New junction evidence | |||||||||||
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? | NC_002947 | 2651914 = | 88 (1.030) | coding (547/1113 nt) | aroF‑I | tyr‑sensitive phospho‑2‑dehydro‑3‑deoxyheptonate aldolase |
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
CGACACGCCGCCTTCCTGGTTGATGCCCAGGAAGCGGTGCGGCTTGGACACCGACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCATCGGTACCGTTCTTGAAACCCACCGCCGAGGACAGGCCCGAGGCCATCTCGCGGTGTGTTTGCGATTCGGTGGTGCGGGCACCGATGGCCGACCAGCTGATCAGGTCTTGCAGGTACTGCGGCGAAATCGGGTCGAGCGCTTCGGTGGCGGTCGGCAGGCCCATTTCGGCCAGGTCCAGCAGCAACTTGCGGCCGATGTGCAGGCCGTCCT > NC_002947/2651765‑2652063 | atgggcctgccgaccgccaccgaagcgctcgacccgatttcgccgcagtacctgcaagacctgatcagctggtcggccatcggtgcccgcaccaccgaatcgcAAACCCACCGCCGAGGACAGGCCCGAGGCCATCTCGCGGTGTGTTTg > 2:1766916‑M1/104‑150 (MQ=255) gACACGCCGCCTTCCTGGTTGATGCCCAGGAAGCGGTGCGGCTTGGACACCGACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCATCGGTACCGTTCTTGAAACCCACCGCCGAGGACAGGCCCGAGGCCATCTCGCGGTGTGTTTGc < 1:620875/150‑1 (MQ=255) acGCCGCCTTCCTGGTTGATGCCCAGGAAGCGGTGCGGCTTGGACACCGACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCATCGGTACCGTTCTTGAAACCCACCGCCGAGGACAGGCCCGAGGCCATCTCGCGGTGTGTTTGCGAt > 2:1443728/1‑150 (MQ=255) 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ccAGGAAGCGGTGCGGCTTGGACACCGACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCATCGGTACCGTTCTTGAAACCCACCGCCGAGGACAGGCCCGAGGCCATCTCGCGGTGCGTTTGCGATTCGGTGGTGCGGGCACCGATgg < 2:1485818/150‑1 (MQ=255) taGCGGTACGGCTTGGACACCGACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCATCGGTACCGTTCTTGAAACCCACCGCCGAGGACAGGCCCGAGGCCATCTCGCGGTGTGTTTGCGATTCGGTGGTGCGGGCACCGATGGCCGAc < 1:2322617/149‑1 (MQ=255) gCGGTACGGCTTGGACACCGACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCATCGGTACCGTTCTTGAAACCCACCGCCGAGGACAGGCCCGAGGCCATCTCGCGGTGTGTTTGCGATTCCATGGTGCGTACACCGAGGGCCGACCa > 2:2322617/1‑150 (MQ=255) cGGTGCGGCTTGGACACCGACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCATCGGTACCGTTCTTGAAACCCACCGCCGAGGACAGGCCCGAGGCCATCTCGCGGTGTGTTTGCGATTCGGTGGTGCGGGCACCGATGGCCGACCAg < 1:2116399/150‑1 (MQ=255) ggTGCGGCTTGGACACCGACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCATCGGTACCGTTCTTGAAACCCACCGCCGAGGACAGGCCCGAGGCCATCTCGCGGTGTGTTTGCGATTCGGTGGTGCGGGCACCGATGGCCGACCAGc < 1:1073407/150‑1 (MQ=255) 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2:1018935/1‑120 (MQ=255) aGGCCCGAGGCCATCTCGCGGTGTGTTTGCGATTCGGTGGTGCGGGCACCGATGGCCGACCAGCTGATCAGGTCTTGCAGGTACTGCGGCGAAATCGGGTCGAGCGCTTCGGTGGCGGTCGGCAGGCCCATTTCGGCCAGGTCCagcagc > 1:2215174/1‑150 (MQ=255) gCCCGAGGCCATCTCGCGGTGTGTTTGCGATTCGGTGGTGCGGGCACCGATGGCCGACCAGCTGATCAGGTCTTGCAGGTACTGCGGCGAAATCGGGTCGAGCGCTTCGGTGGCGGTCGGCAGGCCCATTTCGGCCAGGTCCAGCAGCaa > 1:1975535/1‑150 (MQ=255) gCCCGAGGCCATCTCGCGGTGTGTTTGCGATTCGGTGGTGCGGGCACCGATGGCCGACCAGCTGATCAGGTCTTGCAGGTACTGCGGCGAAATCGGGTCGAGCGCTTCGGTGGCGGTCGGCAGGCCCATTTCGGCCAGGTCCAGCAGCaa > 2:582079/1‑150 (MQ=255) ccGAGGCCATCTCGCGGTGTGTTTGCGATTCGGTGGTGCGGGCACCGATGGCCGACCAGCTGATCAGGTCTTGCAGGTACTGCGGCGAAATCGGGTCGAGCGCTTCGGTGGCGGTCTGCAGGCCCATTTCGGc > 1:52416/1‑133 (MQ=255) ccGAGGCCATCTCGCGGTGTGTTTGCGATTCGGTGGTGCGGGCACCGATGGCCGACCAGCTGATCAGGTCTTGCAGGTACTGCGGCGAAATCGGGTCGAGCGCTTCGGTGGCGGTCTGCAGGCCCATTTCGGc < 2:52416/133‑1 (MQ=255) ccGAGGCCATCTCGCGGTGTGTTTGCGATTCGGTGGTGCGGGCACCGATGGCCGACCAGCTGATCAGGTCTTGCAGGTACTGCGGCGAAATCGGGTCGAGCGCTTCGGTGGCGGTCGGCAGGCCCATTTCGGCCAGGTCCAGCAGCAACt > 2:503819/1‑150 (MQ=255) cATCTCGCGGTGTGTTTGCGATTCGGTGGTGCGGGCACCGATGGCCGACCAGCTGATCAGGTCTTGCAGGTACTGCGGCGAAATCGGGTCGAGCGCTTCGGTGGCGGTCGGCAGGCCCATTTCGGCCAGGTCCAGCAGCAACTTGCGGcc > 2:469140/1‑150 (MQ=255) tcGCGGTGTGTTTGCGATTCGGTGGTGCGGGCACCGATGGCCGACCAGCTGATCAGGTCTTGCAGGTACTGCGGCGAAATCGGGTCGAGCGCTTCGGTGGCGGTCGGAAATCGTATTTCGGCCAGGTCCAGCAGCAACTTGCGGCCGAtg > 1:1832639/1‑150 (MQ=255) gcgGTGTGTTTGCGATTCGGTGGTGCGGGCACCGATGGCCGACCAGCTGATCAGGTCTTGCAGGTACTGCGGCGAAATCGGGTCGa < 2:212075/86‑1 (MQ=255) gcgGTGTGTTTGCGATTCGGTGGTGCGGGCACCGATGGCCGACCAGCTGATCAGGTCTTGCAGGTACTGCGGCGAAATCGGGTCGa > 1:212075/1‑86 (MQ=255) gcgGTGTGTTTGCGATTCGGTGGTGCGGGCACCGATGGCCGACCAGCTGATCAGGTCTTGCAGGTACTGCGGCGAAATCGGGTCGAGCGCTTCGGTGGCGGTCGGCAGGCCCATTTCGGCCAGGTCCAGCAGCAACTTGCGGCCGAtgtg > 1:209899/1‑150 (MQ=255) ggTGTGTTTGCGATTCGGTGGTGCGGGCACCGATGGCCGACCAGCTGATCAGGTCTTGCAGGTACTGCGGCGAAATCGGGTCGAGCGCTTCGGTGGCGGTCGGCAGGCCCATTTCGGCCAGGTCCAGCAGCAACTTGCGGCCGATGTGCa < 1:807811/150‑1 (MQ=255) gtgtgtTTGCGATTCGGTGGTGCGGGCACCGATGGCCGACCAGCTGATCAGGTCTTGCAGGTACTGCGGCGAAATCGGGTCGAGCGCTTCGGTGGCGGTCGGCAGGCCCATTTCGGCCAGGTCCAGCAGCAACTTGCGGCCGATGTGCAg < 2:2142086/150‑1 (MQ=255) gtgtgtTTGCGATTCGGTGGTGCGGGCACCGATGGCCGACCAGCTGATCAGGTCTTGCAGGTACTGCGGCGAAATCGGGTCGAGCGCTTCGGTGGCGGTCGGCAGGCCCATTTCGGCCAGGTCCAGCAGCAACTTGCGGCCGATGTGCAg < 1:1155746/150‑1 (MQ=255) tttGCGATTCGGTGGTGCGGGCACCGATGGCCGACCAGCTGATCAGGTCTTGCAGGTACTGCGGCGAAATCgg < 2:627199‑M2/70‑1 (MQ=255) tttGCGATTCGGTGGTGCGGGCACCGATGGCCGACCAGCTGATCAGGTCTTGCAGGTACTGCGGCGAAATCgg > 1:627199‑M2/4‑73 (MQ=255) tttGCGATTCGGTGGTGCGGGCACCGATGGCCGACCAGCTGATCAGGTCTTGCAGGTACTGCGGCGAAATCGGGTCGAGCGCTTCGGTGGCGGTCGGCAGGCCCATTTCGGCCAGGTCCAGCAGCAACTTGCGGCCGATGTGCAGGCCGt > 1:473110‑M2/4‑150 (MQ=255) ttGCGATTCGGTGGTGCGGGCACCGATGGCCGACCAGCTGATCAGGTCTTGCAGGTACTGCGGCGAAATCGGGTCGAGCGCTTCGGTGGCGGTCGGCAGGCCCATTTCGGCCAGGTCCAGCAGCAACTTGCGGCCGATGTGCAGGCCGTc < 1:1937431‑M2/148‑1 (MQ=255) gCGATTCGGTGGTGCGGGCACCGATGGCCGACCAGCTGATCAGGTCTTGCAGGTACTGCGGCGAAATCGGGTCGAGCGCTTCGGTGGCGGTCGGCAGGCCCATTTCGGCCAGGTCCAGCAGCAACTTGCGGCCGATGTGCAGGCCGTCCt < 1:355661/150‑1 (MQ=255) gCGATTCGGTGGTGCGGGCACCGATGGCCGACCAGCTGATCAGGTCTTGCAGGTACTGCGGCGAAATCGGGTCGAGCGCTTCGGTGGCGGTCGGCAGGCCCATTTCGGCCAGGTCCAGCAGCAACTTGCGGCCGATGTGCAGGCCGTCCt > 2:919834/1‑150 (MQ=255) | CGACACGCCGCCTTCCTGGTTGATGCCCAGGAAGCGGTGCGGCTTGGACACCGACTGCAGGGCATTGATGGCAACGGTCAGGCCGCCATCGGTACCGTTCTTGAAACCCACCGCCGAGGACAGGCCCGAGGCCATCTCGCGGTGTGTTTGCGATTCGGTGGTGCGGGCACCGATGGCCGACCAGCTGATCAGGTCTTGCAGGTACTGCGGCGAAATCGGGTCGAGCGCTTCGGTGGCGGTCGGCAGGCCCATTTCGGCCAGGTCCAGCAGCAACTTGCGGCCGATGTGCAGGCCGTCCT > NC_002947/2651765‑2652063 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |