| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 2568662 | 95 (1.070) | 6 (0.070) | 5/234 | NT | 6.1% | coding (929/1050 nt) | PP_2252 | hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | = 2568673 | 93 (1.100) | coding (918/1050 nt) | PP_2252 | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
ACAGGCCGCCACTAAGGTGGCAGGCGAATGATCAAAGGCGCCTGCTGCTGCTCGACCTGCTGCTCCACCGGCCGCGGCGCACTGGCCAGCAAGCTGTCCTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCACCCCGTAACCGGCTGCGGCAATCGAAATCATCGCCCCTGCCAC > NC_002947/2568530‑2568819 | acaGGCCGCCACTAAGGTGGCAGGCGAATGATCAAAGGCGCCTGCTGCTGCTCGACCTGCTGCTCCACCGGCCGCGGCGCACTGGCCAGCAAGCTGTCCTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCtgg > 2:1258040‑M2/1‑144 (MQ=255) aGGCCGCCACTAAGGTGGCAGGCGAATGATCAAAGGCGCCTGCTGCTGCTCGACCTGCTGCTCCACCGGCCGCGGCGCACTGGCCAGCAAGCTGTCCTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGtt > 1:620286/1‑150 (MQ=255) aGGCCGCCACTAAGGTGGCAGGCGAATGATCAAAGGCGCCTGCTGCTGCTCGACCTGCTGCTCCACCGGCCGCGGCGCACTGGCCAGCAAGCTGTCCTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGtt > 1:1190230/1‑150 (MQ=255) ggCCGCCACTAAGGTGGCAGGCGAATGATCAAAGGCGCCTGCTGCTGCTCGACCTGCTGCTCCACCGGCCGCGGCGCACTGGGCAGCAAGCTGTCCTCAACCTGCCCCGACAGGGAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTtc < 2:1105450/150‑1 (MQ=255) ccgccACTAAGGTGGCAGGCGAATGATCAAAGGCGCCTGCTGCTGCTCGACCTGCTGCTCCACCGGCCGCGGCGCACTGGCCAGCAAGCTGTCCTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTtctc < 1:589815/150‑1 (MQ=255) cgccACTAAGGTGGCAGGCGAATGATCAAAGGCGCCTGCTGCTGCTCGACCTGCTGCTCCACCGGCCGCGGCGCACTGGCCAGCAAGCTGTCCTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTcc > 1:207785/1‑150 (MQ=255) cgccACTAAGGTGGCAGGCGAATGATCAAAGGCGCCTGCTGCTGCTCGACCTGCTGCTCCACCGGCCGCGGCGCACTGGCCAGCAAGCTGTCCTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTcc > 1:818954/1‑150 (MQ=255) gccACTAAGGTGGCAGGCGAATGATCAAAGGCGCCTGCTGCTGCTCGACCTGCTGCTCCACCGGCCGCGGCGCACTGGCCAGCAAGCTGTCCTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCa < 2:1190230/150‑1 (MQ=255) cACTAAGGTGGCAGGCGAATGATCAAAGGCGCCTGCTGCTGCTCGACCTGCTGCTCCACCGGCCGCGGCGCACTGGCCAGCAAGCTGTCCTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATc < 1:1558258/150‑1 (MQ=255) tAAGGTGGCAGGCGAATGATCAAAGGCGCCTGCTGCTGCTCGACCTGCTGCTCCACCGGCCGCGGCGCACTGGCCAGCAAGCTGTCCTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAAc > 2:2226482/1‑150 (MQ=255) aGGTGGCAGGCGAATGATCAAAGGCGCCTGCTGCTGCTCGACCTGCTGCTCCACCGGCCGCGGCGCACTGGCCAGCAAGCTGTCCTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTc < 1:597724/150‑1 (MQ=255) gCGAATGATCAAAGGCGCCTGCTGCTGCTCGACCTGCTGCTCCACCGGCCGCGGCGCACTGGCCAGCAAGCTGTCCTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTc < 1:1195824/150‑1 (MQ=255) gCGAATGATCAAAGGCGCCTGCTGCTGCTCGACCTGCTGCTCCACCGGCCGCGGCGCACTGGCCAGCAAGCTGTCCTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTc > 1:563567/1‑150 (MQ=255) 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tgctgctgcTCGACCTGCTGCTCCACCGGCCGCGGCGCACTGGCCAGCAAGCTGTCCTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACT‑CTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCa > 1:708268/1‑150 (MQ=255) gctgctgctCGACCTGCTGCTCCACCGGCCGCGGCGCACTGGCCAGCAAGCTGTCCTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCa < 1:1480867/150‑1 (MQ=255) ctgctgctCGACCTGCTGCTCCACCGGCCGCGGCGCACTGGCCAGCAAGCTGTCCTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAg < 2:605161/150‑1 (MQ=255) tgctgctCGACCTGCTGCTCCACCGGCCGCGGCGCACTGGCCAGCAAGCTGTCCTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACTCCACGTTCAgg < 1:1182349/150‑1 (MQ=255) gctgctCGACCTGCTGCTCCACCGGCCGCGGCGCACTGGCCAGCAAGCTGTCCTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGa > 2:1571659/1‑150 (MQ=255) 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aCCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCACCCCGTAACCGGCTGCGGCAATCGaa > 1:1097378/1‑150 (MQ=255) cccccGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCACCCCGTAACCGGCTGCGGCAATCGaaa < 1:1988991/150‑1 (MQ=255) ccccGCCATGGCCCCGCTCtggcgggggtctattacctgtcggggcaggttgaggacagcttgctggccagtgcgccgcggccggtggagcagcaggtcgagca > 2:198993‑M2/1‑19 (MQ=255) ccccGCCATGGCCCCGCTCtggcgggggtctattacctgtcggggcaggttgaggacagcttgctggccagtgcgccgcggccggtggagcagcaggtcgagca < 1:198993‑M2/104‑86 (MQ=255) ccccGCCATGGCCCCGCTCtggcgggggtctattacctgtcggggcaggttgaggacagcttgctggccagtgcgc < 2:56134‑M2/76‑58 (MQ=255) ccccGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCAcccc > 2:1585686/1‑126 (MQ=255) ccccGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGATGGTCGAACAACTGCgg > 1:339368/1‑99 (MQ=38) ccccGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGATGGTCGAACAACTGCgg < 2:339368/99‑1 (MQ=38) ccccGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGCACTGCATAACCTTCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCACCCCGTAACCGGCTGCGGCAATCGAAat > 1:1171408/1‑150 (MQ=255) cccGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCATGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCACCCCGTAACCGGCTGCGGCAATCGAAatc > 2:593430/1‑150 (MQ=255) ccGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGggtgg < 2:733323/101‑1 (MQ=255) ccGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGggtgg > 1:733323/1‑101 (MQ=255) ccATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGCTCACCCGCa > 2:1737793/1‑75 (MQ=255) ccATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCa < 1:1737793/75‑1 (MQ=255) aTGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCACCCCGTAACCGGCTGCGGCAATCGAAATCATCGcc < 1:593430/150‑1 (MQ=255) ggCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCACCCCGTAACCGGCTGCGGCAATCGAAATCATCGcccc > 1:309890/1‑150 (MQ=255) ccccGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCCTCACCCCGTAACCGGCTGCGGCAATCGAAATCATCGCCCCTg > 1:633774/1‑150 (MQ=255) gCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCACCCCGTAACCGGCTGCGGCAATCGAAATCATCGCCCCTGCCAc > 1:1275135/1‑150 (MQ=255) ctctGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAg < 1:2149134/53‑1 (MQ=255) ctctGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAg > 2:2149134/1‑53 (MQ=255) | ACAGGCCGCCACTAAGGTGGCAGGCGAATGATCAAAGGCGCCTGCTGCTGCTCGACCTGCTGCTCCACCGGCCGCGGCGCACTGGCCAGCAAGCTGTCCTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCACCCCGTAACCGGCTGCGGCAATCGAAATCATCGCCCCTGCCAC > NC_002947/2568530‑2568819 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |