| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | 3159140 = | 105 (1.190) | 8 (0.100) | 7/234 | NT | 7.3% | coding (1116/2097 nt) | opuA | glycine betaine ABC transporter ATP‑binding protein/permease |
| ? | NC_002947 | 3159173 = | 102 (1.210) | coding (1149/2097 nt) | opuA | glycine betaine ABC transporter ATP‑binding protein/permease | |||||
Only 100 of 128 total aligned reads displayed.
GCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCTTGGCGCTGCTACTGGTGAGTCAGGCACTGACCGTATGGCGCGCCCTGACGCCAGAGGCTGCCGGGACATTGGTGCAGTTTCCCTCCGATCGCGACA > NC_002947/3158991‑3159285 | tcaacgcgtcgatggcaccagcggccgccagcatactgtcgcgatcggagggaaactgcaccaatgtcccggcagcctctggcgtcagggcgcgccatacggtcagtgcctgactcaccagtagcagcgccaagggtaaagcgacacccg > 2:800645‑M1/150‑150 (MQ=255)gccgccGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTgg < 1:452064/150‑1 (MQ=255) caacgcgtcgatggcaccagcggccgccagcatactgtcgcgatcggagggaaactgcaccaatgtcccggcagcctctggcgtcagggcgcgccatacggtcagtgcctgactcaccagtagcagcgccaagggtaaagcgacacccgg > 2:1789387‑M1/149‑150 (MQ=255) caacgcgtcgatggcaccagcggccgccagcatactgtcgcgatcggagcgaaactgcaccagtggcccggtagcctctggcgtcagggcgcgccatacggtcagtgcctgactcaccagtagcagcgccaagggtaaagcgacacccgg > 2:879108‑M1/149‑150 (MQ=255) aacgcgtcgatggcaccagcggccgccagcatactgtcgcgatcggagggaaactgcaccaatgtcccggcagcctctggcgtcagggcgcgccatacggtcagtgcctgactcaccagtagcagcgccaagggtaaagcgacacccGGt > 1:2085184‑M1/148‑150 (MQ=255) gccgGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTg > 2:39348/1‑150 (MQ=255) cgcgtcgatggcaccagcggccgccagcatactgtcgcgatcggagggaaactgcaccaatgtcccggcagcctctggcgtcagggcgcgccatacggtcagtgcctgactcaccagtagcagcgccaagggtaaagcgacacccGGTGa > 2:1250879‑M1/146‑150 (MQ=255) ccgGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGa < 2:1582277/150‑1 (MQ=255) cgGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAg < 1:1951062/150‑1 (MQ=255) ggACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGc < 1:987242/150‑1 (MQ=255) gAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGATGCTGGTCAAACGCTTGGGTTGGGCTGGGCGGAGCCtac > 2:139883/1‑148 (MQ=255) cagcggccgccagcatactgtcgcgatcggagggaaactgcaccaatgtcccggcagcctctggcgtcagggcgcgccatacggtcagtgcctgactccccagtagcagcgccaagggtaaagcgacacccGGTGAGCCTGcacggccac > 1:1024440‑M1/132‑150 (MQ=255) ttCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGcacggccacggc < 2:579725/150‑1 (MQ=255) tggctggcGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGt > 2:777207/1‑150 (MQ=255) ctggcGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGgccgtggccgtgca < 1:477971/150‑3 (MQ=255) tactgtcgcgatcggagggaaactgcaccaatgtcccggcagcctctggcgtcagggcgcgccatacggtcagtgcctgactcaccagtagcagcgccaagggtaaagcgacacccGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCg > 2:986532‑M1/117‑150 (MQ=255) tgctgGTGGAGGTGGTGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCgg > 2:2403286/1‑150 (MQ=255) gTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGgt < 1:1825400/141‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) ctgctgGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCTTGGCGCTGCTACTGGTGAGTCAGACACTGACCGTATGGCGCGCCCTGACGCCAGAGGCTGCCGGGACATTg > 2:336531/1‑150 (MQ=255) tgctgGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCTTGGCGCTGCTACTg < 2:1566376/92‑1 (MQ=255) tgctgGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCTTGGCGCTGCTACTGGTGAGTCAGGCACTGACCGTATGGCGCGCCCTGACGCCagag > 1:580445/1‑134 (MQ=255) tgctgGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCTTGGCGCTGCTACTGGTGAGTCAGGCACTGACCGTATGGCGCGCCCTGACGCCagag < 2:580445/134‑1 (MQ=255) tagcagcgccaagggtaaagcgacacccGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCAcc > 2:848623‑M1/29‑61 (MQ=255) tagcagcgccaagggtaaagcgacacccGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCAcc < 1:848623‑M1/33‑1 (MQ=255) ctgGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCTTGGCGCTGCTACTGGt > 2:330153/1‑92 (MQ=255) 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(MQ=255) gCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCTTGGCGCTGCTACTGGTGAGTCAGGCACTGACCGTATGGCGCGCCCTGACGCCCGAGGCTGACGGGCCATTGGTGCCGTTTCCCt < 2:1241788/150‑1 (MQ=255) gCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCTTGGCGCTGCTACTGGTGAGTCAGGCACTGACCGTATGGCGCGCCCTGACGCCAGAGGCTGCCGGGACATTGGTGCAGttt < 2:221085/146‑1 (MQ=255) gCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCTTGGCGCTGCTACTGGTGAGTCAGGCACTGACCGTATGGCGCGCCCTGACGCCAGAGGCTGCCGGGACATTGGTGCAGttt > 1:221085/1‑146 (MQ=255) cTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCTTGGCGCTGCTACTGGTGAGTCAGGCACTGACCGTATGGCGCGCCCTGACGCCAGAGGCTGCCGGGACATTGGTGCAGTTTCCCTc < 1:139883/150‑1 (MQ=255) ttGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCTTGGCGCTGCTACTGGTGAGTCAGGCACTGACCGTATGGCGCGCCCTGACGCCAGAGGCTGCCGGGACATTGGTGCAGTTTCCCTcc > 1:2379315/1‑150 (MQ=255) tgtgCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCTTGGCGCTGCTACTGGTGCGTCAGGCACTGACCGTATGGCGCGCCCTGACGCCAGAGGCTGCCGGGACATTGGTGCAGTTTCCCTCCGATcgc < 2:467175/150‑1 (MQ=255) | GCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCTTGGCGCTGCTACTGGTGAGTCAGGCACTGACCGTATGGCGCGCCCTGACGCCAGAGGCTGCCGGGACATTGGTGCAGTTTCCCTCCGATCGCGACA > NC_002947/3158991‑3159285 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |