New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 2651868 = | 82 (0.930) | 9 (0.110) | 9/238 | NT | 9.7% | coding (593/1113 nt) | aroF‑I | tyr‑sensitive phospho‑2‑dehydro‑3‑deoxyheptonate aldolase |
? | NC_002947 | 2651914 = | 88 (1.030) | coding (547/1113 nt) | aroF‑I | tyr‑sensitive phospho‑2‑dehydro‑3‑deoxyheptonate aldolase |
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
GCGCAGTACCACGTGGCCGTATGGGTTGCCCTTGGTGGTGACGATCGACACGCCGCCTTCCTGGTTGATGCCCAGGAAGCGGTGCGGCTTGGACACCGACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCATCGGTACCGTTCTTGAAACCCACCGCCGAGGACAGGCCCGAGGCCATCTCGCGGTGTGTTTGCGATTCGGTGGTGCGGGCACCGATGGCCGACCAGCTGATCAGGTCTTGCAGGTACTGCGGCGAAATCGGGTCGAGCGCTTCGGTGGCGGTCGGCAGGCCCA > NC_002947/2651720‑2652015 | gacggcctgcacatcggccgcaagttgctgctggacctggccgaaatgggcctgccgaccgccaccgaagcgctcgacccgatttcgccgcagtacctgcaagacctgatcagctggtcggccatcggtgcccgcaccaccgaatcgcaa < 1:1937431‑M1/2‑1 (MQ=255) cgcAGTACCACGTGGCCGTATGGGTTGCCCTTGGTGGTGACGATCGACACGCCGCCTTCCTGGTTGATGCCCAGGAAGCGGTGCGGCTTGGACACCGACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCATCGGTACCGTTCTTGaaa < 2:1696977/150‑1 (MQ=255) acggcctgcacatcggccgcaagttgctgctggacctggccgaaatgggcctgccgaccgccaccgaagcgctcgacccgatttcgccgcagtacctgcaagacctgatcagctggtcggccatcggtgcccgcaccaccgaatcgcaaa > 1:661666‑M1/148‑150 (MQ=255) acggcctgcacatcggccgcaagttgctgctggacctggccgaaatgggcctgccgaccgccaccgaagcgctcgacccgatttcgccgcagtacctgcaagacctgatcagctggtcggccatcggtgcccgcaccaccgaatcgcaaa > 1:473110‑M1/148‑150 (MQ=255) aGTACCACGTGGCCGTATGGGTTGCCCTTGGTGGTGACGATCGACACGCCGCCTTCCTGGTTGATGCCCAGGAAGCGGTGCGGCTTGGACACCGACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCATCGGTACCGTTCTTGAAAccc > 2:1026227/1‑150 (MQ=255) cACGTGGCCGTATGGGTTGCCCTTGGTGGTGACGATCGACACGCCGCCTTCCTGGTTGATGCCCAGGAAGCGGTGCGGCTTGGACACCGACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCATCGGTACCGTTCTTGAAACCCAccgc > 1:915888/1‑150 (MQ=255) cACGTGGCCGTATGGGTTGCCCTTGGTGGTGACGATCGACACGCCGCCTTCCTGGTTGATGCCCAGGAAGCGGTGCGGCTTGGACACCGACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCATCGGTACCGTTCTTGAAACCCAccgc > 1:1588795/1‑150 (MQ=255) gTGGCCGTATGGGTTGCCCCTGGTGTGGACGATCGACACGCCGCCTTCCTGGTTGATGCCCAGGAAGCGGTGCGGCTTGGACACCGACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCATCGGTACCGTTCTTGAAACCCACCGCCGa < 2:1588795/150‑1 (MQ=255) 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GCGCAGTACCACGTGGCCGTATGGGTTGCCCTTGGTGGTGACGATCGACACGCCGCCTTCCTGGTTGATGCCCAGGAAGCGGTGCGGCTTGGACACCGACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCATCGGTACCGTTCTTGAAACCCACCGCCGAGGACAGGCCCGAGGCCATCTCGCGGTGTGTTTGCGATTCGGTGGTGCGGGCACCGATGGCCGACCAGCTGATCAGGTCTTGCAGGTACTGCGGCGAAATCGGGTCGAGCGCTTCGGTGGCGGTCGGCAGGCCCA > NC_002947/2651720‑2652015 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |