| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 2687631 = | 81 (0.910) | 5 (0.060) | 5/230 | NT | 6.4% | coding (134/2388 nt) | PP_2354 | two‑component system sensor histidine kinase/response regulator |
| ? | NC_002947 | 2687656 = | 70 (0.850) | coding (109/2388 nt) | PP_2354 | two‑component system sensor histidine kinase/response regulator | |||||
ACAGGAATATGAACGGGATGTCGGGTGCCAGGCGTTGGGCGATGGCCAGCACTTCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGCTGTCTTCGACCATCAGTAGTTTCAACGGCGTTTGCTGCATCGTTGCGGCGGCCTCAGTTGCTACCGCGACGGTTCAGTCG > NC_002947/2687509‑2687804 | aCAGGAATATGAACGGGATGTCGGGTGCCAGGCGTTGGGCGATGGCCAGCACTTCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCa < 2:339876/150‑1 (MQ=255) tatGAACGGGATGTCGGGTGCCAGGCGTTGGGCGATGGCCAGCACTTCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATAAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGa > 2:313468/1‑150 (MQ=255) aaCGGGATGTCGGGTGCCAGGCGTTGGGCGATGGCCAGCACTTCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGc > 1:1063638/1‑150 (MQ=255) aCGGGATGTCGGGTGCCAGGCGTTGGGCGATGGCCAGCACTTCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGca > 1:1818569/1‑150 (MQ=255) aCGGGATGTCGGGTGCCAGGCGTTGGGCGATGGAAAGCACTTCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGca > 1:194481/1‑150 (MQ=255) gggATGTCGGGTGCCAGGCGTTGGGCGATGGCCAGCACTTCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCNAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGcaca > 2:2090313/1‑150 (MQ=255) gggATGTCGGGTGCCAGGCGTTGGGCGATGGCCAGCACTTCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGcaca < 1:191700/150‑1 (MQ=255) ggATGTCGGGTGCCAGGCGTTGGGCGATGGCCAGCACTTCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACAt < 2:1095424/150‑1 (MQ=255) gcagcaaacgccgttgaaactactgatggtcgaagacagctcgatggacgctgagcttaccctgatgcgcctggagcgcagcgggctgcatgtgcagtcgcagctggtgttcgacacccgcatggtcgaacaCCAGCTGCGACTGCACAt > 2:1963268‑M2/133‑150 (MQ=255) gATGTCGGGTGCCAGGCGTTGGGCGATGGCCAGCACTTCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATg > 1:209651/1‑150 (MQ=255) gATGTCGGGTGCCAGGCGTTGGGCGATGGCAAGACCTTTTTTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATg < 2:194481/150‑1 (MQ=255) caaacgccgttgaaactactgatggtcgaagacagctcgatggacgctgagcttaccctgatgcgcctggagcgcagcgggctgcatgtgcagtcgcagctggtgttcgacacccgcatggtcgaacaCCAGCTGCGACTGCACATGCAg < 1:1963268‑M2/22‑1 (MQ=255) ccAGGCGTTGGGCGATGGCCAGCACTTCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTgc > 2:1683052/1‑150 (MQ=255) ccAGGCGTTGGGCGATGGCCAGCACTTCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTgc > 1:705745/1‑150 (MQ=255) cAGGCGTTGGGCGATGGCCAGCACTTCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTgcg > 2:1951502/1‑150 (MQ=255) gaaactactgatggtcgaagacagctcgatggacgctgagcttaccctgatgcgcctggagcgcagcgggctgcatgtgcagtcgcagctggtgttcgacacccgcatggtcgaacaCCAGCTGCGACTGcaca > 2:1030246‑M2/118‑134 (MQ=255) gaaactactgatggtcgaagacagctcgatggacgctgagcttaccctgatgcgcctggagcgcagcgggctgcatgtgcagtcgcagctggtgttcgacacccgcatggtcgaacaCCAGCTGCGACTGcaca < 1:1030246‑M2/17‑1 (MQ=255) gTTGGGCGATGGCCAGCACTTCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCa < 2:1063638/150‑1 (MQ=255) ttGGGCGATGGCCAGCACTTCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAg > 2:960264/1‑150 (MQ=255) gtgCGATGGCCAGCACTTCTGTGCCGGACGAGCCCGGTCGCGCGCAGTCACACATGATCAGGTCGTAGCGGGTTTGTCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGgc < 1:1142387/148‑1 (MQ=255) ggCGATGGCCAGCACTTCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGgcg > 2:620195/1‑150 (MQ=255) gATGGCCAGCACTTCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGgc < 1:171418/146‑1 (MQ=255) gATGGCCAGCACTTCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGgc > 2:171418/1‑146 (MQ=255) gATGGCCAGCACTTCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCAt < 1:1431766/150‑1 (MQ=255) gCCAGCACTTCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAgg < 2:1818569/150‑1 (MQ=255) aCTTCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGCA‑ACCAGCTTGGCATCACGCTAGGCGCGACTGCACATGCAGCCAGCTGCGCTCTAGGCGCATCAGGGTAAGc > 1:2089622/1‑150 (MQ=255) ttCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAg < 2:251393/117‑1 (MQ=255) ttCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAg > 1:251393/1‑117 (MQ=255) ttCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAg < 2:630805/132‑1 (MQ=255) ttCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAg > 1:630805/1‑132 (MQ=255) tCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCa < 1:1351148/150‑1 (MQ=255) tgtgCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAacac > 2:1468319/1‑93 (MQ=255) tgtgCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAacac < 1:1468319/93‑1 (MQ=255) tgtgCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGc > 2:261052/1‑150 (MQ=255) gCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGCt > 1:301773/1‑150 (MQ=255) tGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGCTGTc > 2:1086372/1‑150 (MQ=255) ggTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGCTGTCt < 1:342820/150‑1 (MQ=255) ggTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGCTGTCt < 2:2125300/150‑1 (MQ=255) tAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAATCTCAGCGTCCATCGAGCTGTCTTc < 2:1102931/150‑1 (MQ=255) tAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGCTGTCTTc < 2:1019005/150‑1 (MQ=255) tAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGCTGTCTTc < 2:301773/150‑1 (MQ=255) gCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTcc < 1:2391966/107‑1 (MQ=255) gCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTAGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTcc > 2:2391966/1‑107 (MQ=255) gCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGTATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGCTGTCTTCGACCAt < 2:1980421/150‑1 (MQ=255) gCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGca < 2:2361162/83‑1 (MQ=255) gCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGca > 1:2361162/1‑83 (MQ=255) aGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGCTGTCTTCGACCATCa < 1:261052/150‑1 (MQ=255) gTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGCTGTCTTCGACCATCag > 1:2103269/1‑150 (MQ=255) acacaGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGCTGTCTTCGACCATCagtag > 2:1614074/1‑150 (MQ=255) acacaGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGCTGTCTTCGACCATCagtag > 2:1017015/1‑150 (MQ=255) acacaGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGCTGTCTTCGACCATCagtag < 2:672934/150‑1 (MQ=255) 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ctgcatgtgcagtcgcagctggTGTTCGACCATGCGGGTG‑TCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGCTGTCTTCGACCATCAGTAGTTTCAACGGCGTTtg < 1:1963268‑M1/128‑1 (MQ=255) aGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGCTGTCTTCGACCATCAGTAGTTTCAACGGCGTTtgct < 2:705745/150‑1 (MQ=255) gCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGCTGTCTTCGACCATCAGTAGTTTCAACGGCGTTtgctg > 2:689433/1‑150 (MQ=255) gCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGGCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGCTGTCTTCGACCATCAGTAGTTTCAACGGCGTTtgctg > 1:112421/1‑150 (MQ=255) atgtgcagtcgcagctggTGTTCGACCATGCGGGTG‑TCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGCTGTCTTCGACCATCAGTAGTTTCAACGGCGTTtgctgc > 2:1963268‑M1/19‑150 (MQ=255) tgtgcagtcgcagctggTGTTCGACCATGCGGGTG‑TCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGCTGTCTTCGACCATCAGTAGTTTc > 2:1030246‑M1/18‑134 (MQ=255) tgtgcagtcgcagctggTGTTCGACCATGCGGGTG‑TCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGCTGTCTTCGACCATCAGTAGTTTc < 1:1030246‑M1/117‑1 (MQ=255) ccTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATc > 2:395609/1‑104 (MQ=255) ccTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATc < 1:395609/104‑1 (MQ=255) ggCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGCTGTCTTCGACCATCAGTAGTTTCAACGGCGTTTGCTGCATCGTTGCggcggc < 1:1683052/150‑1 (MQ=255) aTGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGCTGTCTTCGACCATCAGTAGTTTCAACGGCGTTTGCTGCATCGTTGCGGCGGCCTc > 2:1282584/1‑150 (MQ=255) TGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGCTGTCTTCGACCATCAGTAGTTTCAACGGCGTTTGCTGCATCGTTGCGGCGGCCTCa > 2:2103269‑M1/1‑150 (MQ=255) tgttcgaccatgcgggtgtcgaacaCCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGCTGTCTTCGACCATCAGTAGTTTCAACGGCGTTTGCTGCATCGTTGCGGCGGCCTCa > 1:707222‑M2/26‑150 (MQ=255) GTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGCTGTCTTCGACCATCAGTAGTTTCAACGGCGTTTGCTGCATCGTTGCGGCGGCCTCAg < 2:1976670‑M1/150‑1 (MQ=255) TTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGCTGTCTTCGACCATCAGTAGTTTCAAc < 2:1491981‑M1/118‑1 (MQ=255) TTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGCTGTCTTCGACCATCAGTAGTTTCAAc > 1:1491981‑M1/1‑118 (MQ=255) GAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGCTGTCTTCGACCATCAGTAGTTTCAACGGCGTTTGCTGCATCGTTGCGGCGGCCTCAGTTGc > 1:689433‑M1/1‑150 (MQ=255) GAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGCTGTCTTCGACCATCAGTAGTTTCAACGGCGTTTGCTGCATCGTTGCGGCGGCCTCAGTTGc > 1:1086372‑M1/1‑150 (MQ=255) acCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGCTGTCTTCGACCATCAGTAGTTTCAACGGCGTTTGCTGCATCGTTGCGGCGGCCTCAGTTGCTAc > 1:841736/1‑150 (MQ=255) tcGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGCTGTCTTCGACCATCAGTAGTTTCAACGGCGTTTGCTGCATCGTTGCGGCGGCCTCAGTTGCTACcg > 2:1361004/2‑150 (MQ=255) ccGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGCTGTCTTCGACCATCAGTAGTTTCAAc > 1:1067356/1‑110 (MQ=255) ccGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGCTGTCTTCGACCATCAGTAGTTTCAAc < 2:1067356/110‑1 (MQ=255) ccGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGCTGTCTTCGACCATCAGTAGTTTCAACGGCGTTTGCTGCATCGTTgc > 1:1910149/1‑130 (MQ=255) ccGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGCTGTCTTCGACCATCAGTAGTTTCAACGGCGTTTGCTGCATCGTTgc < 2:1910149/130‑1 (MQ=255) ccGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGCTGTCTTCGACCATCAGTAGTTTCAACGGCGTTTGCTGCATCGTTGCGGCGGCCTCAGTTGCTACcg > 1:1745473/1‑150 (MQ=255) ccGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGCTGTCTTCGACCATCAGTAGTTTCAACGGCGTTTGCTGCATCGTTGCGGCGGCCTCAGTTGCTACcg > 2:109565/1‑150 (MQ=255) ggTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGCTGTCTTCGACCATCAGTAGTTTCAACGGCGTTTGCTGCATCGTTGCGGCGGCCTCAGTTGCTACCGCGACgg < 2:59690/150‑1 (MQ=255) tcgaacaCCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGCTGTCTTCGACCATCAGTAGTTTCAACGGCGTTTGCTGCATCGTTGCGGCGGCCTCAGTTGCTACCGCGACGGtt < 2:2089622‑M2/143‑1 (MQ=255) gaacaCCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGCTGTCTTCGACCATCAGTAGTTTCAACGGCGTTTGCTGCATCGTTGCGGCGGCCTCAGTTGCTACCGCGACGGTTCa > 2:1526942‑M2/6‑150 (MQ=255) caCCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGCTGTCTTCGACCATCAGTAGTTTCAACGGCGTTTGCTGCATCGTTGCGGCGGCCTCAGTTGCTACCGCGACGGTTCAGTc < 1:591204‑M2/148‑1 (MQ=255) aCCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGCTGTCTTCGACCATCAGTAGTTTCAACGGCGTTTGCTGCATCGTTGCGGCGGCCTCAGTTGCTACCGCGACGGTTCAGTCg < 1:960264‑M2/149‑1 (MQ=255) ccAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGCTGTCTTCGACCATCAGTAGTTTCAACGGCGTTTGCTGCATCGTTGCGGCGGCCTCAGTTGCTACCGCGACGGTTCAGt > 1:1204702/1‑147 (MQ=255) ccAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGCTGTCTTCGACCATCAGTAGTTTCAACGGCGTTTGCTGCATCGTTGCGGCGGCCTCAGTTGCTACCGCGACGGTTCAGt < 2:1204702/147‑1 (MQ=255) | ACAGGAATATGAACGGGATGTCGGGTGCCAGGCGTTGGGCGATGGCCAGCACTTCTGTGCCGGACGAGCCTGGTAGCACGCAGTCACACAGGATCAGGTCGTAGCGGGCCTGGCGCAGGGCATGTTCGAC‑ACCCGCATGGTCGAACACCAGCTGCGACTGCACATGCAGCCCGCTGCGCTCCAGGCGCATCAGGGTAAGCTCAGCGTCCATCGAGCTGTCTTCGACCATCAGTAGTTTCAACGGCGTTTGCTGCATCGTTGCGGCGGCCTCAGTTGCTACCGCGACGGTTCAGTCG > NC_002947/2687509‑2687804 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |