGCGGCGCACTGGCCAGCAAGCTGTCCTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGAGCTCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCt > 1:1954235/1‑150 (MQ=255) 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tCAAAGGCGCCTGCTGCTGCTCGACCTGCTGCTCCACCGGCCGCGGCGCACTGGCCAGCAAGCTGTCCTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCa > 1:1033879/1‑150 (MQ=255) tCAAAGGCGCCTGCTGCTGCTCGACCTGCTGCTCCACCGGCCGCGGCGCACTGGCCAGCAAGCTGTCCTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCAGTCCTGGTTCa > 1:1693652/1‑150 (MQ=255) tCAAAGGCGCCTGCTGCTGCTCGACCTGCTGCTCCAACGGCCGCGGCGCACTGGCCAGCAAGCTGTCCTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCAGAGCGGGGCCAtggcgggggtctattacctgtcggggcaggttga < 2:2082098‑M2/147‑35 (MQ=255) aaaGGCGCCTGCTGCTGCTCGACCTGCTGCTCCACCGGCCGCGGCGCACTGGCCAGCAAGCTGTCCTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAAc < 1:2097021/150‑1 (MQ=255) aaGGCGCCTGCTGCTGCTCGACCTGCTGCTCCACCGGCCGCGGCGCACTGGCCAGCAAGCTGTCCTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACg > 2:358707/1‑150 (MQ=255) ccTGCTGCTGCTCGACCTGCTGCTCCACCGGCCGCGGCGCACTGGCCAGCAAGCTGTCCTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGt > 1:1108575/1‑150 (MQ=255) ctgctgctgCTCGACCTGCTGCTCCACCGGCCGCGGCGCACTGGCCAGCAAGCTGTCCTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGtt < 1:1274216/150‑1 (MQ=255) tgctgctgcTCGACCTGCTGCTCCACCGGCCGCGGCGCACTGGCCAGCAAGCTGTCCTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACT‑CTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCa > 1:708268/1‑150 (MQ=255) gctgctgctCGACCTGCTGCTCCACCGGCCGCGGCGCACTGGCCAGCAAGCTGTCCTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCa < 2:2002391/150‑1 (MQ=255) ctgctgctCGACCTGCTGCTCCACCGGCCGCGGCGCACTGGCCAGCAAGCTGTCCTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAg < 2:605161/150‑1 (MQ=255) 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tCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCAtggccccgctctggcgggggtctattacctgtcggggcaggttgaggacagcttgctggccagtgcgccgcggccggtggagcagcaggtcgagcagcagcaggcgcctttga > 1:2082098‑M1/1‑34 (MQ=255) tCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCAcc > 1:253784/1‑150 (MQ=255) aCCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCACCCCg > 2:1690351/1‑150 (MQ=255) cTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGCTCACCCCCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGTGCACGGTCATGGGTCATCACCCCGTa > 1:208736/1‑150 (MQ=255) cTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCCCCCGCAGTTGTTCGa < 2:1473440/110‑1 (MQ=255) cTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGa > 1:1473440/1‑110 (MQ=255) 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(MQ=255) aaTAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCACCCCGTAACCGGCTGCGGCaa < 1:1558076/150‑1 (MQ=255) aTAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCAcccc < 2:4463/132‑1 (MQ=255) aCCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCACCCCGTAACCGGCTGCGGCAATCGaa > 1:1097378/1‑150 (MQ=255) cccccGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCACCCCGTAACCGGCTGCGGCAATCGaaa < 1:1988991/150‑1 (MQ=255) ccccGCCATGGCCCCGCTCtggcgggggtctattacctgtcggggcaggttgaggacagcttgctggccagtgcgccgcggccggtggagcagcaggtcgagca > 2:198993‑M2/1‑19 (MQ=255) ccccGCCATGGCCCCGCTCtggcgggggtctattacctgtcggggcaggttgaggacagcttgctggccagtgcgccgcggccggtggagcagcaggtcgagca < 1:198993‑M2/104‑86 (MQ=255) ccccGCCATGGCCCCGCTCtggcgggggtctattacctgtcggggcaggttgaggacagcttgctggccagtgcgc < 2:56134‑M2/76‑58 (MQ=255) ccccGCCATGGCCCCGCTCtggcgggggtctattacctgtcggggcaggttgaggacagcttgctggccagtgcgc > 1:56134‑M2/1‑19 (MQ=255) ccccGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCAcccc < 1:1585686/126‑1 (MQ=255) ccccGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCAcccc > 2:1585686/1‑126 (MQ=255) ccccGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGATGGTCGAACAACTGCgg < 2:339368/99‑1 (MQ=38) ccccGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGATGGTCGAACAACTGCgg > 1:339368/1‑99 (MQ=38) ccGCCAgagcggggccatggcgggggtctattacctgtcggggcaggttgaggacagcttgctggccagtgcgccgcggccggtggagcagcaggtcgagcagcagcaggcgcctttga > 1:1319623‑M1/1‑6 (MQ=255) ccGCCAgagcggggccatggcgggggtctattacctgtcggggcaggttgaggacagcttgctggccagtgcgccgcggccggtggagcagcaggtcgagcagcagcaggcgcctttga < 2:1319623‑M1/119‑114 (MQ=255) ccGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGggtgg < 2:733323/101‑1 (MQ=255) ccAgagcggggccatggcgggggtctattacctgtcggggcaggttgaggacagcttgctggccagtgcgccgcggccggtggagcagcaggtcgagcagcagcaggcgcctttgatcattcgcctgccaccttagtggcggcctgt < 1:1258040‑M1/147‑145 (MQ=255) ccAgagcggggccatggcgggggtctattacctgtcggggcaggttgaggacagcttgctggccagtgcgccgcggccggtggagcagcaggtcgagcagcagcaggcgcctttgatcattcgcctgccaccttagtggcggcctgt > 2:1258040‑M1/1‑3 (MQ=255) ccATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGCTCACCCGCa > 2:1737793/1‑75 (MQ=255) ccATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCa < 1:1737793/75‑1 (MQ=255) aTGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCACCCCGTAACCGGCTGCGGCAATCGAAATCATCGcc < 1:593430/150‑1 (MQ=255) | TGCGAAAACGCCGGCACAGGCCGCCACTAAGGTGGCAGGCGAATGATCAAAGGCGCCTGCTGCTGCTCGACCTGCTGCTCCACCGGCCGCGGCGCACTGGCCAGCAAGCTGTCCTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCACCCCGTAACCGGCTGCGGCAATCGAAATCATCGCC > NC_002947/2568515‑2568811 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |