| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 2687631 = | 81 (0.910) | 5 (0.060) | 5/230 | NT | 6.4% | coding (134/2388 nt) | PP_2354 | two‑component system sensor histidine kinase/response regulator |
| ? | NC_002947 | 2687656 = | 70 (0.850) | coding (109/2388 nt) | PP_2354 | two‑component system sensor histidine kinase/response regulator | |||||
CCGCGTGCTCTTCGCCATAAATGCCGGACAGGAATATGAACGGGATGTCGGGTGCCAGGCGTTGGGCGATGGCCAGCACTTCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGCTGTCTTCGACCATCAGTAGTTTCAACGGCGTTTGCTGCATCGTTGCGGCGGCCTCA > NC_002947/2687482‑2687780 | cgactgaaccgtcgcggtagcaactgaggccgccgcaacgatgcagcaaacgccgttgaaactactgatggtcgaagacagctcgatggacgctgagcttaccctgatgcgcctggagcgcagcgggctgcatgtgcagtcgcagctggt < 1:960264‑M1/1‑1 (MQ=255)ccGCGTGCTCTTCGCCATAAATGCCGGACAGGAATATGAACGGGATGTCGGGTGCCAGGCGTTGGGCGATGGCCAGCACTTCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCAt < 1:430902/150‑1 (MQ=255) gactgaaccgtcgcggtagcaactgaggccgccgcaacgatgcagcaaacgccgttgaaactactgatggtcgaagacagctcgatggacgctgagcttaccctgatgcgcctggagcgcagcgggctgcatgtgcagtcgcagctggtg < 1:591204‑M1/2‑1 (MQ=255) cgcgTGCTCTTCGCCATAAATGCCGGACAGGAATATGAACGGGATGTCGGGTGCCAGGCGTTGGGCGATGGCCAGCACTTCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATg > 1:2125300/1‑150 (MQ=255) cgTGCTCTTCGCCATAAATGCCGGACAGGAATATGAACGGGATGTCGGGTGCCAGGCGTTGGGCGATGGCCAGCACTTCTGTGCCGGCCGAGCCTGGTAGCACGCAGTCCCACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGtt > 1:163952/1‑150 (MQ=255) tgaaccgtcgcggtagcaactgaggccgccgcaacgatgcagcaaacgccgttgaaactactgatggtcgaagacagctcgatggacgctgagcttaccctgatgcgcctggagcgcagcgggctgcatgtgcagtcgcagctggTGTTc > 2:1526942‑M1/146‑150 (MQ=255) gCTCTTCGCCATAAATGCCGGACAGGAATATGAACGGGATGTCGGGTGCCAGGCGTTGGGCGATGGCCAGCACTTCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGa < 1:1206258/150‑1 (MQ=255) aaccgtcgcggtagcaactgaggccgccgcaacgatgcagcaaacgccgttgaaactactgatggtcgaagacagctcgatggacgctgagcttaccctgatgcgcctggagcgcagcgggctgcatgtgcagtcgcagctggTGTTCGa < 2:2089622‑M1/7‑1 (MQ=255) ttCGCCATAAATGCCGGACAGGAATATGAACGGGATGTCGGGTGCCAGGCGTTGGGCGATGGCCAGCACTTCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑Acc > 1:1095424/1‑150 (MQ=255) gCCATAAATGCCGGACAGGAATATGAACGGGATGTCGGGTGCCAGGCGTTGGGCGATGGCCAGCACTTCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATg < 1:1489569/138‑1 (MQ=255) gCCATAAATGCCGGACAGGAATATGAACGGGATGTCGGGTGCCAGGCGTTGGGCGATGGCCAGCACTTCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATg > 2:1489569/1‑138 (MQ=255) aTAAATGCCGGACAGGAATATGAACGGGATGTCGGGTGCCAGGCGTTGGGCGATGGCCAGCACTTCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATg < 1:469365/150‑1 (MQ=255) aTAAATGCCGGACAGGAATATGAACGGGATGTCGGGTGCCAGGCGTTGGGCGATGGCCAGCACTTCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATg > 2:591204/1‑150 (MQ=255) aTAAATGCCGGACAGGAATATGAACGGGATGTCGGGTGCCAGGCGTTGGGCGATGGCCAGCACTTCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATg < 2:163952/150‑1 (MQ=255) tAAATGCCGGACAGGAATACGAACGGGATGTCGGGTGCCAGGCGTTGGGCGATGGCCAGCACTTCTGTGCCGGACGAGTCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATgg < 2:2101041/150‑1 (MQ=255) aaaTGCCGGACAGGAATATGAACGGGATGTCGGGTGCCAGGCGTTGGGCGATGGCCAGCACTTCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGt > 1:1102931/1‑150 (MQ=255) aaTGCCGGACAGGAATATGAACGGGATGTCGGGTGCCAGGCGTTGGGCGATGGCCAGCACTTCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCAt < 1:1531845/146‑1 (MQ=255) aaTGCCGGACAGGAATATGAACGGGATGTCGGGTGCCAGGCGTTGGGCGATGGCCAGCACTTCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCAt > 2:1531845/1‑146 (MQ=255) 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aCGGGATGTCGGGTGCCAGGCGTTGGGCGATGGCCAGCACTTCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGca > 1:1818569/1‑150 (MQ=255) aCGGGATGTCGGGTGCCAGGCGTTGGGCGATGGAAAGCACTTCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGca > 1:194481/1‑150 (MQ=255) gggATGTCGGGTGCCAGGCGTTGGGCGATGGCCAGCACTTCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCNAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGcaca > 2:2090313/1‑150 (MQ=255) gggATGTCGGGTGCCAGGCGTTGGGCGATGGCCAGCACTTCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGcaca < 1:191700/150‑1 (MQ=255) ggATGTCGGGTGCCAGGCGTTGGGCGATGGCCAGCACTTCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACAt < 2:1095424/150‑1 (MQ=255) gATGTCGGGTGCCAGGCGTTGGGCGATGGCCAGCACTTCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATg > 1:209651/1‑150 (MQ=255) gATGTCGGGTGCCAGGCGTTGGGCGATGGCAAGACCTTTTTTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATg < 2:194481/150‑1 (MQ=255) ccAGGCGTTGGGCGATGGCCAGCACTTCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTgc > 2:1683052/1‑150 (MQ=255) ccAGGCGTTGGGCGATGGCCAGCACTTCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTgc > 1:705745/1‑150 (MQ=255) cAGGCGTTGGGCGATGGCCAGCACTTCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTgcg > 2:1951502/1‑150 (MQ=255) gTTGGGCGATGGCCAGCACTTCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCa < 2:1063638/150‑1 (MQ=255) ttGGGCGATGGCCAGCACTTCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAg > 2:960264/1‑150 (MQ=255) tGGGCGATGGCCAGCACTTCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGt < 2:1880098/90‑1 (MQ=255) tGGGCGATGGCCAGCACTTCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGt > 1:1880098/1‑90 (MQ=255) gtgCGATGGCCAGCACTTCTGTGCCGGACGAGCCCGGTCGCGCGCAGTCACACATGATCAGGTCGTAGCGGGTTTGTCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGgc < 1:1142387/148‑1 (MQ=255) ggCGATGGCCAGCACTTCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGgcg > 2:620195/1‑150 (MQ=255) gATGGCCAGCACTTCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGgc > 2:171418/1‑146 (MQ=255) gATGGCCAGCACTTCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGgc < 1:171418/146‑1 (MQ=255) gATGGCCAGCACTTCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCAt < 1:1431766/150‑1 (MQ=255) gCCAGCACTTCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAgg < 2:1818569/150‑1 (MQ=255) ccAGCACTTCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑Accc > 1:373431/1‑89 (MQ=255) ccAGCACTTCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑Accc < 2:373431/89‑1 (MQ=255) aCTTCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGCA‑ACCAGCTTGGCATCACGCTAGGCGCGACTGCACATGCAGCCAGCTGCGCTCTAGGCGCATCAGGGTAAGc > 1:2089622/1‑150 (MQ=255) aCTTCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCAt < 1:2264897/88‑1 (MQ=255) aCTTCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCAt > 2:2264897/1‑88 (MQ=255) ttCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAg > 1:251393/1‑117 (MQ=255) ttCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAg < 2:251393/117‑1 (MQ=255) ttCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAg < 2:630805/132‑1 (MQ=255) ttCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAg > 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acaGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGa > 1:1200424/1‑42 (MQ=255) acaGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAggg > 2:1779274/1‑108 (MQ=255) acaGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAggg < 1:1779274/108‑1 (MQ=255) acaGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGc < 2:606650/129‑1 (MQ=255) acaGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGc > 1:606650/1‑129 (MQ=255) acaGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGCTGTCTTCGACCATCag < 1:663204/145‑1 (MQ=255) acaGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGCTGTCTTCGACCATCag > 2:663204/1‑145 (MQ=255) ggATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGCTGTCTTCGACCATCAGTAGTTTCa > 2:1740797/1‑150 (MQ=255) gATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGCTGTCTTCGACCATCAGTAGTTTCaa > 1:59690/1‑150 (MQ=255) aGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGCTGTCTTCGACCATCAGTAGTTTCAACGGc > 2:954659/1‑150 (MQ=255) gTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGCTGTCTTCGACCATCAGTAGTTTCAACGGCGt > 2:628127/1‑150 (MQ=255) gTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGCTGTCTTCGACCATCAGTAGTTTCAACGGCGTTtg < 1:1614074/150‑1 (MQ=255) ctgcatgtgcagtcgcagctggTGTTCGACCATGCGGGTG‑TCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGCTGTCTTCGACCATCAGTAGTTTCAACGGCGTTtg < 1:1963268‑M1/128‑1 (MQ=255) aGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGCTGTCTTCGACCATCAGTAGTTTCAACGGCGTTtgct < 2:705745/150‑1 (MQ=255) gCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGCTGTCTTCGACCATCAGTAGTTTCAACGGCGTTtgctg > 2:689433/1‑150 (MQ=255) gCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGGCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGCTGTCTTCGACCATCAGTAGTTTCAACGGCGTTtgctg > 1:112421/1‑150 (MQ=255) atgtgcagtcgcagctggTGTTCGACCATGCGGGTG‑TCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGCTGTCTTCGACCATCAGTAGTTTCAACGGCGTTtgctgc > 2:1963268‑M1/19‑150 (MQ=255) tgtgcagtcgcagctggTGTTCGACCATGCGGGTG‑TCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGCTGTCTTCGACCATCAGTAGTTTc > 2:1030246‑M1/18‑134 (MQ=255) tgtgcagtcgcagctggTGTTCGACCATGCGGGTG‑TCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGCTGTCTTCGACCATCAGTAGTTTc < 1:1030246‑M1/117‑1 (MQ=255) ccTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATc > 2:395609/1‑104 (MQ=255) ccTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATc < 1:395609/104‑1 (MQ=255) ggCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGCTGTCTTCGACCATCAGTAGTTTCAACGGCGTTTGCTGCATCGTTGCggcggc < 1:1683052/150‑1 (MQ=255) aTGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGCTGTCTTCGACCATCAGTAGTTTCAACGGCGTTTGCTGCATCGTTGCGGCGGCCTc > 2:1282584/1‑150 (MQ=255) TGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGCTGTCTTCGACCATCAGTAGTTTCAACGGCGTTTGCTGCATCGTTGCGGCGGCCTCa > 2:2103269‑M1/1‑150 (MQ=255) | CCGCGTGCTCTTCGCCATAAATGCCGGACAGGAATATGAACGGGATGTCGGGTGCCAGGCGTTGGGCGATGGCCAGCACTTCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGCTGTCTTCGACCATCAGTAGTTTCAACGGCGTTTGCTGCATCGTTGCGGCGGCCTCA > NC_002947/2687482‑2687780 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |