| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | 3159140 = | 105 (1.190) | 8 (0.100) | 7/234 | NT | 7.3% | coding (1116/2097 nt) | opuA | glycine betaine ABC transporter ATP‑binding protein/permease |
| ? | NC_002947 | 3159173 = | 102 (1.210) | coding (1149/2097 nt) | opuA | glycine betaine ABC transporter ATP‑binding protein/permease | |||||
Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
CTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCTTGGCGCTGCTACTGGTGAGTCAGGCACTGACCGTATGGCGCGCCCTGACGCCAGAGGCTGCCGGGACATTGGTGCAGTTTCCCTCCGATCGCGACAGTATGCTGGCGGCCGCTGGTGCCATCGACGCGTTGAT > NC_002947/3159024‑3159322 | tactgtcgcgatcggagggaaactgcaccaatgtcccggcagcctctggcgtcagggcgcgccatacggtcagtgcctgactcaccagtagcagcgccaagggtaaagcgacacccGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCg > 2:986532‑M1/117‑150 (MQ=255) tgctgGTGGAGGTGGTGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCgg > 2:2403286/1‑150 (MQ=255) ggtggAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGgtgt < 2:1507803/150‑1 (MQ=255) gTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGgt > 2:1825400/1‑141 (MQ=255) gTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGgt < 1:1825400/141‑1 (MQ=255) tGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCAAGGCCGTGACTCAAGGGGTGTCGCttaag > 1:945583/1‑147 (MQ=255) ggcCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTAccc > 2:359917/1‑148 (MQ=255) cTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCGCt > 1:1433182/1‑138 (MQ=255) cTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCGCt < 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ttgctGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCTTGGCGCTGCTACTgg > 2:1763898/1‑150 (MQ=255) ttgctGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCTTGGCGCTGCTACTgg > 2:1996176/1‑150 (MQ=255) ctGGCGGGTGGGGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCTTGGCGCTGCTACTGGTGa < 2:61638/150‑1 (MQ=255) ctGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCTTGGCGCTGCTACTGGt < 1:752135/148‑1 (MQ=255) ctGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCTTGGCGCTGCTACTGGt > 2:752135/1‑148 (MQ=255) 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cggtgagtcacggccgtggccgtgcaggctcaccGGGTGTCGCTTTACCCTTGGCGCTGCTACTGGTGAGTCAGGCACTGACCGTATGGCGCGCCCTGACGCCAGAGGCTGCCGGGACATTGGTGCAGTTTCCCTCCGATCGCGACAGTa > 2:986532‑M2/35‑150 (MQ=255) ggtgagtcacggccgtggccgtgcaggctcaccGGGTGTCGCTTTACCCTTGGCGCTGCTa < 1:848623‑M2/28‑1 (MQ=255) ggtgagtcacggccgtggccgtgcaggctcaccGGGTGTCGCTTTACCCTTGGCGCTGCTa > 2:848623‑M2/34‑61 (MQ=255) GTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCTTGGCGCTGCTACt > 1:635016‑M1/1‑62 (MQ=255) GTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCTTGGCGCTGCTACt < 2:635016‑M1/62‑1 (MQ=255) ccTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCTTGGCGCTGCTCCTGGTGAGTCAGGCACTGACCGTATGGCGCGCCCTGACGCCAGAGGCTGCCGGGACATTGGGGCAGTTTCCCTCCGATCGCGACAGTATGCTggc > 1:367762/1‑150 (MQ=255) tGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCTTGGCGCTGCTACTGGTGAGTCAGGCACTGACCGTATGGCGCGCCCTGACGCCAGAGGCTGCCGGGACATTGGTGCAGTTTCCCTCCGATCGCGACAGTATGCTggc < 2:892838/148‑1 (MQ=255) acggccacggccGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCTTGGCGCTGCTACTGGTGAGTCAGGCACTGACCGTATGGCGCGCCCTGACGCCAGAGGCTGCCGGGACATTGGTGCAGTTTCCCTCCGATCGCGACAGTATGCTGGCGGCCg > 1:1653200/1‑150 (MQ=255) acggccacggccGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCTTGGCGCTGCTACTGGTGAGTCAGGCACTGACCGTATGGCGCGCCCTGACGCCAGAGGCTGCCGGGACATTGGTGCAGTTTCCCTCCGATCGCGACAGTATGCTGGCGGCCg < 2:1920234/150‑1 (MQ=255) ggccacggccGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCTTGGCGCTGCTACTGGTGAGTCAGGCACTGACCGTATGGCGCGCCCTGACGCCAGAGGCTGCCGGGACATTGGTGCAGtt > 1:984329/1‑116 (MQ=255) gtggccgtgcaggctcaccGGGTGTCGCTTTACCCTTGGCGCTGCTACTGGGGAGTCAGGCACTGACCGTATGGCGCGCCCTGACGCCAGAGGCTGCCGGGACATTGGTGCAGTTTCCCTCCGATCGCGACAGTATGCTGGCGGCCGCTg > 1:1024440‑M2/20‑150 (MQ=255) ccacggccGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCTTGGCGCTGCTACTGGTGAGTCAGGCACTGACCGTATGGCGCGCCCTGACGCCAGAGGCTGCCGGGACATTGGTGCAGTTTCCCTCCGATCGCGACAGTATGCTGGCGGCCGCTgg > 1:2156831/1‑150 (MQ=255) acggccGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCTTGGCGCTGCTACTGGTGAGTCAGGCACTGa > 1:473109/1‑63 (MQ=255) cGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCTTGGCGCTGCTACTGGTGAGTCAGGCACTGACCGTATGGCGCGCCCTGACGCCAGAGGCTGCCGGGACATTGGTGCAGTTTCCCTCCGATCGCGACAGTATGCTGGCGGCCGCTGGTGCCATc < 2:586473/150‑1 (MQ=255) cGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCTTGGCGCTGCTACTGGTGAGTCAGGCACTGACCGTATGGCGCGCCCTGACGCCAGAGGCTGCCGGGACATTGGTGCAGTTTCCCTCCGATCGCGACAGTATGCTGGCGGCCGCTGGTGCCATc > 1:690222/1‑150 (MQ=255) tcaccGGGTGTCGCTTTACCCTTGGCGCTGCTACTGGTGAGTCAGGCACTGACCGTATGGCGCGCCCTGACGCCAGAGGCTGCCGGGACATTGGTGCAGTTTCCCTCCGATCGCGACAGTATGCTGGCGGCCGCTGGTGCCATCGAcgcg > 2:1250879‑M2/6‑150 (MQ=255) accGGGTGTCGCTTTACCCTTGGCGCTGCTACTGGTGAGTCAGGCACTGACCGTATGGCGCGCCCTGACGCCAGAGGCTGCCGGGACATTGGTGCAGTTTCCCTCCGATCGCGACAGTATGCTGGCGGCCGCTGGTGCCATCGACGCGtt > 1:2085184‑M2/4‑150 (MQ=255) ccGGGTGTCGCTTTACCCTTGGCGCTGCTACTGGTGAGTCAGGCACTGACCGTATGGCGCGCCCTGACGCCAGAGGCTACCGGGCCACTGGTGCAGTTTCGCTCCGATCGCGACAGTATGCTGGCGGCCGCTGGTGCCATCGACGCGTTg > 2:879108‑M2/3‑150 (MQ=255) gggTGTCGCTTTACCCTTGGCGCTGCTACTGGTGAGTCAGGCACTTACCGTATGGCGCGCCCTGACGCCAGAGGCTGCCGGGACATTGGTGCAGTTTCCCTCCGATCGCGATAGTATGCTGGCGGCCGCTGGTGCCATCGACGCGTTgct < 2:753046/150‑3 (MQ=255) | CTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCTTGGCGCTGCTACTGGTGAGTCAGGCACTGACCGTATGGCGCGCCCTGACGCCAGAGGCTGCCGGGACATTGGTGCAGTTTCCCTCCGATCGCGACAGTATGCTGGCGGCCGCTGGTGCCATCGACGCGTTGAT > NC_002947/3159024‑3159322 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |