New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2726286 = | 83 (0.940) | 4 (0.050) | 4/234 | NT | 5.0% | coding (413/1083 nt) | PP_2387 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 2726323 = | 72 (0.860) | coding (376/1083 nt) | PP_2387 | hypothetical protein |
ACAGCGACTGCCGACGAGGTGGTGCGCAGGGCTGCATGCCT‑TCGCTAAAACTGTTGAGAAAGGCCTGGTAGGCCTTGGCGTGCTGCGGGTCGTTGGTACCTGCGAGGACTTCACACAGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAG‑GAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCGCCCGTGAGCATCGACAGGTGCGAGGCCACTGTGTGTTCGT > NC_002947/2726137‑2726433 | acaGCGACTGCCGACGAGGTGGTGCGCAGGGCTGCATGCCT‑TCGCTAAAACTGTTGAGAAAGGCCTGGTAGGCCTTGGCGTGCTGCGGGTCGTTGGTACCTGCGAGGACTTCACACAGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGa < 1:588425/150‑1 (MQ=255) acaGCGACTGCCGACGAGGTGGTGCGCAGGGCTGCATGCCT‑TCGCTAAAACTGTTGAGAAAGGCCTGGTAGGCCTTGGCGTGCTGCGGGTCGTTGGTACCTGCGAGGACTTCACACAGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGa > 2:592014/1‑150 (MQ=255) caGCGACTGCCGACGAGGTGGTGCGCAGGGCTGCCTGCTTGTTGC‑ACAGCTGTTTAGAAAGGCCTGGTAGGCCTTGGCGTGCTGCGGGTCGTTGGTACCTGCGAGGACTTCACACAGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAg < 1:1365537/150‑1 (MQ=255) caGCGACTGCCGACGAGGTGGTGCGCAGGGCTGCATGCCT‑TCGCTAAAACTGTTGAGAAAGGCCTGGTAGGCCTTGGCGTGCTGCGGGTCGTTGGTACCTGCGAGGACTTCACACAGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAg < 2:1148680/150‑1 (MQ=255) gcggctccacagccctgggcatcggcgccagctccgacaaacacacagtggcctcgcacctgtcgatgctcacgggcgaagtctggctgagcctggccggctgcgggctgaacgccacccaggaattgatgatgttcctgacccaccAGc < 2:1395701‑M1/3‑1 (MQ=255) cggctccacagccctgggcatcggcgccagctccgacgaacacacagtggcctcgcacctgtcgatgctcacgggcgaagtctggctgagcctggccggctgcgggctgaacgccacccacgaattgatgatgttcctgaccccccAGca > 1:1447080‑M1/147‑150 (MQ=255) gctccacagccctgggcatcggcgccagctccgacgaacacacagtggcctcgcacctgtcgatgctcacgggcgaagtctggctgagcctggccggctgcgggctgaacgccacccaggaattgatgatgttcctgacccaccAGcacc > 1:1427143‑M1/145‑150 (MQ=255) tGCCGACGAGGTGGTGCGCAGGGCTGCATGCCT‑TCGCTAAAACTGTTGAGAAAGGCCTGGTAGGCCTTGGCGTGCTGCGGGTCGTTGGAAAGCACGAGGACTTCACACAGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGcaccacc > 1:25428/1‑150 (MQ=255) gacgaGGTGGTGCGCAGGGCTGCATGCCT‑TCGCTAAAACTGTTGAGAAAGGCCTGGTAGGCCTTGGCGTGCTGCGGGTCGTTGGTACCTGCGAGGACTTCACACAGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACAt > 2:493172/1‑150 (MQ=255) gacgaGGTGGTGCGCAGGGCTGCATGCCT‑TCGCTAAAACTGTTGAGAAAGGCCTGGTAGGCCTTGGCGTGCTGCGGGTCGTTGGTACCTGCGAGGACTTCACACAGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACAt > 1:193862/1‑150 (MQ=255) ggtgCGCAGGGCTGCATGCCT‑TCGCTAAAACTGTTGAGAAAGGCCTGGTAGGCCTTGGCGTGCTGCGGGTCGTTGGTACCTGCGAGGACTTCACACAGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGt > 2:2044453/1‑150 (MQ=255) tgCGCAGGGCTGCATGCCT‑TCGCTAAAACTGTTGAGAAAGGCCTGGTAGGCCTTGGCGTGCTGCGGGTCGTTGGTACCTGCGAGGACTTCACACAGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTg < 2:1244853/150‑1 (MQ=255) tGCATGCCT‑TCGCTAAAACTGTTGAGAAAGGCCTGGTAGGCCTTGGCGTGCTGCGGGTCGTTGGTACCTGCGAGGACTTCACACAGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCgg > 2:2142485/1‑150 (MQ=255) aTGCCT‑TCGCTAAAACTGTTGAGAAAGGCCTGGTAGGCCTTGGCGTGCTGCGGGTCGTTGGTACCTGCGAGGACTTCACACAGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGc > 2:549166/1‑150 (MQ=255) tGCCT‑TCGCTAAAACTGTTGAGAAAGGCCTGGTAGGCCTTGGCGTGCTGCGGGTCGTTGGTACCTGCGAGGACTTCACACAGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCt > 1:719384/1‑150 (MQ=255) gCCT‑TCGCTAAAACTGTTGAGAAAGGCCTGGTAGGCCTTGGCGTGCTGCGGGTCGTTGGTACCTGCGAGGACTTCACACAGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCtg < 1:1729978/150‑1 (MQ=255) gCCT‑TCGCTAAAACTGTTGAGAAAGGCCTGGTAGGCCTTGGCGTGCTGCGGGTCGTTGGTACCTGCGAGGACTTCACACAGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCtg < 1:2359613/150‑1 (MQ=255) cT‑TCGCTAAAACTGTTGAGAAAGGCCTGGTAGGCCTTGGCGTGCTGCGGGTCGTTGGTACCTGCGAGGACTTCACACAGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCtggt < 2:1975322/150‑1 (MQ=255) 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tCGCTAAAACTGTTGAGAAAGGCCTGGTAGGCCTTGGCGTGCTGCGGGTCGTTGGTACCTGCGAGGACTTCACACAGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCtggtgg < 2:2390312/150‑1 (MQ=255) tCGCTAAAACTGTTGAGAAAGGCCTGGTAGGCCTTGGCGTGCTGCGGGTCGTTGGTACCTGCGAGGACTTCACACAGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCtggtgg < 1:2142485/150‑1 (MQ=255) cTAAAACTGTTGAGAAAGGCCTGGTAGGCCTTGGCGTGCTGCGGGTCGTTGGTACCTGCGAGGACTTCACACAGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTc > 2:2032790/1‑150 (MQ=255) cTAAAACTGTTGAGAAAGGCCTGGTAGGCCTTGGCGTGCTGCGGGTCGTTGGTACCTGCGAGGACTTCACACAGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTc < 2:2247127/150‑1 (MQ=255) cTGTTGAGAAAGGCCTGGTAGGCCTTGGCGTGCTGCGGGTCGTTGGTACCTGCGAGGACTTCACACGGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAG‑GAAc < 2:743957/150‑1 (MQ=255) 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aaaGGCCTGGTAGGCCTTGGCGTGCTGCGGGTCGTTGGTACCTGCGAGGACTTCACACAGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCtggtgt > 1:1583663/1‑132 (MQ=255) aaaGGCCTGGTAGGCCTTGGCGTGCTGCGGGTCGTTGGTACCTGCGAGGACTTCACACAGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAG‑GAACATCATCaa > 1:2402156/1‑150 (MQ=255) tGGTAGGCCTTGGCGTGCTGCGGGTCGTTGGTACCTGCGAGGACTTCACACAGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAG‑GAACATCATCAATTCCTgg < 2:724356/150‑1 (MQ=255) tcacgggcgaagtctggctgagcctggccggctgcgggctgaacgccacccaggaattgatgatgttcctgacccaccAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCtg > 1:1400052‑M1/79‑116 (MQ=255) tcacgggcgaagtctggctgagcctggccggctgcgggctgaacgccacccaggaattgatgatgttcctgacacaccAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCtg < 2:1400052‑M1/38‑1 (MQ=255) gCCTTGGCGTGCTGCGGGTCGTTGGTACCTGCGAGGACTTCACACAGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAG‑GAACATCATCAATTCCTGGGTGGCg > 1:458451/1‑150 (MQ=255) 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gggTCGTTGGTACCTGCGAGGACTTCACACAGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAG‑GAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCg < 1:2032790/150‑1 (MQ=255) cgTCGTTGGTACCTGCGAGGACTTCACACAGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAG‑GAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCgg > 2:1655406/2‑150 (MQ=255) gTTGGTACCTGCGAGGACTTCACACAGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAG‑GAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAg > 2:2206527/1‑150 (MQ=255) ttGGTACCTGCGAGGACTTCACACAGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAG‑GAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAgg > 2:10821/1‑150 (MQ=255) ttGGTACCTGCGAGGACTTCACACAGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAG‑GAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAgg > 2:485291/1‑150 (MQ=255) 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gggCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAG‑GAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCGCCCGTGAGCa < 1:592014/150‑1 (MQ=255) ttCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAG‑GAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCGCCCGTGAGCATCGa > 1:763629/1‑150 (MQ=255) gggCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCTCCCGGTCTGGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAG‑GAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCGCCCGTGAGCATCGACAGGt < 2:193862/150‑1 (MQ=255) gCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAG‑GAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCGCCCGTGAGCATCGACAGGTGc < 2:210815/150‑1 (MQ=255) cAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGTGTCAG‑GAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCGCCCGTGAGCATCGACAGGt < 2:1164243/146‑1 (MQ=255) cAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGTGTCAG‑GAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCGCCCGTGAGCATCGACAGGt > 1:1164243/1‑146 (MQ=255) ggCTGTTGAGGCGACTAAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCGAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAG‑GAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCCGGCTCAGCCAGACTTCGCCCGTGAGCATCGGCAGGTGCGAgg > 2:60362/1‑150 (MQ=255) ggCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAG‑GAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCGCCCGTGAGCATCGACAGGTGCGAg > 2:1916014/1‑149 (MQ=255) ggCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAG‑GAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCGCCCGTGAGCATCGACAGGTGCGAg < 1:1916014/149‑1 (MQ=255) gCTGTTGACGCCACTGGGCACCGCCACATGGCCGAGTCGGCCAAGGCGGGGCTGGTGGGTCAG‑GAACATCATCAATCCCTGCGTCGCGGTCACCCGGCAGCCGGCCAGGCGCAGCCAGACTTCGCCCGTGAGCATCCACAGGTGCGAGGc < 1:60362/150‑1 (MQ=255) tGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCCG‑GAACATTCTTCATTCCTGGGTGCCGTTCACTCCGCATCGGGCTAGGGTTAGCGATACTGCTCCCGGGAGCATCGACAGGTGCGAGGCCa < 2:1480080/150‑1 (MQ=255) ttGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAG‑GAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCGCCCGt > 2:271495/1‑125 (MQ=255) ttGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAG‑GAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCGCCCGt < 1:271495/125‑1 (MQ=255) gAGGCTACTGAGAACCACAACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAG‑GAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCGCCCGTGAGCATCGACAGGTGCGAGGCCACtgt < 2:954169/150‑1 (MQ=255) gAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAG‑GAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCGCCCGTGAGCATCGACAGGTGCGAGGCCACtgt < 1:493172/150‑1 (MQ=255) gAGGCCACGTAGCACCACCACATGACCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAG‑GAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCGCCCGTGAGCATCGACAGGTGCGAGGCCACtgt < 2:390893/150‑1 (MQ=255) ggCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAG‑GAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCGCCCGTGAGCATCGACAGGTGCGAGGCCACtgtgt > 1:1028502/1‑150 (MQ=255) ccACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAG‑GAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCGCCCGTGAGCATCGACAGGTGCGAGGCCACTgtgtgt > 1:682210/1‑150 (MQ=255) ccACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAG‑GAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCGCCCGTGAGCATCGACAGGTGCGAGGCCACTgtgtgt < 1:1655406/150‑1 (MQ=255) cACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAG‑GAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCGCCCGTGAGCATCGACAGGTGCGAGGCCACTGTGTGtt > 1:1113859/1‑150 (MQ=255) aCTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAG‑GAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCGCCCGTGAGCATCGACAGGTGCGAGGCCACTGTGTGTtc < 2:1028502/150‑1 (MQ=255) cTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAG‑GAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCa > 2:686629/1‑104 (MQ=255) cTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAG‑GAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCa < 1:686629/104‑1 (MQ=255) tGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAG‑GAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCGCCCGTGAGCATCGACAGGTGCGAGGCCACTGTGTGTtcgt > 2:2250060/1‑150 (MQ=255) | ACAGCGACTGCCGACGAGGTGGTGCGCAGGGCTGCATGCCT‑TCGCTAAAACTGTTGAGAAAGGCCTGGTAGGCCTTGGCGTGCTGCGGGTCGTTGGTACCTGCGAGGACTTCACACAGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAG‑GAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCGCCCGTGAGCATCGACAGGTGCGAGGCCACTGTGTGTTCGT > NC_002947/2726137‑2726433 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |