New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 3251122 = | 96 (1.080) | 8 (0.090) | 4/238 | NT | 8.3% | coding (464/546 nt) | ureJ | urease accessory protein UreJ |
? | NC_002947 | 3251156 = | 84 (0.980) | coding (498/546 nt) | ureJ | urease accessory protein UreJ |
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
GTCGCTGCTGGCCATGGCCATGCCTGTGTTCGCCTTGTTCCATGGTTGGGCACATGGCGTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGG‑CAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTC‑GGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCGCTGCTGCGCCTGCTGCAGTTGGCCAGCCCCGGCTTGCCGGTGGGTGGTT > NC_002947/3250973‑3251270 | gTCGCTGCTGACAATTGCCATGCCTGTGTTCGCCTTGTTCCATGGTTGGGCACATGGCGTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGG‑CAATTCAGCGCGGGGTTTGTGGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTC‑GGTTg > 1:1182213/1‑150 (MQ=255) tcgaccgcccactccaggccttgcgaataggtaaaaccacccaccggcaagccggggctggccaactgcagcaggcgcagcagcgccaggtcgctgttcatcaaccggccagtaccagcgcggcgccggccaacaggccaccgccaaagg < 1:1286623‑M1/1‑1 (MQ=255) tcgaccgcccactccaggccttgcgaataggtaaaaccacccaccggcaagccggggctggccaactgcagcaggcgcagcagcgccaggtcgcgtttcatcaaccggccagtaccagcgcggcgccggccaacaggccaccgccaaagg < 1:1836097‑M1/1‑1 (MQ=255) tggccatggccaTGCCTGTGTTCGCCTTGTTCCATGGTTGGGCACATGGCGTAGAAGCCACGCCGCGAG‑ATTATGGCCTATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTC‑GGTTGCCtgctgc > 2:695145/1‑150 (MQ=255) tggccatggccaTGCCTGTGTTCGCCTTGTGCCATGGTTGGGCACATGGCGTAGAAGGCACGCCGAGCGCGTTCTGG‑CAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTC‑GGTTGCCtgctgc < 2:248706/150‑1 (MQ=255) tggccatggccaTGCCTGTGTTCGCCTNGTTCCATGGTTGNGCACATNGCGTAGAACCCACGCCGAGCGCGTTCTGG‑CAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTC‑GGTTGCCtgctgc > 1:2235985/1‑150 (MQ=255) gccatggccatgCCTGTGTTCGCCTTGTTCCATGGTTGGGCACATGGCGTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGG‑CAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTC‑GGTTGCCTGCTgc‑‑gc > 2:1038446/1‑150 (MQ=255) catggccatgCCTGTGTTCGCCTTGTTCCATGGTTGGGCACATGGCGTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGG‑CAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTC‑GGTTGCCTGCTGc‑‑gccg < 1:763555/150‑1 (MQ=255) atggccatgCCTGTGTTCGCCTTGTTCCATGGTTGGGCACATGGCGTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGG‑CAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTC‑GGTTGCCTGCTGc‑‑gccgc < 1:1166985/150‑1 (MQ=255) atggccatgCCTGTGTTCGCCTTGTTCCATGGTTGGGCACATGGCGTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGG‑CAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTC‑GGTTGCCTGCTGc‑‑gccgc > 1:278986/1‑150 (MQ=255) gccatgCCTGTGTTCGCCTTGTTCCATGGTTGGGCACATGGCGTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGG‑CAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTC‑GGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCcac > 1:818308/1‑150 (MQ=255) gccatgCCTGTGTTCGCCTTGTTCCATGGTTGGGCACATGGCGTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGG‑CAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTC‑GGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCcac > 1:2138552/1‑150 (MQ=255) ccTGTGTTCGCCTTGTTCCATGGTTGGGCACATGGCGTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGG‑CAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTC‑GGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGc > 1:324965/1‑150 (MQ=255) ccTGTGTTCGCCTTGTTCCATGGTTGGGCACATGGCGTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGG‑CAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTC‑GGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGc < 1:1821245/150‑1 (MQ=255) ccTGTGTTCGCCTTGTTCCATGGTGGGTCACATGGCGTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGG‑CAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTC‑GGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGc > 1:2132679/1‑150 (MQ=255) tgtgTTCGCCTTGTTCCATGGTTGGGCACATGGCGTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGG‑CAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTC‑GGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCt > 2:76815/1‑150 (MQ=255) tgtTCGCCTTGTTACATGGTTCGGCACATGGCGTAGCACCCACGCCGAGCGCGTTCTGG‑CAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTC‑GGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGc > 2:1836097/1‑150 (MQ=255) ttCGCCTTGTTCCATGGTTGGGCACATGGCGTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGG‑CAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTC‑GGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAg > 2:459117/1‑150 (MQ=255) ttCGCCTTGTTCCATGGTTGGGCACATGGCGTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGG‑CAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTC‑GGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAg > 1:213810/1‑150 (MQ=255) ttCGCCTTGTTCCATGGTTGGGCACATGGCGTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGG‑CAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTC‑GGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAg > 2:864176/1‑150 (MQ=255) ttCGCCTTGTTCCATGGTTGGGCACATGGCGTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCT‑G‑CAATTCAGCGGGGGGGTTGTCGGGGGCAGCCGCTTGCTGCTGGCGGGCGGGTTTGGAGGCGGGTTGCTTGCTG‑‑‑GCCGCCACAGGGGccctcaag > 1:2088671/1‑144 (MQ=255) cGCCTTGTTCCATGGTTGGGCACATGGCGTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGG‑CAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTC‑GGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGaa > 1:1435047/1‑150 (MQ=255) gtaaaaccacccaccggcaagccggggctggccaactgcagcaggcgcagcagcgccaggtcgctgttcattaaccggccagtaccagcgcggcgccggccaacaggccaccgccaaagGcc < 1:1142921‑M1/3‑1 (MQ=255) gtaaaaccacccaccggcaagccggggctggccaactgcagcaggcgcagcagcgccaggtcgctgttcatcaaccggccagtaccagcgcggcgccggccaacaggccaccgccaaagGCCTTCTGCAGGCCGCCACAGCGGCCTGCa > 1:681688‑M1/120‑149 (MQ=255) gtaaaaccacccaccggcaagccggggctggccaactgcagcaggcgcagcagcgccaggtcgctgttcatcaaccggccagtaccagcgcggcgccggccaacaggccaccgccaaagGCCTTCTGCAGGCCGCCACAGCGGCCTGCa < 2:681688‑M1/30‑1 (MQ=255) ttCCATGGTTGGGCACATGGCGTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGG‑CAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTCCTCGTGTCCGGCTGTTCTGTG‑TGTTGGCGTTTTC‑‑GCCACCGCAGCGGCCTGCAGAAGGCCttt > 2:1130404/1‑150 (MQ=255) tCCATGGTTGGGCACATGGCGTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGG‑CAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTC‑GGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTg > 1:1928499/1‑150 (MQ=255) ccATGGTTGGGCACATGGCGTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGG‑CAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTC‑GGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTgg > 2:533737/1‑150 (MQ=255) ccATGGTTGGGCACATGGCGTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGG‑CAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTC‑GGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTgg > 2:1731844/1‑150 (MQ=255) ccATGGTTGGGCACATGGCGTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGG‑CAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTC‑GGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGACTTTgg < 1:1791889/150‑1 (MQ=255) cATGGTTGGGCACATGGCGTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGG‑CAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTC‑GGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGc < 1:979202/150‑1 (MQ=255) cATGGTTGGGCACATGGCGTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGG‑CAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTC‑GGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGc > 2:1283764/1‑150 (MQ=255) ggTTGGGCACATGGCGTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGG‑CAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTC‑GGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGt > 2:461027/1‑150 (MQ=255) 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caTGGCGTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGG‑CAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTC‑GGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTg < 2:486625/150‑1 (MQ=255) aTGGCGTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGG‑CAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTC‑GGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTgg > 1:1996416/1‑150 (MQ=255) gCGTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGG‑CAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTC‑GGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCg > 2:2146264/1‑150 (MQ=255) gTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGG‑CAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTC‑GGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAg > 2:1183642/1‑123 (MQ=255) gTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGG‑CAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTC‑GGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAg < 1:1183642/123‑1 (MQ=255) 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ggTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTC‑GGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTgga < 1:1552638/150‑2 (MQ=255) tttGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTC‑GGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGcc < 1:2102667/105‑1 (MQ=255) tttGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTC‑GGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGcc > 2:2102667/1‑105 (MQ=255) tttGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTC‑GGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGgcgc < 1:855733/150‑1 (MQ=255) tCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTC‑GGTTGCATGCTGA‑‑GCAGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCgctgct > 2:593014/1‑150 (MQ=255) gTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTC‑GGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCGCtgctgc < 1:1782281/150‑1 (MQ=255) aGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTC‑GGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGaa > 1:1138528/1‑124 (MQ=255) aGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTC‑GGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGaa < 2:1138528/124‑1 (MQ=255) gCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTC‑GGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTtgat > 1:83182/1‑117 (MQ=255) gCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTC‑GGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTtgat < 2:83182/117‑1 (MQ=255) cTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTC‑GGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCa > 2:449597/1‑60 (MQ=255) cTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTC‑GGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCa < 1:449597/60‑1 (MQ=255) cTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTC‑GGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGtt > 2:859387/1‑113 (MQ=255) cTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTC‑GGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGtt < 1:859387/113‑1 (MQ=255) cTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTC‑GGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCGCTGCTGCGCCTGCTGCAg < 2:2057443/150‑1 (MQ=255) tgGCGGCGGGCTTTGCAGTC‑GGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCTCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCGCTGCTGCGCCTGCTGCAGTTGGCCAg > 2:195830/1‑150 (MQ=255) tgGCGGCGGGCTTTGCAGTC‑GGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCgctgct > 2:1894870/1‑129 (MQ=255) tgGCGGCGGGCTTTGCAGTC‑GGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCgctgct < 1:1894870/129‑1 (MQ=255) tgGCGGCGGGCTTTGCAGTC‑GGTTGCCTGCTGC‑‑GAAGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCGCTGCTGCGCCTGCTGCAGTTGGCCAg > 1:194297/1‑150 (MQ=255) gcggGCTTTGCAGTC‑GGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCGCTGCTGCGCCTGCTGCAGTTGGCCAGCCCCg > 1:945063/1‑150 (MQ=255) gggCTTTGCAGTC‑GGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCGCTGCTGCGCCTGCTGCAGTTGGCCAGCCCCTGc < 1:1038446/150‑1 (MQ=255) gggCTTTGCAGTC‑GGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCGCTGCTGCGCCTGCTGCAGTTGGCCAGCCCCGGc > 1:505876/1‑150 (MQ=255) ggCTTTGCAGTC‑GGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCGCTGCTGCGCCTGCTGCAGTTGGCCAGCCCCGGCt > 2:1094640/1‑150 (MQ=255) aGTC‑GGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCcgcg > 1:2109261/1‑73 (MQ=255) aGTC‑GGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCcgcg < 2:2109261/73‑1 (MQ=255) aGTC‑GGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCGCTGCTGCGCCTGCTGCAGTTGGCCAGCCCCGGCTTGCCggtg > 2:1606663/1‑150 (MQ=255) tC‑GGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCGCTGCTGCGCCTGCTGCAGTTGGCCAGCCCCGGCTTGCCggtggg > 1:1140747/1‑150 (MQ=255) c‑GGTTTCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTAATGACTGCTTCATGAACAGCGACCTGGCGCTGCTGCGCCTGCTGCAGTTGGCCAGCCCCGGCTTGCCggtgggt < 2:1182213/150‑1 (MQ=255) c‑GGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCGCTGCTGCGCCTGCTGCAGTTGGCCAGCCCCGGCTTGCCggtgggt < 1:1606663/150‑1 (MQ=255) ggTTGCCTGCTGC‑‑GCGGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCGCTGCTGCGCCTGCTGCAGTTGGCCAGCCCCGGCTTGCCggtgggtg > 1:581202/1‑150 (MQ=255) tGCCTGCGGC‑‑GCCGCCACAGCTGCCTGCAGAAGGCCTTGGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCGCTGCTGCGCCTGCTGCAGTTGGCCAGCCGCGGCTTGCCGGTGGGTGGtt < 1:2327281/150‑1 (MQ=255) | GTCGCTGCTGGCCATGGCCATGCCTGTGTTCGCCTTGTTCCATGGTTGGGCACATGGCGTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGG‑CAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTC‑GGTTGCCTGCTGC‑‑GCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCGCTGCTGCGCCTGCTGCAGTTGGCCAGCCCCGGCTTGCCGGTGGGTGGTT > NC_002947/3250973‑3251270 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |