New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 3251122 = | 96 (1.080) | 8 (0.090) | 4/238 | NT | 8.3% | coding (464/546 nt) | ureJ | urease accessory protein UreJ |
? | NC_002947 | 3251156 = | 84 (0.980) | coding (498/546 nt) | ureJ | urease accessory protein UreJ |
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
TGTTCCATGGTTGGGCACATGGCGTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGGCAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGCGCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCGCTGCTGCGCCTGCTGCAGTTGGCCAGCCCCGGCTTGCCGGTGGGTGGTTTTACCTATTCGCAAGGCCTGGAGTGGGCGGTCGAG > NC_002947/3251008‑3251305 | tGTTCCATGGTTGGGCACATGGCGTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGGCAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGCGCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCt < 2:2138552/150‑1 (MQ=255) tCCATGGTTGGGCACATGGCGTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGGCAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGCGCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTg > 1:1928499/1‑150 (MQ=255) ccATGGTTGGGCACATGGCGTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGGCAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGCGCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTgg > 2:1731844/1‑150 (MQ=255) ccATGGTTGGGCACATGGCGTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGGCAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGCGCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTgg > 2:533737/1‑150 (MQ=255) ccATGGTTGGGCACATGGCGTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGGCAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGCGCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGACTTTgg < 1:1791889/150‑1 (MQ=255) cATGGTTGGGCACATGGCGTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGGCAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGCGCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGc < 1:979202/150‑1 (MQ=255) cATGGTTGGGCACATGGCGTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGGCAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGCGCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGc > 2:1283764/1‑150 (MQ=255) ggTTGGGCACATGGCGTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGGCAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGCGCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGt > 2:461027/1‑150 (MQ=255) ccggcaagccggggctggccaactgcagcaggcgcagcagcgccaggtcgctgttcatcaaccggccagtaccagcgcggcgccggccaacaggccaccgccaaagGCCTGCTGCGCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGt > 1:1994913‑M1/107‑150 (MQ=255) ccggcaagccggggctggccaactgcagcaggcgcagcagcgccaggtcgctgttcatcaaccggccagtaccagcgcggcgccggccaacaggccaccgccaaagGCCTGCTGCGCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGt < 2:1994913‑M1/44‑1 (MQ=255) tGGGCACATGGCGTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGGCAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGCGCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGc < 2:1594010/150‑1 (MQ=255) caTGGCGTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGGCAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGCGCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTg < 2:486625/150‑1 (MQ=255) tGGCGTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGGCAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGCGCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGc > 1:1839891/1‑150 (MQ=255) gCGTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGGCAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGCGCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCg > 2:2146264/1‑150 (MQ=255) gTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGGCAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGCGCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGgc > 1:1995505/1‑150 (MQ=255) gAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGGCAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGCGCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGcgcc < 1:856960/150‑1 (MQ=255) ccACGCCGAGCGCGTTCTGGCAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGCGCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCgcgc > 1:1960331/1‑150 (MQ=255) cACGCCGAGCGCGTTCTGGCAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGGTTGATACTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGCGCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCt > 1:2102275/1‑150 (MQ=255) 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gTTCTGGCAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGCGCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCgg > 1:536646/1‑150 (MQ=255) tGGCAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGCGCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTtga > 2:855733/1‑150 (MQ=255) ggCAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGCGCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGNGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTtgat < 1:1538733/150‑1 (MQ=255) gCAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGCGCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTtgatg > 2:1510637/1‑150 (MQ=255) aaTTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGCGCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGt < 2:801984/143‑1 (MQ=255) 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ggggTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGCGCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTg > 1:2208416/1‑150 (MQ=255) gggTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGCGCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTgg < 2:1996416/150‑1 (MQ=255) ggTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGCGCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTgga < 1:1552638/150‑2 (MQ=255) gTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGCGCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGgcg > 1:2057443/1‑150 (MQ=255) tttGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGCGCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGcc < 1:2102667/105‑1 (MQ=255) tttGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGCGCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGcc > 2:2102667/1‑105 (MQ=255) 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CTGCTGCGCCGCCACCGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCGCTGCTGCGCCTGCTGCAGTTGGCCAGCCCCGGCTTGCCGGTGGGTGGTTTTa > 2:1682877‑M1/1‑150 (MQ=255) CTGCTGCGCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCTCCTCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCGCTGCTGCGCCTGCTGCAGTTGGCCAGCCCCGGCTTGCCGGTGGGTGGTTTTa > 2:2132679‑M1/1‑150 (MQ=255) CTGCTGCGCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCGCTGCTgcgc > 2:1981654‑M1/1‑107 (MQ=255) CTGCTGCGCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCGCTGCTgcgc < 1:1981654‑M1/107‑1 (MQ=255) CTGCTGCGCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCGCTGCTGCGCCTGCTGCAGTTGGc < 1:52139‑M1/121‑1 (MQ=255) CTGCTGCGCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCGCTGCTGCGCCTGCTGCAGTTGGc > 2:52139‑M1/1‑121 (MQ=255) CTGCTGCGCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCGCTGCTGCGCCTGCTGCAGTTGGCCAGCCCCGGCTTGCCGGTGGGTGGTTTTa < 2:1143642‑M1/150‑1 (MQ=255) tgcaggccgctgtggcggcctgcagaaggcCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCGCTGCTGCGCCTGCTGCAGTTGGCCAGCCCCGGCTTGCCGGTGGGTGGTTTTAc > 1:681688‑M2/31‑149 (MQ=255) gctgcGCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCGCTGCTGCGCCTGCTGCAGTTGGCCAGCCCCGGCTTGCCGGTGGGTGGtttt < 1:956920/147‑1 (MQ=255) tgcGCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCGCTGCTGCGCCTGCTGCAGTTGGCCAGCCCCGGCTTGCCGGTGGGTGGTTTTACCTa < 2:2208416/150‑1 (MQ=255) cgccgcCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCGCTGCTGCGCCTGCTGCAGTTGGCCAGCCCCGGCTTGCCGGTGGGTGGTTTTACCTAtt < 1:1143642/150‑1 (MQ=255) cgccACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGgc < 2:2139687/88‑1 (MQ=255) cgccACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGgc > 1:2139687/1‑88 (MQ=255) gccACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCGCTGCTGCGCCTGCTGCAGTTGGCCAGCCCCGGCTTGCCGGTGGGTGGTTTTACCTATTCGCa > 2:1226612/1‑150 (MQ=255) ccACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCGCTGCTGCGCCTGCTGCAGTTGGCCAGCCCCGGCTTGCCGGTGGGTGGTTTTACCTATTCGCaa < 1:1094640/150‑1 (MQ=255) cacaGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCGCTGCTGCGCCTGCTGCAGTTGGCCAGCCCCGGCTTGCCGGTGGGTGGTTTTACCTATTCGCAAg < 2:278986/150‑1 (MQ=255) acaGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCGCAGCAGCGccaggtc < 1:1037852/100‑6 (MQ=255) acaGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCGCAGCAGCGccaggtc > 2:1037852/1‑95 (MQ=255) gCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCGCTGCTGCGCCTGCTGCAGTTGGCCAGCCCCGGCTTGCCGGTGGGTGGTTTTACCTATTCGCAAGGCCTGGa > 1:394401/1‑150 (MQ=255) cAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCGCTGCTGCGCCTGCTGCAGTTGGCCAGCCCCGGCTTGCCGGTGGGTGGTTTTACCTATTCGCAAGGCCTGGAGTggg > 2:260991/1‑150 (MQ=255) gAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCGCTGCTGCGCCTGCTGCAGTTGGCCAGCCCCGGCTTGCCGGTGGGTGGTTTTACCTATTCGCAAGGCCTGGAGTGGGCg < 1:76815/150‑1 (MQ=255) ggcCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCGCTGCTGCGCCTGCTGCAGTTGGCCAGCCCCGGCTTGCCGGTGGGTGGTTTTAc > 2:1142921‑M2/4‑122 (MQ=255) cCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCGCTGCTGCGCCTGCTGCAGTTGGCCAGCCCCGGCTTGCCGGTGGGTGGTTTTACCTATTCGCAAGGCCTGGAGTGGGCGGTCGa < 1:1286623‑M2/149‑1 (MQ=255) cCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAAACGCGACCTGGCGCTGCTGCGCCTGCTGCAGTTGGCCAGCCCCGGCTTGCCGGTGGGTGGTTTTACCTATTCGCAAGGCCTGGAGTGGGCGGTCGa < 1:1836097‑M2/149‑1 (MQ=255) cTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCGCTGCTGCGCCTGCTGCAGTTGGCCAGCCCCGGCTTGCCGGTGGGTGGTTTTACCTATTCGCAAGGCCTGGAGTGGGCGGTCGAg < 2:562963/150‑1 (MQ=255) cTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCGCTGCTGCGCCTGCTGCAGTTGGCCAGCCCCGGCTTGCCGGTGGGTGGTTTTACCTATTCGCAAGGCCTGGAGTGGGCGGTCGAg < 2:1928499/150‑1 (MQ=255) | TGTTCCATGGTTGGGCACATGGCGTAGAAGCCACGCCGAGCGCGTTCTGGCAATTCAGCGCGGGGTTTGTCGTGGTCAGCGGCTTGCTGCTGGCGGCGGGCTTTGCAGTCGGTTGCCTGCTGCGCCGCCACAGCGGCCTGCAGAAGGCCTTTGGCGGTGGCCTGTTGGCCGGCGCCGCGCTGGTACTGGCCGGTTGATGAACAGCGACCTGGCGCTGCTGCGCCTGCTGCAGTTGGCCAGCCCCGGCTTGCCGGTGGGTGGTTTTACCTATTCGCAAGGCCTGGAGTGGGCGGTCGAG > NC_002947/3251008‑3251305 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |