| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | = 3610388 | 78 (0.880) | 6 (0.070) | 5/234 | NT | 7.5% | coding (3339/3396 nt) | mcoA | Mn(II) copper oxidase A |
| ? | NC_002947 | = 3610420 | 74 (0.880) | coding (3307/3396 nt) | mcoA | Mn(II) copper oxidase A | |||||
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
CGCCAGTACCAGCAGGAATCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑C‑ATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCGGTGGTGGTCACCGCTACCCGCCAACGGGCCCCCGTAGTCGTGGCAGTCAGCGTCGCGTTCCCCAGGCTTACCGGACCACCGGTGGTTGCTGCAGTCACGCTGATGCTGTTGCCCGTGGCCAC > NC_002947/3610240‑3610537 | cGCCAGTACCAGCAGGAATCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑C‑ATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCg > 1:1425366/1‑150 (MQ=255) gCCAGTACCAGCAGGAATCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑C‑ATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGt > 1:881411/1‑150 (MQ=255) cAGTACCAGCAGGAATCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑C‑ATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCg < 2:375245/150‑1 (MQ=255) ttACCGGCAGGAATCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑C‑ATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCt > 2:1776719/2‑150 (MQ=255) gTACCAGCAGGAATCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑C‑ATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCCGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCt < 2:44278/150‑1 (MQ=255) gTACCAGCAGGAATCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑C‑ATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCt > 2:2361594/1‑150 (MQ=255) tACCAGCAGGAATCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑C‑ATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTg > 2:1068635/1‑150 (MQ=255) gcagGAATCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑C‑ATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTg > 2:2183054/1‑150 (MQ=255) gcagGAATCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑C‑ATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTg > 1:1381917/1‑150 (MQ=255) cagGAATCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑C‑ATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTgg < 1:1705487/150‑1 (MQ=255) aaTCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑C‑ATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCgg < 2:2125606/150‑1 (MQ=255) aaTCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑C‑ATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCgg < 1:1776719/150‑1 (MQ=255) aTCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑C‑ATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTAACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCggg < 2:408973/150‑1 (MQ=255) cATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑C‑ATGGTGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCaaa > 1:554765/1‑150 (MQ=255) aTGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑C‑ATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAg > 1:1343061/1‑150 (MQ=255) aGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑C‑ATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCg < 1:2361594/150‑1 (MQ=255) cGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑C‑ATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCggtg < 2:1032309/150‑1 (MQ=255) gggCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGGTGGGGGCAC‑C‑GTATGGGCCCTGACCTGCACTCACTGGTAGGTGACGGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGTGCCAAAGCCggtgt < 2:1131809/150‑2 (MQ=255) 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tCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCGGTGGTGGTCACCGCTACCCGCCAACGGGCCCCCGTAGTCGTGGCAGTCAGCGTCGCGTTCCCCAGGCTTACCGGACCACCGGTGGTtg > 1:1452590/1‑150 (MQ=255) aCCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCGGTGGTGGTCACCGCTACCCGCCAACGGGCCCCCGTAGTCGTGGCAGTCAGCGTCGCGTTCCCCAg > 2:1094236/1‑125 (MQ=255) aCCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCGGTGGTGGTCACCGCTACCCGCCAACGGGCCCCCGTAGTCGTGGCAGTCAGCGTCGCGTTCCCCAg < 1:1094236/125‑1 (MQ=255) aCCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCGGTGGTGGTCACCGCTACCCGCCAACGGGCCCCCGTAGTCGTGGCAGTCAGCGTCGCGTTCCCCAGGCTTACCGGACCACCGGTGGTtgct > 2:2333564/1‑150 (MQ=255) aCCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCGGTGGTGGTCACCGCTACCCGCCAACGGGCCCCCGTAGTCGTGGCAGTCAGCGTCGCGTTCCCCAGGCTTACCGGACCACCGGTGGTtgct > 1:704733/1‑150 (MQ=255) gTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCGGTGGTGGTCACCGCTACCCGCCAACGGGCCCCCGTAGTCGTGGCAGTCAGCGTCGCGTTCCCCAGGCTTACCGGACCACCGGTGGTTGCTGCa < 1:2062919/150‑1 (MQ=255) tCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCGGTGGTGGTCACCGCTACCCGCCAACGGGCCCCCGTAGTCGTGGCAGTCAGCGTCGCGTTCCCCAGGCTTACCGGACCACCGGTGGTTGCTGCAg < 1:1068635/150‑1 (MQ=255) gCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCGGTGGTGGTCACCGCTACCCGCCAACGGGCCCCCGTAGTCGTGGCAGTCAGCGTCGCGTTCCCCAGGCTTACCGGACCACCGGTGGTTGCTGCAGTCAc < 2:1195229/150‑1 (MQ=255) cAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCGGTGGTGGTCACCGCTACCCGCCAACGGGCCCCCGTAGTCGTGGCAGTCAGCGTCTCGTTCCCCAGGCTTACCGGACCACCGGTGGTTGCTGCAGTCACGCt > 1:1292860/1‑150 (MQ=255) cGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCGGTGGTGGTCACCGCTACCCGCCAACGGGCCCCCGTAGTCGTGGCAGTCAGCGTCGCGTTCCCCAGGCTTACCGGACCACCGGTGGTTGCTGCAGTCACGCTGAt > 1:2275672/1‑150 (MQ=255) taTTTCACCGCGACCGCCGCCGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCGGTGGTGGTCACCGCTACCCGCCAACGGGCCCCCGTAGTCGTGGCAGTCAGCGTCGCGTTCCCCAGGCTTACCGGACCACCGGTGGTTGCTGCAGTCACGCTGATGCTg < 2:1292860/149‑1 (MQ=255) aTTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCGGTGGTGGTCACCGCTACCCGCCAACGGGCCCCCGTAGTCGTGGCAGTCAGCGTCGCGTTCCCCAGGCTTACCGGACCACCGGTGGTTGCTGCAGTCACGCTGATGCTGt < 2:1193455/150‑1 (MQ=255) tttCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCGGTGGTGGTCACCGCTACCCGCCAACGGGCCCCCGTAGTCGTGGCAGTCAGCGTCGCGTTCCCCAGGCTTACCGGACCACCGGTGGTTGCTGCAGTCACGCTGATGCTGtt > 1:588500/1‑150 (MQ=255) aCCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCGGTGGTggtcacggtgaaatcgacgctgggccagacggtgacagcgccagtcacatac > 2:888657‑M2/1‑41 (MQ=255) aCCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCGGTGGTggtcacggtgaaatcgacgctgggccagacggtgacagcgccagtcacatac < 1:888657‑M2/93‑53 (MQ=255) gctgaCCaccaccggctttggcccggccacgccagcgacggtcacggtgaaatcgacgctgggccagacggtgacagcgccagtcacatacaagtgagtgcaaagcggggccgcatggcggcccc > 2:405931‑M1/3‑7 (MQ=255) cGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCGGTGGTggtcacggtgaaatcgacgctgggccagacggtgacagcgccagtcacatacaagtgagtgcaaagcggggtccccatgcggccccc < 1:127205‑M2/126‑88 (MQ=255) cGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCGGTGGTggtcacggtgaaatcgacgctgggccagacggtgacagcgccagtcacatacaagtgagtgcaaagcggggccgccatgcggccccc > 2:127205‑M2/1‑39 (MQ=255) cGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCGGTGGTggtcacggtgaaatcgacgctgggccagacggtgacagcgccagtcacatacaagtgagtgcaaagcggggccgccatgcggc < 1:1675612‑M2/122‑84 (MQ=255) cGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCGGTGGTggtcacggtgaaatcgacgctgggccagacggtgacagcgccagtcacatacaagtgagtgcaaagcggggccgccatgcggc > 2:1675612‑M2/1‑39 (MQ=255) ccaccaccggctttggcccggccacgccagcgacggtcacggtgaaatcgacgctgggccagacggtgacagcgccagtcacatacaagtgagtgcaaagcggggccgccatgcggcccccatcagccaacccacgaggaccgcatcatg < 1:1248521‑M1/150‑149 (MQ=255) caccaccggctttggcccggccacgccagcgacggtcacggtgaaatcgacgctgggccagacggtgacagcgccagtcacatacaagtgagtgcaaagcggggccgccatgcggcccccatcagccaacccacgaggaccgcatcatgc < 2:2405175‑M1/150‑150 (MQ=255) caccaccggctttggcccggccacgccagcgacggtcacggtgaaatcgacgctgggccagacggtgacagcgccagtcacatacaagtgagtgcaaagcggggccgcatggcggccccgct < 1:1809191‑M1/122‑122 (MQ=255) | CGCCAGTACCAGCAGGAATCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑C‑ATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCGGTGGTGGTCACCGCTACCCGCCAACGGGCCCCCGTAGTCGTGGCAGTCAGCGTCGCGTTCCCCAGGCTTACCGGACCACCGGTGGTTGCTGCAGTCACGCTGATGCTGTTGCCCGTGGCCAC > NC_002947/3610240‑3610537 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |