| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | 2726286 = | 83 (0.940) | 4 (0.050) | 4/234 | NT | 5.0% | coding (413/1083 nt) | PP_2387 | hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | 2726323 = | 72 (0.860) | coding (376/1083 nt) | PP_2387 | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
GCCTTCGCTAAAACTGTTGAGAAAGGCCTGGTAGGCCTTGGCGTGCTGCGGGTCGTTGGTACCTGCGAGGACTTCACACAGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAG‑GAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCGCCCGTGAGCATCGACAGGTGCGAGGCCACTGTGTGTTCGTCGGAGCTGGCGCCGATGCCCAGGGCTGTGGAGCCGCCGA > NC_002947/2726174‑2726472 | gCCTTCGCTAAAACTGTTGAGAAAGGCCTGGTAGGCCTTGGCGTGCTGCGGGTCGTTGGTACCTGCGAGGACTTCACACAGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCtg < 1:2359613/150‑1 (MQ=255)gCCTTCGCTAAAACTGTTGAGAAAGGCCTGGTAGGCCTTGGCGTGCTGCGGGTCGTTGGTACCTGCGAGGACTTCACACAGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCtg < 1:1729978/150‑1 (MQ=255) acgaacacacagtggcctcgcacctgtcgatgctcacgggcgaagtctggctgagcctggccggctgcgggctgaacgccacccaggaattgatgatgttcctgacccaccAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCtgg > 2:1462217‑M1/112‑150 (MQ=255) 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(MQ=255) tGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAG‑GAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCGCCCGTGAGCATCGACAGGTGCGAGGCCACTGTGTGTtcgt > 2:2250060/1‑150 (MQ=255) ccagcaccgccttggccaactcggccatgtggtggtgctGGTGGGTCAG‑GAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCGCCCGTGAGCATCGACAGGTGCGAGGCCACTGTGTGTtcgt > 2:1462217‑M2/40‑150 (MQ=255) cagcaccgccttggccaactcggccatgtggtggtgctGGTGTGTCAG‑GAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCGCCCGTGa < 2:1400052‑M2/78‑1 (MQ=255) cagcaccgccttggccaactcggccatgtggtggtgctGGTGGGTCAG‑GAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCGCCCGTGa > 1:1400052‑M2/39‑116 (MQ=255) gtACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAG‑GAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCa > 1:1860021‑M1/3‑96 (MQ=255) gtACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAG‑GAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCa < 2:1860021‑M1/94‑1 (MQ=255) accacATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAG‑GAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCGCCCGTGa > 1:1089885/1‑109 (MQ=255) accacATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAG‑GAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCGCCCGTGa < 2:1089885/109‑1 (MQ=255) ccacATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAG‑GAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCGCCCGTGAGCATCGACAGGTGCGAg < 1:439413/125‑1 (MQ=255) ccacATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAG‑GAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCGCCCGTGAGCATCGACAGGTGCGAg > 2:439413/1‑125 (MQ=255) cacaTGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAG‑GAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCTGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCTCCCCGGAGGATCGACTGATGCGAGGCCTCTGGTTTGTCGTCGGAGCTGgc > 2:507588/1‑150 (MQ=255) aTGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAG‑GAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCGCCCGTGAGCATCGACAGGTGCGAGGCCACTGTGTGTTCGTCGGAGCTGGCGcc > 2:476366/1‑150 (MQ=255) ggCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAG‑GAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCGCCCGTGAGCATCGACAGGTGCGAGGCCACTGTGTGTTCGTCGGAGCTGGCGCCGa > 1:14655/1‑150 (MQ=255) gCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAG‑GAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCGCCCGTGAGCATCGACAGGTGCGAGGCCACTGTGTGTTCGTCGGAGCTGGCGCCGAt > 2:1815697/1‑150 (MQ=255) gTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAG‑GAACATCATCAATTCCAGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCGCCCGTGAGCATCGACAGGTGCGAGGCCACTGTGTGTTCGTCGGAGCTGGCGCCGATGCCCa > 2:1061194/1‑150 (MQ=255) ttGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAG‑GAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCGCCCGTGAGCATCGACAGGTGCGAGGCCACTGTGTGTTCGTCGGAGCTGGCGCCGATGCCCAg < 2:1113859/150‑1 (MQ=255) ttGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAG‑GAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCGCCCGTGAGCATCGACAGGTGCGAGGCCACTGTGTGTTCGTCGGAGCTGGCGCCGATGCCCAg < 1:1798738/150‑1 (MQ=255) cAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAG‑GAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCGCCCGTGAGCATCGACAGGTGCGAGGCCACTGTGTGTTCGTCGGAGCTGGCGCCGATGCCCAGGGCtg > 2:1779634/1‑150 (MQ=255) aaGGCGGTGCTGGTGGGTCAG‑GAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCGCCCGTGAGCATCGACAGGTGCGAGGCCACTGTGTGTTCGTCGGAGCTGGCGCCGATGCCCAGGGCtgt < 1:2250060/150‑1 (MQ=255) aaGGCGGTGCTGGTGGGTCAG‑GAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCGCCCGTGAGCATCGACAGGTGCGAGGCCACTGTGTGTTCGTCGGAGCTGGCGCCGATGCCCAGGGCtgt < 2:682210/150‑1 (MQ=255) aaGGCGGTGCTGGTGGGTCAG‑GAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCGCCCGTGAGCATCGACAGGTGCGAGGCCACTGTGTGTTCGTCGGAGCTGGCGCCGATGCCCAGGGCtgt > 1:1216686/1‑150 (MQ=255) aaGGCGGTGCTGGTGGGTCAG‑GAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCGCCCGTGAGCATCGACAGGTGCGAGGCCACTGTGTGTTCGTCGGAGCTGGCGCCGATGCCCAGGGCtgt < 1:507588/150‑1 (MQ=255) ggtgctGGTGGGTCAG‑GAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCGCCCGTGAGCATCGACAGGTGCGAGGCCACTGTGTGTTCGTCGGAGCTGGCGCCGATGCCCAGGGCTGTGGAgc > 1:1427143‑M2/7‑150 (MQ=255) tgctGGGGGGTCAG‑GAACATCATCAATTCGTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCGCCCGTGAGCATCGACAGGTGCGAGGCCACTGTGTGTTCGTCGGAGCTGGCGCCGATGCCCAGGGCTGTGGAgccg > 1:1447080‑M2/5‑150 (MQ=255) gctGGTGGGTCAG‑GAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCGCCCGTGAGCATCGACAGGTGCGAGGCCACTGTGTGTTTGTCGGAGCTGGCGCCGATGCCCAGGGCTGTGGAgccgc < 2:1395701‑M2/147‑1 (MQ=255) ggtggGTCAG‑GAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCGCCCGTGAGCATCGACAGGTGCGAGGCCACTGTGTGTTCGTCGGAGCTGGCGCCGATGCCCAGGGCTGTGGAGCCGCCGa < 2:540130/150‑1 (MQ=255) | GCCTTCGCTAAAACTGTTGAGAAAGGCCTGGTAGGCCTTGGCGTGCTGCGGGTCGTTGGTACCTGCGAGGACTTCACACAGGGCTTCGTGGGCCAGGCTGTTGAGGCCACTGAGCACCACCACATGGCCGAGTTGGCCAAGGCGGTGCTGGTGGGTCAG‑GAACATCATCAATTCCTGGGTGGCGTTCAGCCCGCAGCCGGCCAGGCTCAGCCAGACTTCGCCCGTGAGCATCGACAGGTGCGAGGCCACTGTGTGTTCGTCGGAGCTGGCGCCGATGCCCAGGGCTGTGGAGCCGCCGA > NC_002947/2726174‑2726472 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |